More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3299 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_3299  magnesium transporter  100 
 
 
450 aa  890    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000163374  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5759  magnesium transporter  64.51 
 
 
450 aa  587  1e-166  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.180373 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1629  magnesium transporter, MgtE  46.99 
 
 
450 aa  403  1e-111  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0142198  hitchhiker  0.00754264 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03755  magnesium transporter  41.29 
 
 
449 aa  356  3.9999999999999996e-97  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.578894  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1980  magnesium transporter  42.7 
 
 
451 aa  355  1e-96  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0134  magnesium transporter  41.7 
 
 
450 aa  342  1e-92  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.149732 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0843  magnesium transporter  37.64 
 
 
449 aa  317  3e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1588  response regulator receiver protein  33.03 
 
 
446 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0596  magnesium transporter  32.35 
 
 
451 aa  243  5e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000141787  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0481  magnesium transporter  36.76 
 
 
450 aa  242  7.999999999999999e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000026878  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1654  response regulator receiver protein  31.89 
 
 
446 aa  238  2e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.399924  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12500  magnesium transporter  32.79 
 
 
442 aa  235  1.0000000000000001e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1033  magnesium transporter  34.3 
 
 
473 aa  232  8.000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160673  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1689  magnesium transporter  31.98 
 
 
449 aa  231  2e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2169  magnesium transporter  32.87 
 
 
449 aa  229  8e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.82327 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1386  magnesium transporter  31.47 
 
 
485 aa  229  9e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2282  magnesium transporter  32.29 
 
 
453 aa  228  2e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0198685  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1026  magnesium transporter  32.94 
 
 
461 aa  226  6e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000394015  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1007  magnesium transporter  32.94 
 
 
461 aa  226  6e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00155557  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0267  magnesium transporter  29.8 
 
 
456 aa  226  6e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000106938  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1669  magnesium transporter  32.67 
 
 
462 aa  225  1e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1642  magnesium transporter  32.67 
 
 
462 aa  225  1e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2430  divalent cation transporter  31.97 
 
 
466 aa  224  2e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0143004 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3340  magnesium transporter  33.48 
 
 
473 aa  225  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0546  magnesium transporter  31.52 
 
 
459 aa  223  6e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1897  Mg/Co/Ni transporter, MgtE  31.52 
 
 
444 aa  223  7e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4217  magnesium transporter  33.81 
 
 
452 aa  221  1.9999999999999999e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1939  magnesium transporter  29.66 
 
 
444 aa  221  3e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0382273  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2723  magnesium transporter  32.34 
 
 
462 aa  220  3.9999999999999997e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.310199  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1454  magnesium transporter  33.11 
 
 
447 aa  219  1e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.192338  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2352  magnesium transporter  32 
 
 
468 aa  218  2e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.814401  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1172  divalent cation transporter  32.08 
 
 
450 aa  217  2.9999999999999998e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000987618  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1083  magnesium transporter  31.18 
 
 
471 aa  217  4e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.939247  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0294  magnesium transporter  33.03 
 
 
459 aa  216  9e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2600  magnesium transporter  31.28 
 
 
463 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0589  magnesium transporter  32.16 
 
 
461 aa  211  3e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.124828  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2620  magnesium transport protein  32.64 
 
 
471 aa  211  3e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.475029  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3016  magnesium transporter  30.37 
 
 
443 aa  210  4e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000242012  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0138  divalent cation transporter  31.59 
 
 
486 aa  210  4e-53  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0965  magnesium transporter  30.68 
 
 
481 aa  209  5e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.105361  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2778  magnesium transporter  31.53 
 
 
461 aa  209  6e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.854072  normal  0.0326796 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20831  Mg2+ transporter  30.25 
 
 
469 aa  209  8e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0696  magnesium transporter  30.79 
 
 
470 aa  208  1e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1208  Mg2+ transporter  30.25 
 
 
469 aa  209  1e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4791  putative magnesium transporter MgtE-like (divalent cation transporter Mg2+/Ni2+/Co2+)  34.04 
 
 
472 aa  208  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1801  divalent cation transporter  30.97 
 
 
460 aa  207  3e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1450  magnesium transporter  31.24 
 
 
445 aa  207  3e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.103194  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2089  magnesium transporter  30.33 
 
 
460 aa  207  3e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1461  magnesium transporter  31.18 
 
 
463 aa  207  4e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00122115  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2831  magnesium transporter  32.62 
 
 
458 aa  207  5e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18191  Mg2+ transporter  30.84 
 
 
469 aa  206  6e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2718  magnesium transporter  28.73 
 
 
452 aa  205  1e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2291  magnesium transporter  31.32 
 
 
449 aa  205  1e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1723  Mg2+ transporter  30.77 
 
 
468 aa  205  2e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.20289  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1904  magnesium transporter  32.43 
 
 
462 aa  205  2e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1619  magnesium transporter  31.52 
 
 
481 aa  204  3e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00438274  normal  0.116909 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18401  Mg2+ transporter  31.29 
 
 
468 aa  204  3e-51  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.297681  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3573  magnesium transporter  31.99 
 
 
473 aa  203  6e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.433595  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18221  Mg2+ transporter  30.39 
 
 
468 aa  202  8e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2058  magnesium transporter  30.79 
 
 
460 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0092  magnesium transporter  30.68 
 
 
486 aa  201  1.9999999999999998e-50  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2168  magnesium transporter  30.16 
 
 
453 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.571792  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1269  magnesium transporter  31.31 
 
 
465 aa  201  3e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0779643  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4084  magnesium transporter  33.42 
 
 
470 aa  201  3e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.403557  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0320  divalent cation transporter  30.22 
 
 
460 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0139413 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1255  magnesium transporter  30.79 
 
 
445 aa  198  2.0000000000000003e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.029906  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1147  magnesium transporter  27.95 
 
 
479 aa  197  3e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.552524 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3075  magnesium transporter  31.91 
 
 
473 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.669492 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1995  divalent cation transporter  30.38 
 
 
476 aa  195  1e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0824  magnesium transporter  29.77 
 
 
454 aa  195  1e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1890  magnesium transporter  29.52 
 
 
460 aa  195  1e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3533  magnesium transporter  29.08 
 
 
471 aa  195  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.206013 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1125  magnesium transporter  30.35 
 
 
444 aa  195  2e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0382  magnesium transporter  29.15 
 
 
454 aa  194  3e-48  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2099  magnesium transporter  30.35 
 
 
460 aa  194  3e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.168721  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0681  transcriptional regulator  31.97 
 
 
454 aa  193  5e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3159  magnesium transporter  32.27 
 
 
489 aa  193  6e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2269  magnesium transporter  32.59 
 
 
454 aa  193  6e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0532952  hitchhiker  0.0000374811 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4245  magnesium transporter  29.6 
 
 
454 aa  192  7e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.036971  unclonable  0.0000000195953 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6844  magnesium transporter  34.17 
 
 
454 aa  192  8e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.724655 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2379  magnesium transporter  30.57 
 
 
473 aa  192  8e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.573917  normal  0.465291 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01631  Mg2+ transporter  32.82 
 
 
473 aa  192  8e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6729  magnesium transporter  30.04 
 
 
463 aa  192  9e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.143213  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1523  magnesium transporter  31.75 
 
 
447 aa  192  1e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1722  magnesium transporter  31.1 
 
 
462 aa  192  1e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1471  magnesium transporter  31.88 
 
 
449 aa  191  2e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2441  magnesium transporter  30.94 
 
 
460 aa  191  2e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2786  magnesium transporter  29.04 
 
 
463 aa  191  2e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4471  magnesium transporter  29.41 
 
 
480 aa  190  4e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.223346 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1444  magnesium transporter  29.41 
 
 
480 aa  190  4e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0516873  normal  0.652895 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0412  magnesium transporter  28.67 
 
 
461 aa  190  4e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3760  magnesium transporter  28.29 
 
 
480 aa  190  4e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00964036  normal  0.880674 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3976  magnesium transporter  29.41 
 
 
480 aa  190  4e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2506  divalent cation transporter  29.7 
 
 
494 aa  189  5.999999999999999e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2899  magnesium transporter  28.76 
 
 
480 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17571  Mg2+ transporter  31.04 
 
 
471 aa  189  9e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.161452  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1866  magnesium transporter  32.01 
 
 
471 aa  188  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.165676  normal  0.0535205 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0721  magnesium transporter  28.92 
 
 
454 aa  188  2e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.167519 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2069  magnesium transporter  32.3 
 
 
471 aa  188  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0471  magnesium transporter  30.47 
 
 
482 aa  187  3e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.963916 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>