More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1629 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_1629  magnesium transporter, MgtE  100 
 
 
450 aa  905    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0142198  hitchhiker  0.00754264 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5759  magnesium transporter  51.45 
 
 
450 aa  486  1e-136  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.180373 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3299  magnesium transporter  46.99 
 
 
450 aa  407  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000163374  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1980  magnesium transporter  44.1 
 
 
451 aa  381  1e-104  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03755  magnesium transporter  41.69 
 
 
449 aa  362  9e-99  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.578894  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0134  magnesium transporter  41.93 
 
 
450 aa  340  2e-92  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.149732 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0843  magnesium transporter  39.56 
 
 
449 aa  340  4e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3340  magnesium transporter  29.46 
 
 
473 aa  237  3e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0596  magnesium transporter  32.87 
 
 
451 aa  230  3e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000141787  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0481  magnesium transporter  35.14 
 
 
450 aa  231  3e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000026878  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1026  magnesium transporter  31.08 
 
 
461 aa  228  2e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000394015  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1007  magnesium transporter  31.08 
 
 
461 aa  228  2e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00155557  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0589  magnesium transporter  33.43 
 
 
461 aa  217  4e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.124828  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0696  magnesium transporter  28.67 
 
 
470 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12500  magnesium transporter  31.23 
 
 
442 aa  213  7e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0267  magnesium transporter  28.41 
 
 
456 aa  211  3e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000106938  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4084  magnesium transporter  31.66 
 
 
470 aa  210  4e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.403557  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0714  magnesium transporter  27.73 
 
 
449 aa  209  7e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4217  magnesium transporter  30.02 
 
 
452 aa  209  1e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1619  magnesium transporter  27.63 
 
 
481 aa  208  2e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00438274  normal  0.116909 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1897  Mg/Co/Ni transporter, MgtE  28.13 
 
 
444 aa  207  4e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3016  magnesium transporter  29.55 
 
 
443 aa  207  4e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000242012  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1689  magnesium transporter  28.95 
 
 
449 aa  206  5e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0546  magnesium transporter  28.13 
 
 
459 aa  206  6e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1033  magnesium transporter  29.28 
 
 
473 aa  206  6e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160673  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0824  magnesium transporter  28.54 
 
 
454 aa  206  6e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2786  magnesium transporter  29.54 
 
 
463 aa  206  6e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2291  magnesium transporter  30.54 
 
 
449 aa  206  8e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2168  magnesium transporter  30.09 
 
 
453 aa  206  8e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.571792  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3573  magnesium transporter  29.38 
 
 
473 aa  202  8e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.433595  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1454  magnesium transporter  28.41 
 
 
447 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.192338  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3075  magnesium transporter  29.62 
 
 
473 aa  200  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.669492 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4791  putative magnesium transporter MgtE-like (divalent cation transporter Mg2+/Ni2+/Co2+)  29.34 
 
 
472 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1083  magnesium transporter  29.79 
 
 
471 aa  200  5e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.939247  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2379  magnesium transporter  29.79 
 
 
473 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.573917  normal  0.465291 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2282  magnesium transporter  30.42 
 
 
453 aa  198  2.0000000000000003e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0198685  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0681  transcriptional regulator  30.75 
 
 
454 aa  198  2.0000000000000003e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1588  response regulator receiver protein  25.69 
 
 
446 aa  196  9e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2001  magnesium transporter  31.75 
 
 
447 aa  195  1e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2169  magnesium transporter  31.84 
 
 
449 aa  195  2e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.82327 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2831  magnesium transporter  28.01 
 
 
458 aa  194  2e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0294  magnesium transporter  28.61 
 
 
459 aa  194  3e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1386  magnesium transporter  26.58 
 
 
485 aa  194  4e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1939  magnesium transporter  27.88 
 
 
444 aa  193  4e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0382273  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1269  magnesium transporter  28.22 
 
 
465 aa  192  7e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0779643  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2352  magnesium transporter  27.35 
 
 
468 aa  192  9e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.814401  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1722  magnesium transporter  29.14 
 
 
462 aa  192  9e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2421  magnesium transporter  29.69 
 
 
450 aa  192  1e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.545313  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1450  magnesium transporter  29.31 
 
 
445 aa  192  1e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.103194  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1690  magnesium transporter  31.99 
 
 
452 aa  192  2e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0394876 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0668  magnesium transporter  29.21 
 
 
454 aa  191  2e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.175865  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3354  magnesium transporter  29.21 
 
 
454 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.399526  normal  0.0702195 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0667  magnesium transporter  29.21 
 
 
454 aa  190  4e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0861056  normal  0.126448 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0971  magnesium transporter  29.02 
 
 
453 aa  189  5.999999999999999e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000190733  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1654  response regulator receiver protein  25.46 
 
 
446 aa  189  9e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.399924  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3300  magnesium transporter  27.42 
 
 
457 aa  188  1e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3966  magnesium transporter  29.09 
 
 
454 aa  188  2e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1669  magnesium transporter  28.33 
 
 
462 aa  188  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2620  magnesium transport protein  28.44 
 
 
471 aa  188  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.475029  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0471  magnesium transporter  28.88 
 
 
482 aa  188  2e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.963916 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1742  magnesium transporter  27.62 
 
 
463 aa  187  2e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.99083 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3303  magnesium transporter  31 
 
 
461 aa  187  4e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2879  magnesium transporter  28.37 
 
 
451 aa  187  4e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1642  magnesium transporter  28.33 
 
 
462 aa  187  5e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1904  magnesium transporter  29.89 
 
 
462 aa  186  6e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2723  magnesium transporter  27.87 
 
 
462 aa  186  7e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.310199  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2000  magnesium transporter  29.89 
 
 
454 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2089  magnesium transporter  28.76 
 
 
460 aa  186  1.0000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1208  Mg2+ transporter  27.23 
 
 
469 aa  185  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1125  magnesium transporter  28.71 
 
 
444 aa  186  1.0000000000000001e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4245  magnesium transporter  26.86 
 
 
454 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.036971  unclonable  0.0000000195953 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1995  divalent cation transporter  29.05 
 
 
476 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1255  magnesium transporter  29.8 
 
 
445 aa  185  1.0000000000000001e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.029906  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0320  divalent cation transporter  29.2 
 
 
460 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0139413 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1801  divalent cation transporter  28.41 
 
 
460 aa  185  2.0000000000000003e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4147  magnesium transporter  29.4 
 
 
454 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.235845 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20831  Mg2+ transporter  27.23 
 
 
469 aa  184  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2899  magnesium transporter  27.6 
 
 
480 aa  184  3e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2430  divalent cation transporter  27.34 
 
 
466 aa  183  4.0000000000000006e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0143004 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52460  putative Mg transporter MgtE  27.83 
 
 
482 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4599  putative Mg transporter MgtE  27.83 
 
 
482 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0809  magnesium transporter  29.76 
 
 
542 aa  183  5.0000000000000004e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2778  magnesium transporter  28.31 
 
 
461 aa  183  5.0000000000000004e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.854072  normal  0.0326796 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0702  magnesium transporter  28.31 
 
 
454 aa  183  6e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.952021 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0458  divalent cation transporter  25.62 
 
 
456 aa  183  7e-45  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0711  magnesium transporter  28.31 
 
 
454 aa  182  7e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194916  normal  0.348771 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2728  divalent cation transporter  29.44 
 
 
456 aa  182  9.000000000000001e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2600  magnesium transporter  27.69 
 
 
463 aa  182  9.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2720  magnesium transporter  28.12 
 
 
453 aa  182  1e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.786081  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3673  magnesium transporter  28.31 
 
 
454 aa  182  1e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0193522  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0891  magnesium transporter  27.55 
 
 
449 aa  182  1e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00182098 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0681  magnesium transporter  28.09 
 
 
454 aa  182  1e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.299447  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4471  magnesium transporter  26.84 
 
 
480 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.223346 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1846  magnesium transporter  26.92 
 
 
480 aa  181  2e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.268327  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3552  divalent cation transporter  26.98 
 
 
480 aa  181  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0662808  normal  0.235563 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1444  magnesium transporter  26.84 
 
 
480 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0516873  normal  0.652895 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2496  magnesium transporter  28.64 
 
 
442 aa  181  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3760  magnesium transporter  27.66 
 
 
480 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00964036  normal  0.880674 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0822  magnesium transporter  29.72 
 
 
465 aa  180  4e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2231  magnesium transporter  29.06 
 
 
450 aa  180  4e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.555024  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>