More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2000 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2000  magnesium transporter  100 
 
 
454 aa  892    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1690  magnesium transporter  60.4 
 
 
452 aa  520  1e-146  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0394876 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0824  magnesium transporter  53.01 
 
 
454 aa  472  1e-132  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0714  magnesium transporter  54.73 
 
 
449 aa  470  1.0000000000000001e-131  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2001  magnesium transporter  54.13 
 
 
447 aa  439  9.999999999999999e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1691  magnesium transporter  47.95 
 
 
452 aa  379  1e-104  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0276763 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1342  divalent cation transporter  43.79 
 
 
447 aa  374  1e-102  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.09733  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0891  magnesium transporter  49.2 
 
 
449 aa  371  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00182098 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1082  divalent cation transporter  43.84 
 
 
447 aa  354  1e-96  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2363  magnesium transporter  40.17 
 
 
454 aa  352  7e-96  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0419  magnesium transporter  40.18 
 
 
455 aa  344  2e-93  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0971  magnesium transporter  39.6 
 
 
457 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1785  divalent cation transporter  41.88 
 
 
447 aa  317  3e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2089  magnesium transporter  39.51 
 
 
460 aa  314  1.9999999999999998e-84  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1145  magnesium transporter  39.1 
 
 
457 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0337  MgtE integral membrane region  49.38 
 
 
351 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2786  magnesium transporter  42.09 
 
 
463 aa  310  2e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3300  magnesium transporter  39.5 
 
 
457 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3396  magnesium transporter  42.86 
 
 
457 aa  306  3e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3521  magnesium transporter  42.86 
 
 
457 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1056  magnesium transporter  42.86 
 
 
457 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0801577  hitchhiker  0.0000813528 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2935  magnesium transporter  41.84 
 
 
457 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1801  divalent cation transporter  36.73 
 
 
460 aa  300  4e-80  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1890  magnesium transporter  38.17 
 
 
460 aa  297  3e-79  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2099  magnesium transporter  37.58 
 
 
460 aa  296  5e-79  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.168721  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6729  magnesium transporter  37.95 
 
 
463 aa  295  8e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.143213  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1318  magnesium transporter  36.87 
 
 
458 aa  295  9e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0320  divalent cation transporter  37.58 
 
 
460 aa  291  2e-77  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0139413 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2058  magnesium transporter  37.36 
 
 
460 aa  290  5.0000000000000004e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2441  magnesium transporter  37.05 
 
 
460 aa  286  7e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0914  magnesium transporter  39.15 
 
 
460 aa  283  5.000000000000001e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2002  magnesium transporter  37.67 
 
 
458 aa  280  4e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.493999  normal  0.0929187 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1703  magnesium transporter  41.33 
 
 
445 aa  275  1.0000000000000001e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2831  magnesium transporter  33.56 
 
 
458 aa  274  2.0000000000000002e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1723  Mg2+ transporter  35.79 
 
 
468 aa  273  6e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.20289  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1939  magnesium transporter  31.07 
 
 
444 aa  270  5e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0382273  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1208  Mg2+ transporter  37.59 
 
 
469 aa  269  8.999999999999999e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18401  Mg2+ transporter  35.2 
 
 
468 aa  268  1e-70  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.297681  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20831  Mg2+ transporter  37.83 
 
 
469 aa  269  1e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18221  Mg2+ transporter  34.98 
 
 
468 aa  268  2e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18191  Mg2+ transporter  35.15 
 
 
469 aa  265  8e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12500  magnesium transporter  36.54 
 
 
442 aa  265  1e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2352  magnesium transporter  34.62 
 
 
468 aa  265  2e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.814401  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2718  magnesium transporter  32.14 
 
 
452 aa  262  8.999999999999999e-69  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1269  magnesium transporter  34.84 
 
 
465 aa  262  8.999999999999999e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0779643  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2430  divalent cation transporter  34.46 
 
 
466 aa  260  3e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0143004 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1654  response regulator receiver protein  35 
 
 
446 aa  260  4e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.399924  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3016  magnesium transporter  31.29 
 
 
443 aa  259  8e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000242012  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1588  response regulator receiver protein  33.41 
 
 
446 aa  258  2e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2291  magnesium transporter  32.04 
 
 
449 aa  257  3e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02891  magnesium transporter  37.81 
 
 
455 aa  256  7e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4616  magnesium transporter  37.53 
 
 
456 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.386206  decreased coverage  0.00267397 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4800  magnesium transporter  38.41 
 
 
456 aa  253  6e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.832783  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0946  magnesium transporter  37.65 
 
 
457 aa  252  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1454  magnesium transporter  31.83 
 
 
447 aa  251  2e-65  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.192338  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3903  magnesium transporter  37.79 
 
 
456 aa  251  2e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.508399  normal  0.721995 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1095  magnesium transporter  36.89 
 
 
457 aa  249  5e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.20606  normal  0.133303 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1689  magnesium transporter  32.05 
 
 
449 aa  249  7e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0267  magnesium transporter  31.42 
 
 
456 aa  247  3e-64  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000106938  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0138  divalent cation transporter  36.71 
 
 
486 aa  244  3e-63  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5457  magnesium transporter  37.21 
 
 
456 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.169675 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1172  divalent cation transporter  33.49 
 
 
450 aa  242  1e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000987618  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3303  magnesium transporter  34.88 
 
 
461 aa  241  1e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0876  magnesium transporter  35.57 
 
 
465 aa  241  2e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0822  magnesium transporter  35.57 
 
 
465 aa  241  2e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1669  magnesium transporter  34.86 
 
 
462 aa  241  2e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2496  magnesium transporter  34.29 
 
 
442 aa  240  4e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1642  magnesium transporter  34.86 
 
 
462 aa  239  5.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2282  magnesium transporter  33.79 
 
 
453 aa  239  6.999999999999999e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0198685  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0589  magnesium transporter  30.36 
 
 
461 aa  239  8e-62  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.124828  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2600  magnesium transporter  32.5 
 
 
463 aa  239  8e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1523  magnesium transporter  34.68 
 
 
447 aa  238  1e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2728  divalent cation transporter  34.73 
 
 
456 aa  235  1.0000000000000001e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4147  magnesium transporter  36.88 
 
 
454 aa  234  3e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.235845 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0092  magnesium transporter  34.09 
 
 
486 aa  233  7.000000000000001e-60  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3524  magnesium transporter  39.52 
 
 
454 aa  231  1e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17571  Mg2+ transporter  34.55 
 
 
471 aa  231  3e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.161452  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01631  Mg2+ transporter  34.91 
 
 
473 aa  229  1e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1471  magnesium transporter  34.02 
 
 
449 aa  227  4e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2879  magnesium transporter  34.24 
 
 
451 aa  226  6e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1159  magnesium transporter  33.49 
 
 
450 aa  224  2e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0481  magnesium transporter  31.58 
 
 
450 aa  223  4.9999999999999996e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000026878  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1026  magnesium transporter  29.64 
 
 
461 aa  222  9.999999999999999e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000394015  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3944  magnesium transporter  36.86 
 
 
441 aa  222  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1007  magnesium transporter  29.64 
 
 
461 aa  222  9.999999999999999e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00155557  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0331  magnesium transporter  34.05 
 
 
458 aa  222  9.999999999999999e-57  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4087  magnesium transporter  36.86 
 
 
441 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4054  magnesium transporter  36.86 
 
 
441 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2269  magnesium transporter  32.59 
 
 
454 aa  221  1.9999999999999999e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0532952  hitchhiker  0.0000374811 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0596  magnesium transporter  31.6 
 
 
451 aa  219  1e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000141787  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1083  magnesium transporter  32.21 
 
 
471 aa  218  2e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.939247  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1033  magnesium transporter  32.28 
 
 
473 aa  217  2.9999999999999998e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160673  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0382  magnesium transporter  28.41 
 
 
454 aa  216  5e-55  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl217  Mg/Co/Ni transporter  28.7 
 
 
468 aa  213  5.999999999999999e-54  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.153216  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1461  magnesium transporter  32.18 
 
 
463 aa  212  9e-54  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00122115  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1450  magnesium transporter  27.25 
 
 
445 aa  209  1e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.103194  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1398  magnesium transport protein  32.13 
 
 
458 aa  206  7e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0080  magnesium transporter  35.18 
 
 
438 aa  206  7e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.136894 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25770  Mg2+ transporter MgtE  35.55 
 
 
462 aa  205  1e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5582  magnesium transporter  33.56 
 
 
444 aa  206  1e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>