190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1495 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1495  putative signal-transduction protein with CBS domains  100 
 
 		 153 aa  308  2e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000649642  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2721  putative signal transduction protein with CBS domains  96.08 
 
 		 153 aa  297  3e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1201  CBS domain-containing protein  31.65 
 
 		 152 aa  71.2  0.000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000963836  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1094  signal-transduction protein  33.55 
 
 		 230 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2202  CBS domain-containing protein  29.61 
 
 		 152 aa  63.2  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000112787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  32.62 
 
 		 155 aa  63.2  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6307  putative signal transduction protein with CBS domains  29.14 
 
 		 229 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1873  hypothetical protein  30.46 
 
 		 229 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.994541 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0490  signal transduction protein  27.33 
 
 		 158 aa  57.4  0.00000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.630311  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1028  CBS domain containing membrane protein  26.97 
 
 		 226 aa  57.4  0.00000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0495705 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  27.92 
 
 		 230 aa  57.4  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0305  CBS domain containing membrane protein  27.1 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1134  signal transduction protein  27.85 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2661  CBS domain-containing protein  27.1 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.611003  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0393  CBS domain-containing membrane protein  30.71 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.464074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0069  signal transduction protein  28.66 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6174  CBS domain containing membrane protein  26.11 
 
 		 246 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1812  CBS domain containing membrane protein  26.53 
 
 		 132 aa  55.1  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0963  putative signal transduction protein with CBS domains  33.1 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000158107  normal  0.526521 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3889  signal-transduction protein  28.1 
 
 		 217 aa  54.7  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1703  CBS domain containing membrane protein  28.38 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.311156  normal  0.0624027 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5760  hypothetical protein  26.49 
 
 		 242 aa  54.3  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.594459 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1882  CBS domain-containing protein  28.66 
 
 		 149 aa  53.9  0.0000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000211918  hitchhiker  0.00000438045 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2233  CBS domain-containing protein  29.05 
 
 		 232 aa  52.8  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2388  Polynucleotide adenylyltransferase region  25.53 
 
 		 903 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.991166 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0964  putative signal transduction protein with CBS domains  26.49 
 
 		 192 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000173146  normal  0.539633 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3591  Chloride channel core  37.14 
 
 		 875 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0274826 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3742  Polynucleotide adenylyltransferase region  26.24 
 
 		 903 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1813  CBS domain-containing protein  26.49 
 
 		 154 aa  51.6  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1895  CBS domain-containing protein  36.54 
 
 		 133 aa  52  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.272783 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2997  signal-transduction protein  28.39 
 
 		 223 aa  51.2  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2680  Chloride channel core  27.15 
 
 		 879 aa  51.2  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0591  signal-transduction protein  50.91 
 
 		 155 aa  50.8  0.000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0331315  normal  0.426072 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3436  Chloride channel core  27.15 
 
 		 879 aa  51.2  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3021  CBS domain containing membrane protein  27.74 
 
 		 149 aa  50.8  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1032  putative signal transduction protein with CBS domains  26.35 
 
 		 149 aa  50.4  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0368077  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1708  phosphoesterase, RecJ-like  27.34 
 
 		 904 aa  50.4  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.833662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1175  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  27.78 
 
 		 375 aa  49.7  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1607  CBS domain-containing protein  26.49 
 
 		 170 aa  50.4  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1851  CBS domain containing membrane protein  26.71 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.309684  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2338  CBS domain containing membrane protein  23.46 
 
 		 247 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2451  CBS domain containing membrane protein  31.94 
 
 		 141 aa  49.3  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000150568  normal  0.0113314 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0830  CBS domain-containing protein  37.29 
 
 		 366 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1877  Cl- channel voltage-gated family protein  38.6 
 
 		 859 aa  48.5  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3792  Polynucleotide adenylyltransferase region  25.53 
 
 		 903 aa  48.9  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1912  signal-transduction protein  26.25 
 
 		 242 aa  48.9  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0206039  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2361  putative signal transduction protein with CBS domains  27.97 
 
 		 161 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2488  CBS domain-containing protein  34.33 
 
 		 366 aa  48.9  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0447094  normal  0.553019 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1253  CBS domain-containing protein  27.63 
 
 		 150 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.515572 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1262  CBS domain containing membrane protein  27.1 
 
 		 149 aa  47.8  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00178252  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2915  Chloride channel core  38.46 
 
 		 897 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1131  polynucleotide adenylyltransferase region  25.5 
 
 		 907 aa  47.8  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00727527  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1344  putative signal-transduction protein with CBS domains  25.16 
 
 		 243 aa  47.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2123  CBS domain-containing protein  24.68 
 
 		 159 aa  47.4  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00617964  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0684  polynucleotide adenylyltransferase region  26.43 
 
 		 877 aa  47.4  0.00008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0615  protein of unknown function DUF190  24.07 
 
 		 426 aa  47  0.00009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3960  CBS domain containing protein  21.15 
 
 		 153 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2351  CBS domain-containing protein  29.55 
 
 		 283 aa  47  0.00009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000984272  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2812  CBS domain containing membrane protein  26.45 
 
 		 201 aa  47  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000718769  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1990  CBS domain containing protein  22.14 
 
 		 283 aa  47  0.00009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0969583  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1308  putative signal transduction protein with CBS domains  29.76 
 
 		 161 aa  47  0.00009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4005  CBS domain containing protein  21.15 
 
 		 153 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5546  CBS domain containing membrane protein  27.45 
 
 		 230 aa  47  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103522  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1421  polynucleotide adenylyltransferase region  25.18 
 
 		 909 aa  46.2  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2076  signal-transduction protein  26.57 
 
 		 202 aa  47  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.250965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0051  putative signal transduction protein with CBS domains  25.95 
 
 		 158 aa  46.6  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1203  CBS domain-containing protein  28.06 
 
 		 873 aa  46.6  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.452152  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1801  CBS domain-containing protein  30.07 
 
 		 149 aa  45.8  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0256126  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1004  CBS domain-containing protein  27.63 
 
 		 149 aa  45.8  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024412  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1776  CBS domain containing membrane protein  27.78 
 
 		 381 aa  45.4  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.17343  normal  0.316768 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1497  CBS domain containing protein  27.34 
 
 		 845 aa  45.4  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2352  signal-transduction protein  29.41 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.103406  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0947  CBS domain-containing protein  30 
 
 		 689 aa  45.8  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  25.55 
 
 		 769 aa  45.8  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0215  CBS domain-containing protein  29.17 
 
 		 863 aa  45.8  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0916  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 		 225 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0373364 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4294  polynucleotide adenylyltransferase region  25.18 
 
 		 907 aa  46.2  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00498072  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5888  CBS domain-containing protein  26.8 
 
 		 242 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.361711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4051  signal-transduction protein  26.25 
 
 		 242 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3596  CBS domain-containing protein  26.92 
 
 		 241 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.247468  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0181  signal transduction protein  31.06 
 
 		 152 aa  45.1  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0976  CBS  21.85 
 
 		 909 aa  45.1  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000281258  normal  0.107884 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2162  Cl- channel, voltage gated  30.86 
 
 		 862 aa  44.7  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.30551 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1780  putative signal transduction protein with CBS domains  25.19 
 
 		 141 aa  44.7  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0152  signal transduction protein  25.45 
 
 		 160 aa  44.7  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2097  CBS domain containing protein  40.74 
 
 		 209 aa  44.7  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0917  CBS domain-containing protein  33.64 
 
 		 162 aa  44.7  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848141 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3107  hypothetical protein  26.28 
 
 		 137 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0515224  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1383  signal transduction protein  33.96 
 
 		 282 aa  44.7  0.0005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.56563 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2648  CBS domain containing membrane protein  31.82 
 
 		 154 aa  44.3  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4391  CBS domain-containing protein  33.58 
 
 		 204 aa  44.3  0.0006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  24.44 
 
 		 148 aa  44.3  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0213  CBS domain-containing protein  28.47 
 
 		 863 aa  44.3  0.0006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2607  CBS domain containing membrane protein  27.97 
 
 		 384 aa  44.3  0.0006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00560791  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1365  signal-transduction protein  23.23 
 
 		 243 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.831809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2651  putative signal transduction protein with CBS domains  25.95 
 
 		 161 aa  43.9  0.0007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.440356 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  25.19 
 
 		 147 aa  43.9  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1902  CBS domain-containing protein  25.79 
 
 		 231 aa  44.3  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1577  putative signal transduction protein with CBS domains  26.62 
 
 		 139 aa  43.9  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.011912  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0098  CBS domain-containing protein  23.87 
 
 		 150 aa  43.9  0.0007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>