28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0051 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_0051  putative signal transduction protein with CBS domains  100 
 
 
158 aa  321  3e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2604  CBS domain-containing protein  38.85 
 
 
158 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.019809  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0967  putative transcriptional regulator, XRE family  35.8 
 
 
165 aa  104  5e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10813 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0728  XRE family transcriptional regulator  35.44 
 
 
199 aa  103  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.109971  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2123  CBS domain-containing protein  24.66 
 
 
159 aa  62  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00617964  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2034  response regulator receiver protein  26.45 
 
 
300 aa  50.1  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2721  putative signal transduction protein with CBS domains  24.84 
 
 
153 aa  47.4  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1495  putative signal-transduction protein with CBS domains  25.95 
 
 
153 aa  46.6  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000649642  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2661  CBS domain-containing protein  21.05 
 
 
156 aa  46.2  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.611003  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1808  signal-transduction protein  22.5 
 
 
655 aa  45.4  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1341  response regulator receiver protein  27.27 
 
 
301 aa  45.1  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2355  peptidase M50  34.92 
 
 
396 aa  44.3  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0704943  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0076  MgtE intracellular region  21.77 
 
 
459 aa  44.3  0.0006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.740588  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3488  CBS domain-containing protein  30.65 
 
 
142 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1999  CBS domain-containing protein  26.17 
 
 
152 aa  44.7  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1060  hypothetical protein  36.36 
 
 
413 aa  44.3  0.0008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.767819  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1618  signal transduction protein  26.54 
 
 
656 aa  43.5  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1614  CBS domain-containing protein  24.5 
 
 
431 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2374  signal-transduction protein  29.03 
 
 
146 aa  42.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.425597  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2338  CBS domain containing membrane protein  25.48 
 
 
247 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0535  CBS domain-containing protein  24.07 
 
 
658 aa  42.4  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.672261  normal  0.0583682 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0977  putative signal transduction protein with CBS domains  24.4 
 
 
170 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000121295  normal  0.444169 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0805  CBS domain-containing protein  25.48 
 
 
172 aa  41.6  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2494  CBS domain-containing protein  20.89 
 
 
427 aa  41.2  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00627763  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1671  CBS domain-containing protein  21.09 
 
 
215 aa  40.4  0.009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3318  protein of unknown function DUF190  23.38 
 
 
436 aa  40.4  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.17404  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  21.09 
 
 
215 aa  40.4  0.01  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2559  protein of unknown function DUF21  29.2 
 
 
410 aa  40.4  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.764151  hitchhiker  0.000350536 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>