19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0728 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0728  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 199 aa  402  1e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.109971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0967  putative transcriptional regulator, XRE family  73.33 
 
 		 165 aa  240  1e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10813 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2604  CBS domain-containing protein  61.15 
 
 		 158 aa  199  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.019809  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0051  putative signal transduction protein with CBS domains  35.44 
 
 		 158 aa  103  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2661  CBS domain-containing protein  28.08 
 
 		 156 aa  57.4  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.611003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1838  signal transduction protein  30.66 
 
 		 138 aa  49.7  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00822959 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2139  signal transduction protein  30.66 
 
 		 138 aa  49.7  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0162016 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2228  CBS domain-containing protein  31.39 
 
 		 138 aa  49.7  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1899  signal transduction protein  31.88 
 
 		 138 aa  48.9  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.288112  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1607  CBS domain-containing protein  29.25 
 
 		 170 aa  48.9  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1896  signal transduction protein  30.66 
 
 		 138 aa  48.9  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000161177 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1906  signal transduction protein  30.66 
 
 		 138 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1932  signal transduction protein  30.66 
 
 		 138 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.412842  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2387  putative signal transduction protein with CBS domains  30.66 
 
 		 138 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.851922  normal  0.155065 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2123  CBS domain-containing protein  21.48 
 
 		 159 aa  45.4  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00617964  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1939  signal transduction protein  29.93 
 
 		 138 aa  43.5  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3532  hypothetical protein  30.84 
 
 		 455 aa  42.7  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0964  putative signal transduction protein with CBS domains  23.08 
 
 		 192 aa  42.7  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000173146  normal  0.539633 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1895  CBS domain-containing protein  29.57 
 
 		 133 aa  42  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.272783 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>