More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_2228 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2228  CBS domain-containing protein  100 
 
 		 138 aa  283  4e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1838  signal transduction protein  94.93 
 
 		 138 aa  273  7e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00822959 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2139  signal transduction protein  94.93 
 
 		 138 aa  273  7e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0162016 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1896  signal transduction protein  94.2 
 
 		 138 aa  272  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000161177 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1899  signal transduction protein  92.03 
 
 		 138 aa  267  4e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.288112  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2387  putative signal transduction protein with CBS domains  89.78 
 
 		 138 aa  262  1e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.851922  normal  0.155065 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1932  signal transduction protein  89.78 
 
 		 138 aa  262  1e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.412842  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1906  signal transduction protein  89.78 
 
 		 138 aa  262  1e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1939  signal transduction protein  89.05 
 
 		 138 aa  259  8e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1446  signal transduction protein  78.26 
 
 		 138 aa  231  2.0000000000000002e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.697131  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1506  CBS domain-containing protein  79.71 
 
 		 138 aa  229  9e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2685  signal transduction protein  75.18 
 
 		 138 aa  228  3e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1618  CBS domain-containing protein  77.54 
 
 		 138 aa  222  1e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.182055 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2431  signal transduction protein  73.91 
 
 		 138 aa  221  4e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1909  signal transduction protein  72.46 
 
 		 138 aa  214  2.9999999999999998e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.597362  normal  0.0569884 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1766  signal transduction protein  69.57 
 
 		 138 aa  202  1e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0550  CBS domain-containing protein  44.53 
 
 		 146 aa  132  1.9999999999999998e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004008  inosine monophosphate dehydrogenase-related protein  43.48 
 
 		 139 aa  128  3e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2064  hypothetical protein  41.61 
 
 		 139 aa  127  6e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.769911  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2171  CBS domain-containing protein  44.44 
 
 		 139 aa  124  3e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01513  hypothetical protein  41.3 
 
 		 139 aa  121  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1719  CBS domain-containing protein  43.7 
 
 		 143 aa  120  7e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000658293 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2859  signal transduction protein  45.19 
 
 		 143 aa  120  8e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.206571  hitchhiker  0.00464967 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02402  CBS domain protein  44.44 
 
 		 148 aa  117  3.9999999999999996e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.121948  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2259  signal transduction protein  44.03 
 
 		 138 aa  115  3e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0497964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1712  CBS domain-containing protein  44.44 
 
 		 131 aa  114  3.9999999999999997e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1253  CBS domain-containing protein  42.19 
 
 		 136 aa  104  4e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3311  CBS domain-containing protein  38.64 
 
 		 141 aa  102  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.881932 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2242  CBS domain-containing protein  38.89 
 
 		 144 aa  101  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0256  CBS domain-containing protein  39.02 
 
 		 143 aa  96.3  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2970  CBS domain-containing protein  35.71 
 
 		 147 aa  88.6  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1710  formate/nitrite transporter  33.33 
 
 		 491 aa  85.1  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.402769  hitchhiker  0.00135887 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2376  formate/nitrite transporter  36.29 
 
 		 537 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1674  formate/nitrite transporter  31.3 
 
 		 493 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2287  CBS domain containing membrane protein  31.5 
 
 		 135 aa  70.5  0.000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.146345  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2880  formate/nitrite transporter  30.91 
 
 		 494 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.910131  hitchhiker  0.000564584 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01920  Inosine monophosphate dehydrogenase-related protein  29.41 
 
 		 154 aa  68.6  0.00000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.778717  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2388  formate/nitrite transporter  28.28 
 
 		 508 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0694768 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2470  formate/nitrite transporter  30.7 
 
 		 558 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0519177  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6174  CBS domain containing membrane protein  27.27 
 
 		 246 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1253  CBS domain-containing protein  29.45 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.515572 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0474  putative formate transporter 1  27.1 
 
 		 483 aa  62.8  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188118  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000193  formate efflux transporter  26.97 
 
 		 483 aa  62.8  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000746052  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0243  signal transduction protein  25.52 
 
 		 155 aa  59.7  0.00000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2202  CBS domain-containing protein  30.82 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000112787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1308  putative signal transduction protein with CBS domains  26.8 
 
 		 161 aa  57.8  0.00000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2338  CBS domain containing membrane protein  24.03 
 
 		 247 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2661  CBS domain-containing protein  27.46 
 
 		 156 aa  57.4  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.611003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0188  signal-transduction protein  27.5 
 
 		 128 aa  56.6  0.0000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.885258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05923  methionine gamma-lyase  25.66 
 
 		 483 aa  55.8  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1201  CBS domain-containing protein  27.4 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000963836  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  26.39 
 
 		 230 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0657  signal transduction protein  28.36 
 
 		 309 aa  54.7  0.0000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00784458  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1094  signal-transduction protein  28.57 
 
 		 230 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1851  CBS domain containing membrane protein  25.17 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.309684  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2812  CBS domain containing membrane protein  27.34 
 
 		 201 aa  54.3  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000718769  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1812  CBS domain containing membrane protein  29.17 
 
 		 132 aa  53.9  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2115  signal transduction protein  26.02 
 
 		 300 aa  54.3  0.0000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.548765 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  26.21 
 
 		 152 aa  53.9  0.0000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4294  polynucleotide adenylyltransferase region  29.75 
 
 		 907 aa  53.5  0.0000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00498072  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3570  CBS domain-containing protein  23.38 
 
 		 246 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2019  putative signal transduction protein with CBS domains  26.02 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.80054  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5821  signal-transduction protein  29.92 
 
 		 231 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.12685 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  26.45 
 
 		 155 aa  53.1  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0766  signal transduction protein  32.52 
 
 		 269 aa  53.1  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.024671 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0663  signal-transduction protein  26.83 
 
 		 127 aa  53.1  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2755  CBS domain-containing protein  30.63 
 
 		 896 aa  52.8  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.1635  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1708  phosphoesterase, RecJ-like  30.58 
 
 		 904 aa  52.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.833662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2046  CBS  28.67 
 
 		 150 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.455097  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07150  CBS domain containing protein  31.4 
 
 		 865 aa  52.4  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0367477  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0970  CBS domain-containing protein  24.83 
 
 		 155 aa  52  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0568  signal-transduction protein  28.93 
 
 		 133 aa  52  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.706815 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1225  signal-transduction protein  30.69 
 
 		 127 aa  52.8  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.276884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1695  signal transduction protein  30.43 
 
 		 281 aa  52.8  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000133254 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2229  CBS domain-containing protein  26.05 
 
 		 313 aa  51.6  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  25.52 
 
 		 152 aa  51.6  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4751  CBS domain containing membrane protein  26.9 
 
 		 154 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142923  hitchhiker  0.00000010565 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3539  signal-transduction protein  28.97 
 
 		 146 aa  51.6  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.278615 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27290  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.84 
 
 		 628 aa  52  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2016  CBS domain-containing protein  26.32 
 
 		 144 aa  52  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1462  putative signal transduction protein with CBS domains  30.61 
 
 		 145 aa  51.6  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0493403  normal  0.625814 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1844  CBS domain-containing protein  25.81 
 
 		 688 aa  51.6  0.000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0705  putative transcriptional regulator, XRE family  27.59 
 
 		 150 aa  51.2  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1421  CBS domain-containing protein  26.89 
 
 		 279 aa  50.8  0.000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.351959  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0278  CBS domain containing membrane protein  27.27 
 
 		 150 aa  50.8  0.000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10697 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1028  CBS domain containing membrane protein  25.9 
 
 		 226 aa  50.8  0.000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0495705 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0616  CBS domain-containing protein  30.43 
 
 		 280 aa  50.8  0.000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000000000848956 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0339  CBS domain-containing protein  26.89 
 
 		 279 aa  50.8  0.000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.436853  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1032  putative signal transduction protein with CBS domains  26.03 
 
 		 149 aa  50.4  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0368077  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0498  CBS domain-containing protein  26.05 
 
 		 279 aa  50.8  0.000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.235797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1883  CBS domain-containing protein  25.17 
 
 		 154 aa  50.4  0.000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0937  CBS domain-containing protein  25.98 
 
 		 232 aa  50.4  0.000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.447969  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0566  CBS domain-containing protein  27.97 
 
 		 279 aa  50.4  0.000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.565144  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1281  signal transduction protein  26.14 
 
 		 153 aa  50.1  0.000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.366949  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1929  CBS domain containing protein  29.41 
 
 		 875 aa  50.1  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1895  CBS domain-containing protein  25.6 
 
 		 133 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.272783 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17480  predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains  30.51 
 
 		 191 aa  50.1  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2095  hypothetical protein  28.26 
 
 		 164 aa  49.7  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.040556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2240  signal transduction protein  28.37 
 
 		 153 aa  49.7  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0269  signal transduction protein  25.21 
 
 		 688 aa  49.7  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>