222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2123 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2123  CBS domain-containing protein  100 
 
 		 159 aa  328  2e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00617964  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2661  CBS domain-containing protein  31.79 
 
 		 156 aa  92  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.611003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6174  CBS domain containing membrane protein  32.24 
 
 		 246 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2338  CBS domain containing membrane protein  31.58 
 
 		 247 aa  68.6  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0640  CBS domain-containing protein  31.93 
 
 		 150 aa  62.8  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0051  putative signal transduction protein with CBS domains  24.66 
 
 		 158 aa  62  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2361  putative signal transduction protein with CBS domains  29.49 
 
 		 161 aa  60.8  0.000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1813  CBS domain-containing protein  31.72 
 
 		 154 aa  60.5  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17480  predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains  31.37 
 
 		 191 aa  59.7  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3439  hypothetical protein  29.14 
 
 		 385 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.612003  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1863  putative signal transduction protein with CBS domains  33.9 
 
 		 141 aa  57.8  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40540  CBS domain-containing protein  28.48 
 
 		 385 aa  57.4  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0305  CBS domain containing membrane protein  31.17 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0659  permease of the major facilitator superfamily  34.71 
 
 		 683 aa  56.2  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0490  signal transduction protein  31.01 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.630311  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3596  CBS domain-containing protein  28.3 
 
 		 241 aa  55.1  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.247468  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  28.57 
 
 		 155 aa  55.1  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1851  CBS domain containing membrane protein  27.1 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.309684  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1253  CBS domain-containing protein  26.8 
 
 		 150 aa  53.9  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.515572 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1925  CBS domain protein  29.11 
 
 		 151 aa  53.9  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1597  CBS domain containing membrane protein  29.11 
 
 		 151 aa  53.9  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.105679 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1607  CBS domain-containing protein  29.14 
 
 		 170 aa  53.1  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2034  response regulator receiver protein  21.12 
 
 		 300 aa  53.5  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1435  CBS domain containing protein  24.18 
 
 		 427 aa  52.4  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2202  CBS domain-containing protein  26.97 
 
 		 152 aa  52.8  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000112787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3228  XRE family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 158 aa  51.6  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0859  XRE family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 170 aa  51.2  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  23.72 
 
 		 152 aa  51.2  0.000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2362  signal-transduction protein  22.3 
 
 		 143 aa  51.2  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.67854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1201  CBS domain-containing protein  23.72 
 
 		 152 aa  50.8  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000963836  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2046  CBS  27.27 
 
 		 150 aa  50.8  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.455097  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1703  CBS domain containing membrane protein  25.48 
 
 		 148 aa  50.8  0.000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.311156  normal  0.0624027 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0019  CBS domain-containing protein  26.92 
 
 		 410 aa  50.1  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0798  homoserine O-acetyltransferase  30.28 
 
 		 488 aa  50.4  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2980  signal transduction protein  25.33 
 
 		 423 aa  50.1  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0243  signal transduction protein  43.64 
 
 		 155 aa  50.4  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0680  hypothetical protein  30.07 
 
 		 249 aa  50.4  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.480825 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0675  signal transduction protein  25.36 
 
 		 147 aa  50.1  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2388  Polynucleotide adenylyltransferase region  27.92 
 
 		 903 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.991166 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1198  CBS  29.37 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0920  CBS domain-containing protein  45.28 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2667  CBS domain containing protein  27.1 
 
 		 313 aa  49.7  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.13324  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0663  signal-transduction protein  27.21 
 
 		 127 aa  49.7  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2021  CBS domain containing membrane protein  26.63 
 
 		 164 aa  49.7  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0188  signal-transduction protein  30.08 
 
 		 128 aa  49.3  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.885258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0970  CBS domain-containing protein  22.22 
 
 		 155 aa  48.9  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3570  CBS domain-containing protein  29.22 
 
 		 246 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2529  CBS domain containing membrane protein  29.41 
 
 		 149 aa  48.9  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00130386  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1341  response regulator receiver protein  24.68 
 
 		 301 aa  48.5  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  23.72 
 
 		 152 aa  48.5  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1882  CBS domain-containing protein  25.66 
 
 		 149 aa  48.5  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000211918  hitchhiker  0.00000438045 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1134  signal transduction protein  24.68 
 
 		 151 aa  48.1  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2578  putative signal transduction protein with CBS domains  25.17 
 
 		 124 aa  48.1  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345851  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1015  CBS domain-containing protein  28.08 
 
 		 163 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.110354  normal  0.142835 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0098  CBS domain-containing protein  24.5 
 
 		 150 aa  48.1  0.00005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4929  CBS domain containing protein  22.5 
 
 		 153 aa  48.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.076883 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  37.29 
 
 		 145 aa  48.1  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0098  CBS domain-containing protein  24.5 
 
 		 150 aa  48.1  0.00005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27290  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.14 
 
 		 628 aa  47.8  0.00006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1495  putative signal-transduction protein with CBS domains  24.68 
 
 		 153 aa  47.4  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000649642  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4294  polynucleotide adenylyltransferase region  26.11 
 
 		 907 aa  47.8  0.00007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00498072  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2906  signal transduction protein  26.83 
 
 		 291 aa  47.4  0.00007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1796  CBS domain-containing protein  35.94 
 
 		 315 aa  47.8  0.00007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.507937  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1289  signal transduction protein  38.18 
 
 		 153 aa  47.4  0.00008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0213  CBS domain-containing protein  41.67 
 
 		 863 aa  47.4  0.00008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2721  putative signal transduction protein with CBS domains  26.71 
 
 		 153 aa  47.4  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3709  putative signal transduction protein with CBS domains  27.27 
 
 		 284 aa  47.4  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2015  CBS domain containing membrane protein  27.74 
 
 		 368 aa  46.6  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00292892  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1004  CBS domain-containing protein  25 
 
 		 149 aa  47  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024412  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0532  signal-transduction protein  28.32 
 
 		 375 aa  46.6  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0376075 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0181  signal transduction protein  28.06 
 
 		 152 aa  47  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0215  CBS domain-containing protein  41.67 
 
 		 863 aa  46.6  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0278  CBS domain containing membrane protein  25.49 
 
 		 150 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10697 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5919  signal-transduction protein  45.28 
 
 		 162 aa  45.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.512609  normal  0.346148 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2651  putative signal transduction protein with CBS domains  27.68 
 
 		 161 aa  46.2  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.440356 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0636  signal-transduction protein  37.25 
 
 		 139 aa  45.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00478917  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1028  CBS domain containing membrane protein  21.66 
 
 		 226 aa  45.8  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0495705 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0069  signal transduction protein  28.69 
 
 		 158 aa  46.6  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0631  signal-transduction protein  25.53 
 
 		 189 aa  46.2  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3725  signal-transduction protein  38.18 
 
 		 143 aa  46.6  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01671  CBS domain protein  33.33 
 
 		 104 aa  45.8  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.147887  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1517  hypothetical protein  28.48 
 
 		 502 aa  46.2  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.743674  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5583  CBS domain-containing protein  27.88 
 
 		 392 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.849861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0568  signal-transduction protein  26.35 
 
 		 133 aa  46.2  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.706815 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3268  CBS domain-containing protein  25.56 
 
 		 142 aa  45.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2661  signal-transduction protein  37.5 
 
 		 177 aa  45.4  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.63207  normal  0.665873 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1203  CBS domain-containing protein  43.24 
 
 		 873 aa  45.4  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.452152  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1933  CBS domain-containing protein  23.42 
 
 		 228 aa  45.4  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.316651  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3505  signal-transduction protein  45.31 
 
 		 142 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1420  polyA polymerase family protein  40.32 
 
 		 880 aa  45.4  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0185526  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3577  signal-transduction protein  45.31 
 
 		 142 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0441383 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3907  signal-transduction protein  43.86 
 
 		 142 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.184794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0728  XRE family transcriptional regulator  21.48 
 
 		 199 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.109971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3517  signal-transduction protein  45.31 
 
 		 142 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.787187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1068  CBS domain-containing protein  26.85 
 
 		 139 aa  45.4  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5213  hypothetical protein  33.96 
 
 		 142 aa  45.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal  0.0487848 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2494  CBS domain-containing protein  23.6 
 
 		 427 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00627763  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1013  CBS domain-containing protein  40.74 
 
 		 216 aa  45.1  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0086429  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0768  CBS domain containing membrane protein  31.58 
 
 		 138 aa  45.4  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.838909  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0264  signal protein  27.14 
 
 		 614 aa  45.1  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>