161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1813 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1813  CBS domain-containing protein  100 
 
 		 154 aa  312  9.999999999999999e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2361  putative signal transduction protein with CBS domains  51.95 
 
 		 161 aa  171  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1607  CBS domain-containing protein  46.75 
 
 		 170 aa  145  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1513  CBS domain-containing protein  44.16 
 
 		 153 aa  121  4e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1014  putative signal transduction protein with CBS domains  39.62 
 
 		 162 aa  99.8  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.673137  normal  0.137576 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1509  CBS domain-containing protein  32.47 
 
 		 163 aa  87  8e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1015  CBS domain-containing protein  32.67 
 
 		 163 aa  84  6e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.110354  normal  0.142835 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0964  putative signal transduction protein with CBS domains  32.21 
 
 		 192 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000173146  normal  0.539633 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0963  putative signal transduction protein with CBS domains  30.97 
 
 		 162 aa  72.8  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000158107  normal  0.526521 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0965  CBS domain-containing protein  31.82 
 
 		 156 aa  70.1  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000272777  normal  0.399502 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1999  CBS domain-containing protein  25.97 
 
 		 152 aa  67.8  0.00000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2123  CBS domain-containing protein  31.72 
 
 		 159 aa  60.5  0.000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00617964  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2034  response regulator receiver protein  26.83 
 
 		 300 aa  56.6  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0916  CBS domain-containing protein  28.3 
 
 		 225 aa  55.1  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0373364 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1341  response regulator receiver protein  26.83 
 
 		 301 aa  54.7  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0659  permease of the major facilitator superfamily  28.83 
 
 		 683 aa  53.1  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0795  CBS domain-containing protein  25.99 
 
 		 186 aa  52.8  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0152604  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0765  CBS  31.25 
 
 		 224 aa  51.6  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1495  putative signal-transduction protein with CBS domains  26.49 
 
 		 153 aa  51.6  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000649642  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3778  CBS domain-containing protein  27.36 
 
 		 225 aa  51.2  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.857066  normal  0.425445 
 
 
-
 
NC_002936  DET0949  CBS domain-containing protein  32.2 
 
 		 162 aa  50.1  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1134  signal transduction protein  30.09 
 
 		 151 aa  50.1  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1308  putative signal transduction protein with CBS domains  30.22 
 
 		 161 aa  50.1  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2721  putative signal transduction protein with CBS domains  25.17 
 
 		 153 aa  50.1  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0798  homoserine O-acetyltransferase  28.15 
 
 		 488 aa  49.3  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5608  signal transduction protein  25.42 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.606425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0991  CBS domain-containing protein  26.67 
 
 		 196 aa  49.3  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2791  hypothetical protein  27.34 
 
 		 141 aa  49.3  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.402578  normal  0.193338 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4084  magnesium transporter  26.04 
 
 		 470 aa  48.9  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.403557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2078  CBS  33.33 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000000050024  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0269  signal transduction protein  38.6 
 
 		 688 aa  48.9  0.00003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2231  signal-transduction protein  35.48 
 
 		 188 aa  48.5  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.943647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0805  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  26.81 
 
 		 488 aa  47.8  0.00005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2848  CBS domain containing membrane protein  30.84 
 
 		 223 aa  48.1  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1639  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  23.08 
 
 		 488 aa  47.8  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0762082  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0833  CBS domain-containing protein  30.51 
 
 		 162 aa  47.8  0.00006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0248  putative signal transduction protein with CBS domains  43.14 
 
 		 149 aa  47.4  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  28.32 
 
 		 215 aa  47.4  0.00006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0383  putative signal transduction protein with CBS domains  27.5 
 
 		 149 aa  47.8  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0412615  normal  0.799719 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1996  CBS domain-containing protein  24.22 
 
 		 177 aa  47.4  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1505  CBS domain-containing protein  28.57 
 
 		 282 aa  47.4  0.00007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.206773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0098  CBS domain-containing protein  25.79 
 
 		 150 aa  47.4  0.00008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0098  CBS domain-containing protein  25.79 
 
 		 150 aa  47.4  0.00008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0490  signal transduction protein  24.68 
 
 		 158 aa  47  0.00009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.630311  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  28.57 
 
 		 256 aa  47  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1028  CBS domain containing membrane protein  41.3 
 
 		 226 aa  47  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0495705 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2046  CBS  43.4 
 
 		 150 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.455097  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0413  putative signal transduction protein with CBS domains  32.74 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0401079 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1567  CBS domain-containing protein  28.45 
 
 		 280 aa  45.8  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  unclonable  0.0000000000000154873 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2494  CBS domain-containing protein  25.17 
 
 		 427 aa  46.2  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00627763  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1671  CBS domain-containing protein  27.43 
 
 		 215 aa  45.4  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3120  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  30.43 
 
 		 489 aa  45.4  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.899033  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_820  CBS domain protein  31.9 
 
 		 162 aa  45.4  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2879  magnesium transporter  23.13 
 
 		 451 aa  45.4  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1695  signal transduction protein  27.33 
 
 		 281 aa  45.4  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000133254 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0244  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  46.51 
 
 		 487 aa  45.1  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.20132  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2620  magnesium transport protein  27.08 
 
 		 471 aa  44.7  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.475029  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2035  CBS domain-containing protein  26.52 
 
 		 143 aa  44.7  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1895  CBS domain-containing protein  31.15 
 
 		 133 aa  44.3  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.272783 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0337  MgtE integral membrane region  23.13 
 
 		 351 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1844  CBS domain-containing protein  35.09 
 
 		 688 aa  44.7  0.0005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0394  CBS domain-containing membrane protein  42.22 
 
 		 201 aa  44.3  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.474769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2778  magnesium transporter  24.24 
 
 		 461 aa  44.3  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.854072  normal  0.0326796 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0822  diguanylate cyclase  44.44 
 
 		 287 aa  44.3  0.0006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0119  CBS domain containing protein  32.84 
 
 		 181 aa  44.3  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.851715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1033  magnesium transporter  26.04 
 
 		 473 aa  44.3  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3837  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.87 
 
 		 520 aa  43.9  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3311  CBS domain-containing protein  30.91 
 
 		 141 aa  43.9  0.0009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.881932 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4227  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.87 
 
 		 520 aa  43.9  0.0009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.147199 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1761  CBS domain-containing protein  34.85 
 
 		 315 aa  43.5  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000282472  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5455  CBS domain containing membrane protein  43.9 
 
 		 379 aa  43.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.547444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0615  protein of unknown function DUF190  39.13 
 
 		 426 aa  43.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0196  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  24.76 
 
 		 490 aa  43.5  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0916  IMP dehydrogenase  23.08 
 
 		 484 aa  43.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.366746  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0616  CBS domain-containing protein  23.68 
 
 		 280 aa  43.1  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000000000848956 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0100  putative signal transduction protein with CBS domains  24.09 
 
 		 143 aa  43.5  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0112  signal transduction protein  35.53 
 
 		 213 aa  43.5  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0311515  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1923  CBS domain containing protein  29.46 
 
 		 154 aa  43.1  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0288  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.33 
 
 		 486 aa  42.4  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0134  magnesium transporter  26.12 
 
 		 450 aa  42.4  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.149732 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2529  CBS domain containing membrane protein  36.54 
 
 		 149 aa  42.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00130386  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0138  hypothetical protein  34.62 
 
 		 503 aa  42.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2352  magnesium transporter  26.97 
 
 		 468 aa  42.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.814401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1742  magnesium transporter  23.53 
 
 		 463 aa  42.7  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.99083 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2138  putative signal transduction protein with CBS domains  34.88 
 
 		 151 aa  42.4  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1517  hypothetical protein  38.46 
 
 		 502 aa  43.1  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.743674  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0709  CBS domain containing protein  34.62 
 
 		 214 aa  43.1  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1207  signal transduction protein  36.84 
 
 		 213 aa  42.7  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.230194  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3057  CBS domain-containing protein  21.43 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.193556  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0714  CBS domain containing protein  25.52 
 
 		 227 aa  42  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.724637  normal  0.522786 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1023  hypothetical protein  37.78 
 
 		 243 aa  42  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1172  divalent cation transporter  25.17 
 
 		 450 aa  42.4  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000987618  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01920  Inosine monophosphate dehydrogenase-related protein  34.62 
 
 		 154 aa  42  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.778717  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1752  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  40.48 
 
 		 500 aa  42  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.151769  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4214  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  38.1 
 
 		 488 aa  42  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1912  signal-transduction protein  40 
 
 		 242 aa  42  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0206039  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2711  CBS domain-containing membrane protein  23.64 
 
 		 217 aa  42  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0253  signal-transduction protein  22.38 
 
 		 140 aa  42  0.003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00276555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1620  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.78 
 
 		 489 aa  42  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.690045 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1435  CBS domain containing protein  23.01 
 
 		 427 aa  42  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>