74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_1014 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_1014  putative signal transduction protein with CBS domains  100 
 
 
162 aa  329  9e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.673137  normal  0.137576 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1015  CBS domain-containing protein  42.77 
 
 
163 aa  124  8.000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.110354  normal  0.142835 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0964  putative signal transduction protein with CBS domains  34.38 
 
 
192 aa  108  3e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000173146  normal  0.539633 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1509  CBS domain-containing protein  37.34 
 
 
163 aa  101  3e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1813  CBS domain-containing protein  39.62 
 
 
154 aa  99.8  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1607  CBS domain-containing protein  36.31 
 
 
170 aa  98.2  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2361  putative signal transduction protein with CBS domains  33.75 
 
 
161 aa  96.7  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0965  CBS domain-containing protein  33.96 
 
 
156 aa  90.1  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000272777  normal  0.399502 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1513  CBS domain-containing protein  34.59 
 
 
153 aa  88.6  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0963  putative signal transduction protein with CBS domains  31.01 
 
 
162 aa  67.8  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000158107  normal  0.526521 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1999  CBS domain-containing protein  27.1 
 
 
152 aa  67.8  0.00000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1341  response regulator receiver protein  29.17 
 
 
301 aa  66.2  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0383  putative signal transduction protein with CBS domains  30.28 
 
 
149 aa  52.4  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0412615  normal  0.799719 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  33.64 
 
 
256 aa  50.4  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0112  signal transduction protein  40.58 
 
 
213 aa  49.7  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0311515  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0340  signal-transduction protein  35.06 
 
 
120 aa  49.3  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0589746  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0977  putative signal transduction protein with CBS domains  25.47 
 
 
170 aa  48.9  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000121295  normal  0.444169 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0711  signal transduction protein  40.3 
 
 
213 aa  48.5  0.00004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.402319  normal  0.674474 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0795  CBS domain-containing protein  23.03 
 
 
186 aa  48.1  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0152604  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4543  CBS domain-containing protein  38.18 
 
 
639 aa  48.1  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.661781  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1207  signal transduction protein  37.68 
 
 
213 aa  47.4  0.00008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.230194  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3300  CBS domain containing protein  33.04 
 
 
216 aa  47  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.490249  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0937  putative signal transduction protein with CBS domains  30.63 
 
 
214 aa  46.6  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000079186  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0947  CBS domain containing protein  33.04 
 
 
216 aa  47  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0017149 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0375  CBS domain-containing protein  31.88 
 
 
209 aa  46.2  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1916  CBS domain containing membrane protein  32.43 
 
 
219 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.683041  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2097  CBS domain containing protein  30.17 
 
 
209 aa  46.2  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4458  CBS domain containing membrane protein  27.73 
 
 
640 aa  45.1  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0027  CBS domain containing protein  31.4 
 
 
210 aa  45.1  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.63793  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0680  hypothetical protein  30 
 
 
249 aa  44.7  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.480825 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1136  signal transduction protein  34.95 
 
 
214 aa  44.3  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0714  CBS domain containing protein  29.41 
 
 
227 aa  43.9  0.0009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.724637  normal  0.522786 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1294  CBS domain-containing protein  32.04 
 
 
386 aa  43.5  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0268357 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3131  cyclic nucleotide-binding domain (cNMP-BD) protein  38.1 
 
 
633 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0394  CBS domain-containing membrane protein  34.62 
 
 
201 aa  43.5  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.474769  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0967  hypothetical protein  27.73 
 
 
281 aa  42.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1760  CBS domain-containing protein  41.67 
 
 
279 aa  42.4  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000218135  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1495  putative signal-transduction protein with CBS domains  29.33 
 
 
153 aa  42.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000649642  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_820  CBS domain protein  27.87 
 
 
162 aa  43.1  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1873  hypothetical protein  25.83 
 
 
229 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.994541 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2721  putative signal transduction protein with CBS domains  28.95 
 
 
153 aa  42.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  25.62 
 
 
230 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2575  CBS domain-containing protein  29.27 
 
 
446 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1697  CBS domain-containing protein  29.25 
 
 
615 aa  41.6  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2260  CBS domain-containing protein  29.27 
 
 
150 aa  42  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000586041  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0833  CBS domain-containing protein  25.85 
 
 
162 aa  41.6  0.004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6307  putative signal transduction protein with CBS domains  25.83 
 
 
229 aa  42  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2369  cyclic nucleotide-binding protein  27.36 
 
 
615 aa  41.6  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00413273 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0584  CBS domain-containing protein  29.27 
 
 
446 aa  41.2  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0877  CBS domain-containing protein  27.08 
 
 
446 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0288  CBS domain-containing protein  27.08 
 
 
446 aa  41.6  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0859  XRE family transcriptional regulator  37.04 
 
 
170 aa  41.6  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1468  CBS domain-containing protein  27.08 
 
 
446 aa  41.6  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.71369  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3404  signal transduction protein  38.1 
 
 
212 aa  41.2  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.843193  normal  0.543078 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1665  CBS domain-containing protein  27.08 
 
 
446 aa  41.6  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.310496  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2439  putative transporter  27.08 
 
 
446 aa  41.6  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.273576  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0320  CBS domain-containing protein  27.08 
 
 
446 aa  41.6  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.41193  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0490  signal transduction protein  43.48 
 
 
158 aa  41.2  0.006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.630311  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0130  hypothetical protein  26.67 
 
 
378 aa  41.2  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1393  signal transduction protein  26.47 
 
 
136 aa  41.2  0.006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.137975 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2190  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  26.77 
 
 
963 aa  41.2  0.006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0978  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  35.09 
 
 
635 aa  40.8  0.007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.082367  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1524  signal transduction protein  38.1 
 
 
212 aa  40.8  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0592801 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0264  signal protein  30.23 
 
 
614 aa  40.8  0.007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3960  CBS domain containing protein  35.19 
 
 
153 aa  40.8  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0707  CBS domain containing membrane protein  28.18 
 
 
221 aa  40.8  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4005  CBS domain containing protein  35.19 
 
 
153 aa  40.8  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2623  CBS domain containing protein  33.01 
 
 
215 aa  40.8  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1524  CBS domain-containing protein  29.09 
 
 
618 aa  40.8  0.008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2010  CBS domain-containing protein  47.37 
 
 
144 aa  40.4  0.009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.348735  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1887  CBS domain containing membrane protein  29.06 
 
 
153 aa  40.8  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278261  normal  0.114824 
 
 
-
 
NC_002936  DET0949  CBS domain-containing protein  28.32 
 
 
162 aa  40.4  0.009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2651  putative signal transduction protein with CBS domains  32.26 
 
 
161 aa  40.4  0.01  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.440356 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2231  signal-transduction protein  37.68 
 
 
188 aa  40.4  0.01  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.943647  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>