31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0833 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0833  CBS domain-containing protein  100 
 
 
162 aa  322  1e-87  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0949  CBS domain-containing protein  90.62 
 
 
162 aa  300  5.000000000000001e-81  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_820  CBS domain protein  89.51 
 
 
162 aa  297  3e-80  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0324  putative signal transduction protein with CBS domains  25.64 
 
 
147 aa  47.8  0.00006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1813  CBS domain-containing protein  30.51 
 
 
154 aa  47.8  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0991  CBS domain-containing protein  31.78 
 
 
196 aa  44.7  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1382  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.11 
 
 
489 aa  44.7  0.0005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.614319 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1824  CBS  42 
 
 
154 aa  44.7  0.0006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.539518 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  28.69 
 
 
215 aa  44.3  0.0006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1671  CBS domain-containing protein  28.69 
 
 
215 aa  43.9  0.0008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1807  signal-transduction protein  29.2 
 
 
145 aa  43.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1845  signal-transduction protein  26.03 
 
 
145 aa  43.5  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1014  putative signal transduction protein with CBS domains  25.85 
 
 
162 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.673137  normal  0.137576 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0228  CBS domain-containing protein  33.82 
 
 
145 aa  42  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0636  signal-transduction protein  28.83 
 
 
139 aa  41.6  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00478917  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3846  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  30.65 
 
 
459 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.692652  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3706  cystathionine beta-synthase  28.95 
 
 
459 aa  41.6  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3846  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  28.95 
 
 
459 aa  41.6  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0776  CBS domain protein  28.83 
 
 
139 aa  41.6  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00143526  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4559  CBS domain protein  28.83 
 
 
139 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000024778  normal  0.1618 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2962  putative signal transduction protein with CBS domains  35 
 
 
145 aa  41.2  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1916  CBS domain containing membrane protein  35.44 
 
 
219 aa  41.2  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.683041  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3763  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  30.26 
 
 
459 aa  41.2  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0765  CBS  26.12 
 
 
224 aa  41.2  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3960  CBS domain containing protein  37.5 
 
 
153 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47178  predicted protein  24.63 
 
 
182 aa  40.8  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4005  CBS domain containing protein  37.5 
 
 
153 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1026  magnesium transporter  31.62 
 
 
461 aa  41.2  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000394015  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1007  magnesium transporter  31.62 
 
 
461 aa  41.2  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00155557  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4751  CBS domain containing membrane protein  40 
 
 
154 aa  40.4  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142923  hitchhiker  0.00000010565 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2202  CBS domain-containing protein  44 
 
 
152 aa  40.4  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000112787  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>