More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_3846 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_3846  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  100 
 
 
459 aa  941    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.692652  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3763  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  84.97 
 
 
459 aa  825    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3706  cystathionine beta-synthase  85.62 
 
 
459 aa  829    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3846  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  85.19 
 
 
459 aa  827    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3718  cystathionine beta-synthase  51.19 
 
 
463 aa  446  1.0000000000000001e-124  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000446047  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4156  cystathionine beta-synthase  43.64 
 
 
461 aa  386  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.884438 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0083  cystathionine beta-synthase  47.42 
 
 
458 aa  370  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1048  cystathionine beta-synthase  46.24 
 
 
455 aa  371  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5829  cystathionine beta-synthase  43.17 
 
 
458 aa  371  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.454339 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3118  cystathionine beta-synthase  47.52 
 
 
456 aa  369  1e-101  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000273151 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4422  cystathionine beta-synthase  46.02 
 
 
455 aa  365  1e-100  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2830  cystathionine beta-synthase  54.23 
 
 
332 aa  368  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.908849  normal  0.0512396 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8566  cystathionine beta-synthase  45.61 
 
 
456 aa  365  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0912  cystathionine beta-synthase  44.85 
 
 
456 aa  361  1e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.78601 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0438  cystathionine beta-synthase  45.67 
 
 
455 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1927  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  42.73 
 
 
453 aa  358  9.999999999999999e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0855  cystathionine beta-synthase  44.21 
 
 
456 aa  355  1e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0877269 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0700  cystathionine beta-synthase  44.64 
 
 
456 aa  353  5e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3667  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  43.04 
 
 
496 aa  352  8e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.699338  normal  0.0676519 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31890  cystathionine beta-synthase  45.36 
 
 
457 aa  349  7e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.499085  normal  0.354911 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1082  cystathionine beta-synthase  44.16 
 
 
454 aa  348  1e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0925  cystathionine beta-synthase  44.44 
 
 
468 aa  347  2e-94  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.731257 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4209  cystathionine beta-synthase  44.21 
 
 
464 aa  347  3e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0939  cystathionine beta-synthase  44.54 
 
 
462 aa  347  3e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44231  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0644  cystathionine beta-synthase  44.69 
 
 
463 aa  345  8.999999999999999e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0943  cystathionine beta-synthase  44.59 
 
 
454 aa  342  1e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2762  cystathionine beta-synthase  42.77 
 
 
461 aa  339  5.9999999999999996e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00303095 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0375  cystathionine beta-synthase  44.89 
 
 
462 aa  338  1.9999999999999998e-91  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.457937 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6424  cystathionine beta-synthase  44.4 
 
 
463 aa  337  3.9999999999999995e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.510477  normal  0.13322 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0908  cystathionine beta-synthase  44.76 
 
 
469 aa  334  2e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2671  cystathionine beta-synthase  43.75 
 
 
468 aa  334  2e-90  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1434  Cysteine synthase  42.26 
 
 
453 aa  333  6e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.700608 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3062  cystathionine beta-synthase  43.52 
 
 
461 aa  332  6e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0923483  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3152  cystathionine beta-synthase  43.61 
 
 
460 aa  331  2e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.676366  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2043  cystathionine beta-synthase  45.08 
 
 
464 aa  331  2e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.140313  normal  0.388176 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4380  cystathionine beta-synthase  44.64 
 
 
464 aa  329  5.0000000000000004e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.558337  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4224  cystathionine beta-synthase  44.42 
 
 
464 aa  328  9e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4149  cystathionine beta-synthase  44.42 
 
 
464 aa  328  9e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0798519  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1990  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  51.08 
 
 
326 aa  328  1.0000000000000001e-88  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5286  cystathionine beta-synthase  41.1 
 
 
459 aa  327  3e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.153908  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11095  cystathionine beta-synthase CBS  45.85 
 
 
464 aa  327  3e-88  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000328093  normal  0.348251 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1054  cystathionine beta-synthase  45.26 
 
 
465 aa  326  6e-88  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.655144 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4674  cystathionine beta-synthase  44.9 
 
 
464 aa  325  1e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.202958 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1157  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  52.32 
 
 
326 aa  323  4e-87  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00130  cystathionine beta-synthase  47.84 
 
 
326 aa  323  5e-87  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1617  cystathionine beta-synthase  41.29 
 
 
464 aa  318  1e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0488  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  38.1 
 
 
456 aa  313  3.9999999999999997e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05220  cystathionine beta-synthase  38.24 
 
 
457 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0499  cystathionine beta-synthase  38.46 
 
 
457 aa  312  9e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77227  cystathionine beta-synthase  37.58 
 
 
494 aa  311  2e-83  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2600  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  40.35 
 
 
465 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0422691  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08106  putative cystathionine beta-synthase  47.08 
 
 
345 aa  309  9e-83  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.434389  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03155  cystathionine beta-synthase  38.23 
 
 
464 aa  308  2.0000000000000002e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.140599  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4194  cysteine synthase  50.16 
 
 
340 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.360882 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0276  cysteine synthase A  46.27 
 
 
324 aa  301  2e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.146971  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2956  cystathionine beta-synthase  41.38 
 
 
465 aa  300  3e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.192465  normal  0.0470778 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_42003  predicted protein  40.69 
 
 
469 aa  300  3e-80  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3248  cystathionine beta-synthase  37.03 
 
 
479 aa  299  5e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.564607 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1770  cystathionine beta-synthase  38.96 
 
 
456 aa  299  7e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00709311  hitchhiker  0.000202602 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3360  cysteine synthase A  44.58 
 
 
324 aa  297  3e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.359843  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1627  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  37.94 
 
 
455 aa  295  8e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000745759 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1945  Cysteine synthase  35.54 
 
 
457 aa  294  2e-78  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0787  cystathionine beta-synthase  38.27 
 
 
454 aa  294  2e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.40993  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2557  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  43.65 
 
 
346 aa  294  2e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17600  cystathionine beta-synthase  48.15 
 
 
521 aa  293  4e-78  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4907  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  36.91 
 
 
479 aa  293  4e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2430  pyridoxal-phosphate dependent enzyme family protein  49.68 
 
 
327 aa  292  7e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00735557  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3819  cysteine synthase A  44.41 
 
 
324 aa  290  3e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3300  cystathionine beta-synthase  38.44 
 
 
464 aa  289  8e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2138  cysteine synthase A  44.41 
 
 
323 aa  286  4e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4638  cysteine synthase A  44.41 
 
 
325 aa  286  4e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000171052 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5010  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  44.72 
 
 
325 aa  286  4e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.278031  normal  0.209222 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2094  cysteine synthase A  44.41 
 
 
323 aa  286  4e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2178  Cysteine synthase  34.14 
 
 
466 aa  286  5e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4559  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  44.72 
 
 
328 aa  286  5e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0914  cysteine synthase  48.32 
 
 
355 aa  286  8e-76  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.141926  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1829  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  45.51 
 
 
333 aa  285  1.0000000000000001e-75  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0936757  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3442  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  38.27 
 
 
461 aa  283  6.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5839  cysteine synthase A  43.17 
 
 
324 aa  281  2e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0059  putative cystathionine beta-synthase  48.11 
 
 
316 aa  280  3e-74  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.857844  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2125  cystathionine beta-synthase  48.11 
 
 
316 aa  279  6e-74  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.700222  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1804  cysteine synthase A  43.79 
 
 
334 aa  280  6e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1347  cysteine synthase A  42.77 
 
 
324 aa  279  7e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0350194 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1534  cysteine synthase A  44.41 
 
 
325 aa  279  8e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.393204  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3378  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  38.27 
 
 
461 aa  279  9e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.19393  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4742  cysteine synthase A  43.87 
 
 
326 aa  276  8e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1718  cysteine synthase A  43.16 
 
 
338 aa  276  8e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.858313  normal  0.306784 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0171  cysteine synthase A  43.21 
 
 
372 aa  274  2.0000000000000002e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1694  cysteine synthase A  43.52 
 
 
331 aa  273  4.0000000000000004e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2126  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  34.59 
 
 
457 aa  269  1e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0281  CBS  34.21 
 
 
459 aa  268  1e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.076451 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1633  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  33.26 
 
 
456 aa  267  4e-70  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05820  Cystathionine beta-synthase (EC 4.2.1.22) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:B2LXT5]  40.05 
 
 
535 aa  266  5e-70  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.555504 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1704  cystathionine beta-synthase  33.26 
 
 
456 aa  265  8.999999999999999e-70  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2756  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  42.86 
 
 
343 aa  265  1e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3927  cysteine synthase A  41.67 
 
 
344 aa  261  1e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.385733 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2280  cysteine synthase  33.26 
 
 
459 aa  261  1e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2907  cysteine synthase A  41.03 
 
 
346 aa  260  4e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.156329  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3958  cysteine synthase A  42.86 
 
 
332 aa  259  8e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.328768 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1100  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  42.02 
 
 
349 aa  258  1e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>