More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1617 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_2043  cystathionine beta-synthase  82.75 
 
 
464 aa  755    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.140313  normal  0.388176 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3152  cystathionine beta-synthase  85.59 
 
 
460 aa  786    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.676366  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1617  cystathionine beta-synthase  100 
 
 
464 aa  931    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4422  cystathionine beta-synthase  73.14 
 
 
455 aa  682    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31890  cystathionine beta-synthase  73.26 
 
 
457 aa  662    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.499085  normal  0.354911 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0700  cystathionine beta-synthase  72.71 
 
 
456 aa  653    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4209  cystathionine beta-synthase  72.16 
 
 
464 aa  639    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0855  cystathionine beta-synthase  69.57 
 
 
456 aa  634    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0877269 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0925  cystathionine beta-synthase  73.94 
 
 
468 aa  657    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.731257 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4674  cystathionine beta-synthase  83.41 
 
 
464 aa  763    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.202958 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1082  cystathionine beta-synthase  75.92 
 
 
454 aa  664    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11095  cystathionine beta-synthase CBS  81.22 
 
 
464 aa  733    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000328093  normal  0.348251 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4149  cystathionine beta-synthase  82.1 
 
 
464 aa  753    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0798519  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8566  cystathionine beta-synthase  69.13 
 
 
456 aa  640    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4224  cystathionine beta-synthase  82.1 
 
 
464 aa  753    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4380  cystathionine beta-synthase  82.31 
 
 
464 aa  754    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.558337  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2671  cystathionine beta-synthase  70.4 
 
 
468 aa  632  1e-180  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0644  cystathionine beta-synthase  70.9 
 
 
463 aa  631  1e-180  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0912  cystathionine beta-synthase  68.91 
 
 
456 aa  631  1e-180  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.78601 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0943  cystathionine beta-synthase  69.65 
 
 
454 aa  629  1e-179  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1048  cystathionine beta-synthase  68.63 
 
 
455 aa  629  1e-179  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0083  cystathionine beta-synthase  68.33 
 
 
458 aa  621  1e-177  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3118  cystathionine beta-synthase  69.13 
 
 
456 aa  616  1e-175  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000273151 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0939  cystathionine beta-synthase  68.75 
 
 
462 aa  614  9.999999999999999e-175  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44231  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1054  cystathionine beta-synthase  69.72 
 
 
465 aa  612  9.999999999999999e-175  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.655144 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0438  cystathionine beta-synthase  68.85 
 
 
455 aa  607  9.999999999999999e-173  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3062  cystathionine beta-synthase  66.95 
 
 
461 aa  604  1.0000000000000001e-171  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0923483  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2762  cystathionine beta-synthase  65.24 
 
 
461 aa  589  1e-167  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00303095 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6424  cystathionine beta-synthase  62.42 
 
 
463 aa  542  1e-153  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.510477  normal  0.13322 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0375  cystathionine beta-synthase  61.82 
 
 
462 aa  539  9.999999999999999e-153  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.457937 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2956  cystathionine beta-synthase  55.1 
 
 
465 aa  452  1.0000000000000001e-126  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.192465  normal  0.0470778 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17600  cystathionine beta-synthase  50.96 
 
 
521 aa  449  1e-125  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4156  cystathionine beta-synthase  48.05 
 
 
461 aa  439  9.999999999999999e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.884438 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0908  cystathionine beta-synthase  53.26 
 
 
469 aa  434  1e-120  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5829  cystathionine beta-synthase  46.81 
 
 
458 aa  401  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.454339 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0914  cysteine synthase  63.16 
 
 
355 aa  387  1e-106  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.141926  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1927  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  44.4 
 
 
453 aa  373  1e-102  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1434  Cysteine synthase  43.97 
 
 
453 aa  361  1e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.700608 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3718  cystathionine beta-synthase  43.4 
 
 
463 aa  354  2e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000446047  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3706  cystathionine beta-synthase  43.25 
 
 
459 aa  353  2.9999999999999997e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3763  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  42.83 
 
 
459 aa  353  4e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3846  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  42.83 
 
 
459 aa  352  8e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2830  cystathionine beta-synthase  55.66 
 
 
332 aa  352  1e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.908849  normal  0.0512396 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3846  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  41.56 
 
 
459 aa  341  2e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.692652  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1990  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  56.04 
 
 
326 aa  339  5e-92  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1157  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  56.17 
 
 
326 aa  334  2e-90  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3667  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  42.04 
 
 
496 aa  328  1.0000000000000001e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.699338  normal  0.0676519 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00130  cystathionine beta-synthase  50.15 
 
 
326 aa  316  6e-85  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5286  cystathionine beta-synthase  38.88 
 
 
459 aa  304  3.0000000000000004e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.153908  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2600  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  39.14 
 
 
465 aa  301  1e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0422691  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77227  cystathionine beta-synthase  39.59 
 
 
494 aa  291  2e-77  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3248  cystathionine beta-synthase  39.04 
 
 
479 aa  289  7e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.564607 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2178  Cysteine synthase  35.34 
 
 
466 aa  288  2e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2557  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  44.62 
 
 
346 aa  286  5.999999999999999e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0488  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  36.77 
 
 
456 aa  285  9e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08106  putative cystathionine beta-synthase  44.95 
 
 
345 aa  285  1.0000000000000001e-75  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.434389  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03155  cystathionine beta-synthase  37.42 
 
 
464 aa  283  5.000000000000001e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.140599  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05220  cystathionine beta-synthase  38.24 
 
 
457 aa  280  4e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1945  Cysteine synthase  33.84 
 
 
457 aa  276  5e-73  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0499  cystathionine beta-synthase  37.8 
 
 
457 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1829  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  43.9 
 
 
333 aa  273  6e-72  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0936757  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_42003  predicted protein  39.21 
 
 
469 aa  270  2.9999999999999997e-71  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0787  cystathionine beta-synthase  38.63 
 
 
454 aa  268  1e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.40993  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4907  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  36.56 
 
 
479 aa  267  2.9999999999999995e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0281  CBS  34.42 
 
 
459 aa  266  4e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.076451 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0059  putative cystathionine beta-synthase  44.94 
 
 
316 aa  266  5.999999999999999e-70  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.857844  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2280  cysteine synthase  33.33 
 
 
459 aa  266  8e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4194  cysteine synthase  45.54 
 
 
340 aa  265  8.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.360882 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2125  cystathionine beta-synthase  45.25 
 
 
316 aa  265  8.999999999999999e-70  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.700222  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1704  cystathionine beta-synthase  33.98 
 
 
456 aa  264  3e-69  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1633  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  33.76 
 
 
456 aa  263  4.999999999999999e-69  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0978  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  43.75 
 
 
307 aa  260  4e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0170  cysteine synthase family protein  42.24 
 
 
302 aa  259  6e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0289  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  43.21 
 
 
510 aa  258  1e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.16012 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1385  cysteine synthase  45.19 
 
 
311 aa  257  3e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.9014  normal  0.484311 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3378  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  38.21 
 
 
461 aa  257  4e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.19393  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2475  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  42.43 
 
 
307 aa  256  5e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  45.28 
 
 
312 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3819  cysteine synthase A  43.52 
 
 
324 aa  255  1.0000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3300  cystathionine beta-synthase  37.91 
 
 
464 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2126  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  33.69 
 
 
457 aa  252  9.000000000000001e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3442  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  37.77 
 
 
461 aa  252  9.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1627  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  36.01 
 
 
455 aa  251  2e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000745759 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1770  cystathionine beta-synthase  36.23 
 
 
456 aa  251  3e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00709311  hitchhiker  0.000202602 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2500  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  43.42 
 
 
315 aa  251  3e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2880  hypothetical protein  46.65 
 
 
316 aa  249  5e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0171  cysteine synthase A  42.11 
 
 
372 aa  249  7e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  44.23 
 
 
311 aa  249  1e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05820  Cystathionine beta-synthase (EC 4.2.1.22) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:B2LXT5]  40.42 
 
 
535 aa  248  2e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.555504 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2430  pyridoxal-phosphate dependent enzyme family protein  42.54 
 
 
327 aa  248  2e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00735557  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2553  Cysteine synthase  33.55 
 
 
457 aa  248  2e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3022  hypothetical protein  46.33 
 
 
316 aa  247  3e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  43.12 
 
 
312 aa  247  3e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0030  cysteine synthase A  45.51 
 
 
311 aa  247  4e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0152  cysteine synthase  43.85 
 
 
310 aa  247  4e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3855  cysteine synthase  48.69 
 
 
344 aa  246  6e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0548  cysteine synthase A  43.52 
 
 
310 aa  245  1.9999999999999999e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4559  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  42.72 
 
 
328 aa  245  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0535  cysteine synthase A  43.52 
 
 
310 aa  245  1.9999999999999999e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.775182  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0166  cysteine synthase family protein  42.57 
 
 
302 aa  245  1.9999999999999999e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>