More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2762 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_2762  cystathionine beta-synthase  100 
 
 
461 aa  929    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00303095 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3062  cystathionine beta-synthase  89.59 
 
 
461 aa  824    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0923483  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0925  cystathionine beta-synthase  66.67 
 
 
468 aa  624  1e-177  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.731257 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4422  cystathionine beta-synthase  64.35 
 
 
455 aa  607  9.999999999999999e-173  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1082  cystathionine beta-synthase  66.74 
 
 
454 aa  606  9.999999999999999e-173  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4224  cystathionine beta-synthase  64.81 
 
 
464 aa  593  1e-168  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4380  cystathionine beta-synthase  65.02 
 
 
464 aa  593  1e-168  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.558337  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4149  cystathionine beta-synthase  64.81 
 
 
464 aa  593  1e-168  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0798519  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1617  cystathionine beta-synthase  65.24 
 
 
464 aa  589  1e-167  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2671  cystathionine beta-synthase  62.18 
 
 
468 aa  590  1e-167  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4674  cystathionine beta-synthase  64.81 
 
 
464 aa  583  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.202958 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2043  cystathionine beta-synthase  64.81 
 
 
464 aa  583  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.140313  normal  0.388176 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3152  cystathionine beta-synthase  63.3 
 
 
460 aa  583  1.0000000000000001e-165  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.676366  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1054  cystathionine beta-synthase  65.38 
 
 
465 aa  580  1e-164  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.655144 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11095  cystathionine beta-synthase CBS  63.95 
 
 
464 aa  577  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000328093  normal  0.348251 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0644  cystathionine beta-synthase  63.2 
 
 
463 aa  571  1.0000000000000001e-162  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0943  cystathionine beta-synthase  62.69 
 
 
454 aa  568  1e-161  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31890  cystathionine beta-synthase  63.12 
 
 
457 aa  570  1e-161  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.499085  normal  0.354911 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0912  cystathionine beta-synthase  62.83 
 
 
456 aa  569  1e-161  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.78601 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0700  cystathionine beta-synthase  61.82 
 
 
456 aa  567  1e-160  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0855  cystathionine beta-synthase  62.77 
 
 
456 aa  567  1e-160  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0877269 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8566  cystathionine beta-synthase  61.47 
 
 
456 aa  561  1.0000000000000001e-159  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0939  cystathionine beta-synthase  62.82 
 
 
462 aa  559  1e-158  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44231  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4209  cystathionine beta-synthase  60.48 
 
 
464 aa  556  1e-157  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3118  cystathionine beta-synthase  62.34 
 
 
456 aa  552  1e-156  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000273151 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1048  cystathionine beta-synthase  60.61 
 
 
455 aa  550  1e-155  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0083  cystathionine beta-synthase  60.34 
 
 
458 aa  545  1e-154  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0438  cystathionine beta-synthase  62.12 
 
 
455 aa  543  1e-153  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0375  cystathionine beta-synthase  57.11 
 
 
462 aa  492  9.999999999999999e-139  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.457937 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6424  cystathionine beta-synthase  55.77 
 
 
463 aa  490  1e-137  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.510477  normal  0.13322 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17600  cystathionine beta-synthase  76.16 
 
 
521 aa  478  1e-133  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4156  cystathionine beta-synthase  47.51 
 
 
461 aa  437  1e-121  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.884438 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0908  cystathionine beta-synthase  50.11 
 
 
469 aa  426  1e-118  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2956  cystathionine beta-synthase  50.97 
 
 
465 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.192465  normal  0.0470778 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5829  cystathionine beta-synthase  45.97 
 
 
458 aa  392  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.454339 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0914  cysteine synthase  58.28 
 
 
355 aa  375  1e-103  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.141926  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3718  cystathionine beta-synthase  44.85 
 
 
463 aa  367  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000446047  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3706  cystathionine beta-synthase  43.13 
 
 
459 aa  363  2e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3846  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  42.92 
 
 
459 aa  363  4e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3763  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  42.92 
 
 
459 aa  362  5.0000000000000005e-99  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3846  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  42.77 
 
 
459 aa  361  2e-98  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.692652  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1157  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  56.8 
 
 
326 aa  347  2e-94  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1434  Cysteine synthase  43.38 
 
 
453 aa  346  4e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.700608 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1927  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  42.31 
 
 
453 aa  341  2e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2830  cystathionine beta-synthase  50.89 
 
 
332 aa  341  2e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.908849  normal  0.0512396 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1990  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  52.73 
 
 
326 aa  333  4e-90  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3667  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  45.23 
 
 
496 aa  333  5e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.699338  normal  0.0676519 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00130  cystathionine beta-synthase  48.05 
 
 
326 aa  315  7e-85  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77227  cystathionine beta-synthase  45.26 
 
 
494 aa  307  2.0000000000000002e-82  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_42003  predicted protein  40.7 
 
 
469 aa  294  3e-78  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05220  cystathionine beta-synthase  37.53 
 
 
457 aa  293  4e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0499  cystathionine beta-synthase  37.53 
 
 
457 aa  292  1e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0059  putative cystathionine beta-synthase  48.75 
 
 
316 aa  291  1e-77  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.857844  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5286  cystathionine beta-synthase  39.76 
 
 
459 aa  292  1e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.153908  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2125  cystathionine beta-synthase  49.06 
 
 
316 aa  291  2e-77  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.700222  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0488  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  37.69 
 
 
456 aa  291  2e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1829  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  44.55 
 
 
333 aa  287  2.9999999999999996e-76  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0936757  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3248  cystathionine beta-synthase  36.66 
 
 
479 aa  285  8e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.564607 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08106  putative cystathionine beta-synthase  45.9 
 
 
345 aa  284  3.0000000000000004e-75  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.434389  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2600  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  36.83 
 
 
465 aa  282  9e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0422691  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2557  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  42.11 
 
 
346 aa  281  2e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2178  Cysteine synthase  33.26 
 
 
466 aa  279  8e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03155  cystathionine beta-synthase  36.83 
 
 
464 aa  277  3e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.140599  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1945  Cysteine synthase  32.55 
 
 
457 aa  269  8e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1704  cystathionine beta-synthase  34.69 
 
 
456 aa  269  1e-70  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05820  Cystathionine beta-synthase (EC 4.2.1.22) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:B2LXT5]  41.76 
 
 
535 aa  268  2e-70  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.555504 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4907  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  34.83 
 
 
479 aa  267  2.9999999999999995e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1633  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  34.48 
 
 
456 aa  267  2.9999999999999995e-70  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1627  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  37.61 
 
 
455 aa  266  7e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000745759 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0787  cystathionine beta-synthase  36.01 
 
 
454 aa  261  2e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.40993  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3855  cysteine synthase  49.04 
 
 
344 aa  259  5.0000000000000005e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2880  hypothetical protein  46.25 
 
 
316 aa  258  1e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4194  cysteine synthase  43.84 
 
 
340 aa  258  1e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.360882 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1770  cystathionine beta-synthase  37.15 
 
 
456 aa  258  2e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00709311  hitchhiker  0.000202602 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0289  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  47.29 
 
 
510 aa  257  3e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.16012 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3022  hypothetical protein  45.94 
 
 
316 aa  256  7e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  44.95 
 
 
312 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2500  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  44.37 
 
 
315 aa  254  3e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0276  cysteine synthase A  43.03 
 
 
324 aa  252  8.000000000000001e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.146971  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0170  cysteine synthase family protein  42.58 
 
 
302 aa  251  2e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5010  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  41.21 
 
 
325 aa  250  5e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.278031  normal  0.209222 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3819  cysteine synthase A  41.74 
 
 
324 aa  249  5e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0171  cysteine synthase A  42.42 
 
 
372 aa  249  6e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2475  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  42.49 
 
 
307 aa  249  1e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0281  CBS  31.91 
 
 
459 aa  248  1e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.076451 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1694  cysteine synthase A  41.69 
 
 
331 aa  248  2e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2430  pyridoxal-phosphate dependent enzyme family protein  44.44 
 
 
327 aa  247  3e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00735557  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  43.75 
 
 
311 aa  247  3e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2126  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  31.13 
 
 
457 aa  247  4e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1385  cysteine synthase  42.31 
 
 
311 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.9014  normal  0.484311 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0152  cysteine synthase  43.51 
 
 
310 aa  244  1.9999999999999999e-63  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  43.23 
 
 
312 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0548  cysteine synthase A  42.49 
 
 
310 aa  244  3e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0535  cysteine synthase A  42.49 
 
 
310 aa  244  3e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.775182  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1560  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  44.74 
 
 
302 aa  243  3.9999999999999997e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.180171  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1534  cysteine synthase A  41.72 
 
 
325 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.393204  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0978  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  42.17 
 
 
307 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0011  cysteine synthase A  45.03 
 
 
310 aa  242  9e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.857978  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0030  cysteine synthase A  44.06 
 
 
311 aa  242  1e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2280  cysteine synthase  30.41 
 
 
459 aa  242  1e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>