More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1048 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_0855  cystathionine beta-synthase  73.63 
 
 
456 aa  662    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0877269 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3118  cystathionine beta-synthase  82.42 
 
 
456 aa  715    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000273151 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31890  cystathionine beta-synthase  72.31 
 
 
457 aa  640    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.499085  normal  0.354911 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0083  cystathionine beta-synthase  76.59 
 
 
458 aa  682    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1048  cystathionine beta-synthase  100 
 
 
455 aa  919    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0912  cystathionine beta-synthase  73.63 
 
 
456 aa  664    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.78601 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0438  cystathionine beta-synthase  80.88 
 
 
455 aa  706    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0943  cystathionine beta-synthase  71.08 
 
 
454 aa  637    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4422  cystathionine beta-synthase  70.04 
 
 
455 aa  644    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8566  cystathionine beta-synthase  80.88 
 
 
456 aa  742    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0700  cystathionine beta-synthase  72.03 
 
 
456 aa  655    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0644  cystathionine beta-synthase  73.51 
 
 
463 aa  664    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1617  cystathionine beta-synthase  68.63 
 
 
464 aa  626  1e-178  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3152  cystathionine beta-synthase  69.21 
 
 
460 aa  624  1e-177  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.676366  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2043  cystathionine beta-synthase  68.56 
 
 
464 aa  619  1e-176  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.140313  normal  0.388176 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4209  cystathionine beta-synthase  69.8 
 
 
464 aa  616  1e-175  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4380  cystathionine beta-synthase  67.25 
 
 
464 aa  612  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.558337  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1082  cystathionine beta-synthase  71.15 
 
 
454 aa  612  9.999999999999999e-175  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4149  cystathionine beta-synthase  67.03 
 
 
464 aa  612  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0798519  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4224  cystathionine beta-synthase  67.03 
 
 
464 aa  612  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4674  cystathionine beta-synthase  67.69 
 
 
464 aa  612  9.999999999999999e-175  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.202958 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11095  cystathionine beta-synthase CBS  68.78 
 
 
464 aa  610  1e-173  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000328093  normal  0.348251 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0925  cystathionine beta-synthase  67.24 
 
 
468 aa  594  1e-168  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.731257 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0939  cystathionine beta-synthase  67.46 
 
 
462 aa  590  1e-167  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44231  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2671  cystathionine beta-synthase  64.18 
 
 
468 aa  572  1.0000000000000001e-162  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3062  cystathionine beta-synthase  64.29 
 
 
461 aa  573  1.0000000000000001e-162  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0923483  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6424  cystathionine beta-synthase  65.51 
 
 
463 aa  566  1e-160  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.510477  normal  0.13322 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1054  cystathionine beta-synthase  65.59 
 
 
465 aa  553  1e-156  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.655144 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0375  cystathionine beta-synthase  63.68 
 
 
462 aa  553  1e-156  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.457937 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2762  cystathionine beta-synthase  60.61 
 
 
461 aa  549  1e-155  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00303095 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2956  cystathionine beta-synthase  59.87 
 
 
465 aa  489  1e-137  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.192465  normal  0.0470778 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4156  cystathionine beta-synthase  50.55 
 
 
461 aa  461  1e-129  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.884438 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0908  cystathionine beta-synthase  54.68 
 
 
469 aa  451  1e-125  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5829  cystathionine beta-synthase  46.78 
 
 
458 aa  414  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.454339 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17600  cystathionine beta-synthase  66.88 
 
 
521 aa  407  1.0000000000000001e-112  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1927  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  45.43 
 
 
453 aa  395  1e-109  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3846  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  46.35 
 
 
459 aa  396  1e-109  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.692652  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0914  cysteine synthase  62.23 
 
 
355 aa  389  1e-107  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.141926  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3846  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  45.53 
 
 
459 aa  387  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3706  cystathionine beta-synthase  45.49 
 
 
459 aa  385  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3763  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  45.28 
 
 
459 aa  385  1e-105  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3718  cystathionine beta-synthase  47.41 
 
 
463 aa  384  1e-105  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000446047  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1434  Cysteine synthase  43.33 
 
 
453 aa  371  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.700608 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2830  cystathionine beta-synthase  54.57 
 
 
332 aa  364  2e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.908849  normal  0.0512396 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1157  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  59.38 
 
 
326 aa  353  4e-96  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1990  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  56.35 
 
 
326 aa  347  2e-94  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3667  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  41.42 
 
 
496 aa  346  6e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.699338  normal  0.0676519 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00130  cystathionine beta-synthase  50.92 
 
 
326 aa  342  1e-92  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2600  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  41.77 
 
 
465 aa  324  2e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0422691  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5286  cystathionine beta-synthase  40.39 
 
 
459 aa  323  3e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.153908  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0488  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  38.39 
 
 
456 aa  308  1.0000000000000001e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1829  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  46.95 
 
 
333 aa  307  3e-82  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0936757  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77227  cystathionine beta-synthase  39.88 
 
 
494 aa  305  1.0000000000000001e-81  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08106  putative cystathionine beta-synthase  46.18 
 
 
345 aa  304  2.0000000000000002e-81  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.434389  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3248  cystathionine beta-synthase  41.37 
 
 
479 aa  302  7.000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.564607 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2557  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  45.21 
 
 
346 aa  302  9e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0289  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  52.62 
 
 
510 aa  301  2e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.16012 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05220  cystathionine beta-synthase  41.36 
 
 
457 aa  300  3e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03155  cystathionine beta-synthase  38.18 
 
 
464 aa  300  4e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.140599  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05820  Cystathionine beta-synthase (EC 4.2.1.22) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:B2LXT5]  43.22 
 
 
535 aa  297  2e-79  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.555504 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0787  cystathionine beta-synthase  40.44 
 
 
454 aa  297  2e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.40993  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0499  cystathionine beta-synthase  40.92 
 
 
457 aa  295  1e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1633  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  36.66 
 
 
456 aa  291  2e-77  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_42003  predicted protein  40 
 
 
469 aa  290  5.0000000000000004e-77  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1704  cystathionine beta-synthase  36.44 
 
 
456 aa  288  1e-76  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2178  Cysteine synthase  35.46 
 
 
466 aa  288  2e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1770  cystathionine beta-synthase  38.73 
 
 
456 aa  284  2.0000000000000002e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00709311  hitchhiker  0.000202602 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4907  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  37.21 
 
 
479 aa  281  1e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3855  cysteine synthase  54.9 
 
 
344 aa  280  3e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0059  putative cystathionine beta-synthase  47.15 
 
 
316 aa  280  4e-74  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.857844  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2125  cystathionine beta-synthase  47.15 
 
 
316 aa  280  5e-74  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.700222  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1627  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  38.65 
 
 
455 aa  280  5e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000745759 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3378  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  39.34 
 
 
461 aa  274  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.19393  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3300  cystathionine beta-synthase  39.56 
 
 
464 aa  273  5.000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0171  cysteine synthase A  46.13 
 
 
372 aa  273  6e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1694  cysteine synthase A  45.99 
 
 
331 aa  272  1e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3442  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  39.12 
 
 
461 aa  271  2e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0276  cysteine synthase A  45.85 
 
 
324 aa  270  5e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.146971  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4194  cysteine synthase  46.13 
 
 
340 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.360882 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3819  cysteine synthase A  44.92 
 
 
324 aa  266  7e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  45.03 
 
 
312 aa  265  1e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4559  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  44.58 
 
 
328 aa  264  3e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2500  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  43.75 
 
 
315 aa  263  3e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3360  cysteine synthase A  45.2 
 
 
324 aa  262  6.999999999999999e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.359843  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1347  cysteine synthase A  44.27 
 
 
324 aa  262  8e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0350194 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1804  cysteine synthase A  43.43 
 
 
334 aa  259  7e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0978  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  43.75 
 
 
307 aa  258  1e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4638  cysteine synthase A  43.52 
 
 
325 aa  257  2e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000171052 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  43.89 
 
 
312 aa  258  2e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5839  cysteine synthase A  44.92 
 
 
324 aa  257  3e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1718  cysteine synthase A  43.52 
 
 
338 aa  257  4e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.858313  normal  0.306784 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1945  Cysteine synthase  32.76 
 
 
457 aa  256  7e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0548  cysteine synthase A  44.52 
 
 
310 aa  255  1.0000000000000001e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0535  cysteine synthase A  44.52 
 
 
310 aa  255  1.0000000000000001e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.775182  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5010  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  44.58 
 
 
325 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.278031  normal  0.209222 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2138  cysteine synthase A  43.65 
 
 
323 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2880  hypothetical protein  44.62 
 
 
316 aa  254  2.0000000000000002e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2094  cysteine synthase A  43.65 
 
 
323 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08057  Cysteine synthase (CSase)(EC 2.5.1.47)(O-acetylserine sulfhydrylase)(O-acetylserine (thiol)-lyase)(OAS-TL) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P50867]  43.56 
 
 
370 aa  254  3e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0152  cysteine synthase  45.18 
 
 
310 aa  254  3e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>