More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4209 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1617  cystathionine beta-synthase  71.95 
 
 		 464 aa  639    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0644  cystathionine beta-synthase  71.09 
 
 		 463 aa  639    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0912  cystathionine beta-synthase  72.15 
 
 		 456 aa  643    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.78601 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0700  cystathionine beta-synthase  73.58 
 
 		 456 aa  650    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4422  cystathionine beta-synthase  72.27 
 
 		 455 aa  679    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0855  cystathionine beta-synthase  72.59 
 
 		 456 aa  646    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0877269 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4209  cystathionine beta-synthase  100 
 
 		 464 aa  926    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2043  cystathionine beta-synthase  70.11 
 
 		 464 aa  630  1e-179  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.140313  normal  0.388176 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31890  cystathionine beta-synthase  71.3 
 
 		 457 aa  629  1e-179  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.499085  normal  0.354911 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8566  cystathionine beta-synthase  70.31 
 
 		 456 aa  627  1e-178  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0083  cystathionine beta-synthase  70.31 
 
 		 458 aa  624  1e-178  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1082  cystathionine beta-synthase  71.62 
 
 		 454 aa  624  1e-177  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4380  cystathionine beta-synthase  69.85 
 
 		 464 aa  621  1e-177  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.558337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4674  cystathionine beta-synthase  69.85 
 
 		 464 aa  622  1e-177  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202958 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1048  cystathionine beta-synthase  69.8 
 
 		 455 aa  618  1e-176  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0943  cystathionine beta-synthase  68.63 
 
 		 454 aa  620  1e-176  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4149  cystathionine beta-synthase  69.63 
 
 		 464 aa  620  1e-176  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0798519  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4224  cystathionine beta-synthase  69.63 
 
 		 464 aa  620  1e-176  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3152  cystathionine beta-synthase  69.41 
 
 		 460 aa  615  1e-175  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.676366  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0438  cystathionine beta-synthase  70.02 
 
 		 455 aa  613  9.999999999999999e-175  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11095  cystathionine beta-synthase CBS  70.07 
 
 		 464 aa  611  1e-173  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000328093  normal  0.348251 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0939  cystathionine beta-synthase  69.11 
 
 		 462 aa  610  1e-173  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44231  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0925  cystathionine beta-synthase  69.08 
 
 		 468 aa  607  9.999999999999999e-173  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.731257 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3118  cystathionine beta-synthase  70.24 
 
 		 456 aa  602  1.0000000000000001e-171  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000273151 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2671  cystathionine beta-synthase  68.09 
 
 		 468 aa  603  1.0000000000000001e-171  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1054  cystathionine beta-synthase  67.67 
 
 		 465 aa  574  1.0000000000000001e-162  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.655144 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3062  cystathionine beta-synthase  62.07 
 
 		 461 aa  563  1.0000000000000001e-159  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0923483  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2762  cystathionine beta-synthase  60.48 
 
 		 461 aa  556  1e-157  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00303095 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6424  cystathionine beta-synthase  64.22 
 
 		 463 aa  544  1e-153  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.510477  normal  0.13322 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0375  cystathionine beta-synthase  63.7 
 
 		 462 aa  534  1e-150  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.457937 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4156  cystathionine beta-synthase  49.13 
 
 		 461 aa  440  9.999999999999999e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.884438 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0908  cystathionine beta-synthase  53.16 
 
 		 469 aa  432  1e-120  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2956  cystathionine beta-synthase  54.45 
 
 		 465 aa  429  1e-119  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.192465  normal  0.0470778 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17600  cystathionine beta-synthase  66.87 
 
 		 521 aa  412  1e-114  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5829  cystathionine beta-synthase  47.11 
 
 		 458 aa  408  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.454339 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1927  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  46.04 
 
 		 453 aa  391  1e-107  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3718  cystathionine beta-synthase  46.15 
 
 		 463 aa  379  1e-104  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000446047  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3706  cystathionine beta-synthase  46.82 
 
 		 459 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3763  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  45.61 
 
 		 459 aa  377  1e-103  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1434  Cysteine synthase  44.52 
 
 		 453 aa  375  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.700608 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3846  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  46.4 
 
 		 459 aa  376  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3846  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  44.21 
 
 		 459 aa  371  1e-101  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.692652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0914  cysteine synthase  59.17 
 
 		 355 aa  368  1e-100  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.141926  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00130  cystathionine beta-synthase  54.24 
 
 		 326 aa  358  9e-98  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2830  cystathionine beta-synthase  56.1 
 
 		 332 aa  355  1e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.908849  normal  0.0512396 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3667  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  43.35 
 
 		 496 aa  352  8.999999999999999e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.699338  normal  0.0676519 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1157  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  56.23 
 
 		 326 aa  347  4e-94  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1990  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  56.44 
 
 		 326 aa  345  7e-94  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2600  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  40.43 
 
 		 465 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0422691  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08106  putative cystathionine beta-synthase  47.27 
 
 		 345 aa  307  2.0000000000000002e-82  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.434389  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5286  cystathionine beta-synthase  39.87 
 
 		 459 aa  304  2.0000000000000002e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.153908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77227  cystathionine beta-synthase  39.36 
 
 		 494 aa  303  4.0000000000000003e-81  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05220  cystathionine beta-synthase  40.13 
 
 		 457 aa  301  2e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3248  cystathionine beta-synthase  39.69 
 
 		 479 aa  299  6e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.564607 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0499  cystathionine beta-synthase  39.69 
 
 		 457 aa  297  3e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0488  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  37.77 
 
 		 456 aa  291  2e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0787  cystathionine beta-synthase  40.04 
 
 		 454 aa  290  4e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.40993  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1829  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  45.26 
 
 		 333 aa  290  5.0000000000000004e-77  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0936757  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2557  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  42.6 
 
 		 346 aa  289  9e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03155  cystathionine beta-synthase  37.58 
 
 		 464 aa  284  2.0000000000000002e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.140599  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2178  Cysteine synthase  35.13 
 
 		 466 aa  281  1e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_42003  predicted protein  40.99 
 
 		 469 aa  278  1e-73  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4907  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  36.03 
 
 		 479 aa  276  6e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0059  putative cystathionine beta-synthase  46.54 
 
 		 316 aa  276  8e-73  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.857844  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2125  cystathionine beta-synthase  46.54 
 
 		 316 aa  275  1.0000000000000001e-72  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.700222  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3378  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  40.26 
 
 		 461 aa  270  2.9999999999999997e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.19393  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05820  Cystathionine beta-synthase (EC 4.2.1.22) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:B2LXT5]  41.69 
 
 		 535 aa  268  2e-70  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.555504 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3300  cystathionine beta-synthase  39.96 
 
 		 464 aa  267  2e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1770  cystathionine beta-synthase  37.74 
 
 		 456 aa  268  2e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00709311  hitchhiker  0.000202602 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1627  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  37.12 
 
 		 455 aa  266  4e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000745759 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4194  cysteine synthase  47.48 
 
 		 340 aa  266  5e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.360882 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3442  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  39.82 
 
 		 461 aa  265  8.999999999999999e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0289  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  51.32 
 
 		 510 aa  265  1e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.16012 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1704  cystathionine beta-synthase  34.06 
 
 		 456 aa  265  2e-69  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1633  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  33.84 
 
 		 456 aa  263  3e-69  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1945  Cysteine synthase  35.31 
 
 		 457 aa  261  2e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2280  cysteine synthase  33.48 
 
 		 459 aa  258  2e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2430  pyridoxal-phosphate dependent enzyme family protein  45.28 
 
 		 327 aa  256  6e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00735557  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2880  hypothetical protein  45.25 
 
 		 316 aa  256  6e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1694  cysteine synthase A  44.04 
 
 		 331 aa  255  1.0000000000000001e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3855  cysteine synthase  50.32 
 
 		 344 aa  255  1.0000000000000001e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3022  hypothetical protein  44.94 
 
 		 316 aa  253  5.000000000000001e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1804  cysteine synthase A  43.87 
 
 		 334 aa  253  5.000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2500  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  42.35 
 
 		 315 aa  252  9.000000000000001e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  43.71 
 
 		 312 aa  251  2e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0978  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  42.67 
 
 		 307 aa  250  4e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3819  cysteine synthase A  44.34 
 
 		 324 aa  249  5e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  45.1 
 
 		 311 aa  249  6e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0152  cysteine synthase  44.12 
 
 		 310 aa  248  2e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2014  cysteine synthase A  47.23 
 
 		 309 aa  247  3e-64  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0113  normal  0.0387372 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0276  cysteine synthase A  45.11 
 
 		 324 aa  247  4e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.146971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0548  cysteine synthase A  43.14 
 
 		 310 aa  246  4.9999999999999997e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0535  cysteine synthase A  43.14 
 
 		 310 aa  246  4.9999999999999997e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.775182  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2475  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  41.04 
 
 		 307 aa  246  6e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0171  cysteine synthase A  42.64 
 
 		 372 aa  246  6.999999999999999e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3364  cysteine synthase A  45.93 
 
 		 304 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000830673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2126  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  34.28 
 
 		 457 aa  242  1e-62  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3085  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  40.75 
 
 		 307 aa  242  1e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.520498  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  42.38 
 
 		 312 aa  242  1e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0170  cysteine synthase family protein  39.02 
 
 		 302 aa  242  1e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>