More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_3300 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011145  AnaeK_3378  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  95.98 
 
 		 461 aa  854    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.19393  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3442  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  95.76 
 
 		 461 aa  854    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3300  cystathionine beta-synthase  100 
 
 		 464 aa  918    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0787  cystathionine beta-synthase  64.06 
 
 		 454 aa  565  1e-160  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.40993  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03155  cystathionine beta-synthase  61.5 
 
 		 464 aa  562  1.0000000000000001e-159  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.140599  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0488  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  60.66 
 
 		 456 aa  550  1e-155  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3248  cystathionine beta-synthase  60.4 
 
 		 479 aa  531  1e-150  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.564607 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2600  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  60.4 
 
 		 465 aa  533  1e-150  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0422691  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0499  cystathionine beta-synthase  59.22 
 
 		 457 aa  525  1e-148  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4907  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  58.82 
 
 		 479 aa  526  1e-148  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05220  cystathionine beta-synthase  59.44 
 
 		 457 aa  527  1e-148  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1627  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  60 
 
 		 455 aa  518  1.0000000000000001e-145  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000745759 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1770  cystathionine beta-synthase  59.87 
 
 		 456 aa  512  1e-144  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00709311  hitchhiker  0.000202602 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1633  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  54.65 
 
 		 456 aa  497  1e-139  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1704  cystathionine beta-synthase  54.87 
 
 		 456 aa  496  1e-139  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4156  cystathionine beta-synthase  40.58 
 
 		 461 aa  309  5.9999999999999995e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.884438 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3718  cystathionine beta-synthase  39.65 
 
 		 463 aa  299  9e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000446047  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5286  cystathionine beta-synthase  41.02 
 
 		 459 aa  292  8e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.153908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3846  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  38.44 
 
 		 459 aa  289  8e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.692652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3846  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  38.51 
 
 		 459 aa  284  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3706  cystathionine beta-synthase  38.51 
 
 		 459 aa  282  1e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3763  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  38.29 
 
 		 459 aa  281  2e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0908  cystathionine beta-synthase  43.52 
 
 		 469 aa  280  5e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1927  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  35.15 
 
 		 453 aa  270  5.9999999999999995e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8566  cystathionine beta-synthase  39.91 
 
 		 456 aa  268  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6424  cystathionine beta-synthase  41.1 
 
 		 463 aa  265  2e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.510477  normal  0.13322 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0700  cystathionine beta-synthase  40.52 
 
 		 456 aa  261  2e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4422  cystathionine beta-synthase  40.17 
 
 		 455 aa  256  8e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1048  cystathionine beta-synthase  39.56 
 
 		 455 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0855  cystathionine beta-synthase  39.26 
 
 		 456 aa  252  1e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0877269 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0644  cystathionine beta-synthase  37.88 
 
 		 463 aa  250  5e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3667  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  34.96 
 
 		 496 aa  248  1e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.699338  normal  0.0676519 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4209  cystathionine beta-synthase  39.96 
 
 		 464 aa  247  3e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0912  cystathionine beta-synthase  38.61 
 
 		 456 aa  246  9e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.78601 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31890  cystathionine beta-synthase  40.04 
 
 		 457 aa  243  7e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.499085  normal  0.354911 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0375  cystathionine beta-synthase  39.87 
 
 		 462 aa  241  2e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.457937 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3152  cystathionine beta-synthase  39.52 
 
 		 460 aa  241  2.9999999999999997e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.676366  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0925  cystathionine beta-synthase  40.34 
 
 		 468 aa  239  6.999999999999999e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.731257 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77227  cystathionine beta-synthase  34.74 
 
 		 494 aa  236  5.0000000000000005e-61  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1082  cystathionine beta-synthase  38.91 
 
 		 454 aa  235  1.0000000000000001e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3118  cystathionine beta-synthase  38.16 
 
 		 456 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000273151 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5829  cystathionine beta-synthase  34.44 
 
 		 458 aa  234  2.0000000000000002e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.454339 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0083  cystathionine beta-synthase  37.96 
 
 		 458 aa  233  4.0000000000000004e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1617  cystathionine beta-synthase  37.8 
 
 		 464 aa  233  5e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2830  cystathionine beta-synthase  41.43 
 
 		 332 aa  232  8.000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.908849  normal  0.0512396 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1718  cysteine synthase A  44.65 
 
 		 338 aa  232  8.000000000000001e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.858313  normal  0.306784 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0939  cystathionine beta-synthase  37.23 
 
 		 462 aa  232  8.000000000000001e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44231  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1434  Cysteine synthase  32.37 
 
 		 453 aa  230  5e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.700608 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0438  cystathionine beta-synthase  37.12 
 
 		 455 aa  229  7e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0276  cysteine synthase A  44.62 
 
 		 324 aa  229  1e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.146971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_42003  predicted protein  39.95 
 
 		 469 aa  229  1e-58  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0943  cystathionine beta-synthase  37.55 
 
 		 454 aa  228  1e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1054  cystathionine beta-synthase  38.56 
 
 		 465 aa  227  4e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.655144 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3062  cystathionine beta-synthase  36.11 
 
 		 461 aa  227  4e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0923483  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11095  cystathionine beta-synthase CBS  37.47 
 
 		 464 aa  224  2e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000328093  normal  0.348251 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1655  cysteine synthase  43.69 
 
 		 315 aa  224  2e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.561904  normal  0.310159 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3360  cysteine synthase A  42.86 
 
 		 324 aa  224  2e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.359843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3819  cysteine synthase A  42.99 
 
 		 324 aa  224  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5010  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  43.61 
 
 		 325 aa  224  3e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.278031  normal  0.209222 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4149  cystathionine beta-synthase  37.53 
 
 		 464 aa  224  3e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0798519  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4224  cystathionine beta-synthase  37.53 
 
 		 464 aa  224  3e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4380  cystathionine beta-synthase  37.31 
 
 		 464 aa  223  7e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.558337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1666  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  42.39 
 
 		 348 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.44586 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1694  cysteine synthase A  43.03 
 
 		 331 aa  222  9.999999999999999e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1387  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  42.94 
 
 		 348 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1990  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  41.93 
 
 		 326 aa  221  1.9999999999999999e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5839  cysteine synthase A  44.2 
 
 		 324 aa  221  3e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1100  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  43.45 
 
 		 349 aa  221  3e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2762  cystathionine beta-synthase  34.4 
 
 		 461 aa  220  5e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00303095 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1391  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  42.72 
 
 		 348 aa  218  1e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108416 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1157  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  42.37 
 
 		 326 aa  219  1e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1804  cysteine synthase A  41.9 
 
 		 334 aa  218  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1275  cysteine synthase A  42.19 
 
 		 345 aa  217  2.9999999999999998e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.175602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2043  cystathionine beta-synthase  37.31 
 
 		 464 aa  218  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.140313  normal  0.388176 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05820  Cystathionine beta-synthase (EC 4.2.1.22) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:B2LXT5]  36.22 
 
 		 535 aa  216  5e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.555504 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1560  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  43.75 
 
 		 302 aa  216  5e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.180171  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4674  cystathionine beta-synthase  36.83 
 
 		 464 aa  217  5e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202958 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3958  cysteine synthase A  41.93 
 
 		 332 aa  216  8e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.328768 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00130  cystathionine beta-synthase  37.04 
 
 		 326 aa  214  2.9999999999999995e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2671  cystathionine beta-synthase  38.22 
 
 		 468 aa  213  3.9999999999999995e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2125  cystathionine beta-synthase  41.56 
 
 		 316 aa  212  1e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.700222  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4194  cysteine synthase  40.06 
 
 		 340 aa  212  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.360882 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1534  cysteine synthase A  42.68 
 
 		 325 aa  212  1e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.393204  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0059  putative cystathionine beta-synthase  41.25 
 
 		 316 aa  211  2e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.857844  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0499  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  40.77 
 
 		 343 aa  211  2e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.377757 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2922  cysteine synthase A  40.62 
 
 		 336 aa  211  3e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.195824 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1347  cysteine synthase A  40.06 
 
 		 324 aa  211  3e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0350194 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1121  cysteine synthase A  39.58 
 
 		 332 aa  211  3e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2323  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  41.12 
 
 		 343 aa  211  3e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.03827 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1525  cysteine synthase A  40.43 
 
 		 352 aa  210  5e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.19401 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1087  cysteine synthase  41.5 
 
 		 303 aa  209  7e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.542203  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0152  cysteine synthase  39.81 
 
 		 310 aa  209  8e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0170  cysteine synthase family protein  37.09 
 
 		 302 aa  209  8e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0535  cysteine synthase A  38.82 
 
 		 310 aa  207  2e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.775182  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1493  cysteine synthase A  40.67 
 
 		 333 aa  207  2e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.464198 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0548  cysteine synthase A  38.82 
 
 		 310 aa  207  2e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2178  Cysteine synthase  30.85 
 
 		 466 aa  207  3e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4742  cysteine synthase A  39.56 
 
 		 326 aa  207  3e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4559  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  40.19 
 
 		 328 aa  207  4e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2557  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  35.19 
 
 		 346 aa  206  5e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>