More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl2880 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp3022  hypothetical protein  99.68 
 
 
316 aa  647    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2880  hypothetical protein  100 
 
 
316 aa  650    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2125  cystathionine beta-synthase  72.47 
 
 
316 aa  459  9.999999999999999e-129  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.700222  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0059  putative cystathionine beta-synthase  71.84 
 
 
316 aa  456  1e-127  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.857844  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5286  cystathionine beta-synthase  65.61 
 
 
459 aa  426  1e-118  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.153908  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_42003  predicted protein  66.88 
 
 
469 aa  409  1e-113  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77227  cystathionine beta-synthase  58.75 
 
 
494 aa  355  3.9999999999999996e-97  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05820  Cystathionine beta-synthase (EC 4.2.1.22) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:B2LXT5]  55.25 
 
 
535 aa  330  2e-89  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.555504 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4156  cystathionine beta-synthase  51.12 
 
 
461 aa  325  6e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.884438 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2830  cystathionine beta-synthase  46.58 
 
 
332 aa  295  9e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.908849  normal  0.0512396 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4422  cystathionine beta-synthase  46.65 
 
 
455 aa  292  5e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3706  cystathionine beta-synthase  46.71 
 
 
459 aa  291  1e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3763  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  46.08 
 
 
459 aa  288  1e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3846  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  45.77 
 
 
459 aa  286  4e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3846  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  45.77 
 
 
459 aa  285  9e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.692652  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1990  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  48.12 
 
 
326 aa  281  1e-74  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06170  cystathionine beta-synthase, putative  45.8 
 
 
398 aa  277  2e-73  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.504616  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3718  cystathionine beta-synthase  45.2 
 
 
463 aa  277  2e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000446047  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8566  cystathionine beta-synthase  46.52 
 
 
456 aa  276  3e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0908  cystathionine beta-synthase  47.63 
 
 
469 aa  276  3e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0943  cystathionine beta-synthase  47.63 
 
 
454 aa  271  1e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2762  cystathionine beta-synthase  46.25 
 
 
461 aa  271  1e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00303095 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0644  cystathionine beta-synthase  47.28 
 
 
463 aa  270  2e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0700  cystathionine beta-synthase  46.01 
 
 
456 aa  270  2e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00130  cystathionine beta-synthase  45.17 
 
 
326 aa  268  7e-71  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0855  cystathionine beta-synthase  45.08 
 
 
456 aa  266  2.9999999999999995e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0877269 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4209  cystathionine beta-synthase  45.25 
 
 
464 aa  265  7e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1082  cystathionine beta-synthase  47.76 
 
 
454 aa  265  7e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0488  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  43.48 
 
 
456 aa  265  7e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5829  cystathionine beta-synthase  45.82 
 
 
458 aa  263  2e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.454339 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1048  cystathionine beta-synthase  44.62 
 
 
455 aa  264  2e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3062  cystathionine beta-synthase  44.69 
 
 
461 aa  263  3e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0923483  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0912  cystathionine beta-synthase  44.44 
 
 
456 aa  263  4e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.78601 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1157  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  49.06 
 
 
326 aa  261  1e-68  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3118  cystathionine beta-synthase  45.57 
 
 
456 aa  259  4e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000273151 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1617  cystathionine beta-synthase  46.65 
 
 
464 aa  259  5.0000000000000005e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6424  cystathionine beta-synthase  43.75 
 
 
463 aa  258  1e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.510477  normal  0.13322 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4149  cystathionine beta-synthase  46.84 
 
 
464 aa  258  1e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0798519  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4224  cystathionine beta-synthase  46.84 
 
 
464 aa  258  1e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4380  cystathionine beta-synthase  46.52 
 
 
464 aa  257  2e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.558337  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0083  cystathionine beta-synthase  44.51 
 
 
458 aa  257  2e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31890  cystathionine beta-synthase  46.96 
 
 
457 aa  256  3e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.499085  normal  0.354911 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1927  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  44.24 
 
 
453 aa  256  3e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08106  putative cystathionine beta-synthase  40.43 
 
 
345 aa  255  6e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.434389  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0438  cystathionine beta-synthase  46.33 
 
 
455 aa  255  7e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0081  cysteine synthase A  47.02 
 
 
301 aa  254  1.0000000000000001e-66  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.130263  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3152  cystathionine beta-synthase  47.08 
 
 
460 aa  253  3e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.676366  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03155  cystathionine beta-synthase  41.3 
 
 
464 aa  252  6e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.140599  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2043  cystathionine beta-synthase  46.65 
 
 
464 aa  251  8.000000000000001e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.140313  normal  0.388176 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  43.19 
 
 
312 aa  251  1e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2600  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  40.38 
 
 
465 aa  251  1e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0422691  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0914  cysteine synthase  42.99 
 
 
355 aa  251  2e-65  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.141926  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0170  cysteine synthase family protein  46.33 
 
 
302 aa  251  2e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2475  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  45.92 
 
 
307 aa  249  3e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1228  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  45.54 
 
 
302 aa  250  3e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17600  cystathionine beta-synthase  44.3 
 
 
521 aa  250  3e-65  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11095  cystathionine beta-synthase CBS  45.25 
 
 
464 aa  248  9e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000328093  normal  0.348251 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3667  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  44.86 
 
 
496 aa  248  1e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.699338  normal  0.0676519 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2500  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  41.47 
 
 
315 aa  247  2e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4674  cystathionine beta-synthase  46.33 
 
 
464 aa  247  2e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.202958 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3248  cystathionine beta-synthase  38.87 
 
 
479 aa  246  4e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.564607 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2671  cystathionine beta-synthase  43.12 
 
 
468 aa  246  4e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2557  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  39.81 
 
 
346 aa  245  6e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  42.52 
 
 
312 aa  245  6.999999999999999e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0717  cysteine synthase A  45.36 
 
 
321 aa  245  6.999999999999999e-64  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00067142  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0978  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  44.82 
 
 
307 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0925  cystathionine beta-synthase  44.1 
 
 
468 aa  244  9.999999999999999e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.731257 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1560  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  44.22 
 
 
302 aa  244  9.999999999999999e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.180171  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0152  cysteine synthase  43.29 
 
 
310 aa  243  3e-63  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0535  cysteine synthase A  43.81 
 
 
310 aa  242  6e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.775182  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0548  cysteine synthase A  43.81 
 
 
310 aa  242  6e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0375  cystathionine beta-synthase  46.03 
 
 
462 aa  242  6e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.457937 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4220  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  42.86 
 
 
307 aa  241  9e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4492  O-acetylserine lyase  42.86 
 
 
307 aa  241  1e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.986798  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0939  cystathionine beta-synthase  42.81 
 
 
462 aa  241  1e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44231  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05220  cystathionine beta-synthase  38.87 
 
 
457 aa  241  2e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4455  O-acetylserine lyase  42.86 
 
 
307 aa  239  4e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0499  cystathionine beta-synthase  38.87 
 
 
457 aa  239  4e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3085  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  43.18 
 
 
307 aa  239  5e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.520498  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0744  O-acetylserine lyase  42.53 
 
 
307 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4269  O-acetylserine lyase  42.53 
 
 
307 aa  238  6.999999999999999e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4106  cysteine synthase  42.53 
 
 
307 aa  238  6.999999999999999e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4117  cysteine synthase  42.53 
 
 
307 aa  238  6.999999999999999e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4453  O-acetylserine lyase  42.53 
 
 
307 aa  238  6.999999999999999e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4601  O-acetylserine lyase  42.53 
 
 
307 aa  238  6.999999999999999e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0433  cysteine synthase K/M/A  42.86 
 
 
307 aa  238  9e-62  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.818582  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4506  O-acetylserine lyase  42.53 
 
 
307 aa  238  1e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0207318  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0822  cysteine synthase A  44.63 
 
 
308 aa  236  3e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.326455 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0166  cysteine synthase family protein  47 
 
 
302 aa  236  5.0000000000000005e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0964  cysteine synthase  43.09 
 
 
320 aa  235  9e-61  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274794  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1829  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  38.46 
 
 
333 aa  234  1.0000000000000001e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0936757  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2956  cystathionine beta-synthase  44.95 
 
 
465 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.192465  normal  0.0470778 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2871  cysteine synthase A  45.05 
 
 
318 aa  233  3e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1054  cystathionine beta-synthase  43.08 
 
 
465 aa  231  1e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.655144 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1385  cysteine synthase  41.75 
 
 
311 aa  231  1e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.9014  normal  0.484311 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2430  pyridoxal-phosphate dependent enzyme family protein  42.17 
 
 
327 aa  230  2e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00735557  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  43.28 
 
 
311 aa  230  2e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1135  cysteine synthase A  41.56 
 
 
320 aa  229  3e-59  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0019697  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1434  Cysteine synthase  40.92 
 
 
453 aa  230  3e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.700608 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_953  cysteine synthase  41.45 
 
 
320 aa  230  3e-59  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000343054  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>