More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2600 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2600  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  100 
 
 		 465 aa  942    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0422691  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0787  cystathionine beta-synthase  66 
 
 		 454 aa  593  1e-168  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.40993  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03155  cystathionine beta-synthase  61.11 
 
 		 464 aa  585  1e-166  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.140599  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0488  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  60.67 
 
 		 456 aa  582  1.0000000000000001e-165  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1627  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  61.42 
 
 		 455 aa  577  1.0000000000000001e-163  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000745759 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0499  cystathionine beta-synthase  62.05 
 
 		 457 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05220  cystathionine beta-synthase  61.61 
 
 		 457 aa  571  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3248  cystathionine beta-synthase  60.26 
 
 		 479 aa  568  1e-161  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.564607 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4907  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  60.13 
 
 		 479 aa  561  1e-158  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1770  cystathionine beta-synthase  61.92 
 
 		 456 aa  554  1e-156  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00709311  hitchhiker  0.000202602 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3378  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  61.69 
 
 		 461 aa  542  1e-153  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.19393  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3442  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  61.02 
 
 		 461 aa  537  1e-151  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3300  cystathionine beta-synthase  60.4 
 
 		 464 aa  533  1e-150  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1633  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  54.67 
 
 		 456 aa  523  1e-147  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1704  cystathionine beta-synthase  54.89 
 
 		 456 aa  522  1e-147  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4156  cystathionine beta-synthase  41.59 
 
 		 461 aa  349  5e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.884438 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3718  cystathionine beta-synthase  41.15 
 
 		 463 aa  331  1e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000446047  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5286  cystathionine beta-synthase  40.92 
 
 		 459 aa  330  3e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.153908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3846  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  41.79 
 
 		 459 aa  323  3e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3706  cystathionine beta-synthase  41.79 
 
 		 459 aa  322  7e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3763  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  41.58 
 
 		 459 aa  322  9.999999999999999e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0908  cystathionine beta-synthase  43.92 
 
 		 469 aa  320  3e-86  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8566  cystathionine beta-synthase  40.96 
 
 		 456 aa  313  5.999999999999999e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3846  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  40.35 
 
 		 459 aa  310  2.9999999999999997e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.692652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4422  cystathionine beta-synthase  41.05 
 
 		 455 aa  307  3e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1927  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  36.7 
 
 		 453 aa  306  6e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1048  cystathionine beta-synthase  41.77 
 
 		 455 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0700  cystathionine beta-synthase  41.36 
 
 		 456 aa  303  6.000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6424  cystathionine beta-synthase  41.65 
 
 		 463 aa  294  2e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.510477  normal  0.13322 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0438  cystathionine beta-synthase  40.56 
 
 		 455 aa  293  6e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0644  cystathionine beta-synthase  39.39 
 
 		 463 aa  291  1e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4209  cystathionine beta-synthase  40.43 
 
 		 464 aa  292  1e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3118  cystathionine beta-synthase  42.05 
 
 		 456 aa  292  1e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000273151 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0083  cystathionine beta-synthase  40.48 
 
 		 458 aa  290  4e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5829  cystathionine beta-synthase  36.73 
 
 		 458 aa  288  2e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.454339 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0855  cystathionine beta-synthase  39.91 
 
 		 456 aa  284  3.0000000000000004e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0877269 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31890  cystathionine beta-synthase  41.76 
 
 		 457 aa  282  8.000000000000001e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.499085  normal  0.354911 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3667  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  36.59 
 
 		 496 aa  281  1e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.699338  normal  0.0676519 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0925  cystathionine beta-synthase  40.69 
 
 		 468 aa  281  2e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.731257 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0943  cystathionine beta-synthase  39.05 
 
 		 454 aa  280  3e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1617  cystathionine beta-synthase  39.14 
 
 		 464 aa  279  8e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0912  cystathionine beta-synthase  39.26 
 
 		 456 aa  278  2e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.78601 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3152  cystathionine beta-synthase  39.69 
 
 		 460 aa  277  2e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.676366  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1694  cysteine synthase A  46.54 
 
 		 331 aa  277  3e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0375  cystathionine beta-synthase  40.48 
 
 		 462 aa  274  2.0000000000000002e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.457937 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2043  cystathionine beta-synthase  39.09 
 
 		 464 aa  273  7e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.140313  normal  0.388176 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0939  cystathionine beta-synthase  39.37 
 
 		 462 aa  271  1e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44231  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1082  cystathionine beta-synthase  39.74 
 
 		 454 aa  271  2e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3062  cystathionine beta-synthase  37.9 
 
 		 461 aa  269  1e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0923483  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77227  cystathionine beta-synthase  37.17 
 
 		 494 aa  268  2e-70  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4149  cystathionine beta-synthase  38.88 
 
 		 464 aa  268  2e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0798519  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4224  cystathionine beta-synthase  38.88 
 
 		 464 aa  268  2e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4380  cystathionine beta-synthase  38.66 
 
 		 464 aa  267  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.558337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2830  cystathionine beta-synthase  42.9 
 
 		 332 aa  265  8.999999999999999e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.908849  normal  0.0512396 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1434  Cysteine synthase  33.78 
 
 		 453 aa  265  1e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.700608 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2671  cystathionine beta-synthase  38.61 
 
 		 468 aa  265  2e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4674  cystathionine beta-synthase  37.8 
 
 		 464 aa  263  4.999999999999999e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202958 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2762  cystathionine beta-synthase  36.83 
 
 		 461 aa  261  2e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00303095 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11095  cystathionine beta-synthase CBS  38.44 
 
 		 464 aa  258  1e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000328093  normal  0.348251 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1804  cysteine synthase A  43.61 
 
 		 334 aa  256  6e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2557  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  38.01 
 
 		 346 aa  256  8e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1990  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  45.31 
 
 		 326 aa  254  3e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1054  cystathionine beta-synthase  38.96 
 
 		 465 aa  253  5.000000000000001e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.655144 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_42003  predicted protein  37.26 
 
 		 469 aa  253  6e-66  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1829  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  40.5 
 
 		 333 aa  253  7e-66  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0936757  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00130  cystathionine beta-synthase  38.94 
 
 		 326 aa  250  3e-65  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08106  putative cystathionine beta-synthase  37.07 
 
 		 345 aa  250  5e-65  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.434389  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0276  cysteine synthase A  44.03 
 
 		 324 aa  248  2e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.146971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3360  cysteine synthase A  42.81 
 
 		 324 aa  248  2e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.359843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1718  cysteine synthase A  42.25 
 
 		 338 aa  248  2e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.858313  normal  0.306784 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3819  cysteine synthase A  42.06 
 
 		 324 aa  246  6e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0171  cysteine synthase A  42.77 
 
 		 372 aa  244  3e-63  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2956  cystathionine beta-synthase  38.13 
 
 		 465 aa  244  3e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.192465  normal  0.0470778 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5010  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  42.19 
 
 		 325 aa  243  7.999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.278031  normal  0.209222 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5839  cysteine synthase A  42.59 
 
 		 324 aa  241  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1560  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  47.85 
 
 		 302 aa  240  2.9999999999999997e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.180171  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0170  cysteine synthase family protein  40.53 
 
 		 302 aa  240  2.9999999999999997e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4742  cysteine synthase A  40.44 
 
 		 326 aa  240  5e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05820  Cystathionine beta-synthase (EC 4.2.1.22) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:B2LXT5]  42.5 
 
 		 535 aa  238  1e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.555504 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3958  cysteine synthase A  42.54 
 
 		 332 aa  239  1e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.328768 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1157  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  41.18 
 
 		 326 aa  238  2e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1121  cysteine synthase A  40.44 
 
 		 332 aa  237  4e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4638  cysteine synthase A  39.56 
 
 		 325 aa  237  4e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000171052 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1347  cysteine synthase A  39.62 
 
 		 324 aa  236  6e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0350194 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1534  cysteine synthase A  41.25 
 
 		 325 aa  236  9e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.393204  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0059  putative cystathionine beta-synthase  40.38 
 
 		 316 aa  234  2.0000000000000002e-60  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.857844  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2125  cystathionine beta-synthase  41.01 
 
 		 316 aa  233  4.0000000000000004e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.700222  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4559  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  38.87 
 
 		 328 aa  233  7.000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0914  cysteine synthase  41.74 
 
 		 355 aa  232  8.000000000000001e-60  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.141926  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1363  cysteine synthase A  41.12 
 
 		 346 aa  231  2e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1493  cysteine synthase A  41.74 
 
 		 333 aa  231  3e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.464198 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4194  cysteine synthase  39.81 
 
 		 340 aa  230  4e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.360882 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1275  cysteine synthase A  41.01 
 
 		 345 aa  228  1e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.175602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2094  cysteine synthase A  39.75 
 
 		 323 aa  229  1e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2138  cysteine synthase A  39.75 
 
 		 323 aa  229  1e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0152  cysteine synthase  42.95 
 
 		 310 aa  228  2e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1228  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  42.38 
 
 		 302 aa  228  2e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1655  cysteine synthase  43.87 
 
 		 315 aa  228  2e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.561904  normal  0.310159 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17600  cystathionine beta-synthase  42.45 
 
 		 521 aa  228  2e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1525  cysteine synthase A  39.58 
 
 		 352 aa  227  4e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.19401 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>