More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4674 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_3152  cystathionine beta-synthase  81.56 
 
 
460 aa  748    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.676366  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4422  cystathionine beta-synthase  75.11 
 
 
455 aa  687    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2043  cystathionine beta-synthase  94.58 
 
 
464 aa  853    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.140313  normal  0.388176 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2671  cystathionine beta-synthase  70.97 
 
 
468 aa  639    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31890  cystathionine beta-synthase  70.09 
 
 
457 aa  636    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.499085  normal  0.354911 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4674  cystathionine beta-synthase  100 
 
 
464 aa  927    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.202958 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11095  cystathionine beta-synthase CBS  87.5 
 
 
464 aa  798    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000328093  normal  0.348251 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4224  cystathionine beta-synthase  91.16 
 
 
464 aa  836    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4380  cystathionine beta-synthase  91.38 
 
 
464 aa  837    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.558337  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1082  cystathionine beta-synthase  74.02 
 
 
454 aa  655    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1617  cystathionine beta-synthase  83.41 
 
 
464 aa  764    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4149  cystathionine beta-synthase  91.16 
 
 
464 aa  836    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0798519  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0925  cystathionine beta-synthase  72.3 
 
 
468 aa  647    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.731257 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8566  cystathionine beta-synthase  68.85 
 
 
456 aa  629  1e-179  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0700  cystathionine beta-synthase  69 
 
 
456 aa  626  1e-178  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4209  cystathionine beta-synthase  69.85 
 
 
464 aa  622  1e-177  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0855  cystathionine beta-synthase  68.93 
 
 
456 aa  623  1e-177  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0877269 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0644  cystathionine beta-synthase  69.8 
 
 
463 aa  615  1e-175  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1048  cystathionine beta-synthase  67.69 
 
 
455 aa  616  1e-175  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1054  cystathionine beta-synthase  71.22 
 
 
465 aa  617  1e-175  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.655144 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0912  cystathionine beta-synthase  67.83 
 
 
456 aa  617  1e-175  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.78601 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0943  cystathionine beta-synthase  68.12 
 
 
454 aa  607  9.999999999999999e-173  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0083  cystathionine beta-synthase  66.81 
 
 
458 aa  607  9.999999999999999e-173  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3062  cystathionine beta-synthase  67.31 
 
 
461 aa  602  1.0000000000000001e-171  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0923483  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0939  cystathionine beta-synthase  69.2 
 
 
462 aa  604  1.0000000000000001e-171  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44231  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0438  cystathionine beta-synthase  68.56 
 
 
455 aa  601  1e-170  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3118  cystathionine beta-synthase  67.69 
 
 
456 aa  594  1e-168  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000273151 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2762  cystathionine beta-synthase  64.81 
 
 
461 aa  584  1.0000000000000001e-165  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00303095 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6424  cystathionine beta-synthase  63.3 
 
 
463 aa  548  1e-155  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.510477  normal  0.13322 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0375  cystathionine beta-synthase  62.47 
 
 
462 aa  538  1e-151  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.457937 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2956  cystathionine beta-synthase  54.9 
 
 
465 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.192465  normal  0.0470778 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17600  cystathionine beta-synthase  49.9 
 
 
521 aa  440  9.999999999999999e-123  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4156  cystathionine beta-synthase  46.67 
 
 
461 aa  430  1e-119  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.884438 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0908  cystathionine beta-synthase  53.76 
 
 
469 aa  427  1e-118  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5829  cystathionine beta-synthase  45.63 
 
 
458 aa  389  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.454339 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0914  cysteine synthase  64.2 
 
 
355 aa  389  1e-107  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.141926  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1927  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  44.09 
 
 
453 aa  364  2e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3706  cystathionine beta-synthase  45.24 
 
 
459 aa  356  5.999999999999999e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3763  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  44.81 
 
 
459 aa  355  1e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3846  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  44.81 
 
 
459 aa  353  2.9999999999999997e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3718  cystathionine beta-synthase  44.44 
 
 
463 aa  351  2e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000446047  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3846  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  44.9 
 
 
459 aa  350  3e-95  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.692652  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1434  Cysteine synthase  42.67 
 
 
453 aa  348  1e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.700608 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2830  cystathionine beta-synthase  54.15 
 
 
332 aa  342  1e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.908849  normal  0.0512396 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1990  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  54.8 
 
 
326 aa  335  1e-90  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1157  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  57.41 
 
 
326 aa  334  2e-90  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3667  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  41.24 
 
 
496 aa  314  1.9999999999999998e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.699338  normal  0.0676519 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00130  cystathionine beta-synthase  49.24 
 
 
326 aa  309  5.9999999999999995e-83  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5286  cystathionine beta-synthase  39.61 
 
 
459 aa  295  1e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.153908  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2600  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  37.8 
 
 
465 aa  285  8e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0422691  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08106  putative cystathionine beta-synthase  44.51 
 
 
345 aa  284  2.0000000000000002e-75  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.434389  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2557  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  43.73 
 
 
346 aa  282  9e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77227  cystathionine beta-synthase  38.15 
 
 
494 aa  281  1e-74  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2178  Cysteine synthase  34.92 
 
 
466 aa  276  7e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3248  cystathionine beta-synthase  37.36 
 
 
479 aa  273  3e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.564607 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1829  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  44.21 
 
 
333 aa  274  3e-72  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0936757  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1945  Cysteine synthase  34.9 
 
 
457 aa  273  4.0000000000000004e-72  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05220  cystathionine beta-synthase  36.9 
 
 
457 aa  272  1e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0059  putative cystathionine beta-synthase  48.24 
 
 
316 aa  270  4e-71  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.857844  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2125  cystathionine beta-synthase  48.56 
 
 
316 aa  269  5.9999999999999995e-71  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.700222  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0281  CBS  35.16 
 
 
459 aa  268  1e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.076451 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0488  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  36.34 
 
 
456 aa  268  2e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0499  cystathionine beta-synthase  36.46 
 
 
457 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  48.01 
 
 
312 aa  266  4e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03155  cystathionine beta-synthase  36.77 
 
 
464 aa  265  1e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.140599  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_42003  predicted protein  39.91 
 
 
469 aa  264  2e-69  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4194  cysteine synthase  45.54 
 
 
340 aa  261  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.360882 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2500  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  45.07 
 
 
315 aa  261  2e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  47.19 
 
 
312 aa  260  4e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2126  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  34.64 
 
 
457 aa  257  3e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0978  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  44.41 
 
 
307 aa  257  3e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2280  cysteine synthase  33.48 
 
 
459 aa  257  3e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0787  cystathionine beta-synthase  36.92 
 
 
454 aa  256  5e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.40993  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4907  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  35.37 
 
 
479 aa  255  9e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1385  cysteine synthase  44.26 
 
 
311 aa  252  9.000000000000001e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.9014  normal  0.484311 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2430  pyridoxal-phosphate dependent enzyme family protein  44.84 
 
 
327 aa  252  1e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00735557  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2475  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  41.78 
 
 
307 aa  251  2e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05820  Cystathionine beta-synthase (EC 4.2.1.22) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:B2LXT5]  41.59 
 
 
535 aa  250  5e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.555504 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0289  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  43.8 
 
 
510 aa  249  8e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.16012 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0152  cysteine synthase  44.33 
 
 
310 aa  247  3e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0535  cysteine synthase A  44.67 
 
 
310 aa  247  3e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.775182  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0170  cysteine synthase family protein  41.97 
 
 
302 aa  247  3e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0548  cysteine synthase A  44.67 
 
 
310 aa  247  3e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2553  Cysteine synthase  33.41 
 
 
457 aa  246  6.999999999999999e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  45.37 
 
 
311 aa  246  8e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3855  cysteine synthase  48.04 
 
 
344 aa  246  9e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2014  cysteine synthase A  47.92 
 
 
309 aa  245  9.999999999999999e-64  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0113  normal  0.0387372 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3819  cysteine synthase A  42.36 
 
 
324 aa  244  3e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0171  cysteine synthase A  41.8 
 
 
372 aa  243  5e-63  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2880  hypothetical protein  46.2 
 
 
316 aa  243  7e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3360  cysteine synthase A  43.45 
 
 
324 aa  242  9e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.359843  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1694  cysteine synthase A  41.67 
 
 
331 aa  242  1e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3085  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  40.65 
 
 
307 aa  241  2e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.520498  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3022  hypothetical protein  46.01 
 
 
316 aa  240  4e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3378  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  36.83 
 
 
461 aa  240  5e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.19393  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1087  cysteine synthase  45.39 
 
 
303 aa  239  5.999999999999999e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.542203  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0276  cysteine synthase A  41.98 
 
 
324 aa  239  8e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.146971  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1706  cysteine synthase  49.84 
 
 
306 aa  239  8e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000550718  normal  0.263535 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3300  cystathionine beta-synthase  36.83 
 
 
464 aa  238  2e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1633  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  32.63 
 
 
456 aa  237  3e-61  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>