More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1945 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2178  Cysteine synthase  73.96 
 
 		 466 aa  711    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1945  Cysteine synthase  100 
 
 		 457 aa  943    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2280  cysteine synthase  67.61 
 
 		 459 aa  647    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2126  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  66.08 
 
 		 457 aa  625  1e-178  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0281  CBS  63.68 
 
 		 459 aa  617  1e-175  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.076451 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2553  Cysteine synthase  66.08 
 
 		 457 aa  598  1e-170  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1634  CBS  59 
 
 		 457 aa  528  1e-148  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3846  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  36.54 
 
 		 459 aa  298  1e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3763  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  36.76 
 
 		 459 aa  298  1e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3706  cystathionine beta-synthase  36.32 
 
 		 459 aa  298  1e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4156  cystathionine beta-synthase  35.19 
 
 		 461 aa  294  2e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.884438 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3846  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  35.54 
 
 		 459 aa  294  2e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.692652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1927  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  32.75 
 
 		 453 aa  285  1.0000000000000001e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2830  cystathionine beta-synthase  40.24 
 
 		 332 aa  270  4e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.908849  normal  0.0512396 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3718  cystathionine beta-synthase  32.68 
 
 		 463 aa  266  4e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000446047  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4422  cystathionine beta-synthase  34.78 
 
 		 455 aa  266  4e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0908  cystathionine beta-synthase  34.78 
 
 		 469 aa  261  1e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3062  cystathionine beta-synthase  33.83 
 
 		 461 aa  262  1e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0923483  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1617  cystathionine beta-synthase  33.84 
 
 		 464 aa  261  2e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4674  cystathionine beta-synthase  34.9 
 
 		 464 aa  258  1e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202958 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4149  cystathionine beta-synthase  34.33 
 
 		 464 aa  256  4e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0798519  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4224  cystathionine beta-synthase  34.33 
 
 		 464 aa  256  4e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4380  cystathionine beta-synthase  34.12 
 
 		 464 aa  256  8e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.558337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5829  cystathionine beta-synthase  32.17 
 
 		 458 aa  256  9e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.454339 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8566  cystathionine beta-synthase  34.55 
 
 		 456 aa  254  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2762  cystathionine beta-synthase  32.34 
 
 		 461 aa  254  2.0000000000000002e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00303095 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2043  cystathionine beta-synthase  34.84 
 
 		 464 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.140313  normal  0.388176 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1434  Cysteine synthase  32.39 
 
 		 453 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.700608 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0855  cystathionine beta-synthase  33.98 
 
 		 456 aa  251  2e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0877269 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0083  cystathionine beta-synthase  34.98 
 
 		 458 aa  251  2e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1082  cystathionine beta-synthase  34.27 
 
 		 454 aa  251  2e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3667  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  30.68 
 
 		 496 aa  250  3e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.699338  normal  0.0676519 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0700  cystathionine beta-synthase  34.75 
 
 		 456 aa  250  4e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0438  cystathionine beta-synthase  34.27 
 
 		 455 aa  249  1e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3152  cystathionine beta-synthase  34.06 
 
 		 460 aa  248  1e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.676366  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0912  cystathionine beta-synthase  33.99 
 
 		 456 aa  248  2e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.78601 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31890  cystathionine beta-synthase  34.06 
 
 		 457 aa  247  3e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.499085  normal  0.354911 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0939  cystathionine beta-synthase  36.05 
 
 		 462 aa  246  6e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44231  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0644  cystathionine beta-synthase  33.76 
 
 		 463 aa  245  9.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4209  cystathionine beta-synthase  35.31 
 
 		 464 aa  245  9.999999999999999e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11095  cystathionine beta-synthase CBS  34.05 
 
 		 464 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000328093  normal  0.348251 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1048  cystathionine beta-synthase  32.76 
 
 		 455 aa  241  2.9999999999999997e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6424  cystathionine beta-synthase  32.9 
 
 		 463 aa  239  6.999999999999999e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.510477  normal  0.13322 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0943  cystathionine beta-synthase  33.98 
 
 		 454 aa  239  9e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3118  cystathionine beta-synthase  34.98 
 
 		 456 aa  238  1e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000273151 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0375  cystathionine beta-synthase  33.62 
 
 		 462 aa  236  7e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.457937 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0925  cystathionine beta-synthase  33.26 
 
 		 468 aa  231  2e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.731257 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05220  cystathionine beta-synthase  32.45 
 
 		 457 aa  231  2e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00130  cystathionine beta-synthase  35.94 
 
 		 326 aa  231  3e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0499  cystathionine beta-synthase  32.23 
 
 		 457 aa  230  3e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5286  cystathionine beta-synthase  31.96 
 
 		 459 aa  230  4e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.153908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2671  cystathionine beta-synthase  32.77 
 
 		 468 aa  229  8e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3248  cystathionine beta-synthase  32.24 
 
 		 479 aa  228  2e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.564607 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2600  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  32.98 
 
 		 465 aa  222  8e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0422691  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2557  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  34.26 
 
 		 346 aa  221  3e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1990  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  35.74 
 
 		 326 aa  219  8.999999999999998e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4907  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  32.99 
 
 		 479 aa  218  2.9999999999999998e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17600  cystathionine beta-synthase  37.04 
 
 		 521 aa  216  8e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1054  cystathionine beta-synthase  32.2 
 
 		 465 aa  214  2.9999999999999995e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.655144 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77227  cystathionine beta-synthase  30.12 
 
 		 494 aa  211  3e-53  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0488  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  33.76 
 
 		 456 aa  210  5e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0914  cysteine synthase  35.87 
 
 		 355 aa  209  8e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.141926  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1157  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  36.68 
 
 		 326 aa  209  1e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08106  putative cystathionine beta-synthase  33.02 
 
 		 345 aa  207  3e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.434389  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03155  cystathionine beta-synthase  32.73 
 
 		 464 aa  207  3e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.140599  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0787  cystathionine beta-synthase  31.94 
 
 		 454 aa  207  4e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.40993  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1829  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  33.54 
 
 		 333 aa  206  1e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0936757  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2956  cystathionine beta-synthase  31.4 
 
 		 465 aa  204  3e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.192465  normal  0.0470778 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4194  cysteine synthase  35.9 
 
 		 340 aa  203  7e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.360882 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2430  pyridoxal-phosphate dependent enzyme family protein  36.48 
 
 		 327 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00735557  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1770  cystathionine beta-synthase  31.11 
 
 		 456 aa  199  1.0000000000000001e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00709311  hitchhiker  0.000202602 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0059  putative cystathionine beta-synthase  35.51 
 
 		 316 aa  197  2.0000000000000003e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.857844  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2125  cystathionine beta-synthase  35.51 
 
 		 316 aa  196  7e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.700222  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3300  cystathionine beta-synthase  30.16 
 
 		 464 aa  195  1e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3378  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  30.82 
 
 		 461 aa  195  2e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.19393  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3442  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  30.6 
 
 		 461 aa  194  3e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1633  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  31.62 
 
 		 456 aa  191  2.9999999999999997e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1627  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  30.79 
 
 		 455 aa  191  2.9999999999999997e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000745759 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1704  cystathionine beta-synthase  31.62 
 
 		 456 aa  189  7e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4638  cysteine synthase A  33.97 
 
 		 325 aa  189  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000171052 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1804  cysteine synthase A  33.64 
 
 		 334 aa  187  3e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3360  cysteine synthase A  33.01 
 
 		 324 aa  187  3e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.359843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3819  cysteine synthase A  32.37 
 
 		 324 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_42003  predicted protein  29.53 
 
 		 469 aa  183  5.0000000000000004e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5010  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  30.63 
 
 		 325 aa  181  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.278031  normal  0.209222 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4742  cysteine synthase A  33.87 
 
 		 326 aa  181  2.9999999999999997e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2138  cysteine synthase A  33.87 
 
 		 323 aa  180  4e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4559  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  32.91 
 
 		 328 aa  180  4e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2094  cysteine synthase A  33.87 
 
 		 323 aa  180  4e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0822  cysteine synthase A  36.1 
 
 		 308 aa  178  1e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.326455 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2212  cysteine synthase B  36.96 
 
 		 307 aa  178  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199065 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1560  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  34.84 
 
 		 302 aa  177  2e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.180171  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2365  cysteine synthase  37.46 
 
 		 322 aa  177  2e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0276  cysteine synthase A  31.41 
 
 		 324 aa  177  3e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.146971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1347  cysteine synthase A  32.37 
 
 		 324 aa  177  4e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0350194 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3782  cysteine synthase  36 
 
 		 320 aa  177  4e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00462193  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0152  cysteine synthase  34.97 
 
 		 310 aa  176  6e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  34.53 
 
 		 312 aa  176  6e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2500  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  31.72 
 
 		 315 aa  176  6e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0535  cysteine synthase A  34.62 
 
 		 310 aa  175  9.999999999999999e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.775182  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>