More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3855 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3855  cysteine synthase  100 
 
 		 344 aa  686    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1048  cystathionine beta-synthase  54.9 
 
 		 455 aa  298  1e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4422  cystathionine beta-synthase  49.52 
 
 		 455 aa  296  3e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0912  cystathionine beta-synthase  52.58 
 
 		 456 aa  291  1e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.78601 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0855  cystathionine beta-synthase  52.26 
 
 		 456 aa  291  1e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0877269 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0644  cystathionine beta-synthase  51.27 
 
 		 463 aa  289  4e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4156  cystathionine beta-synthase  45.98 
 
 		 461 aa  288  8e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.884438 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0700  cystathionine beta-synthase  52.09 
 
 		 456 aa  288  9e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8566  cystathionine beta-synthase  50 
 
 		 456 aa  283  3.0000000000000004e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0083  cystathionine beta-synthase  51.23 
 
 		 458 aa  283  4.0000000000000003e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3062  cystathionine beta-synthase  50.16 
 
 		 461 aa  276  3e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0923483  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2762  cystathionine beta-synthase  48.59 
 
 		 461 aa  275  7e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00303095 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0943  cystathionine beta-synthase  49.68 
 
 		 454 aa  275  9e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3118  cystathionine beta-synthase  53.53 
 
 		 456 aa  273  3e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000273151 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31890  cystathionine beta-synthase  51.12 
 
 		 457 aa  270  2e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.499085  normal  0.354911 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4209  cystathionine beta-synthase  50 
 
 		 464 aa  269  5e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0438  cystathionine beta-synthase  51.92 
 
 		 455 aa  268  1e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3152  cystathionine beta-synthase  51.13 
 
 		 460 aa  267  2e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.676366  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2671  cystathionine beta-synthase  48.9 
 
 		 468 aa  265  8.999999999999999e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4380  cystathionine beta-synthase  50.16 
 
 		 464 aa  264  2e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.558337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0939  cystathionine beta-synthase  49.69 
 
 		 462 aa  264  2e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44231  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4149  cystathionine beta-synthase  49.84 
 
 		 464 aa  263  3e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0798519  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4224  cystathionine beta-synthase  49.84 
 
 		 464 aa  263  3e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6424  cystathionine beta-synthase  50.96 
 
 		 463 aa  262  6e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.510477  normal  0.13322 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1082  cystathionine beta-synthase  49.2 
 
 		 454 aa  258  8e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1617  cystathionine beta-synthase  48.39 
 
 		 464 aa  258  9e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0925  cystathionine beta-synthase  49.38 
 
 		 468 aa  258  1e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.731257 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2043  cystathionine beta-synthase  48.04 
 
 		 464 aa  256  3e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.140313  normal  0.388176 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0375  cystathionine beta-synthase  51.13 
 
 		 462 aa  256  5e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.457937 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17600  cystathionine beta-synthase  49.53 
 
 		 521 aa  255  7e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4674  cystathionine beta-synthase  48.04 
 
 		 464 aa  255  8e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202958 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2600  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  47.15 
 
 		 465 aa  253  3e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0422691  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0908  cystathionine beta-synthase  46.95 
 
 		 469 aa  253  5.000000000000001e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0914  cysteine synthase  47.76 
 
 		 355 aa  252  6e-66  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.141926  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11095  cystathionine beta-synthase CBS  47.39 
 
 		 464 aa  251  1e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000328093  normal  0.348251 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3706  cystathionine beta-synthase  43.71 
 
 		 459 aa  248  1e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3846  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  43.71 
 
 		 459 aa  247  3e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2830  cystathionine beta-synthase  42.51 
 
 		 332 aa  246  3e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.908849  normal  0.0512396 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3763  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  43.4 
 
 		 459 aa  245  6e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3846  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  43.08 
 
 		 459 aa  243  3e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.692652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1927  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  38.94 
 
 		 453 aa  240  2e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00130  cystathionine beta-synthase  40.5 
 
 		 326 aa  238  9e-62  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0787  cystathionine beta-synthase  43.26 
 
 		 454 aa  238  9e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.40993  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3248  cystathionine beta-synthase  44.06 
 
 		 479 aa  238  1e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.564607 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05220  cystathionine beta-synthase  43.75 
 
 		 457 aa  237  2e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0289  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  48.89 
 
 		 510 aa  236  3e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.16012 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0499  cystathionine beta-synthase  43.75 
 
 		 457 aa  235  7e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2956  cystathionine beta-synthase  47.06 
 
 		 465 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.192465  normal  0.0470778 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2634  cysteine synthase B  46.64 
 
 		 303 aa  233  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.031236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2700  cysteine synthase B  46.31 
 
 		 303 aa  233  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.227311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2806  cysteine synthase B  46.64 
 
 		 303 aa  232  8.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2585  cysteine synthase B  45.97 
 
 		 303 aa  230  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2676  cysteine synthase B  45.97 
 
 		 303 aa  230  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5829  cystathionine beta-synthase  39.75 
 
 		 458 aa  229  5e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.454339 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1215  cysteine synthase B  44.08 
 
 		 312 aa  228  9e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4064  cysteine synthase B  42.99 
 
 		 312 aa  228  9e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.606315  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1054  cystathionine beta-synthase  47.68 
 
 		 465 aa  228  9e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.655144 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2576  cysteine synthase B  45.3 
 
 		 303 aa  228  1e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.717552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3718  cystathionine beta-synthase  41.82 
 
 		 463 aa  228  1e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000446047  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1255  cysteine synthase B  44.08 
 
 		 312 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.152363  hitchhiker  0.00382615 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02321  cysteine synthase B (O-acetylserine sulfhydrolase B)  45.3 
 
 		 303 aa  227  2e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1434  Cysteine synthase  41.12 
 
 		 453 aa  227  2e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.700608 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1654  cysteine synthase B  44.08 
 
 		 299 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0738123  normal  0.776685 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02282  hypothetical protein  45.3 
 
 		 303 aa  227  2e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2793  cysteine synthase B  45.3 
 
 		 303 aa  227  2e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2557  cysteine synthase B  45.3 
 
 		 303 aa  227  2e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1258  cysteine synthase B  45.3 
 
 		 303 aa  227  2e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111513 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1804  cysteine synthase A  43.49 
 
 		 334 aa  226  3e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2707  cysteine synthase B  45.3 
 
 		 303 aa  227  3e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.397465  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37080  cysteine synthase B  43.96 
 
 		 299 aa  226  4e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1100  cysteine synthase B  43.93 
 
 		 297 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2240  cysteine synthase B  44.37 
 
 		 297 aa  226  6e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3651  cysteine synthase B  44.97 
 
 		 303 aa  225  9e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.370065  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1240  cysteine synthase B  44.97 
 
 		 303 aa  224  1e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0351057  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03155  cystathionine beta-synthase  40.81 
 
 		 464 aa  224  2e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.140599  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1087  cysteine synthase  46.2 
 
 		 303 aa  223  4.9999999999999996e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.542203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1694  cysteine synthase A  44.97 
 
 		 331 aa  223  4.9999999999999996e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3277  cysteine synthase B  42.95 
 
 		 293 aa  222  7e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000158492  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1861  cysteine synthase B  42.24 
 
 		 295 aa  222  9e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2947  cysteine synthase B  44.97 
 
 		 303 aa  221  9.999999999999999e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.209095  normal  0.369793 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0797  cysteine synthase B  43.71 
 
 		 299 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0588  cysteine synthase  45.87 
 
 		 303 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0475794 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0064  cysteine synthase B  43.52 
 
 		 295 aa  220  3e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4559  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  41.51 
 
 		 328 aa  220  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4578  cysteine synthase B  43.42 
 
 		 299 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3031  cysteine synthase B  42.24 
 
 		 296 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0964  cysteine synthase  43.65 
 
 		 320 aa  219  5e-56  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274794  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52210  cysteine synthase B  43.42 
 
 		 299 aa  219  5e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.183215 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2937  cysteine synthase B  43 
 
 		 303 aa  219  6e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0276  cysteine synthase A  42.59 
 
 		 324 aa  219  7e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.146971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1646  cysteine synthase B  42.02 
 
 		 303 aa  219  7e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0488  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  39.88 
 
 		 456 aa  219  7.999999999999999e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1899  cysteine synthase B  41.91 
 
 		 295 aa  218  1e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.512952  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1692  cysteine synthase B  43.43 
 
 		 300 aa  218  1e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0768  cysteine synthase B  43.1 
 
 		 293 aa  218  1e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0171  cysteine synthase A  42.01 
 
 		 372 aa  218  1e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0418  cysteine synthase B  42.67 
 
 		 300 aa  217  2e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2984  cysteine synthase B  42.67 
 
 		 300 aa  217  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4907  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  39.69 
 
 		 479 aa  218  2e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  41.21 
 
 		 312 aa  217  2e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>