More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1255 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_1255  cysteine synthase B  100 
 
 		 312 aa  640    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.152363  hitchhiker  0.00382615 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4064  cysteine synthase B  98.39 
 
 		 312 aa  630  1e-180  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.606315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1215  cysteine synthase B  97.44 
 
 		 312 aa  629  1e-179  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1654  cysteine synthase B  99.33 
 
 		 299 aa  609  1e-173  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0738123  normal  0.776685 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4219  cysteine synthase B  88.39 
 
 		 313 aa  568  1e-161  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0547109  normal  0.0641656 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52210  cysteine synthase B  90.6 
 
 		 299 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.183215 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4578  cysteine synthase B  89.26 
 
 		 299 aa  555  1e-157  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3697  cysteine synthase B  83.87 
 
 		 313 aa  543  1e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.703798  hitchhiker  0.00106032 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1692  cysteine synthase B  84.85 
 
 		 300 aa  532  1e-150  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1733  cysteine synthase B  85.81 
 
 		 301 aa  533  1e-150  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.217633  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37080  cysteine synthase B  84.85 
 
 		 299 aa  531  1e-150  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2240  cysteine synthase B  76.03 
 
 		 297 aa  476  1e-133  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1100  cysteine synthase B  74.66 
 
 		 297 aa  470  1.0000000000000001e-131  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1251  cysteine synthase B  75.59 
 
 		 297 aa  468  1.0000000000000001e-131  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.122681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1861  cysteine synthase B  73.29 
 
 		 295 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0964  cysteine synthase B  72.95 
 
 		 297 aa  455  1e-127  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0797  cysteine synthase B  71.43 
 
 		 299 aa  454  1.0000000000000001e-126  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0064  cysteine synthase B  74.32 
 
 		 295 aa  450  1e-125  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1352  cysteine synthase B  72.3 
 
 		 297 aa  449  1e-125  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.078483  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1899  cysteine synthase B  71.58 
 
 		 295 aa  441  1e-123  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.512952  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1636  cysteine synthase B  70.61 
 
 		 298 aa  443  1e-123  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1287  cysteine synthase B  70.95 
 
 		 299 aa  437  9.999999999999999e-123  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.257463 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2239  cysteine synthase B  71.19 
 
 		 296 aa  440  9.999999999999999e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00226796 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0588  cysteine synthase  70.55 
 
 		 303 aa  438  9.999999999999999e-123  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0475794 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3031  cysteine synthase B  69.05 
 
 		 296 aa  435  1e-121  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1306  cysteine synthase B  70.65 
 
 		 302 aa  432  1e-120  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000334367  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0917  cysteine synthase B  66.11 
 
 		 300 aa  426  1e-118  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4168  cysteine synthase B  67.11 
 
 		 300 aa  424  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1646  cysteine synthase B  66.44 
 
 		 303 aa  424  1e-118  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1014  cysteine synthase B  67.11 
 
 		 300 aa  424  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.440167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0576  cysteine synthase B  67.11 
 
 		 300 aa  424  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.353475  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1055  cysteine synthase B  66.23 
 
 		 325 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0418  cysteine synthase B  66.44 
 
 		 300 aa  423  1e-117  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2874  cysteine synthase B  66.44 
 
 		 303 aa  423  1e-117  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.466504  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2560  cysteine synthase B  66.44 
 
 		 300 aa  421  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0211  cysteine synthase B  66.44 
 
 		 303 aa  423  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2984  cysteine synthase B  66.44 
 
 		 300 aa  423  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0935  cysteine synthase B  66.78 
 
 		 300 aa  422  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0754  cysteine synthase B  66.78 
 
 		 300 aa  422  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3011  cysteine synthase B  71.58 
 
 		 292 aa  423  1e-117  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.421236  normal  0.0437724 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3091  cysteine synthase B  71.58 
 
 		 292 aa  422  1e-117  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0134095  normal  0.472051 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0931  cysteine synthase B  66.44 
 
 		 300 aa  421  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2249  cysteine synthase B  67.45 
 
 		 300 aa  423  1e-117  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.138088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3188  cysteine synthase B  71.23 
 
 		 292 aa  422  1e-117  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.124444  normal  0.617635 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2937  cysteine synthase B  66.11 
 
 		 303 aa  422  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2562  cysteine synthase B  66.44 
 
 		 303 aa  423  1e-117  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0938  cysteine synthase B  66.44 
 
 		 303 aa  423  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0858  cysteine synthase B  65.77 
 
 		 300 aa  419  1e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.947605 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3598  cysteine synthase B  71.72 
 
 		 288 aa  417  1e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2221  cysteine synthase B  69.52 
 
 		 295 aa  421  1e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2806  cysteine synthase B  68.97 
 
 		 303 aa  418  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1006  cysteine synthase B  71.23 
 
 		 292 aa  420  1e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000380642  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1100  cysteine synthase B  71.23 
 
 		 292 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00123647  normal  0.0556364 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1067  cysteine synthase B  71.23 
 
 		 292 aa  418  1e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000450075  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0998  cysteine synthase B  70.89 
 
 		 292 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0298171  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02321  cysteine synthase B (O-acetylserine sulfhydrolase B)  69.31 
 
 		 303 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1240  cysteine synthase B  69.31 
 
 		 303 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0351057  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2634  cysteine synthase B  68.97 
 
 		 303 aa  416  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.031236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2576  cysteine synthase B  69.31 
 
 		 303 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.717552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2585  cysteine synthase B  68.97 
 
 		 303 aa  417  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3291  cysteine synthase B  70.89 
 
 		 292 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00528645  normal  0.163316 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1258  cysteine synthase B  69.31 
 
 		 303 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111513 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2557  cysteine synthase B  69.31 
 
 		 303 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2676  cysteine synthase B  68.62 
 
 		 303 aa  416  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2707  cysteine synthase B  69.31 
 
 		 303 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.397465  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1303  cysteine synthase B  68.28 
 
 		 292 aa  416  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.498371  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1296  cysteine synthase B  67.45 
 
 		 300 aa  416  9.999999999999999e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2765  cysteine synthase B  68.28 
 
 		 292 aa  416  9.999999999999999e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.288853  hitchhiker  0.00234405 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02282  hypothetical protein  69.31 
 
 		 303 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2793  cysteine synthase B  69.31 
 
 		 303 aa  416  9.999999999999999e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2700  cysteine synthase B  68.62 
 
 		 303 aa  416  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.227311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0508  cysteine synthase B  67.91 
 
 		 303 aa  413  1e-114  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1412  cysteine synthase B  67.93 
 
 		 292 aa  413  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.203131  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3726  cysteine synthase B  66.44 
 
 		 300 aa  414  1e-114  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0731  cysteine synthase B  65.1 
 
 		 311 aa  412  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.895889 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2947  cysteine synthase B  68.97 
 
 		 303 aa  412  1e-114  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.209095  normal  0.369793 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3651  cysteine synthase B  68.97 
 
 		 303 aa  413  1e-114  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.370065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3172  cysteine synthase B  67.45 
 
 		 300 aa  412  1e-114  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.248825 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0787  cysteine synthase B  64.43 
 
 		 300 aa  414  1e-114  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.280782 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2386  cysteine synthase B  65.2 
 
 		 301 aa  408  1e-113  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.509251  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0664  cysteine synthase B  65.99 
 
 		 301 aa  409  1e-113  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1132  cysteine synthase  66.55 
 
 		 301 aa  409  1e-113  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0134492 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2378  cysteine synthase B  64.43 
 
 		 300 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.098453  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0990  cysteine synthase B  67.11 
 
 		 300 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3277  cysteine synthase B  65.17 
 
 		 293 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000158492  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2993  cysteine synthase B  67.11 
 
 		 300 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.254167  hitchhiker  0.00110964 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2900  cysteine synthase B  65.2 
 
 		 301 aa  406  1.0000000000000001e-112  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1026  cysteine synthase B  65.77 
 
 		 300 aa  406  1.0000000000000001e-112  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1005  cysteine synthase B  65.98 
 
 		 294 aa  401  1e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.817675  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2212  cysteine synthase B  65.2 
 
 		 307 aa  404  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199065 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1987  cysteine synthase B  65.54 
 
 		 306 aa  402  1e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121319 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0768  cysteine synthase B  65.64 
 
 		 293 aa  399  9.999999999999999e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3199  cysteine synthase B  65.86 
 
 		 293 aa  399  9.999999999999999e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.707785  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3453  cysteine synthase B  67.93 
 
 		 293 aa  393  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.176702 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1285  cysteine synthase  65.53 
 
 		 300 aa  390  1e-107  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0346  cysteine synthase B  63.76 
 
 		 318 aa  382  1e-105  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2832  cysteine synthase B  61.94 
 
 		 294 aa  378  1e-104  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2454  cysteine synthase  61.94 
 
 		 294 aa  378  1e-104  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0944548  normal  0.580019 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0380  cysteine synthase B  63.42 
 
 		 318 aa  380  1e-104  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.012156 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0386  cysteine synthase B  65.12 
 
 		 315 aa  377  1e-103  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00653923  unclonable  0.00000000049747 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>