More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5829 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_5829  cystathionine beta-synthase  100 
 
 
458 aa  944    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.454339 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1434  Cysteine synthase  59.56 
 
 
453 aa  553  1e-156  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.700608 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1927  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  58.55 
 
 
453 aa  536  1e-151  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3667  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  56.55 
 
 
496 aa  530  1e-149  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.699338  normal  0.0676519 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00130  cystathionine beta-synthase  68.5 
 
 
326 aa  476  1e-133  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3718  cystathionine beta-synthase  50.88 
 
 
463 aa  436  1e-121  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000446047  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4422  cystathionine beta-synthase  47.62 
 
 
455 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4156  cystathionine beta-synthase  46.94 
 
 
461 aa  403  1e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.884438 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0855  cystathionine beta-synthase  47.42 
 
 
456 aa  402  1e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0877269 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08106  putative cystathionine beta-synthase  56.44 
 
 
345 aa  400  9.999999999999999e-111  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.434389  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0644  cystathionine beta-synthase  48.16 
 
 
463 aa  396  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0912  cystathionine beta-synthase  46.55 
 
 
456 aa  396  1e-109  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.78601 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1082  cystathionine beta-synthase  48.6 
 
 
454 aa  392  1e-108  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8566  cystathionine beta-synthase  46.57 
 
 
456 aa  394  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0083  cystathionine beta-synthase  48.5 
 
 
458 aa  390  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2557  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  52.66 
 
 
346 aa  389  1e-107  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1048  cystathionine beta-synthase  46.78 
 
 
455 aa  390  1e-107  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0908  cystathionine beta-synthase  45.3 
 
 
469 aa  385  1e-106  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0943  cystathionine beta-synthase  47.61 
 
 
454 aa  386  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4209  cystathionine beta-synthase  47.11 
 
 
464 aa  383  1e-105  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1829  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  53.05 
 
 
333 aa  382  1e-105  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0936757  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0438  cystathionine beta-synthase  47.64 
 
 
455 aa  379  1e-104  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2671  cystathionine beta-synthase  46.76 
 
 
468 aa  377  1e-103  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3763  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  43.51 
 
 
459 aa  375  1e-103  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3706  cystathionine beta-synthase  42.83 
 
 
459 aa  375  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1617  cystathionine beta-synthase  46.81 
 
 
464 aa  376  1e-103  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0925  cystathionine beta-synthase  45.49 
 
 
468 aa  372  1e-102  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.731257 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4224  cystathionine beta-synthase  46.7 
 
 
464 aa  374  1e-102  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4149  cystathionine beta-synthase  46.7 
 
 
464 aa  374  1e-102  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0798519  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4380  cystathionine beta-synthase  46.91 
 
 
464 aa  375  1e-102  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.558337  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3062  cystathionine beta-synthase  46.4 
 
 
461 aa  374  1e-102  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0923483  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3846  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  42.86 
 
 
459 aa  374  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2762  cystathionine beta-synthase  45.97 
 
 
461 aa  369  1e-101  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00303095 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6424  cystathionine beta-synthase  45.61 
 
 
463 aa  370  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.510477  normal  0.13322 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2830  cystathionine beta-synthase  53.01 
 
 
332 aa  369  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.908849  normal  0.0512396 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3118  cystathionine beta-synthase  46.14 
 
 
456 aa  371  1e-101  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000273151 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3846  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  43.17 
 
 
459 aa  371  1e-101  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.692652  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0375  cystathionine beta-synthase  46.45 
 
 
462 aa  367  1e-100  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.457937 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11095  cystathionine beta-synthase CBS  46.48 
 
 
464 aa  364  1e-99  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000328093  normal  0.348251 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2043  cystathionine beta-synthase  46.27 
 
 
464 aa  364  2e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.140313  normal  0.388176 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4674  cystathionine beta-synthase  45.63 
 
 
464 aa  363  2e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.202958 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31890  cystathionine beta-synthase  46.02 
 
 
457 aa  363  3e-99  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.499085  normal  0.354911 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0700  cystathionine beta-synthase  44.9 
 
 
456 aa  362  7.0000000000000005e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3152  cystathionine beta-synthase  45.81 
 
 
460 aa  360  2e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.676366  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0939  cystathionine beta-synthase  45.01 
 
 
462 aa  361  2e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44231  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1054  cystathionine beta-synthase  44.12 
 
 
465 aa  343  4e-93  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.655144 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1157  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  53.05 
 
 
326 aa  331  1e-89  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17600  cystathionine beta-synthase  53.33 
 
 
521 aa  315  9.999999999999999e-85  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2956  cystathionine beta-synthase  40.3 
 
 
465 aa  313  4.999999999999999e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.192465  normal  0.0470778 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1990  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  50.92 
 
 
326 aa  312  7.999999999999999e-84  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77227  cystathionine beta-synthase  40.41 
 
 
494 aa  309  6.999999999999999e-83  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0914  cysteine synthase  51.37 
 
 
355 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.141926  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5286  cystathionine beta-synthase  38.63 
 
 
459 aa  307  3e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.153908  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3360  cysteine synthase A  45.09 
 
 
324 aa  293  3e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.359843  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03155  cystathionine beta-synthase  37.53 
 
 
464 aa  288  1e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.140599  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0499  cystathionine beta-synthase  37.19 
 
 
457 aa  288  1e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2600  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  36.73 
 
 
465 aa  288  2e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0422691  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_42003  predicted protein  41.08 
 
 
469 aa  286  4e-76  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3248  cystathionine beta-synthase  34.82 
 
 
479 aa  285  9e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.564607 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3819  cysteine synthase A  45.26 
 
 
324 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0488  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  38.19 
 
 
456 aa  285  2.0000000000000002e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05220  cystathionine beta-synthase  36.75 
 
 
457 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2430  pyridoxal-phosphate dependent enzyme family protein  49.53 
 
 
327 aa  280  3e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00735557  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4907  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  36.92 
 
 
479 aa  280  3e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0276  cysteine synthase A  43.12 
 
 
324 aa  278  2e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.146971  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4194  cysteine synthase  45.77 
 
 
340 aa  277  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.360882 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4742  cysteine synthase A  45.15 
 
 
326 aa  277  2e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1347  cysteine synthase A  44.68 
 
 
324 aa  276  5e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0350194 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5010  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  44.17 
 
 
325 aa  276  5e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.278031  normal  0.209222 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5839  cysteine synthase A  43.6 
 
 
324 aa  273  7e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4638  cysteine synthase A  43.98 
 
 
325 aa  272  1e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000171052 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0787  cystathionine beta-synthase  35.57 
 
 
454 aa  270  5e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.40993  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05820  Cystathionine beta-synthase (EC 4.2.1.22) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:B2LXT5]  40.65 
 
 
535 aa  269  7e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.555504 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0059  putative cystathionine beta-synthase  47.52 
 
 
316 aa  267  2.9999999999999995e-70  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.857844  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2094  cysteine synthase A  43.29 
 
 
323 aa  267  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2138  cysteine synthase A  43.29 
 
 
323 aa  267  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4559  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  42.94 
 
 
328 aa  267  4e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2125  cystathionine beta-synthase  47.52 
 
 
316 aa  266  5e-70  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.700222  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1534  cysteine synthase A  43.26 
 
 
325 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.393204  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1804  cysteine synthase A  42.68 
 
 
334 aa  262  6.999999999999999e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0171  cysteine synthase A  42.64 
 
 
372 aa  262  8.999999999999999e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1633  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  34 
 
 
456 aa  261  3e-68  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1704  cystathionine beta-synthase  34 
 
 
456 aa  259  5.0000000000000005e-68  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2178  Cysteine synthase  32.17 
 
 
466 aa  259  7e-68  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1694  cysteine synthase A  40.61 
 
 
331 aa  256  5e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1718  cysteine synthase A  38.64 
 
 
338 aa  256  6e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.858313  normal  0.306784 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1945  Cysteine synthase  32.17 
 
 
457 aa  256  9e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1627  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  35.82 
 
 
455 aa  254  2.0000000000000002e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000745759 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2907  cysteine synthase A  42.15 
 
 
346 aa  252  7e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.156329  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0281  CBS  32.47 
 
 
459 aa  252  8.000000000000001e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.076451 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1770  cystathionine beta-synthase  34.88 
 
 
456 aa  252  1e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00709311  hitchhiker  0.000202602 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2564  cysteine synthase A  41.98 
 
 
345 aa  251  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.544676  normal  0.832918 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0499  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  40.65 
 
 
343 aa  250  4e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.377757 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2837  cysteine synthase A  41.59 
 
 
345 aa  247  3e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.953672  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2475  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  43.81 
 
 
307 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2871  cysteine synthase A  43.96 
 
 
318 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2553  cysteine synthase A  40.86 
 
 
366 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.0093457  normal  0.73463 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3958  cysteine synthase A  42.41 
 
 
332 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.328768 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2126  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  32.07 
 
 
457 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1439  cysteine synthase A  41.74 
 
 
394 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.159205  normal  0.177571 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>