More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3248 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3248  cystathionine beta-synthase  100 
 
 		 479 aa  976    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.564607 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0499  cystathionine beta-synthase  85.56 
 
 		 457 aa  799    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05220  cystathionine beta-synthase  85.56 
 
 		 457 aa  798    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0787  cystathionine beta-synthase  64.57 
 
 		 454 aa  587  1e-166  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.40993  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0488  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  62.58 
 
 		 456 aa  575  1.0000000000000001e-163  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03155  cystathionine beta-synthase  61.3 
 
 		 464 aa  576  1.0000000000000001e-163  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.140599  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2600  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  60.26 
 
 		 465 aa  568  1e-161  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0422691  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1627  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  61.78 
 
 		 455 aa  561  1.0000000000000001e-159  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000745759 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4907  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  60.57 
 
 		 479 aa  559  1e-158  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3378  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  60.67 
 
 		 461 aa  535  1e-151  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.19393  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3300  cystathionine beta-synthase  60.4 
 
 		 464 aa  531  1e-150  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3442  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  60.22 
 
 		 461 aa  530  1e-149  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1633  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  56.1 
 
 		 456 aa  518  1e-146  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1704  cystathionine beta-synthase  56.32 
 
 		 456 aa  518  1e-146  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1770  cystathionine beta-synthase  58.44 
 
 		 456 aa  516  1.0000000000000001e-145  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00709311  hitchhiker  0.000202602 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4156  cystathionine beta-synthase  41.7 
 
 		 461 aa  353  2.9999999999999997e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.884438 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3718  cystathionine beta-synthase  41.43 
 
 		 463 aa  347  3e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000446047  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0908  cystathionine beta-synthase  42.64 
 
 		 469 aa  308  1.0000000000000001e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3706  cystathionine beta-synthase  37.8 
 
 		 459 aa  304  2.0000000000000002e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3846  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  37.58 
 
 		 459 aa  303  6.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3763  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  37.36 
 
 		 459 aa  300  3e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5286  cystathionine beta-synthase  38.89 
 
 		 459 aa  299  6e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.153908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3846  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  37.03 
 
 		 459 aa  299  6e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.692652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1927  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  35.31 
 
 		 453 aa  291  1e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8566  cystathionine beta-synthase  39.6 
 
 		 456 aa  289  9e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0700  cystathionine beta-synthase  41.01 
 
 		 456 aa  286  5e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5829  cystathionine beta-synthase  34.82 
 
 		 458 aa  285  9e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.454339 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3667  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  36.81 
 
 		 496 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.699338  normal  0.0676519 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1048  cystathionine beta-synthase  41.37 
 
 		 455 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4422  cystathionine beta-synthase  39.43 
 
 		 455 aa  285  2.0000000000000002e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3118  cystathionine beta-synthase  41.1 
 
 		 456 aa  283  5.000000000000001e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000273151 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0644  cystathionine beta-synthase  39.47 
 
 		 463 aa  282  8.000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4209  cystathionine beta-synthase  39.69 
 
 		 464 aa  282  9e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6424  cystathionine beta-synthase  40.56 
 
 		 463 aa  282  9e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.510477  normal  0.13322 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0083  cystathionine beta-synthase  39.87 
 
 		 458 aa  276  4e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3062  cystathionine beta-synthase  38.39 
 
 		 461 aa  276  4e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0923483  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0438  cystathionine beta-synthase  40.13 
 
 		 455 aa  276  8e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1434  Cysteine synthase  35.11 
 
 		 453 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.700608 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0855  cystathionine beta-synthase  39.21 
 
 		 456 aa  270  2.9999999999999997e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0877269 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1617  cystathionine beta-synthase  39.04 
 
 		 464 aa  270  4e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3152  cystathionine beta-synthase  38.95 
 
 		 460 aa  270  5e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.676366  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0943  cystathionine beta-synthase  39.12 
 
 		 454 aa  269  5.9999999999999995e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0912  cystathionine beta-synthase  39.21 
 
 		 456 aa  269  7e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.78601 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2762  cystathionine beta-synthase  36.66 
 
 		 461 aa  267  2.9999999999999995e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00303095 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1082  cystathionine beta-synthase  38.94 
 
 		 454 aa  267  2.9999999999999995e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31890  cystathionine beta-synthase  39.91 
 
 		 457 aa  265  2e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.499085  normal  0.354911 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2043  cystathionine beta-synthase  38.21 
 
 		 464 aa  263  4e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.140313  normal  0.388176 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1694  cysteine synthase A  43.85 
 
 		 331 aa  263  4e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2830  cystathionine beta-synthase  43.96 
 
 		 332 aa  263  6e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.908849  normal  0.0512396 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0925  cystathionine beta-synthase  38.84 
 
 		 468 aa  262  8e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.731257 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77227  cystathionine beta-synthase  39.39 
 
 		 494 aa  262  1e-68  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0939  cystathionine beta-synthase  37.66 
 
 		 462 aa  260  3e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44231  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0375  cystathionine beta-synthase  38.51 
 
 		 462 aa  259  5.0000000000000005e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.457937 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1718  cysteine synthase A  43.67 
 
 		 338 aa  259  5.0000000000000005e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.858313  normal  0.306784 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00130  cystathionine beta-synthase  39.38 
 
 		 326 aa  259  9e-68  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4380  cystathionine beta-synthase  37.58 
 
 		 464 aa  257  3e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.558337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4224  cystathionine beta-synthase  37.36 
 
 		 464 aa  256  7e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4149  cystathionine beta-synthase  37.36 
 
 		 464 aa  256  7e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0798519  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4674  cystathionine beta-synthase  37.36 
 
 		 464 aa  255  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202958 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11095  cystathionine beta-synthase CBS  38.6 
 
 		 464 aa  255  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000328093  normal  0.348251 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05820  Cystathionine beta-synthase (EC 4.2.1.22) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:B2LXT5]  38.19 
 
 		 535 aa  254  2.0000000000000002e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.555504 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08106  putative cystathionine beta-synthase  38.44 
 
 		 345 aa  253  5.000000000000001e-66  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.434389  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4742  cysteine synthase A  39.76 
 
 		 326 aa  252  1e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3958  cysteine synthase A  42.24 
 
 		 332 aa  248  2e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.328768 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2671  cystathionine beta-synthase  37.07 
 
 		 468 aa  246  4.9999999999999997e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2094  cysteine synthase A  40.68 
 
 		 323 aa  246  6e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2138  cysteine synthase A  40.68 
 
 		 323 aa  246  6e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3360  cysteine synthase A  40.99 
 
 		 324 aa  246  9e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.359843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1560  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  46.69 
 
 		 302 aa  245  9.999999999999999e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.180171  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1804  cysteine synthase A  40.06 
 
 		 334 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0171  cysteine synthase A  40.12 
 
 		 372 aa  244  1.9999999999999999e-63  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5839  cysteine synthase A  40.88 
 
 		 324 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3819  cysteine synthase A  40.37 
 
 		 324 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1054  cystathionine beta-synthase  36.5 
 
 		 465 aa  243  3.9999999999999997e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.655144 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4638  cysteine synthase A  38.65 
 
 		 325 aa  243  5e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000171052 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5010  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  40.37 
 
 		 325 aa  243  5e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.278031  normal  0.209222 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1347  cysteine synthase A  38.51 
 
 		 324 aa  243  6e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0350194 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0914  cysteine synthase  41.59 
 
 		 355 aa  241  2e-62  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.141926  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4559  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  38.15 
 
 		 328 aa  240  4e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0276  cysteine synthase A  40.81 
 
 		 324 aa  239  1e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.146971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0170  cysteine synthase family protein  40.67 
 
 		 302 aa  237  4e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1990  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  42.06 
 
 		 326 aa  236  5.0000000000000005e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_42003  predicted protein  35.89 
 
 		 469 aa  236  6e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2557  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  36.45 
 
 		 346 aa  236  7e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2323  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  41.44 
 
 		 343 aa  236  7e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.03827 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2125  cystathionine beta-synthase  40.38 
 
 		 316 aa  236  9e-61  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.700222  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0059  putative cystathionine beta-synthase  40.06 
 
 		 316 aa  236  9e-61  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.857844  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1829  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  35.67 
 
 		 333 aa  234  3e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0936757  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1525  cysteine synthase A  41.49 
 
 		 352 aa  234  3e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.19401 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1121  cysteine synthase A  39.69 
 
 		 332 aa  234  4.0000000000000004e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2756  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  41.37 
 
 		 343 aa  232  1e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2280  cysteine synthase  34.29 
 
 		 459 aa  231  2e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0499  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  41.93 
 
 		 343 aa  230  5e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.377757 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2907  cysteine synthase A  41.61 
 
 		 346 aa  230  5e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.156329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1157  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  39.94 
 
 		 326 aa  229  1e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2837  cysteine synthase A  40.68 
 
 		 345 aa  229  1e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.953672  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1945  Cysteine synthase  32.24 
 
 		 457 aa  228  2e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2178  Cysteine synthase  32.52 
 
 		 466 aa  227  5.0000000000000005e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4194  cysteine synthase  38.41 
 
 		 340 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.360882 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17600  cystathionine beta-synthase  42.12 
 
 		 521 aa  226  6e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>