More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3062 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_2762  cystathionine beta-synthase  89.59 
 
 		 461 aa  823    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00303095 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3062  cystathionine beta-synthase  100 
 
 		 461 aa  929    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0923483  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4422  cystathionine beta-synthase  67.39 
 
 		 455 aa  624  1e-178  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0925  cystathionine beta-synthase  67.95 
 
 		 468 aa  622  1e-177  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.731257 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1082  cystathionine beta-synthase  68.91 
 
 		 454 aa  617  1e-175  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4224  cystathionine beta-synthase  67.81 
 
 		 464 aa  614  1e-175  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4380  cystathionine beta-synthase  68.03 
 
 		 464 aa  615  1e-175  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.558337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4149  cystathionine beta-synthase  67.81 
 
 		 464 aa  614  1e-175  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0798519  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2043  cystathionine beta-synthase  67.38 
 
 		 464 aa  605  9.999999999999999e-173  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.140313  normal  0.388176 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2671  cystathionine beta-synthase  64.74 
 
 		 468 aa  603  1.0000000000000001e-171  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3152  cystathionine beta-synthase  67.17 
 
 		 460 aa  602  1.0000000000000001e-171  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.676366  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1617  cystathionine beta-synthase  66.95 
 
 		 464 aa  603  1.0000000000000001e-171  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4674  cystathionine beta-synthase  67.31 
 
 		 464 aa  601  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202958 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0855  cystathionine beta-synthase  66.02 
 
 		 456 aa  591  1e-168  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0877269 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0700  cystathionine beta-synthase  64.64 
 
 		 456 aa  588  1e-167  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11095  cystathionine beta-synthase CBS  66.31 
 
 		 464 aa  591  1e-167  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000328093  normal  0.348251 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0943  cystathionine beta-synthase  65.73 
 
 		 454 aa  587  1e-166  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1054  cystathionine beta-synthase  66.24 
 
 		 465 aa  587  1e-166  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.655144 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0912  cystathionine beta-synthase  65 
 
 		 456 aa  581  1.0000000000000001e-165  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.78601 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31890  cystathionine beta-synthase  65.08 
 
 		 457 aa  579  1e-164  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.499085  normal  0.354911 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0644  cystathionine beta-synthase  64.94 
 
 		 463 aa  575  1.0000000000000001e-163  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8566  cystathionine beta-synthase  63.2 
 
 		 456 aa  572  1.0000000000000001e-162  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1048  cystathionine beta-synthase  64.29 
 
 		 455 aa  574  1.0000000000000001e-162  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0083  cystathionine beta-synthase  63.58 
 
 		 458 aa  565  1e-160  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4209  cystathionine beta-synthase  62.2 
 
 		 464 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3118  cystathionine beta-synthase  64.29 
 
 		 456 aa  559  1e-158  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000273151 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0438  cystathionine beta-synthase  65.37 
 
 		 455 aa  558  1e-158  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0939  cystathionine beta-synthase  63.89 
 
 		 462 aa  560  1e-158  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44231  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6424  cystathionine beta-synthase  57.91 
 
 		 463 aa  504  1e-141  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.510477  normal  0.13322 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0375  cystathionine beta-synthase  57.97 
 
 		 462 aa  492  9.999999999999999e-139  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.457937 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17600  cystathionine beta-synthase  76.16 
 
 		 521 aa  470  1.0000000000000001e-131  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4156  cystathionine beta-synthase  49.02 
 
 		 461 aa  445  1.0000000000000001e-124  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.884438 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0908  cystathionine beta-synthase  51.4 
 
 		 469 aa  426  1e-118  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2956  cystathionine beta-synthase  52.48 
 
 		 465 aa  410  1e-113  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.192465  normal  0.0470778 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5829  cystathionine beta-synthase  46.4 
 
 		 458 aa  396  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.454339 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0914  cysteine synthase  61.52 
 
 		 355 aa  390  1e-107  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.141926  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3718  cystathionine beta-synthase  45.49 
 
 		 463 aa  368  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000446047  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3846  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  44.19 
 
 		 459 aa  361  1e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3706  cystathionine beta-synthase  43.97 
 
 		 459 aa  358  9e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3763  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  43.76 
 
 		 459 aa  358  9.999999999999999e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3846  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  43.52 
 
 		 459 aa  355  7.999999999999999e-97  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.692652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1157  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  57.7 
 
 		 326 aa  350  3e-95  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1927  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  42.09 
 
 		 453 aa  343  2.9999999999999997e-93  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2830  cystathionine beta-synthase  51.78 
 
 		 332 aa  339  5.9999999999999996e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.908849  normal  0.0512396 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1990  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  54.55 
 
 		 326 aa  339  8e-92  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1434  Cysteine synthase  42.31 
 
 		 453 aa  338  9.999999999999999e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.700608 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3667  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  45 
 
 		 496 aa  332  9e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.699338  normal  0.0676519 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00130  cystathionine beta-synthase  48.05 
 
 		 326 aa  318  1e-85  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77227  cystathionine beta-synthase  46.45 
 
 		 494 aa  315  9e-85  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05220  cystathionine beta-synthase  39.26 
 
 		 457 aa  298  1e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5286  cystathionine beta-synthase  40.71 
 
 		 459 aa  295  1e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.153908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3248  cystathionine beta-synthase  38.39 
 
 		 479 aa  295  2e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.564607 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0499  cystathionine beta-synthase  38.39 
 
 		 457 aa  293  3e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2600  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  37.9 
 
 		 465 aa  289  6e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0422691  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_42003  predicted protein  39.88 
 
 		 469 aa  289  9e-77  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2178  Cysteine synthase  34.32 
 
 		 466 aa  286  7e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0059  putative cystathionine beta-synthase  48.12 
 
 		 316 aa  284  2.0000000000000002e-75  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.857844  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2125  cystathionine beta-synthase  48.44 
 
 		 316 aa  283  3.0000000000000004e-75  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.700222  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0488  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  37.47 
 
 		 456 aa  282  8.000000000000001e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08106  putative cystathionine beta-synthase  44.38 
 
 		 345 aa  282  8.000000000000001e-75  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.434389  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1829  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  43.94 
 
 		 333 aa  281  1e-74  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0936757  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03155  cystathionine beta-synthase  37.47 
 
 		 464 aa  279  6e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.140599  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2557  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  42.11 
 
 		 346 aa  279  9e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1945  Cysteine synthase  33.83 
 
 		 457 aa  276  6e-73  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05820  Cystathionine beta-synthase (EC 4.2.1.22) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:B2LXT5]  42.46 
 
 		 535 aa  271  2.9999999999999997e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.555504 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4907  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  35.04 
 
 		 479 aa  267  2.9999999999999995e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1704  cystathionine beta-synthase  34.48 
 
 		 456 aa  263  3e-69  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1633  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  34.26 
 
 		 456 aa  262  8e-69  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0787  cystathionine beta-synthase  36.44 
 
 		 454 aa  262  1e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.40993  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0170  cysteine synthase family protein  43.55 
 
 		 302 aa  262  1e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1627  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  36.91 
 
 		 455 aa  260  4e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000745759 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3855  cysteine synthase  50.32 
 
 		 344 aa  258  1e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4194  cysteine synthase  44.98 
 
 		 340 aa  256  6e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.360882 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0171  cysteine synthase A  42.42 
 
 		 372 aa  254  2.0000000000000002e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3819  cysteine synthase A  42.94 
 
 		 324 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2880  hypothetical protein  44.69 
 
 		 316 aa  254  3e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1770  cystathionine beta-synthase  36.73 
 
 		 456 aa  254  3e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00709311  hitchhiker  0.000202602 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3378  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  36.5 
 
 		 461 aa  251  1e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.19393  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5010  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  42.73 
 
 		 325 aa  252  1e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.278031  normal  0.209222 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3022  hypothetical protein  44.38 
 
 		 316 aa  251  2e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  44.38 
 
 		 311 aa  251  2e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2430  pyridoxal-phosphate dependent enzyme family protein  44.3 
 
 		 327 aa  250  3e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00735557  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0289  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  47.89 
 
 		 510 aa  251  3e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.16012 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2475  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  42.77 
 
 		 307 aa  250  3e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1385  cysteine synthase  42.95 
 
 		 311 aa  250  3e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.9014  normal  0.484311 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2500  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  43.09 
 
 		 315 aa  249  6e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0276  cysteine synthase A  43.65 
 
 		 324 aa  249  7e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.146971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1560  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  47.37 
 
 		 302 aa  249  8e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.180171  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  43.65 
 
 		 312 aa  248  1e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2280  cysteine synthase  31.69 
 
 		 459 aa  249  1e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0152  cysteine synthase  45.42 
 
 		 310 aa  248  2e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3300  cystathionine beta-synthase  36.11 
 
 		 464 aa  247  4e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1534  cysteine synthase A  43.56 
 
 		 325 aa  246  6e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.393204  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3442  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  36.07 
 
 		 461 aa  246  6.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1336  cysteine synthase A  48.28 
 
 		 311 aa  245  9.999999999999999e-64  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2126  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  32.39 
 
 		 457 aa  245  9.999999999999999e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0535  cysteine synthase A  43.27 
 
 		 310 aa  245  1.9999999999999999e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.775182  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0548  cysteine synthase A  43.27 
 
 		 310 aa  245  1.9999999999999999e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0964  cysteine synthase  44.05 
 
 		 320 aa  243  3.9999999999999997e-63  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274794  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0281  CBS  31.69 
 
 		 459 aa  243  5e-63  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.076451 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>