More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3118 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0700  cystathionine beta-synthase  73.57 
 
 		 456 aa  668    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0644  cystathionine beta-synthase  76.1 
 
 		 463 aa  694    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8566  cystathionine beta-synthase  84.87 
 
 		 456 aa  776    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4422  cystathionine beta-synthase  70.48 
 
 		 455 aa  654    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0855  cystathionine beta-synthase  71.93 
 
 		 456 aa  654    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0877269 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0438  cystathionine beta-synthase  80.66 
 
 		 455 aa  706    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0083  cystathionine beta-synthase  76.37 
 
 		 458 aa  689    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0912  cystathionine beta-synthase  72.63 
 
 		 456 aa  659    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.78601 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3118  cystathionine beta-synthase  100 
 
 		 456 aa  917    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000273151 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1048  cystathionine beta-synthase  82.42 
 
 		 455 aa  737    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31890  cystathionine beta-synthase  73.03 
 
 		 457 aa  647    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.499085  normal  0.354911 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1617  cystathionine beta-synthase  69.13 
 
 		 464 aa  630  1e-179  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3152  cystathionine beta-synthase  68.85 
 
 		 460 aa  625  1e-178  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.676366  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0943  cystathionine beta-synthase  69.32 
 
 		 454 aa  623  1e-177  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4209  cystathionine beta-synthase  70.24 
 
 		 464 aa  617  1e-175  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2043  cystathionine beta-synthase  68.63 
 
 		 464 aa  615  1e-175  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.140313  normal  0.388176 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4224  cystathionine beta-synthase  67.97 
 
 		 464 aa  612  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4380  cystathionine beta-synthase  68.19 
 
 		 464 aa  613  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.558337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4149  cystathionine beta-synthase  67.97 
 
 		 464 aa  612  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0798519  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11095  cystathionine beta-synthase CBS  68.85 
 
 		 464 aa  608  1e-173  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000328093  normal  0.348251 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4674  cystathionine beta-synthase  67.54 
 
 		 464 aa  605  9.999999999999999e-173  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202958 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0925  cystathionine beta-synthase  68.02 
 
 		 468 aa  601  1.0000000000000001e-171  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.731257 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1082  cystathionine beta-synthase  68.94 
 
 		 454 aa  602  1.0000000000000001e-171  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0939  cystathionine beta-synthase  67.68 
 
 		 462 aa  593  1e-168  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44231  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6424  cystathionine beta-synthase  66.81 
 
 		 463 aa  577  1.0000000000000001e-163  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.510477  normal  0.13322 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3062  cystathionine beta-synthase  64.29 
 
 		 461 aa  575  1.0000000000000001e-163  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0923483  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2671  cystathionine beta-synthase  65.03 
 
 		 468 aa  574  1.0000000000000001e-162  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0375  cystathionine beta-synthase  66.08 
 
 		 462 aa  571  1.0000000000000001e-162  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.457937 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2762  cystathionine beta-synthase  62.34 
 
 		 461 aa  565  1e-160  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00303095 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1054  cystathionine beta-synthase  66.09 
 
 		 465 aa  558  1e-158  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.655144 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2956  cystathionine beta-synthase  59.08 
 
 		 465 aa  484  1e-136  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.192465  normal  0.0470778 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0908  cystathionine beta-synthase  56.64 
 
 		 469 aa  460  9.999999999999999e-129  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4156  cystathionine beta-synthase  49.67 
 
 		 461 aa  458  9.999999999999999e-129  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.884438 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17600  cystathionine beta-synthase  67.81 
 
 		 521 aa  414  1e-114  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5829  cystathionine beta-synthase  46.35 
 
 		 458 aa  406  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.454339 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3846  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  47.52 
 
 		 459 aa  404  1e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.692652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3718  cystathionine beta-synthase  47.96 
 
 		 463 aa  393  1e-108  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000446047  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0914  cysteine synthase  60.4 
 
 		 355 aa  392  1e-108  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.141926  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3763  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  45.81 
 
 		 459 aa  389  1e-107  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3706  cystathionine beta-synthase  46.02 
 
 		 459 aa  390  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3846  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  46.38 
 
 		 459 aa  389  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1927  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  44.37 
 
 		 453 aa  382  1e-105  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1434  Cysteine synthase  44.64 
 
 		 453 aa  371  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.700608 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2830  cystathionine beta-synthase  56.7 
 
 		 332 aa  367  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.908849  normal  0.0512396 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3667  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  42.55 
 
 		 496 aa  360  3e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.699338  normal  0.0676519 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1157  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  59.57 
 
 		 326 aa  359  5e-98  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1990  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  56.04 
 
 		 326 aa  343  2e-93  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00130  cystathionine beta-synthase  52.15 
 
 		 326 aa  340  2.9999999999999998e-92  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2600  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  42.05 
 
 		 465 aa  325  1e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0422691  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5286  cystathionine beta-synthase  40.88 
 
 		 459 aa  322  6e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.153908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0488  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  39.05 
 
 		 456 aa  322  7e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05220  cystathionine beta-synthase  41.98 
 
 		 457 aa  322  7e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0499  cystathionine beta-synthase  41.54 
 
 		 457 aa  317  3e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77227  cystathionine beta-synthase  40.4 
 
 		 494 aa  316  4e-85  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03155  cystathionine beta-synthase  38.83 
 
 		 464 aa  316  5e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.140599  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3248  cystathionine beta-synthase  41.1 
 
 		 479 aa  311  1e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.564607 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08106  putative cystathionine beta-synthase  46.79 
 
 		 345 aa  307  3e-82  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.434389  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1829  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  46.95 
 
 		 333 aa  306  4.0000000000000004e-82  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0936757  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0787  cystathionine beta-synthase  40.53 
 
 		 454 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.40993  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1633  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  37.53 
 
 		 456 aa  303  4.0000000000000003e-81  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0289  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  53.55 
 
 		 510 aa  301  1e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.16012 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1704  cystathionine beta-synthase  37.31 
 
 		 456 aa  300  3e-80  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2557  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  44.18 
 
 		 346 aa  297  3e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0059  putative cystathionine beta-synthase  48.73 
 
 		 316 aa  291  1e-77  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.857844  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2125  cystathionine beta-synthase  48.73 
 
 		 316 aa  291  2e-77  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.700222  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1627  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  38.51 
 
 		 455 aa  285  2.0000000000000002e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000745759 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05820  Cystathionine beta-synthase (EC 4.2.1.22) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:B2LXT5]  44.76 
 
 		 535 aa  284  3.0000000000000004e-75  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.555504 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4907  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  36.77 
 
 		 479 aa  282  7.000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2178  Cysteine synthase  36.54 
 
 		 466 aa  281  2e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3855  cysteine synthase  54.4 
 
 		 344 aa  275  1.0000000000000001e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1770  cystathionine beta-synthase  37.88 
 
 		 456 aa  274  2.0000000000000002e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00709311  hitchhiker  0.000202602 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_42003  predicted protein  48.76 
 
 		 469 aa  272  1e-71  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0171  cysteine synthase A  45.82 
 
 		 372 aa  271  2e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4194  cysteine synthase  47.08 
 
 		 340 aa  271  2e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.360882 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3360  cysteine synthase A  46.44 
 
 		 324 aa  271  2.9999999999999997e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.359843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3378  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  38.24 
 
 		 461 aa  269  8.999999999999999e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.19393  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1694  cysteine synthase A  44.44 
 
 		 331 aa  266  4e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1945  Cysteine synthase  34.98 
 
 		 457 aa  266  5e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3819  cysteine synthase A  45.06 
 
 		 324 aa  266  5e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3300  cystathionine beta-synthase  38.16 
 
 		 464 aa  266  8e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3442  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  38.02 
 
 		 461 aa  265  1e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5839  cysteine synthase A  45.06 
 
 		 324 aa  262  1e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0276  cysteine synthase A  44.44 
 
 		 324 aa  261  1e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.146971  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2880  hypothetical protein  45.57 
 
 		 316 aa  261  2e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5010  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  44.58 
 
 		 325 aa  261  2e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.278031  normal  0.209222 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0978  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  44.41 
 
 		 307 aa  260  4e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2500  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  43.75 
 
 		 315 aa  259  8e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1560  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  47.68 
 
 		 302 aa  259  1e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.180171  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1804  cysteine synthase A  43.12 
 
 		 334 aa  258  1e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  45.03 
 
 		 312 aa  258  1e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4559  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  43.96 
 
 		 328 aa  258  2e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3022  hypothetical protein  45.25 
 
 		 316 aa  258  2e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1534  cysteine synthase A  45.34 
 
 		 325 aa  256  6e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.393204  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4638  cysteine synthase A  43.83 
 
 		 325 aa  256  7e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000171052 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1718  cysteine synthase A  42.3 
 
 		 338 aa  256  8e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.858313  normal  0.306784 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1347  cysteine synthase A  43.34 
 
 		 324 aa  255  1.0000000000000001e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0350194 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4742  cysteine synthase A  43.52 
 
 		 326 aa  254  2.0000000000000002e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0535  cysteine synthase A  44.85 
 
 		 310 aa  252  1e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.775182  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0548  cysteine synthase A  44.85 
 
 		 310 aa  252  1e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0170  cysteine synthase family protein  40.59 
 
 		 302 aa  252  1e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>