More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_1704 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_0488  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  78.51 
 
 		 456 aa  738    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1704  cystathionine beta-synthase  100 
 
 		 456 aa  937    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03155  cystathionine beta-synthase  80.04 
 
 		 464 aa  755    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.140599  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1633  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  99.12 
 
 		 456 aa  931    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2600  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  54.89 
 
 		 465 aa  522  1e-147  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0422691  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0499  cystathionine beta-synthase  56.44 
 
 		 457 aa  521  1e-146  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3248  cystathionine beta-synthase  56.32 
 
 		 479 aa  518  1e-146  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.564607 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05220  cystathionine beta-synthase  56.22 
 
 		 457 aa  521  1e-146  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0787  cystathionine beta-synthase  55.53 
 
 		 454 aa  498  1e-139  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.40993  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3300  cystathionine beta-synthase  54.87 
 
 		 464 aa  496  1e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3442  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  54.91 
 
 		 461 aa  490  1e-137  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3378  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  54.91 
 
 		 461 aa  488  1e-137  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.19393  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4907  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  53.41 
 
 		 479 aa  481  1e-135  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1770  cystathionine beta-synthase  52.19 
 
 		 456 aa  483  1e-135  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00709311  hitchhiker  0.000202602 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1627  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  52.85 
 
 		 455 aa  483  1e-135  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000745759 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4156  cystathionine beta-synthase  37.31 
 
 		 461 aa  303  3.0000000000000004e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.884438 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3718  cystathionine beta-synthase  36.6 
 
 		 463 aa  298  2e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000446047  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5286  cystathionine beta-synthase  37.28 
 
 		 459 aa  292  1e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.153908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8566  cystathionine beta-synthase  37.01 
 
 		 456 aa  282  9e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3846  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  34.41 
 
 		 459 aa  276  6e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3118  cystathionine beta-synthase  37.31 
 
 		 456 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000273151 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1048  cystathionine beta-synthase  36.88 
 
 		 455 aa  274  3e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3763  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  34.19 
 
 		 459 aa  273  4.0000000000000004e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3706  cystathionine beta-synthase  34.19 
 
 		 459 aa  272  8.000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0908  cystathionine beta-synthase  39.26 
 
 		 469 aa  269  8e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0700  cystathionine beta-synthase  36.09 
 
 		 456 aa  269  8.999999999999999e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0644  cystathionine beta-synthase  35.05 
 
 		 463 aa  267  4e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3846  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  33.26 
 
 		 459 aa  265  8.999999999999999e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.692652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1927  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  32.46 
 
 		 453 aa  265  1e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6424  cystathionine beta-synthase  35.73 
 
 		 463 aa  263  4e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.510477  normal  0.13322 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0438  cystathionine beta-synthase  36.23 
 
 		 455 aa  263  6.999999999999999e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4422  cystathionine beta-synthase  34.35 
 
 		 455 aa  261  1e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5829  cystathionine beta-synthase  34 
 
 		 458 aa  259  5.0000000000000005e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.454339 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0083  cystathionine beta-synthase  35.05 
 
 		 458 aa  258  2e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0925  cystathionine beta-synthase  34.94 
 
 		 468 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.731257 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2762  cystathionine beta-synthase  35.12 
 
 		 461 aa  251  2e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00303095 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1082  cystathionine beta-synthase  35.29 
 
 		 454 aa  249  6e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4209  cystathionine beta-synthase  34.06 
 
 		 464 aa  249  6e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1617  cystathionine beta-synthase  33.98 
 
 		 464 aa  247  2e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3062  cystathionine beta-synthase  34.9 
 
 		 461 aa  246  6.999999999999999e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0923483  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0855  cystathionine beta-synthase  33.48 
 
 		 456 aa  242  9e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0877269 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3152  cystathionine beta-synthase  34.32 
 
 		 460 aa  242  1e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.676366  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0939  cystathionine beta-synthase  34.02 
 
 		 462 aa  242  1e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44231  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0912  cystathionine beta-synthase  33.26 
 
 		 456 aa  241  2e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.78601 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2830  cystathionine beta-synthase  39.88 
 
 		 332 aa  238  1e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.908849  normal  0.0512396 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31890  cystathionine beta-synthase  34.84 
 
 		 457 aa  238  2e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.499085  normal  0.354911 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0943  cystathionine beta-synthase  33.77 
 
 		 454 aa  234  3e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3667  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  31.43 
 
 		 496 aa  233  4.0000000000000004e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.699338  normal  0.0676519 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0375  cystathionine beta-synthase  33.77 
 
 		 462 aa  233  4.0000000000000004e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.457937 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77227  cystathionine beta-synthase  32.92 
 
 		 494 aa  233  6e-60  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1434  Cysteine synthase  32.15 
 
 		 453 aa  233  6e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.700608 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05820  Cystathionine beta-synthase (EC 4.2.1.22) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:B2LXT5]  32.63 
 
 		 535 aa  232  1e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.555504 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_42003  predicted protein  33.05 
 
 		 469 aa  230  4e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2671  cystathionine beta-synthase  32.43 
 
 		 468 aa  224  3e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4224  cystathionine beta-synthase  32.63 
 
 		 464 aa  223  4e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4149  cystathionine beta-synthase  32.63 
 
 		 464 aa  223  4e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0798519  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4380  cystathionine beta-synthase  32.42 
 
 		 464 aa  223  7e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.558337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1694  cysteine synthase A  37.65 
 
 		 331 aa  223  8e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2043  cystathionine beta-synthase  32.69 
 
 		 464 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.140313  normal  0.388176 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0059  putative cystathionine beta-synthase  39.01 
 
 		 316 aa  221  1.9999999999999999e-56  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.857844  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1054  cystathionine beta-synthase  33.33 
 
 		 465 aa  221  1.9999999999999999e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.655144 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11095  cystathionine beta-synthase CBS  32.69 
 
 		 464 aa  221  3e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000328093  normal  0.348251 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2125  cystathionine beta-synthase  38.7 
 
 		 316 aa  220  5e-56  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.700222  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4674  cystathionine beta-synthase  32.63 
 
 		 464 aa  219  7.999999999999999e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202958 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1990  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  39.2 
 
 		 326 aa  213  3.9999999999999995e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1525  cysteine synthase A  34.87 
 
 		 352 aa  212  1e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.19401 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00130  cystathionine beta-synthase  35.28 
 
 		 326 aa  212  1e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1718  cysteine synthase A  36.12 
 
 		 338 aa  211  3e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.858313  normal  0.306784 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1157  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  38.46 
 
 		 326 aa  209  6e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0914  cysteine synthase  36.92 
 
 		 355 aa  209  8e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.141926  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17600  cystathionine beta-synthase  38 
 
 		 521 aa  207  2e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08106  putative cystathionine beta-synthase  33.54 
 
 		 345 aa  206  7e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.434389  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2956  cystathionine beta-synthase  31.32 
 
 		 465 aa  206  1e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.192465  normal  0.0470778 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1560  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  39.35 
 
 		 302 aa  204  2e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.180171  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3958  cysteine synthase A  36.22 
 
 		 332 aa  204  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.328768 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0170  cysteine synthase family protein  37.22 
 
 		 302 aa  204  3e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1804  cysteine synthase A  36.86 
 
 		 334 aa  203  5e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2557  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  34.36 
 
 		 346 aa  203  6e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2067  cysteine synthase A  35.16 
 
 		 346 aa  202  8e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1121  cysteine synthase A  35.17 
 
 		 332 aa  202  9.999999999999999e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1829  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  34.05 
 
 		 333 aa  202  9.999999999999999e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0936757  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2880  hypothetical protein  38.39 
 
 		 316 aa  201  1.9999999999999998e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0276  cysteine synthase A  37.23 
 
 		 324 aa  201  3e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.146971  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2430  pyridoxal-phosphate dependent enzyme family protein  37.22 
 
 		 327 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00735557  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1655  cysteine synthase  38.91 
 
 		 315 aa  199  1.0000000000000001e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.561904  normal  0.310159 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0499  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  36.5 
 
 		 343 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.377757 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3022  hypothetical protein  38.08 
 
 		 316 aa  198  2.0000000000000003e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1861  cysteine synthase B  37.79 
 
 		 295 aa  197  3e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4194  cysteine synthase  35.87 
 
 		 340 aa  197  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.360882 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1893  cysteine synthase A  36.73 
 
 		 326 aa  197  3e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.484332  normal  0.0992226 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3360  cysteine synthase A  36.11 
 
 		 324 aa  197  4.0000000000000005e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.359843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5010  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  35.76 
 
 		 325 aa  196  6e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.278031  normal  0.209222 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4638  cysteine synthase A  34.86 
 
 		 325 aa  196  6e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000171052 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5839  cysteine synthase A  36.39 
 
 		 324 aa  196  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3927  cysteine synthase A  33.91 
 
 		 344 aa  196  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.385733 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0171  cysteine synthase A  35.29 
 
 		 372 aa  196  1e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1100  cysteine synthase B  37.54 
 
 		 297 aa  194  2e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2297  cysteine synthases  38.39 
 
 		 308 aa  194  3e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2907  cysteine synthase A  34.39 
 
 		 346 aa  193  5e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.156329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3819  cysteine synthase A  35.65 
 
 		 324 aa  193  6e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>