More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1157 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1157  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  100 
 
 		 326 aa  660    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1990  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  76.07 
 
 		 326 aa  510  1e-143  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4156  cystathionine beta-synthase  59.57 
 
 		 461 aa  393  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.884438 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4422  cystathionine beta-synthase  58.02 
 
 		 455 aa  385  1e-106  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2830  cystathionine beta-synthase  56.92 
 
 		 332 aa  387  1e-106  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.908849  normal  0.0512396 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0912  cystathionine beta-synthase  60.31 
 
 		 456 aa  372  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.78601 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0855  cystathionine beta-synthase  60.62 
 
 		 456 aa  373  1e-102  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0877269 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8566  cystathionine beta-synthase  58.64 
 
 		 456 aa  365  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1048  cystathionine beta-synthase  59.57 
 
 		 455 aa  363  3e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1082  cystathionine beta-synthase  58.33 
 
 		 454 aa  360  2e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0700  cystathionine beta-synthase  56.79 
 
 		 456 aa  360  2e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3062  cystathionine beta-synthase  57.7 
 
 		 461 aa  360  2e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0923483  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3706  cystathionine beta-synthase  53.56 
 
 		 459 aa  359  3e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3763  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  53.56 
 
 		 459 aa  359  5e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3118  cystathionine beta-synthase  59.57 
 
 		 456 aa  357  9.999999999999999e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000273151 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5829  cystathionine beta-synthase  53.35 
 
 		 458 aa  357  9.999999999999999e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.454339 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3846  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  53.25 
 
 		 459 aa  357  1.9999999999999998e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0943  cystathionine beta-synthase  58.2 
 
 		 454 aa  355  6.999999999999999e-97  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2762  cystathionine beta-synthase  56.8 
 
 		 461 aa  355  7.999999999999999e-97  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00303095 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3846  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  52.32 
 
 		 459 aa  354  1e-96  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.692652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0914  cysteine synthase  56.06 
 
 		 355 aa  353  2e-96  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.141926  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3718  cystathionine beta-synthase  56.13 
 
 		 463 aa  353  2e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000446047  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0083  cystathionine beta-synthase  56.75 
 
 		 458 aa  352  5e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0644  cystathionine beta-synthase  56.62 
 
 		 463 aa  352  5.9999999999999994e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6424  cystathionine beta-synthase  57.75 
 
 		 463 aa  351  8e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.510477  normal  0.13322 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4209  cystathionine beta-synthase  56.23 
 
 		 464 aa  350  1e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2671  cystathionine beta-synthase  55.46 
 
 		 468 aa  349  3e-95  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31890  cystathionine beta-synthase  57.1 
 
 		 457 aa  348  6e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.499085  normal  0.354911 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3152  cystathionine beta-synthase  58.02 
 
 		 460 aa  347  1e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.676366  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1927  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  51.68 
 
 		 453 aa  348  1e-94  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0925  cystathionine beta-synthase  53.85 
 
 		 468 aa  345  4e-94  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.731257 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0908  cystathionine beta-synthase  55.45 
 
 		 469 aa  345  5e-94  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0438  cystathionine beta-synthase  58.15 
 
 		 455 aa  345  6e-94  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11095  cystathionine beta-synthase CBS  56.79 
 
 		 464 aa  343  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000328093  normal  0.348251 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1617  cystathionine beta-synthase  56.17 
 
 		 464 aa  343  2.9999999999999997e-93  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0375  cystathionine beta-synthase  58.46 
 
 		 462 aa  342  7e-93  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.457937 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4380  cystathionine beta-synthase  56.48 
 
 		 464 aa  340  1e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.558337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2043  cystathionine beta-synthase  57.72 
 
 		 464 aa  340  1e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.140313  normal  0.388176 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4149  cystathionine beta-synthase  56.17 
 
 		 464 aa  340  2e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0798519  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0939  cystathionine beta-synthase  55.52 
 
 		 462 aa  340  2e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44231  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4224  cystathionine beta-synthase  56.17 
 
 		 464 aa  340  2e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4674  cystathionine beta-synthase  57.41 
 
 		 464 aa  340  2e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202958 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00130  cystathionine beta-synthase  49.54 
 
 		 326 aa  340  2.9999999999999998e-92  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1054  cystathionine beta-synthase  55.36 
 
 		 465 aa  332  6e-90  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.655144 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17600  cystathionine beta-synthase  55.05 
 
 		 521 aa  332  6e-90  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1434  Cysteine synthase  52.29 
 
 		 453 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.700608 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08106  putative cystathionine beta-synthase  48.32 
 
 		 345 aa  317  2e-85  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.434389  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3667  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  50 
 
 		 496 aa  313  2.9999999999999996e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.699338  normal  0.0676519 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2956  cystathionine beta-synthase  54.77 
 
 		 465 aa  309  4e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.192465  normal  0.0470778 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1829  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  47.72 
 
 		 333 aa  305  6e-82  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0936757  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2557  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  46.65 
 
 		 346 aa  303  3.0000000000000004e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2125  cystathionine beta-synthase  49.69 
 
 		 316 aa  296  3e-79  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.700222  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0059  putative cystathionine beta-synthase  49.69 
 
 		 316 aa  294  1e-78  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.857844  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77227  cystathionine beta-synthase  48.62 
 
 		 494 aa  293  3e-78  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  48.04 
 
 		 312 aa  285  7e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4194  cysteine synthase  48.43 
 
 		 340 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.360882 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_42003  predicted protein  49.09 
 
 		 469 aa  278  7e-74  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  46.43 
 
 		 312 aa  278  7e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2430  pyridoxal-phosphate dependent enzyme family protein  46.39 
 
 		 327 aa  271  8.000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00735557  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3819  cysteine synthase A  44.44 
 
 		 324 aa  271  9e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5286  cystathionine beta-synthase  43.52 
 
 		 459 aa  269  5e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.153908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3360  cysteine synthase A  43.96 
 
 		 324 aa  268  8e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.359843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2600  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  41.18 
 
 		 465 aa  266  4e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0422691  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0276  cysteine synthase A  43.21 
 
 		 324 aa  266  5e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.146971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0548  cysteine synthase A  45.93 
 
 		 310 aa  265  7e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5010  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  43.34 
 
 		 325 aa  265  7e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.278031  normal  0.209222 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0535  cysteine synthase A  45.93 
 
 		 310 aa  265  7e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.775182  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5839  cysteine synthase A  42.59 
 
 		 324 aa  265  7e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05820  Cystathionine beta-synthase (EC 4.2.1.22) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:B2LXT5]  46.01 
 
 		 535 aa  263  2e-69  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.555504 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0152  cysteine synthase  45.6 
 
 		 310 aa  262  4.999999999999999e-69  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2880  hypothetical protein  49.06 
 
 		 316 aa  262  6.999999999999999e-69  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1385  cysteine synthase  44.41 
 
 		 311 aa  262  8e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.9014  normal  0.484311 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1804  cysteine synthase A  43.34 
 
 		 334 aa  261  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1534  cysteine synthase A  42.86 
 
 		 325 aa  260  2e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.393204  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3022  hypothetical protein  48.75 
 
 		 316 aa  259  6e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1560  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  46.58 
 
 		 302 aa  257  2e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.180171  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0170  cysteine synthase family protein  42.44 
 
 		 302 aa  256  3e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2871  cysteine synthase A  46.27 
 
 		 318 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2014  cysteine synthase A  47.32 
 
 		 309 aa  253  2.0000000000000002e-66  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0113  normal  0.0387372 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  44.94 
 
 		 311 aa  253  2.0000000000000002e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0499  cystathionine beta-synthase  40.88 
 
 		 457 aa  253  3e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05220  cystathionine beta-synthase  40.88 
 
 		 457 aa  253  3e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2475  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  41.61 
 
 		 307 aa  252  6e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2178  Cysteine synthase  38.32 
 
 		 466 aa  251  8.000000000000001e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3248  cystathionine beta-synthase  39.94 
 
 		 479 aa  251  1e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.564607 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0978  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  43.23 
 
 		 307 aa  251  2e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1694  cysteine synthase A  41.67 
 
 		 331 aa  249  4e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4638  cysteine synthase A  41.36 
 
 		 325 aa  248  7e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000171052 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0964  cysteine synthase  43.83 
 
 		 320 aa  248  1e-64  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274794  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0889  cysteine synthase A  42.44 
 
 		 304 aa  248  1e-64  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4559  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  40.25 
 
 		 328 aa  248  1e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1615  cysteine synthase A  44.44 
 
 		 308 aa  248  1e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2237  cysteine synthase A  45.91 
 
 		 317 aa  248  1e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.425208 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3364  cysteine synthase A  42.49 
 
 		 304 aa  247  2e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000830673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0413  cysteine synthase  45.13 
 
 		 309 aa  247  2e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24430  cysteine synthase  45.74 
 
 		 311 aa  247  2e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.653671  normal  0.574826 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2500  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  40.45 
 
 		 315 aa  246  4e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0922  cysteine synthase A  42.54 
 
 		 304 aa  246  4e-64  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.107998  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1718  cysteine synthase A  40.12 
 
 		 338 aa  245  6e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.858313  normal  0.306784 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4907  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  38.56 
 
 		 479 aa  245  6.999999999999999e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>