More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_2014 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_2014  cysteine synthase A  100 
 
 
309 aa  618  1e-176  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0113  normal  0.0387372 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3186  cysteine synthase A  73.94 
 
 
310 aa  455  1e-127  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000213805  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0011  cysteine synthase A  72.82 
 
 
310 aa  452  1.0000000000000001e-126  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.857978  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  71.43 
 
 
311 aa  439  9.999999999999999e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2286  cysteine synthase A  71.34 
 
 
309 aa  422  1e-117  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04800  cysteine synthase A  69.58 
 
 
309 aa  423  1e-117  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000597368  normal  0.814351 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1301  cysteine synthase A  70.13 
 
 
309 aa  414  9.999999999999999e-116  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.568697 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2000  cysteine synthase A  66.67 
 
 
317 aa  388  1e-107  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.982832  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0549  cysteine synthase A  62.21 
 
 
310 aa  389  1e-107  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000133483 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1551  cysteine synthase K/M/A  65.69 
 
 
317 aa  386  1e-106  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1149  cysteine synthase A  66.88 
 
 
311 aa  384  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000025777  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0889  cysteine synthase A  58.31 
 
 
304 aa  372  1e-102  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1558  cysteine synthase  65.91 
 
 
309 aa  370  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1971  cysteine synthase  64.61 
 
 
308 aa  370  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000186941  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1022  cysteine synthase A  64.5 
 
 
310 aa  366  1e-100  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0422971  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1258  cysteine synthase K/M/A  66.56 
 
 
327 aa  364  1e-100  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.198511  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12358  cysteine synthase A cysK1  63.43 
 
 
310 aa  363  2e-99  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2487  cysteine synthase A  61.17 
 
 
309 aa  362  5.0000000000000005e-99  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.074698 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2871  cysteine synthase A  62.46 
 
 
318 aa  361  1e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1718  cysteine synthase A  62.87 
 
 
308 aa  360  2e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000370956  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3364  cysteine synthase A  60.91 
 
 
304 aa  360  2e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000830673  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3859  cysteine synthase A  66.34 
 
 
309 aa  358  5e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000825635  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0922  cysteine synthase A  56.35 
 
 
304 aa  358  6e-98  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.107998  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3334  cysteine synthase A  67.1 
 
 
309 aa  358  7e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.229416  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0921  cysteine synthase A  62.09 
 
 
317 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2021  cysteine synthase A  64.72 
 
 
309 aa  355  3.9999999999999996e-97  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0166882  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2677  cysteine synthase A  58.9 
 
 
309 aa  354  8.999999999999999e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.601381  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2003  cysteine synthase A  62.14 
 
 
308 aa  354  1e-96  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.537357 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4128  cysteine synthase  62.54 
 
 
310 aa  353  2e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1615  cysteine synthase A  60.66 
 
 
308 aa  353  2.9999999999999997e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0420  cysteine synthase A  61.76 
 
 
311 aa  353  2.9999999999999997e-96  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.858609  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2427  cysteine synthase  62.54 
 
 
309 aa  353  2.9999999999999997e-96  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00952791  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2581  cysteine synthase A  58.58 
 
 
309 aa  352  5e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0364  cysteine synthase  60.91 
 
 
322 aa  352  5e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1280  cysteine synthase  58.58 
 
 
309 aa  352  5.9999999999999994e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0485567  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3067  cysteine synthase  59.74 
 
 
316 aa  351  8.999999999999999e-96  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3549  cysteine synthase A  59.93 
 
 
322 aa  350  1e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1983  cysteine synthase A  61.24 
 
 
309 aa  350  1e-95  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.722669  normal  0.957709 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0178  cysteine synthase A  63.19 
 
 
331 aa  350  2e-95  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0433  cysteine synthase K/M/A  56.96 
 
 
307 aa  350  2e-95  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.818582  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4340  cysteine synthase A  62.21 
 
 
320 aa  350  2e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.238175  normal  0.899822 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4605  cysteine synthase A  61.56 
 
 
320 aa  350  3e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0452  cysteine synthase  59.68 
 
 
319 aa  349  4e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.118838 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2233  cysteine synthase A  58.58 
 
 
308 aa  348  5e-95  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0548  cysteine synthase A  58.88 
 
 
310 aa  347  1e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1332  cysteine synthase A  59.6 
 
 
309 aa  347  1e-94  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000281475  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0535  cysteine synthase A  58.88 
 
 
310 aa  347  1e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.775182  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0413  cysteine synthase  61.84 
 
 
309 aa  347  2e-94  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0030  cysteine synthase A  58.71 
 
 
311 aa  345  5e-94  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05340  cysteine synthase  58.42 
 
 
304 aa  345  5e-94  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3794  cysteine synthase  56.86 
 
 
339 aa  345  5e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2759  cysteine synthase A  61.49 
 
 
311 aa  345  6e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2853  cysteine synthase A  61.17 
 
 
311 aa  344  1e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000434249  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2067  cysteine synthase A  58.44 
 
 
327 aa  344  1e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.197318 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2853  cysteine synthase A  58.06 
 
 
320 aa  343  2e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  58.12 
 
 
312 aa  343  2e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1506  cysteine synthase A  61.94 
 
 
309 aa  343  2.9999999999999997e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000603625  normal  0.533317 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2422  cysteine synthase  61.89 
 
 
308 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0516344 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2364  cysteine synthase  59.22 
 
 
310 aa  341  9e-93  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.174971  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  57.79 
 
 
312 aa  341  1e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0213  cysteine synthase  60.26 
 
 
329 aa  340  1e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0914276  normal  0.144885 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2657  cysteine synthase A  61.94 
 
 
309 aa  340  2e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.249918  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1235  cysteine synthase  58.2 
 
 
320 aa  340  2e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.779914  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2681  cysteine synthase A  60.13 
 
 
308 aa  340  2e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0782138 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1541  cysteine synthase A  57.74 
 
 
330 aa  339  2.9999999999999998e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2560  cysteine synthase A  62.87 
 
 
310 aa  339  2.9999999999999998e-92  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24430  cysteine synthase  59.09 
 
 
311 aa  339  4e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.653671  normal  0.574826 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0152  cysteine synthase  57.76 
 
 
310 aa  338  7e-92  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3256  cysteine synthase A  60.65 
 
 
309 aa  338  9e-92  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0964  cysteine synthase  57.95 
 
 
320 aa  337  9.999999999999999e-92  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274794  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5019  cysteine synthase  55.48 
 
 
320 aa  337  1.9999999999999998e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0961303  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0154  cysteine synthase K/M/A  53.07 
 
 
307 aa  337  1.9999999999999998e-91  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000000054726  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1671  cysteine synthase A  58.77 
 
 
311 aa  337  1.9999999999999998e-91  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.422965  normal  0.494898 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2446  cysteine synthase  57.47 
 
 
311 aa  336  1.9999999999999998e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00671922  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1390  cysteine synthase  61.04 
 
 
311 aa  336  2.9999999999999997e-91  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.173456  normal  0.100727 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26180  cysteine synthase  60.91 
 
 
309 aa  336  2.9999999999999997e-91  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4466  cysteine synthase A  58.82 
 
 
327 aa  335  5e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00243818 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2176  cysteine synthase A  58.25 
 
 
309 aa  334  1e-90  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.265161  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2668  cysteine synthase  62.14 
 
 
311 aa  334  1e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.456987  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1015  cysteine synthase A  60.26 
 
 
328 aa  334  1e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2297  cysteine synthases  58.31 
 
 
308 aa  334  1e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1638  cysteine synthase A  57.33 
 
 
309 aa  333  2e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.444809  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5186  cysteine synthase A  58.82 
 
 
327 aa  333  2e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129775  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3416  cysteine synthase  56.21 
 
 
311 aa  333  2e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2508  cysteine synthase  57.74 
 
 
320 aa  333  3e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000293117  normal  0.173804 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1385  cysteine synthase  54.07 
 
 
311 aa  333  3e-90  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.9014  normal  0.484311 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4407  cysteine synthase A  58.77 
 
 
328 aa  333  3e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.119856 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1893  cysteine synthase A  60.26 
 
 
327 aa  333  3e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.480284  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1135  cysteine synthase A  56.95 
 
 
320 aa  332  4e-90  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0019697  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5034  cysteine synthase A  56.13 
 
 
320 aa  332  4e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2195  cysteine synthase A  58.12 
 
 
311 aa  332  5e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000876073 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0075  cysteine synthase A  59.48 
 
 
328 aa  331  1e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0477  cysteine synthase  61.76 
 
 
332 aa  330  2e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1336  cysteine synthase A  59.87 
 
 
311 aa  330  2e-89  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0343  cysteine synthase A  61.44 
 
 
332 aa  330  3e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.516891  normal  0.476462 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26961  O-acetylserinethiol lyase/cysteine synthase  61.62 
 
 
305 aa  329  4e-89  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1502  cysteine synthase A  57.1 
 
 
321 aa  329  5.0000000000000004e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.18267e-17 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1706  cysteine synthase  61.89 
 
 
306 aa  328  6e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000550718  normal  0.263535 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2096  cysteine synthase  58.39 
 
 
323 aa  328  6e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.553585  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_953  cysteine synthase  56.95 
 
 
320 aa  328  7e-89  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000343054  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>