More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_42003 on replicon NC_011677
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011677  PHATRDRAFT_42003  predicted protein  100 
 
 		 469 aa  960    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5286  cystathionine beta-synthase  52.78 
 
 		 459 aa  476  1e-133  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.153908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77227  cystathionine beta-synthase  48.46 
 
 		 494 aa  417  9.999999999999999e-116  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05820  Cystathionine beta-synthase (EC 4.2.1.22) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:B2LXT5]  52.79 
 
 		 535 aa  414  1e-114  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.555504 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2880  hypothetical protein  66.88 
 
 		 316 aa  413  1e-114  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3022  hypothetical protein  66.56 
 
 		 316 aa  409  1e-113  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0059  putative cystathionine beta-synthase  63.12 
 
 		 316 aa  394  1e-108  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.857844  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2125  cystathionine beta-synthase  63.44 
 
 		 316 aa  394  1e-108  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.700222  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4156  cystathionine beta-synthase  47.21 
 
 		 461 aa  362  6e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.884438 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3718  cystathionine beta-synthase  42.09 
 
 		 463 aa  357  2.9999999999999997e-97  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000446047  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3846  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  40.69 
 
 		 459 aa  330  2e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.692652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3706  cystathionine beta-synthase  41.83 
 
 		 459 aa  330  3e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3846  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  41.39 
 
 		 459 aa  328  1.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3667  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  41.11 
 
 		 496 aa  327  4.0000000000000003e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.699338  normal  0.0676519 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3763  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  41.18 
 
 		 459 aa  327  4.0000000000000003e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5829  cystathionine beta-synthase  41.08 
 
 		 458 aa  322  9.999999999999999e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.454339 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4422  cystathionine beta-synthase  40.34 
 
 		 455 aa  312  6.999999999999999e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0908  cystathionine beta-synthase  40.34 
 
 		 469 aa  312  6.999999999999999e-84  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2762  cystathionine beta-synthase  40.7 
 
 		 461 aa  306  8.000000000000001e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00303095 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8566  cystathionine beta-synthase  40.17 
 
 		 456 aa  304  3.0000000000000004e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2830  cystathionine beta-synthase  48.45 
 
 		 332 aa  303  6.000000000000001e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.908849  normal  0.0512396 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6424  cystathionine beta-synthase  42.22 
 
 		 463 aa  303  6.000000000000001e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.510477  normal  0.13322 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1048  cystathionine beta-synthase  40 
 
 		 455 aa  301  1e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3062  cystathionine beta-synthase  39.88 
 
 		 461 aa  300  3e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0923483  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA06170  cystathionine beta-synthase, putative  46.92 
 
 		 398 aa  297  2e-79  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.504616  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1434  Cysteine synthase  38.1 
 
 		 453 aa  297  2e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.700608 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0644  cystathionine beta-synthase  38.37 
 
 		 463 aa  297  3e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0943  cystathionine beta-synthase  41.01 
 
 		 454 aa  295  1e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1927  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  40.41 
 
 		 453 aa  294  3e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1990  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  48.35 
 
 		 326 aa  293  4e-78  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4209  cystathionine beta-synthase  40.99 
 
 		 464 aa  293  4e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00130  cystathionine beta-synthase  44.92 
 
 		 326 aa  289  7e-77  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0855  cystathionine beta-synthase  39.45 
 
 		 456 aa  287  2.9999999999999996e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0877269 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2600  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  37.26 
 
 		 465 aa  286  7e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0422691  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2671  cystathionine beta-synthase  40.65 
 
 		 468 aa  282  8.000000000000001e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0083  cystathionine beta-synthase  42.03 
 
 		 458 aa  282  1e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0438  cystathionine beta-synthase  39.58 
 
 		 455 aa  281  2e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1157  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  49.09 
 
 		 326 aa  281  2e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4224  cystathionine beta-synthase  40.34 
 
 		 464 aa  281  2e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0700  cystathionine beta-synthase  37.95 
 
 		 456 aa  281  2e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4149  cystathionine beta-synthase  40.34 
 
 		 464 aa  281  2e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0798519  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4380  cystathionine beta-synthase  40.13 
 
 		 464 aa  280  3e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.558337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0912  cystathionine beta-synthase  38.17 
 
 		 456 aa  280  4e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.78601 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0914  cysteine synthase  48.01 
 
 		 355 aa  280  4e-74  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.141926  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1082  cystathionine beta-synthase  38.56 
 
 		 454 aa  279  8e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1617  cystathionine beta-synthase  39.21 
 
 		 464 aa  279  1e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11095  cystathionine beta-synthase CBS  40.47 
 
 		 464 aa  277  2e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000328093  normal  0.348251 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0925  cystathionine beta-synthase  40.17 
 
 		 468 aa  276  7e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.731257 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05220  cystathionine beta-synthase  36.66 
 
 		 457 aa  276  8e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0488  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  36.05 
 
 		 456 aa  275  2.0000000000000002e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0939  cystathionine beta-synthase  39.13 
 
 		 462 aa  274  3e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44231  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2043  cystathionine beta-synthase  39.87 
 
 		 464 aa  273  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.140313  normal  0.388176 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0499  cystathionine beta-synthase  36.44 
 
 		 457 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3118  cystathionine beta-synthase  48.76 
 
 		 456 aa  273  7e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000273151 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31890  cystathionine beta-synthase  38.78 
 
 		 457 aa  272  1e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.499085  normal  0.354911 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03155  cystathionine beta-synthase  35.41 
 
 		 464 aa  272  1e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.140599  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3152  cystathionine beta-synthase  39.23 
 
 		 460 aa  271  2e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.676366  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4674  cystathionine beta-synthase  39.91 
 
 		 464 aa  271  2e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202958 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08106  putative cystathionine beta-synthase  40.24 
 
 		 345 aa  269  8e-71  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.434389  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0375  cystathionine beta-synthase  41.15 
 
 		 462 aa  268  1e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.457937 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3248  cystathionine beta-synthase  35.89 
 
 		 479 aa  263  3e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.564607 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1829  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  41.41 
 
 		 333 aa  261  2e-68  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0936757  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2557  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  40.74 
 
 		 346 aa  260  3e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4194  cysteine synthase  43.75 
 
 		 340 aa  259  7e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.360882 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3300  cystathionine beta-synthase  39.95 
 
 		 464 aa  258  1e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4907  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  32.13 
 
 		 479 aa  258  2e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1633  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  33.05 
 
 		 456 aa  258  2e-67  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1054  cystathionine beta-synthase  40.04 
 
 		 465 aa  257  3e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.655144 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1704  cystathionine beta-synthase  32.55 
 
 		 456 aa  256  8e-67  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  45.14 
 
 		 311 aa  256  8e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0787  cystathionine beta-synthase  36 
 
 		 454 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.40993  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  42.72 
 
 		 312 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3442  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  39.04 
 
 		 461 aa  253  4.0000000000000004e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1560  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  45.16 
 
 		 302 aa  253  7e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.180171  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1694  cysteine synthase A  42.9 
 
 		 331 aa  253  8.000000000000001e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3378  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  39.29 
 
 		 461 aa  252  1e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.19393  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  42.07 
 
 		 312 aa  251  2e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2956  cystathionine beta-synthase  41.35 
 
 		 465 aa  249  6e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.192465  normal  0.0470778 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2500  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  41.42 
 
 		 315 aa  248  2e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2430  pyridoxal-phosphate dependent enzyme family protein  44.69 
 
 		 327 aa  247  3e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00735557  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0170  cysteine synthase family protein  44.37 
 
 		 302 aa  247  3e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1228  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  44.84 
 
 		 302 aa  246  4e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1770  cystathionine beta-synthase  38.21 
 
 		 456 aa  246  6.999999999999999e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00709311  hitchhiker  0.000202602 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3085  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  42.22 
 
 		 307 aa  246  6.999999999999999e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.520498  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1525  cysteine synthase A  42.14 
 
 		 352 aa  245  9.999999999999999e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.19401 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1391  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  42.55 
 
 		 348 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108416 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1534  cysteine synthase A  41.8 
 
 		 325 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.393204  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3819  cysteine synthase A  42.06 
 
 		 324 aa  244  3e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17600  cystathionine beta-synthase  44.17 
 
 		 521 aa  244  3e-63  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1666  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  42.55 
 
 		 348 aa  243  5e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.44586 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0744  O-acetylserine lyase  41.72 
 
 		 307 aa  243  7e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4269  O-acetylserine lyase  41.72 
 
 		 307 aa  242  7.999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4106  cysteine synthase  41.72 
 
 		 307 aa  242  7.999999999999999e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4117  cysteine synthase  41.72 
 
 		 307 aa  242  7.999999999999999e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4453  O-acetylserine lyase  41.72 
 
 		 307 aa  242  7.999999999999999e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4601  O-acetylserine lyase  41.72 
 
 		 307 aa  242  7.999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2475  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  40.19 
 
 		 307 aa  242  9e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3364  cysteine synthase A  43.91 
 
 		 304 aa  242  1e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000830673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4220  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  42.53 
 
 		 307 aa  241  1e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3360  cysteine synthase A  42.01 
 
 		 324 aa  242  1e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.359843  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>