More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNA06170 on replicon NC_006670
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006670  CNA06170  cystathionine beta-synthase, putative  100 
 
 
398 aa  821    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.504616  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5286  cystathionine beta-synthase  49.15 
 
 
459 aa  307  2.0000000000000002e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.153908  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77227  cystathionine beta-synthase  51.16 
 
 
494 aa  290  4e-77  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_42003  predicted protein  47.44 
 
 
469 aa  286  5e-76  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2125  cystathionine beta-synthase  49.85 
 
 
316 aa  278  1e-73  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.700222  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05820  Cystathionine beta-synthase (EC 4.2.1.22) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:B2LXT5]  47.88 
 
 
535 aa  277  2e-73  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.555504 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0059  putative cystathionine beta-synthase  49.27 
 
 
316 aa  276  6e-73  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.857844  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2880  hypothetical protein  48.69 
 
 
316 aa  274  2.0000000000000002e-72  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3022  hypothetical protein  48.4 
 
 
316 aa  271  2e-71  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4156  cystathionine beta-synthase  42.7 
 
 
461 aa  263  4e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.884438 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4422  cystathionine beta-synthase  42.23 
 
 
455 aa  242  9e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0170  cysteine synthase family protein  41.76 
 
 
302 aa  234  2.0000000000000002e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0700  cystathionine beta-synthase  43.86 
 
 
456 aa  229  8e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0914  cysteine synthase  40.92 
 
 
355 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.141926  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3846  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  38.21 
 
 
459 aa  220  3e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.692652  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1560  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  40.41 
 
 
302 aa  220  3.9999999999999997e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.180171  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2830  cystathionine beta-synthase  39.07 
 
 
332 aa  219  5e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.908849  normal  0.0512396 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3718  cystathionine beta-synthase  37.9 
 
 
463 aa  218  1e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000446047  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1048  cystathionine beta-synthase  40.7 
 
 
455 aa  218  2e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8566  cystathionine beta-synthase  41.22 
 
 
456 aa  218  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0908  cystathionine beta-synthase  41.04 
 
 
469 aa  218  2e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0943  cystathionine beta-synthase  40.37 
 
 
454 aa  217  2e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2671  cystathionine beta-synthase  42.16 
 
 
468 aa  217  2.9999999999999998e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0644  cystathionine beta-synthase  42.48 
 
 
463 aa  214  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0166  cysteine synthase family protein  41.89 
 
 
302 aa  215  9.999999999999999e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3118  cystathionine beta-synthase  42.69 
 
 
456 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000273151 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0855  cystathionine beta-synthase  40.71 
 
 
456 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0877269 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3062  cystathionine beta-synthase  42.18 
 
 
461 aa  214  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0923483  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0925  cystathionine beta-synthase  41.32 
 
 
468 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.731257 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0438  cystathionine beta-synthase  42.4 
 
 
455 aa  212  1e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31890  cystathionine beta-synthase  43.32 
 
 
457 aa  211  1e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.499085  normal  0.354911 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0912  cystathionine beta-synthase  40.41 
 
 
456 aa  211  2e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.78601 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3846  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  35.62 
 
 
459 aa  211  3e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3763  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  35.11 
 
 
459 aa  209  1e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0978  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  38.6 
 
 
307 aa  207  2e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3706  cystathionine beta-synthase  35.62 
 
 
459 aa  207  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2762  cystathionine beta-synthase  39.36 
 
 
461 aa  207  3e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00303095 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5829  cystathionine beta-synthase  39.77 
 
 
458 aa  207  3e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.454339 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0939  cystathionine beta-synthase  41.4 
 
 
462 aa  206  5e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44231  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2600  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  38.66 
 
 
465 aa  206  6e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0422691  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4209  cystathionine beta-synthase  41.23 
 
 
464 aa  205  1e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3152  cystathionine beta-synthase  42.09 
 
 
460 aa  205  1e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.676366  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2475  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  37.43 
 
 
307 aa  204  2e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0213  cysteine synthase  38.24 
 
 
329 aa  204  2e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0914276  normal  0.144885 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0083  cystathionine beta-synthase  40.64 
 
 
458 aa  204  3e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1082  cystathionine beta-synthase  40.38 
 
 
454 aa  203  5e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3085  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  37.8 
 
 
307 aa  203  5e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.520498  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0556  cysteine synthases  37.83 
 
 
323 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.523099  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1054  cystathionine beta-synthase  43.41 
 
 
465 aa  199  5e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.655144 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6424  cystathionine beta-synthase  38.89 
 
 
463 aa  197  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.510477  normal  0.13322 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1228  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  37.24 
 
 
302 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1617  cystathionine beta-synthase  39.65 
 
 
464 aa  197  3e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3364  cysteine synthase A  39.35 
 
 
304 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000830673  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4269  O-acetylserine lyase  36.9 
 
 
307 aa  196  6e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4106  cysteine synthase  36.9 
 
 
307 aa  196  6e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4117  cysteine synthase  36.9 
 
 
307 aa  196  6e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4380  cystathionine beta-synthase  41.02 
 
 
464 aa  196  6e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.558337  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4601  O-acetylserine lyase  36.9 
 
 
307 aa  196  6e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4453  O-acetylserine lyase  36.9 
 
 
307 aa  196  6e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  36.76 
 
 
311 aa  196  7e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4506  O-acetylserine lyase  36.9 
 
 
307 aa  196  9e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0207318  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11095  cystathionine beta-synthase CBS  38.81 
 
 
464 aa  195  1e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000328093  normal  0.348251 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4149  cystathionine beta-synthase  40.72 
 
 
464 aa  195  1e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0798519  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4224  cystathionine beta-synthase  40.72 
 
 
464 aa  195  1e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0964  cysteine synthase  37.18 
 
 
320 aa  195  1e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274794  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4455  O-acetylserine lyase  36.9 
 
 
307 aa  194  2e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1829  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  36.92 
 
 
333 aa  194  2e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0936757  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3794  cysteine synthase  37.86 
 
 
339 aa  194  2e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2043  cystathionine beta-synthase  40.12 
 
 
464 aa  194  2e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.140313  normal  0.388176 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0744  O-acetylserine lyase  36.61 
 
 
307 aa  194  3e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4907  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  33.68 
 
 
479 aa  193  4e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4220  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  36.61 
 
 
307 aa  193  4e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4492  O-acetylserine lyase  36.9 
 
 
307 aa  193  5e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.986798  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0488  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  35 
 
 
456 aa  193  5e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17600  cystathionine beta-synthase  41.33 
 
 
521 aa  192  1e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4674  cystathionine beta-synthase  39.82 
 
 
464 aa  191  1e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.202958 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_953  cysteine synthase  36.13 
 
 
320 aa  191  2.9999999999999997e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000343054  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4340  cysteine synthase A  38.15 
 
 
320 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.238175  normal  0.899822 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4605  cysteine synthase A  38.73 
 
 
320 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  36.47 
 
 
312 aa  189  5e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3549  cysteine synthase A  36.99 
 
 
322 aa  189  1e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2365  cysteine synthase  38.24 
 
 
322 aa  188  1e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0266  cysteine synthase A  37.91 
 
 
291 aa  187  2e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0459085  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1157  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  38.89 
 
 
326 aa  188  2e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0364  cysteine synthase  35.92 
 
 
322 aa  188  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  36.76 
 
 
312 aa  188  2e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0413  cysteine synthase  38.92 
 
 
309 aa  186  4e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4175  cysteine synthase  37.24 
 
 
323 aa  186  5e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08106  putative cystathionine beta-synthase  35.88 
 
 
345 aa  186  7e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.434389  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3248  cystathionine beta-synthase  34.39 
 
 
479 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.564607 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2871  cysteine synthase A  37.01 
 
 
318 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1990  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  37.97 
 
 
326 aa  184  2.0000000000000003e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03155  cystathionine beta-synthase  35.14 
 
 
464 aa  184  3e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.140599  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2176  cysteine synthase A  36.99 
 
 
309 aa  183  4.0000000000000006e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.265161  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5034  cysteine synthase A  37.35 
 
 
320 aa  183  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2853  cysteine synthase A  36.76 
 
 
320 aa  183  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1927  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  34.67 
 
 
453 aa  183  4.0000000000000006e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2557  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  33.95 
 
 
346 aa  183  5.0000000000000004e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3667  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  38.18 
 
 
496 aa  183  6e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.699338  normal  0.0676519 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1385  cysteine synthase  34.11 
 
 
311 aa  182  8.000000000000001e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.9014  normal  0.484311 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>