More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4175 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_4175  cysteine synthase  100 
 
 		 323 aa  651    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  56.29 
 
 		 312 aa  357  9.999999999999999e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  55.3 
 
 		 312 aa  352  7e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0152  cysteine synthase  55.08 
 
 		 310 aa  343  2e-93  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2430  cysteine synthase A  61.15 
 
 		 306 aa  340  1e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0548  cysteine synthase A  53.77 
 
 		 310 aa  338  8e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0535  cysteine synthase A  53.77 
 
 		 310 aa  338  8e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.775182  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2988  cysteine synthase  59.6 
 
 		 307 aa  335  5.999999999999999e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000571381  normal  0.7688 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0535  cysteine synthase A  59.41 
 
 		 307 aa  334  1e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0678503  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1706  cysteine synthase  61 
 
 		 306 aa  332  6e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000550718  normal  0.263535 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3907  cysteine synthase A  57.09 
 
 		 307 aa  324  1e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000106704  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0433  cysteine synthase K/M/A  53.97 
 
 		 307 aa  317  3e-85  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.818582  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1091  cysteine synthase  54.79 
 
 		 303 aa  310  2e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000826995  decreased coverage  0.00308217 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1615  cysteine synthase A  55.63 
 
 		 308 aa  308  8e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0922  cysteine synthase A  50.16 
 
 		 304 aa  308  9e-83  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.107998  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1718  cysteine synthase A  56.29 
 
 		 308 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000370956  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1655  cysteine synthase  52.84 
 
 		 315 aa  307  1.0000000000000001e-82  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.561904  normal  0.310159 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0889  cysteine synthase A  51.5 
 
 		 304 aa  306  3e-82  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1558  cysteine synthase  58.39 
 
 		 309 aa  306  3e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3859  cysteine synthase A  58.39 
 
 		 309 aa  306  3e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000825635  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  53.33 
 
 		 311 aa  305  5.0000000000000004e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1385  cysteine synthase  51.13 
 
 		 311 aa  305  5.0000000000000004e-82  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.9014  normal  0.484311 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0030  cysteine synthase A  51.45 
 
 		 311 aa  305  6e-82  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1087  cysteine synthase  55.18 
 
 		 303 aa  305  6e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.542203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23060  cysteine synthase A  52.82 
 
 		 305 aa  305  7e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000228532  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0170  cysteine synthase A  46.36 
 
 		 304 aa  303  2.0000000000000002e-81  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00475319  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12358  cysteine synthase A cysK1  54.88 
 
 		 310 aa  303  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1822  cysteine synthase A  49.68 
 
 		 302 aa  302  6.000000000000001e-81  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.470327  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1638  cysteine synthase A  54.07 
 
 		 309 aa  301  1e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.444809  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0154  cysteine synthase K/M/A  51.47 
 
 		 307 aa  300  2e-80  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000000054726  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3608  cysteine synthase  56.58 
 
 		 324 aa  300  3e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0650049  hitchhiker  0.00838778 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0076  cysteine synthase A  53.59 
 
 		 307 aa  299  4e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00534286 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3416  cysteine synthase  52.61 
 
 		 311 aa  299  4e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2021  cysteine synthase A  56.25 
 
 		 309 aa  299  6e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0166882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1792  cysteine synthase  53.16 
 
 		 307 aa  297  1e-79  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000703556  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2422  cysteine synthase  56.38 
 
 		 308 aa  298  1e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0516344 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0065  cysteine synthase A  55.37 
 
 		 308 aa  296  3e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3364  cysteine synthase A  51.82 
 
 		 304 aa  296  3e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000830673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0822  cysteine synthase A  52.82 
 
 		 308 aa  296  3e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.326455 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0266  cysteine synthase A  53.9 
 
 		 291 aa  296  4e-79  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0459085  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1971  cysteine synthase  56.38 
 
 		 308 aa  295  5e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000186941  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0067  cysteine synthase A  54.72 
 
 		 308 aa  295  7e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000200639  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0264  cysteine synthase A  53.56 
 
 		 290 aa  295  9e-79  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0316091  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2365  cysteine synthase  55.18 
 
 		 322 aa  293  3e-78  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2871  cysteine synthase A  54.3 
 
 		 318 aa  292  4e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4653  cysteine synthase  47.35 
 
 		 306 aa  292  6e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518003  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2427  cysteine synthase  54.46 
 
 		 309 aa  291  7e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00952791  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3593  cysteine synthase  56.19 
 
 		 309 aa  291  1e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.471921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1551  cysteine synthase K/M/A  53.55 
 
 		 317 aa  291  1e-77  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0450  cysteine synthase  49.67 
 
 		 306 aa  291  1e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.865285 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1922  cysteine synthase A  50.65 
 
 		 307 aa  291  1e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1022  cysteine synthase A  54.46 
 
 		 310 aa  290  2e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0422971  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0902  cysteine synthase A  48.32 
 
 		 299 aa  290  2e-77  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00000000036612  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2487  cysteine synthase A  52.15 
 
 		 309 aa  290  3e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.074698 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1589  cysteine synthase  49.34 
 
 		 302 aa  290  3e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.424086  normal  0.274481 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0011  cysteine synthase A  54 
 
 		 310 aa  289  4e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.857978  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0063  cysteine synthase A  54.25 
 
 		 307 aa  289  4e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1332  cysteine synthase A  54.28 
 
 		 309 aa  289  4e-77  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000281475  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2000  cysteine synthase A  52.96 
 
 		 317 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.982832  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3445  cysteine synthase A  50 
 
 		 305 aa  289  5.0000000000000004e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1506  cysteine synthase A  53.75 
 
 		 309 aa  289  5.0000000000000004e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000603625  normal  0.533317 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2657  cysteine synthase A  54.07 
 
 		 309 aa  288  6e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.249918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0063  cysteine synthase A  54.9 
 
 		 307 aa  288  7e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1258  cysteine synthase K/M/A  53.67 
 
 		 327 aa  288  1e-76  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.198511  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1442  cysteine synthase  49.34 
 
 		 305 aa  288  1e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.593251 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1045  cysteine synthases  50 
 
 		 306 aa  288  1e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.801481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2677  cysteine synthase A  54.46 
 
 		 309 aa  288  1e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.601381  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2103  cysteine synthase  49.01 
 
 		 305 aa  287  2e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0401259  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1438  cysteine synthase A  51.32 
 
 		 305 aa  286  2e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.412307  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3280  cysteine synthase A  48.5 
 
 		 302 aa  286  2.9999999999999996e-76  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1448  cysteine synthase A  52.19 
 
 		 306 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3398  cysteine synthase A  50.84 
 
 		 307 aa  286  4e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0066  cysteine synthase A  53.27 
 
 		 307 aa  285  5e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2776  cysteine synthase A  55.7 
 
 		 312 aa  286  5e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.984194  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0452  cysteine synthase  52.13 
 
 		 319 aa  285  5e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.118838 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0420  cysteine synthase A  48.71 
 
 		 311 aa  285  5e-76  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.858609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3334  cysteine synthase A  51.97 
 
 		 309 aa  285  5.999999999999999e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.229416  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0964  cysteine synthase  50 
 
 		 320 aa  285  5.999999999999999e-76  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274794  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3460  cysteine synthases  49.34 
 
 		 305 aa  285  7e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2581  cysteine synthase A  54.13 
 
 		 309 aa  285  8e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0079  cysteine synthase A  53.92 
 
 		 307 aa  285  9e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0990  cysteine synthase A  48.32 
 
 		 299 aa  285  1.0000000000000001e-75  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  hitchhiker  0.0058381  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1149  cysteine synthase A  55.48 
 
 		 311 aa  284  1.0000000000000001e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000025777  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0075  cysteine synthase A  53.92 
 
 		 307 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5241  cysteine synthase A  53.92 
 
 		 307 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0191728 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2297  cysteine synthases  55.37 
 
 		 308 aa  284  1.0000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0067  cysteine synthase A  53.59 
 
 		 307 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0063  cysteine synthase  53.59 
 
 		 307 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0063  cysteine synthase (cysteine synthase A) (O-acetylserine sulfhydrylase)  53.59 
 
 		 307 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0051359  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0067  cysteine synthase A  53.59 
 
 		 307 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4466  cysteine synthase A  55.26 
 
 		 327 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00243818 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1210  cysteine synthase  49.19 
 
 		 305 aa  283  2.0000000000000002e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.473529  normal  0.609276 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0213  cysteine synthase  51.64 
 
 		 329 aa  283  2.0000000000000002e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0914276  normal  0.144885 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1280  cysteine synthase  54.13 
 
 		 309 aa  283  3.0000000000000004e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0485567  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0921  cysteine synthase A  53.29 
 
 		 317 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1697  cysteine synthase A  51.68 
 
 		 305 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.516314  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1831  cysteine synthase A  51.68 
 
 		 305 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1691  cysteine synthase A  51.68 
 
 		 305 aa  282  4.0000000000000003e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1919  cysteine synthase A  51.34 
 
 		 305 aa  282  5.000000000000001e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.468327  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1653  cysteine synthase A  51.34 
 
 		 305 aa  282  5.000000000000001e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>