More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3907 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3907  cysteine synthase A  100 
 
 		 307 aa  620  1e-176  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000106704  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0535  cysteine synthase A  75.9 
 
 		 307 aa  457  9.999999999999999e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0678503  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2988  cysteine synthase  76.55 
 
 		 307 aa  457  1e-127  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000571381  normal  0.7688 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2430  cysteine synthase A  67.43 
 
 		 306 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0152  cysteine synthase  62 
 
 		 310 aa  391  1e-108  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0535  cysteine synthase A  61.67 
 
 		 310 aa  388  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.775182  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0548  cysteine synthase A  61.67 
 
 		 310 aa  388  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  61.13 
 
 		 312 aa  379  1e-104  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  59.8 
 
 		 312 aa  370  1e-101  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1706  cysteine synthase  64.9 
 
 		 306 aa  359  4e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000550718  normal  0.263535 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0076  cysteine synthase A  61.59 
 
 		 307 aa  355  5e-97  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00534286 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1615  cysteine synthase A  61.79 
 
 		 308 aa  347  2e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0065  cysteine synthase A  62.95 
 
 		 308 aa  347  2e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2422  cysteine synthase  63.04 
 
 		 308 aa  346  3e-94  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0516344 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  58.69 
 
 		 311 aa  346  4e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0067  cysteine synthase A  61.97 
 
 		 308 aa  344  1e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000200639  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0011  cysteine synthase A  62.75 
 
 		 310 aa  342  4e-93  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.857978  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2000  cysteine synthase A  62.88 
 
 		 317 aa  340  2e-92  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.982832  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3364  cysteine synthase A  58.61 
 
 		 304 aa  338  5.9999999999999996e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000830673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3859  cysteine synthase A  65.2 
 
 		 309 aa  338  7e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000825635  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1718  cysteine synthase A  59.6 
 
 		 308 aa  338  9e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000370956  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0063  cysteine synthase A  61.79 
 
 		 307 aa  336  1.9999999999999998e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0079  cysteine synthase A  61.79 
 
 		 307 aa  335  5e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23060  cysteine synthase A  58.8 
 
 		 305 aa  335  5.999999999999999e-91  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000228532  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1551  cysteine synthase K/M/A  61.41 
 
 		 317 aa  335  7e-91  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0075  cysteine synthase A  62.13 
 
 		 307 aa  335  7.999999999999999e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0067  cysteine synthase A  61.46 
 
 		 307 aa  334  1e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0063  cysteine synthase  61.46 
 
 		 307 aa  334  1e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0063  cysteine synthase (cysteine synthase A) (O-acetylserine sulfhydrylase)  61.46 
 
 		 307 aa  334  1e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0051359  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0067  cysteine synthase A  61.46 
 
 		 307 aa  334  1e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3186  cysteine synthase A  62.75 
 
 		 310 aa  333  2e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000213805  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0063  cysteine synthase A  61.46 
 
 		 307 aa  333  3e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0066  cysteine synthase A  61.13 
 
 		 307 aa  332  4e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5241  cysteine synthase A  60.93 
 
 		 307 aa  332  6e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0191728 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4175  cysteine synthase  56.33 
 
 		 323 aa  330  3e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2487  cysteine synthase A  56.58 
 
 		 309 aa  328  6e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.074698 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0413  cysteine synthase  60.4 
 
 		 309 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1258  cysteine synthase K/M/A  62.42 
 
 		 327 aa  326  3e-88  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.198511  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1558  cysteine synthase  61.26 
 
 		 309 aa  325  5e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12358  cysteine synthase A cysK1  58.17 
 
 		 310 aa  325  5e-88  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0170  cysteine synthase A  51.66 
 
 		 304 aa  324  1e-87  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00475319  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1022  cysteine synthase A  60.81 
 
 		 310 aa  323  2e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0422971  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1792  cysteine synthase  54.97 
 
 		 307 aa  323  2e-87  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000703556  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0420  cysteine synthase A  57.53 
 
 		 311 aa  323  2e-87  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.858609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2677  cysteine synthase A  57.57 
 
 		 309 aa  320  1.9999999999999998e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.601381  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0154  cysteine synthase K/M/A  55.59 
 
 		 307 aa  319  3e-86  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000000054726  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0433  cysteine synthase K/M/A  55.26 
 
 		 307 aa  319  3e-86  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.818582  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1149  cysteine synthase A  59.4 
 
 		 311 aa  319  3e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000025777  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0234  cysteine synthase K/M/A  59.74 
 
 		 314 aa  319  3.9999999999999996e-86  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2871  cysteine synthase A  57.79 
 
 		 318 aa  319  3.9999999999999996e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0030  cysteine synthase A  57.28 
 
 		 311 aa  318  7e-86  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1280  cysteine synthase  56.91 
 
 		 309 aa  318  7.999999999999999e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0485567  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2233  cysteine synthase A  58.75 
 
 		 308 aa  318  9e-86  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2003  cysteine synthase A  57.76 
 
 		 308 aa  318  9e-86  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.537357 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2581  cysteine synthase A  57.24 
 
 		 309 aa  318  1e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1971  cysteine synthase  57.43 
 
 		 308 aa  316  3e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000186941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2014  cysteine synthase A  58.22 
 
 		 309 aa  315  6e-85  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0113  normal  0.0387372 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2021  cysteine synthase A  60.61 
 
 		 309 aa  315  9e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0166882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2176  cysteine synthase A  58.09 
 
 		 309 aa  315  9e-85  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.265161  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1385  cysteine synthase  53.8 
 
 		 311 aa  314  9.999999999999999e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.9014  normal  0.484311 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2657  cysteine synthase A  60.94 
 
 		 309 aa  314  9.999999999999999e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.249918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1506  cysteine synthase A  60.61 
 
 		 309 aa  313  1.9999999999999998e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000603625  normal  0.533317 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3398  cysteine synthase A  55.59 
 
 		 307 aa  313  2.9999999999999996e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3280  cysteine synthase A  56.15 
 
 		 302 aa  311  5.999999999999999e-84  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3006  cysteine synthase A  55.92 
 
 		 305 aa  311  9e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.599463  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2427  cysteine synthase  57.43 
 
 		 309 aa  311  9e-84  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00952791  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3723  cysteine synthase  55.92 
 
 		 305 aa  311  9e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.353313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2560  cysteine synthase A  57.76 
 
 		 310 aa  311  1e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1983  cysteine synthase A  54.28 
 
 		 309 aa  311  1e-83  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.722669  normal  0.957709 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3334  cysteine synthase A  59.22 
 
 		 309 aa  310  2e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.229416  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1091  cysteine synthase  57.97 
 
 		 303 aa  310  2e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000826995  decreased coverage  0.00308217 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3445  cysteine synthase A  54.61 
 
 		 305 aa  310  2e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0450  cysteine synthase  54.13 
 
 		 306 aa  309  2.9999999999999997e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.865285 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2237  cysteine synthase A  56.07 
 
 		 317 aa  309  4e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.425208 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0921  cysteine synthase A  57.53 
 
 		 317 aa  309  4e-83  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2853  cysteine synthase A  56.58 
 
 		 311 aa  308  5e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000434249  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2364  cysteine synthase  56.77 
 
 		 310 aa  309  5e-83  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.174971  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0334  cysteine synthase A  56.95 
 
 		 308 aa  308  8e-83  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2759  cysteine synthase A  56.58 
 
 		 311 aa  308  8e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1045  cysteine synthases  53.14 
 
 		 306 aa  308  9e-83  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.801481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3794  cysteine synthase  53.77 
 
 		 339 aa  307  1.0000000000000001e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1529  cysteine synthase A  54.67 
 
 		 300 aa  308  1.0000000000000001e-82  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000033727  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0865  cysteine synthase  52.96 
 
 		 306 aa  307  1.0000000000000001e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1678  cysteine synthase A  54.3 
 
 		 305 aa  306  2.0000000000000002e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.423565  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1653  cysteine synthase A  54.3 
 
 		 305 aa  306  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1875  cysteine synthase A  54.3 
 
 		 305 aa  306  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000101872 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1954  cysteine synthase A  54.3 
 
 		 305 aa  306  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221871  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1919  cysteine synthase A  54.64 
 
 		 305 aa  306  3e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.468327  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1837  cysteine synthase A  54.64 
 
 		 305 aa  306  3e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4128  cysteine synthase  56.91 
 
 		 310 aa  306  3e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1442  cysteine synthase  53.95 
 
 		 305 aa  306  3e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.593251 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1322  cysteine synthase A  54.67 
 
 		 300 aa  306  3e-82  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353191  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4307  cysteine synthase  55.63 
 
 		 309 aa  306  3e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.782932  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1697  cysteine synthase A  53.97 
 
 		 305 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.516314  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1831  cysteine synthase A  53.97 
 
 		 305 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3460  cysteine synthases  54.61 
 
 		 305 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0549  cysteine synthase A  55.18 
 
 		 310 aa  305  4.0000000000000004e-82  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000133483 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0404  cysteine synthase  54.58 
 
 		 308 aa  305  5.0000000000000004e-82  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1691  cysteine synthase A  54.64 
 
 		 305 aa  305  7e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2103  cysteine synthase  53.8 
 
 		 305 aa  305  8.000000000000001e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0401259  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>