More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1045 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1045  cysteine synthases  100 
 
 		 306 aa  621  1e-177  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.801481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2103  cysteine synthase  81.64 
 
 		 305 aa  513  1e-144  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0401259  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1210  cysteine synthase  80.92 
 
 		 305 aa  500  1e-141  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.473529  normal  0.609276 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3445  cysteine synthase A  78.69 
 
 		 305 aa  494  1e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0450  cysteine synthase  77.38 
 
 		 306 aa  489  1e-137  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.865285 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4743  cysteine synthase  79.34 
 
 		 305 aa  487  1e-136  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3398  cysteine synthase A  78.03 
 
 		 307 aa  484  1e-136  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3460  cysteine synthases  77.05 
 
 		 305 aa  479  1e-134  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1442  cysteine synthase  75.41 
 
 		 305 aa  471  1e-132  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.593251 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0865  cysteine synthase  75.82 
 
 		 306 aa  468  1.0000000000000001e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4297  cysteine synthase  77.05 
 
 		 321 aa  453  1.0000000000000001e-126  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3006  cysteine synthase A  74.75 
 
 		 305 aa  444  1.0000000000000001e-124  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.599463  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3723  cysteine synthase  74.75 
 
 		 305 aa  444  1.0000000000000001e-124  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.353313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1589  cysteine synthase  71.57 
 
 		 302 aa  441  1e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.424086  normal  0.274481 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6147  cysteine synthase A  71.48 
 
 		 305 aa  421  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6440  cysteine synthase A  71.8 
 
 		 305 aa  422  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.796756 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4653  cysteine synthase  59.41 
 
 		 306 aa  379  1e-104  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518003  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1822  cysteine synthase A  58.67 
 
 		 302 aa  349  4e-95  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.470327  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  56.33 
 
 		 312 aa  323  3e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0152  cysteine synthase  54.15 
 
 		 310 aa  322  6e-87  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0535  cysteine synthase A  54.82 
 
 		 310 aa  321  9.000000000000001e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.775182  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0548  cysteine synthase A  54.82 
 
 		 310 aa  321  9.000000000000001e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  55 
 
 		 312 aa  315  4e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1091  cysteine synthase  55.81 
 
 		 303 aa  307  1.0000000000000001e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000826995  decreased coverage  0.00308217 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2988  cysteine synthase  57.28 
 
 		 307 aa  304  1.0000000000000001e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000571381  normal  0.7688 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1706  cysteine synthase  57.48 
 
 		 306 aa  302  4.0000000000000003e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000550718  normal  0.263535 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0535  cysteine synthase A  56.91 
 
 		 307 aa  300  2e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0678503  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1615  cysteine synthase A  56.21 
 
 		 308 aa  296  3e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23060  cysteine synthase A  55.67 
 
 		 305 aa  290  3e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000228532  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0076  cysteine synthase A  52.65 
 
 		 307 aa  285  5e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00534286 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3907  cysteine synthase A  53.14 
 
 		 307 aa  285  5.999999999999999e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000106704  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0067  cysteine synthase A  57.48 
 
 		 308 aa  285  5.999999999999999e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000200639  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0065  cysteine synthase A  57.48 
 
 		 308 aa  284  1.0000000000000001e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0081  cysteine synthase A  51.01 
 
 		 301 aa  284  2.0000000000000002e-75  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.130263  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1971  cysteine synthase  56.62 
 
 		 308 aa  283  3.0000000000000004e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000186941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3280  cysteine synthase A  51.5 
 
 		 302 aa  283  4.0000000000000003e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0937  cysteine synthase A  56.33 
 
 		 326 aa  282  6.000000000000001e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.251918 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0973  cysteine synthase A  56.33 
 
 		 326 aa  282  6.000000000000001e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0856961  normal  0.0511521 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3363  cysteine synthase A  54.93 
 
 		 324 aa  281  7.000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.589605  normal  0.886902 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0717  cysteine synthase A  51.01 
 
 		 321 aa  281  1e-74  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00067142  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4757  cysteine synthase A  53.62 
 
 		 328 aa  280  3e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.157844 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0913  cysteine synthase A  56.33 
 
 		 325 aa  279  3e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.282212 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0063  cysteine synthase A  52.98 
 
 		 307 aa  279  4e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1792  cysteine synthase  53.16 
 
 		 307 aa  279  5e-74  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000703556  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0063  cysteine synthase A  53.64 
 
 		 307 aa  278  8e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0066  cysteine synthase A  52.65 
 
 		 307 aa  277  2e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0079  cysteine synthase A  52.65 
 
 		 307 aa  276  4e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2430  cysteine synthase A  55.37 
 
 		 306 aa  275  5e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0067  cysteine synthase A  52.65 
 
 		 307 aa  275  6e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0063  cysteine synthase  52.65 
 
 		 307 aa  275  6e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0063  cysteine synthase (cysteine synthase A) (O-acetylserine sulfhydrylase)  52.65 
 
 		 307 aa  275  6e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0051359  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0067  cysteine synthase A  52.65 
 
 		 307 aa  275  6e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0075  cysteine synthase A  52.32 
 
 		 307 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0549  cysteine synthase A  50.17 
 
 		 310 aa  273  2.0000000000000002e-72  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000133483 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1280  cysteine synthase  53.67 
 
 		 309 aa  274  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0485567  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3794  cysteine synthase  53.11 
 
 		 339 aa  273  3e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1529  cysteine synthase A  53.02 
 
 		 300 aa  273  3e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000033727  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5241  cysteine synthase A  52.32 
 
 		 307 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0191728 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0030  cysteine synthase A  51.32 
 
 		 311 aa  272  5.000000000000001e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3416  cysteine synthase  52.81 
 
 		 311 aa  272  5.000000000000001e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1322  cysteine synthase A  52.68 
 
 		 300 aa  272  6e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353191  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2487  cysteine synthase A  53.95 
 
 		 309 aa  272  6e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.074698 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4175  cysteine synthase  50 
 
 		 323 aa  271  9e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0170  cysteine synthase A  45.7 
 
 		 304 aa  270  2e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00475319  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2581  cysteine synthase A  53.33 
 
 		 309 aa  270  2e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2677  cysteine synthase A  53.33 
 
 		 309 aa  270  2.9999999999999997e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.601381  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3859  cysteine synthase A  54.28 
 
 		 309 aa  268  5.9999999999999995e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000825635  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1718  cysteine synthase A  52.81 
 
 		 308 aa  268  1e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000370956  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0832  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  49.66 
 
 		 306 aa  268  1e-70  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00340267  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1448  cysteine synthase A  50.66 
 
 		 306 aa  267  2e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0922  cysteine synthase A  46.64 
 
 		 304 aa  267  2e-70  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.107998  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1022  cysteine synthase A  54.25 
 
 		 310 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0422971  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1506  cysteine synthase A  54.3 
 
 		 309 aa  266  2.9999999999999995e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000603625  normal  0.533317 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2182  cysteine synthase A  52.41 
 
 		 316 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2021  cysteine synthase A  53.44 
 
 		 309 aa  266  2.9999999999999995e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0166882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2657  cysteine synthase A  53.8 
 
 		 309 aa  265  5.999999999999999e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.249918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02140  cysteine synthase  47.91 
 
 		 317 aa  265  8e-70  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.445604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2422  cysteine synthase  53.14 
 
 		 308 aa  264  1e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0516344 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0011  cysteine synthase A  51.31 
 
 		 310 aa  263  2e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.857978  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0266  cysteine synthase A  50.86 
 
 		 291 aa  263  2e-69  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0459085  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0264  cysteine synthase A  50.86 
 
 		 290 aa  264  2e-69  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0316091  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1551  cysteine synthase K/M/A  51.99 
 
 		 317 aa  264  2e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2297  cysteine synthases  53.92 
 
 		 308 aa  264  2e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0964  cysteine synthase  51.84 
 
 		 320 aa  263  3e-69  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274794  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_953  cysteine synthase  52.51 
 
 		 320 aa  263  3e-69  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000343054  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1720  cysteine synthase  50.33 
 
 		 302 aa  263  3e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0556189 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0149  cysteine synthase  49.67 
 
 		 306 aa  263  4e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3186  cysteine synthase A  52.63 
 
 		 310 aa  262  4e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000213805  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0433  cysteine synthase K/M/A  48.84 
 
 		 307 aa  262  6.999999999999999e-69  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.818582  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1541  cysteine synthase A  50.8 
 
 		 330 aa  261  8.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0154  cysteine synthase K/M/A  48.66 
 
 		 307 aa  261  8.999999999999999e-69  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000000054726  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  47.71 
 
 		 311 aa  261  8.999999999999999e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0452  cysteine synthase  51.62 
 
 		 319 aa  261  1e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.118838 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0024  cysteine synthase A  50.17 
 
 		 307 aa  260  2e-68  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2871  cysteine synthase A  52.12 
 
 		 318 aa  260  2e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3334  cysteine synthase A  53.97 
 
 		 309 aa  259  3e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.229416  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12358  cysteine synthase A cysK1  52.3 
 
 		 310 aa  259  4e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0420  cysteine synthase A  49.02 
 
 		 311 aa  259  4e-68  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.858609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0822  cysteine synthase A  50.84 
 
 		 308 aa  258  6e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.326455 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24430  cysteine synthase  51.84 
 
 		 311 aa  258  1e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.653671  normal  0.574826 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>