More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6440 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_6440  cysteine synthase A  100 
 
 		 305 aa  610  1e-173  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.796756 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6147  cysteine synthase A  98.03 
 
 		 305 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1442  cysteine synthase  80.59 
 
 		 305 aa  510  1e-143  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.593251 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3460  cysteine synthases  77.63 
 
 		 305 aa  488  1e-137  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3445  cysteine synthase A  76.32 
 
 		 305 aa  482  1e-135  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4743  cysteine synthase  75.99 
 
 		 305 aa  479  1e-134  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4297  cysteine synthase  79.28 
 
 		 321 aa  477  1e-133  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3006  cysteine synthase A  79.28 
 
 		 305 aa  473  1e-132  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.599463  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0450  cysteine synthase  75.33 
 
 		 306 aa  472  1e-132  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.865285 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3723  cysteine synthase  79.28 
 
 		 305 aa  473  1e-132  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.353313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3398  cysteine synthase A  75 
 
 		 307 aa  470  1.0000000000000001e-131  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0865  cysteine synthase  73.44 
 
 		 306 aa  466  9.999999999999999e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1210  cysteine synthase  74.01 
 
 		 305 aa  457  9.999999999999999e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.473529  normal  0.609276 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1045  cysteine synthases  71.8 
 
 		 306 aa  439  9.999999999999999e-123  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.801481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2103  cysteine synthase  67.87 
 
 		 305 aa  429  1e-119  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0401259  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1589  cysteine synthase  64.9 
 
 		 302 aa  409  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.424086  normal  0.274481 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4653  cysteine synthase  58.33 
 
 		 306 aa  374  1e-103  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518003  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1822  cysteine synthase A  62.05 
 
 		 302 aa  376  1e-103  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.470327  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0152  cysteine synthase  55.56 
 
 		 310 aa  322  5e-87  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0535  cysteine synthase A  54.55 
 
 		 310 aa  322  5e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.775182  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0548  cysteine synthase A  54.55 
 
 		 310 aa  322  5e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  52.65 
 
 		 312 aa  322  6e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1706  cysteine synthase  59.06 
 
 		 306 aa  320  1.9999999999999998e-86  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000550718  normal  0.263535 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  50.99 
 
 		 312 aa  311  1e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0717  cysteine synthase A  53.49 
 
 		 321 aa  305  5.0000000000000004e-82  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00067142  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1091  cysteine synthase  55.37 
 
 		 303 aa  302  5.000000000000001e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000826995  decreased coverage  0.00308217 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0170  cysteine synthase A  48.5 
 
 		 304 aa  300  2e-80  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00475319  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0081  cysteine synthase A  51.5 
 
 		 301 aa  295  8e-79  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.130263  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1971  cysteine synthase  54.93 
 
 		 308 aa  294  1e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000186941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3416  cysteine synthase  53.31 
 
 		 311 aa  295  1e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3280  cysteine synthase A  50 
 
 		 302 aa  292  6e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23060  cysteine synthase A  52.49 
 
 		 305 aa  290  2e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000228532  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4757  cysteine synthase A  51.97 
 
 		 328 aa  289  4e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.157844 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1792  cysteine synthase  53.16 
 
 		 307 aa  289  4e-77  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000703556  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0076  cysteine synthase A  53.04 
 
 		 307 aa  288  6e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00534286 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0937  cysteine synthase A  53.31 
 
 		 326 aa  287  2e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.251918 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0973  cysteine synthase A  53.31 
 
 		 326 aa  287  2e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0856961  normal  0.0511521 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1448  cysteine synthase A  50.33 
 
 		 306 aa  285  5.999999999999999e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2430  cysteine synthase A  53.33 
 
 		 306 aa  285  7e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3363  cysteine synthase A  51.48 
 
 		 324 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.589605  normal  0.886902 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0065  cysteine synthase A  55.41 
 
 		 308 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0067  cysteine synthase A  55.41 
 
 		 308 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000200639  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0913  cysteine synthase A  52.98 
 
 		 325 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.282212 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0063  cysteine synthase A  53.38 
 
 		 307 aa  282  6.000000000000001e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2021  cysteine synthase A  52.98 
 
 		 309 aa  281  9e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0166882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0063  cysteine synthase A  54.05 
 
 		 307 aa  280  2e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3334  cysteine synthase A  52.81 
 
 		 309 aa  279  4e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.229416  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2581  cysteine synthase A  54.36 
 
 		 309 aa  279  4e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2487  cysteine synthase A  52.15 
 
 		 309 aa  279  4e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.074698 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1983  cysteine synthase A  53.29 
 
 		 309 aa  279  5e-74  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.722669  normal  0.957709 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2677  cysteine synthase A  54.36 
 
 		 309 aa  279  5e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.601381  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0079  cysteine synthase A  53.04 
 
 		 307 aa  278  7e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0067  cysteine synthase A  53.04 
 
 		 307 aa  278  8e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0063  cysteine synthase  53.04 
 
 		 307 aa  278  8e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0063  cysteine synthase (cysteine synthase A) (O-acetylserine sulfhydrylase)  53.04 
 
 		 307 aa  278  8e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0051359  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0067  cysteine synthase A  53.04 
 
 		 307 aa  278  8e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0066  cysteine synthase A  52.7 
 
 		 307 aa  278  9e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5186  cysteine synthase A  52.79 
 
 		 327 aa  278  9e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129775  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1280  cysteine synthase  53.36 
 
 		 309 aa  278  1e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0485567  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1615  cysteine synthase A  50.33 
 
 		 308 aa  277  2e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0832  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  47.32 
 
 		 306 aa  277  2e-73  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00340267  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0075  cysteine synthase A  53.04 
 
 		 307 aa  277  2e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5241  cysteine synthase A  53.04 
 
 		 307 aa  276  3e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0191728 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3794  cysteine synthase  50.32 
 
 		 339 aa  276  3e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0264  cysteine synthase A  49.48 
 
 		 290 aa  275  6e-73  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0316091  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0030  cysteine synthase A  49.01 
 
 		 311 aa  274  1.0000000000000001e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02140  cysteine synthase  47.9 
 
 		 317 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.445604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0922  cysteine synthase A  46.28 
 
 		 304 aa  274  1.0000000000000001e-72  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.107998  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2362  cysteine synthase  50.49 
 
 		 307 aa  273  2.0000000000000002e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.306184  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2853  cysteine synthase A  54.79 
 
 		 311 aa  274  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000434249  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0266  cysteine synthase A  49.14 
 
 		 291 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0459085  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3859  cysteine synthase A  53.31 
 
 		 309 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000825635  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0149  cysteine synthase  48.17 
 
 		 306 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2759  cysteine synthase A  54.64 
 
 		 311 aa  274  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2988  cysteine synthase  51.16 
 
 		 307 aa  272  4.0000000000000004e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000571381  normal  0.7688 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0964  cysteine synthase  49.83 
 
 		 320 aa  273  4.0000000000000004e-72  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274794  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1322  cysteine synthase A  50.34 
 
 		 300 aa  272  5.000000000000001e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353191  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1438  cysteine synthase A  49.83 
 
 		 305 aa  271  7e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.412307  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3549  cysteine synthase A  51.15 
 
 		 322 aa  271  8.000000000000001e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1919  cysteine synthase A  49.67 
 
 		 305 aa  271  9e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.468327  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3653  cysteine synthase A  49.84 
 
 		 319 aa  271  9e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.528018  hitchhiker  1.6930700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0535  cysteine synthase A  51.16 
 
 		 307 aa  271  1e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0678503  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1697  cysteine synthase A  49.67 
 
 		 305 aa  271  1e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.516314  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1653  cysteine synthase A  49.67 
 
 		 305 aa  271  1e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1954  cysteine synthase A  50 
 
 		 305 aa  271  1e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221871  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1831  cysteine synthase A  49.67 
 
 		 305 aa  271  1e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0433  cysteine synthase K/M/A  47.67 
 
 		 307 aa  271  1e-71  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.818582  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0889  cysteine synthase A  46.82 
 
 		 304 aa  271  1e-71  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1691  cysteine synthase A  50 
 
 		 305 aa  270  2e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1678  cysteine synthase A  49.67 
 
 		 305 aa  270  2e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.423565  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1922  cysteine synthase A  47.68 
 
 		 307 aa  270  2e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1875  cysteine synthase A  49.67 
 
 		 305 aa  270  2e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000101872 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1718  cysteine synthase A  51.82 
 
 		 308 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000370956  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1529  cysteine synthase A  50 
 
 		 300 aa  270  2.9999999999999997e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000033727  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1837  cysteine synthase A  49.67 
 
 		 305 aa  269  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4466  cysteine synthase A  50.82 
 
 		 327 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00243818 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2422  cysteine synthase  50.5 
 
 		 308 aa  269  4e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0516344 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0404  cysteine synthase  52.01 
 
 		 308 aa  269  4e-71  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1135  cysteine synthase A  51.01 
 
 		 320 aa  269  5e-71  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0019697  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1638  cysteine synthase A  52.44 
 
 		 309 aa  269  5e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.444809  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>