More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_0170 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_0170  cysteine synthase A  100 
 
 
304 aa  612  9.999999999999999e-175  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00475319  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3280  cysteine synthase A  65.13 
 
 
302 aa  392  1e-108  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3063  cysteine synthase  66.78 
 
 
304 aa  375  1e-103  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  56.77 
 
 
312 aa  348  5e-95  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  55.78 
 
 
312 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1322  cysteine synthase A  59.21 
 
 
300 aa  338  5.9999999999999996e-92  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353191  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1529  cysteine synthase A  58.88 
 
 
300 aa  336  2.9999999999999997e-91  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000033727  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0152  cysteine synthase  54.33 
 
 
310 aa  330  2e-89  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0548  cysteine synthase A  54.3 
 
 
310 aa  327  1.0000000000000001e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0535  cysteine synthase A  54.3 
 
 
310 aa  327  1.0000000000000001e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.775182  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1448  cysteine synthase A  58.03 
 
 
306 aa  314  9.999999999999999e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4653  cysteine synthase  51.16 
 
 
306 aa  310  2e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518003  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  51.63 
 
 
311 aa  305  8.000000000000001e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0076  cysteine synthase A  55.3 
 
 
307 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00534286 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3460  cysteine synthases  50.83 
 
 
305 aa  301  6.000000000000001e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23060  cysteine synthase A  53.95 
 
 
305 aa  301  7.000000000000001e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000228532  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1442  cysteine synthase  49.5 
 
 
305 aa  299  4e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.593251 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1822  cysteine synthase A  48.84 
 
 
302 aa  298  5e-80  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.470327  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2430  cysteine synthase A  51.64 
 
 
306 aa  298  7e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0081  cysteine synthase A  50.83 
 
 
301 aa  298  1e-79  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.130263  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3907  cysteine synthase A  51.66 
 
 
307 aa  298  1e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000106704  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1655  cysteine synthase  48.69 
 
 
315 aa  297  1e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.561904  normal  0.310159 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0065  cysteine synthase A  55.81 
 
 
308 aa  297  1e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2988  cysteine synthase  51.99 
 
 
307 aa  297  2e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000571381  normal  0.7688 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0063  cysteine synthase A  56.62 
 
 
307 aa  296  4e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0067  cysteine synthase A  55.81 
 
 
308 aa  296  4e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000200639  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1087  cysteine synthase  48.66 
 
 
303 aa  294  1e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.542203  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1551  cysteine synthase K/M/A  53.64 
 
 
317 aa  294  1e-78  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1706  cysteine synthase  51.64 
 
 
306 aa  294  1e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000550718  normal  0.263535 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0717  cysteine synthase A  50.17 
 
 
321 aa  294  2e-78  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00067142  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0066  cysteine synthase A  56.62 
 
 
307 aa  292  4e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3445  cysteine synthase A  49.17 
 
 
305 aa  292  5e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0266  cysteine synthase A  53.06 
 
 
291 aa  291  6e-78  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0459085  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0079  cysteine synthase A  55.96 
 
 
307 aa  291  1e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1589  cysteine synthase  50 
 
 
302 aa  291  1e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.424086  normal  0.274481 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0063  cysteine synthase A  56.62 
 
 
307 aa  290  1e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0865  cysteine synthase  48.5 
 
 
306 aa  290  2e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0535  cysteine synthase A  51.32 
 
 
307 aa  290  3e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0678503  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0067  cysteine synthase A  55.63 
 
 
307 aa  290  3e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0063  cysteine synthase  55.63 
 
 
307 aa  290  3e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0063  cysteine synthase (cysteine synthase A) (O-acetylserine sulfhydrylase)  55.63 
 
 
307 aa  290  3e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0051359  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0067  cysteine synthase A  55.63 
 
 
307 aa  290  3e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2000  cysteine synthase A  52.32 
 
 
317 aa  289  3e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.982832  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6440  cysteine synthase A  48.5 
 
 
305 aa  290  3e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.796756 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0075  cysteine synthase A  55.96 
 
 
307 aa  289  4e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3006  cysteine synthase A  48.84 
 
 
305 aa  288  7e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.599463  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3723  cysteine synthase  48.84 
 
 
305 aa  288  7e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.353313  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1792  cysteine synthase  53.14 
 
 
307 aa  288  9e-77  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000703556  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0264  cysteine synthase A  52.38 
 
 
290 aa  288  1e-76  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0316091  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1385  cysteine synthase  46.71 
 
 
311 aa  287  2e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.9014  normal  0.484311 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6147  cysteine synthase A  48.17 
 
 
305 aa  286  2e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0149  cysteine synthase  47.04 
 
 
306 aa  286  2e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3398  cysteine synthase A  47.51 
 
 
307 aa  286  4e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5241  cysteine synthase A  55.3 
 
 
307 aa  285  5e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0191728 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1210  cysteine synthase  49.34 
 
 
305 aa  285  7e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.473529  normal  0.609276 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4743  cysteine synthase  47.84 
 
 
305 aa  284  1.0000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2103  cysteine synthase  47.68 
 
 
305 aa  284  1.0000000000000001e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0401259  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0822  cysteine synthase A  48.34 
 
 
308 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.326455 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4175  cysteine synthase  46.36 
 
 
323 aa  283  2.0000000000000002e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1718  cysteine synthase A  50.33 
 
 
308 aa  282  6.000000000000001e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000370956  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2014  cysteine synthase A  50.49 
 
 
309 aa  281  8.000000000000001e-75  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0113  normal  0.0387372 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0433  cysteine synthase K/M/A  50.33 
 
 
307 aa  281  9e-75  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.818582  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4297  cysteine synthase  47.51 
 
 
321 aa  281  9e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2003  cysteine synthase A  51.64 
 
 
308 aa  281  1e-74  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.537357 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0011  cysteine synthase A  51.8 
 
 
310 aa  281  1e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.857978  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_953  cysteine synthase  51 
 
 
320 aa  281  1e-74  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000343054  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0450  cysteine synthase  45.51 
 
 
306 aa  281  1e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.865285 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0964  cysteine synthase  50.84 
 
 
320 aa  280  2e-74  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274794  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2422  cysteine synthase  50.16 
 
 
308 aa  280  2e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0516344 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0413  cysteine synthase  50.16 
 
 
309 aa  280  2e-74  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1438  cysteine synthase A  50.67 
 
 
305 aa  280  2e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1615  cysteine synthase A  49.18 
 
 
308 aa  280  2e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3186  cysteine synthase A  51.15 
 
 
310 aa  280  3e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000213805  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1149  cysteine synthase A  51.82 
 
 
311 aa  279  4e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000025777  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2581  cysteine synthase A  48.85 
 
 
309 aa  278  6e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2677  cysteine synthase A  48.85 
 
 
309 aa  278  6e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.601381  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5186  cysteine synthase A  50.16 
 
 
327 aa  278  6e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129775  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1971  cysteine synthase  50.33 
 
 
308 aa  278  7e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000186941  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0549  cysteine synthase A  48.37 
 
 
310 aa  278  9e-74  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000133483 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2871  cysteine synthase A  49.51 
 
 
318 aa  278  9e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1280  cysteine synthase  48.2 
 
 
309 aa  277  1e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0485567  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2487  cysteine synthase A  46.89 
 
 
309 aa  277  2e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.074698 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1734  cysteine synthase  47.68 
 
 
301 aa  277  2e-73  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.30022  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1558  cysteine synthase  50.49 
 
 
309 aa  277  2e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0420  cysteine synthase A  50 
 
 
311 aa  277  2e-73  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.858609  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3859  cysteine synthase A  51.32 
 
 
309 aa  277  2e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000825635  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4466  cysteine synthase A  49.51 
 
 
327 aa  275  5e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00243818 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0404  cysteine synthase  52.3 
 
 
308 aa  275  5e-73  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0030  cysteine synthase A  51.66 
 
 
311 aa  275  7e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0334  cysteine synthase A  51.97 
 
 
308 aa  275  1.0000000000000001e-72  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3363  cysteine synthase A  50.49 
 
 
324 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.589605  normal  0.886902 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3364  cysteine synthase A  46.71 
 
 
304 aa  274  1.0000000000000001e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000830673  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1258  cysteine synthase K/M/A  49.35 
 
 
327 aa  273  2.0000000000000002e-72  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.198511  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1506  cysteine synthase A  51.15 
 
 
309 aa  273  3e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000603625  normal  0.533317 
 
 
-
 
NC_002936  DET1135  cysteine synthase A  49.83 
 
 
320 aa  272  6e-72  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0019697  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2237  cysteine synthase A  49.84 
 
 
317 aa  272  6e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.425208 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2657  cysteine synthase A  50.82 
 
 
309 aa  271  7e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.249918  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1720  cysteine synthase  48.37 
 
 
302 aa  271  1e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0556189 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1045  cysteine synthases  45.7 
 
 
306 aa  270  2e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.801481  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2021  cysteine synthase A  50.49 
 
 
309 aa  270  2.9999999999999997e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0166882  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>