More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2103 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2103  cysteine synthase  100 
 
 		 305 aa  622  1e-177  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0401259  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1045  cysteine synthases  81.64 
 
 		 306 aa  513  1e-144  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.801481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1210  cysteine synthase  79.4 
 
 		 305 aa  487  1e-137  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.473529  normal  0.609276 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4743  cysteine synthase  76.39 
 
 		 305 aa  475  1e-133  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3445  cysteine synthase A  75.74 
 
 		 305 aa  476  1e-133  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3460  cysteine synthases  75.41 
 
 		 305 aa  471  1e-132  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3398  cysteine synthase A  75.08 
 
 		 307 aa  473  1e-132  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0450  cysteine synthase  73.44 
 
 		 306 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.865285 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1442  cysteine synthase  74.1 
 
 		 305 aa  462  1e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.593251 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0865  cysteine synthase  74.84 
 
 		 306 aa  463  1e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4297  cysteine synthase  73.77 
 
 		 321 aa  440  9.999999999999999e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3006  cysteine synthase A  72.13 
 
 		 305 aa  437  1e-121  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.599463  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1589  cysteine synthase  71.24 
 
 		 302 aa  437  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.424086  normal  0.274481 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3723  cysteine synthase  72.13 
 
 		 305 aa  437  1e-121  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.353313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6440  cysteine synthase A  67.87 
 
 		 305 aa  418  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.796756 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6147  cysteine synthase A  67.54 
 
 		 305 aa  414  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4653  cysteine synthase  58.75 
 
 		 306 aa  378  1e-104  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518003  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1822  cysteine synthase A  58.33 
 
 		 302 aa  342  4e-93  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.470327  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  56.62 
 
 		 312 aa  324  1e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1706  cysteine synthase  59.14 
 
 		 306 aa  315  7e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000550718  normal  0.263535 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  54.97 
 
 		 312 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0548  cysteine synthase A  52.82 
 
 		 310 aa  308  9e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0535  cysteine synthase A  52.82 
 
 		 310 aa  308  9e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.775182  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0152  cysteine synthase  51.16 
 
 		 310 aa  301  7.000000000000001e-81  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1091  cysteine synthase  55.15 
 
 		 303 aa  296  2e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000826995  decreased coverage  0.00308217 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23060  cysteine synthase A  55.15 
 
 		 305 aa  290  2e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000228532  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0973  cysteine synthase A  55.33 
 
 		 326 aa  286  2e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0856961  normal  0.0511521 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0937  cysteine synthase A  55.33 
 
 		 326 aa  286  2e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.251918 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0913  cysteine synthase A  55.67 
 
 		 325 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.282212 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2988  cysteine synthase  53.97 
 
 		 307 aa  285  7e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000571381  normal  0.7688 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4757  cysteine synthase A  54.61 
 
 		 328 aa  285  9e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.157844 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3907  cysteine synthase A  53.8 
 
 		 307 aa  284  1.0000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000106704  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0170  cysteine synthase A  47.68 
 
 		 304 aa  284  1.0000000000000001e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00475319  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3363  cysteine synthase A  53.95 
 
 		 324 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.589605  normal  0.886902 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0535  cysteine synthase A  54.82 
 
 		 307 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0678503  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3794  cysteine synthase  54.58 
 
 		 339 aa  282  4.0000000000000003e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1792  cysteine synthase  53.33 
 
 		 307 aa  282  6.000000000000001e-75  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000703556  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1615  cysteine synthase A  54.4 
 
 		 308 aa  281  1e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3280  cysteine synthase A  50.5 
 
 		 302 aa  278  1e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3416  cysteine synthase  51.5 
 
 		 311 aa  276  3e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0067  cysteine synthase A  54.33 
 
 		 308 aa  275  8e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000200639  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0717  cysteine synthase A  48.99 
 
 		 321 aa  274  1.0000000000000001e-72  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00067142  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0065  cysteine synthase A  54 
 
 		 308 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0076  cysteine synthase A  52.46 
 
 		 307 aa  272  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00534286 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2021  cysteine synthase A  53.62 
 
 		 309 aa  272  5.000000000000001e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0166882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4175  cysteine synthase  49.01 
 
 		 323 aa  272  6e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0063  cysteine synthase A  53.31 
 
 		 307 aa  272  6e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2487  cysteine synthase A  53.29 
 
 		 309 aa  271  7e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.074698 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1448  cysteine synthase A  50.99 
 
 		 306 aa  271  1e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1971  cysteine synthase  54.97 
 
 		 308 aa  271  1e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000186941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0081  cysteine synthase A  48.99 
 
 		 301 aa  270  2e-71  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.130263  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1322  cysteine synthase A  51.68 
 
 		 300 aa  270  2e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353191  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1506  cysteine synthase A  55.12 
 
 		 309 aa  270  2e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000603625  normal  0.533317 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2657  cysteine synthase A  54.79 
 
 		 309 aa  269  2.9999999999999997e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.249918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1529  cysteine synthase A  52.01 
 
 		 300 aa  269  2.9999999999999997e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000033727  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0537  cysteine synthase  53.44 
 
 		 321 aa  270  2.9999999999999997e-71  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00106309  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0420  cysteine synthase A  50.99 
 
 		 311 aa  268  5.9999999999999995e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.858609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02140  cysteine synthase  48.55 
 
 		 317 aa  268  5.9999999999999995e-71  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.445604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0922  cysteine synthase A  46.49 
 
 		 304 aa  268  5.9999999999999995e-71  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.107998  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2430  cysteine synthase A  51.99 
 
 		 306 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0832  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  47.81 
 
 		 306 aa  266  2.9999999999999995e-70  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00340267  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3859  cysteine synthase A  53.29 
 
 		 309 aa  265  5e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000825635  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0549  cysteine synthase A  50.33 
 
 		 310 aa  266  5e-70  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000133483 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3782  cysteine synthase  51.47 
 
 		 320 aa  265  5e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00462193  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0452  cysteine synthase  52.27 
 
 		 319 aa  265  5.999999999999999e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.118838 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0063  cysteine synthase A  53.11 
 
 		 307 aa  265  5.999999999999999e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0066  cysteine synthase A  52.46 
 
 		 307 aa  264  1e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0334  cysteine synthase A  52.98 
 
 		 308 aa  263  2e-69  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2508  cysteine synthase  53.72 
 
 		 320 aa  263  2e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000293117  normal  0.173804 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1541  cysteine synthase A  51.42 
 
 		 330 aa  263  2e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1280  cysteine synthase  52 
 
 		 309 aa  263  2e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0485567  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3067  cysteine synthase  54.13 
 
 		 316 aa  264  2e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4466  cysteine synthase A  51.64 
 
 		 327 aa  264  2e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00243818 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0079  cysteine synthase A  52.46 
 
 		 307 aa  263  3e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2422  cysteine synthase  52.82 
 
 		 308 aa  263  3e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0516344 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1983  cysteine synthase A  52.63 
 
 		 309 aa  263  3e-69  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.722669  normal  0.957709 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0067  cysteine synthase A  52.46 
 
 		 307 aa  263  4e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0063  cysteine synthase  52.46 
 
 		 307 aa  263  4e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0063  cysteine synthase (cysteine synthase A) (O-acetylserine sulfhydrylase)  52.46 
 
 		 307 aa  263  4e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0051359  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0067  cysteine synthase A  52.46 
 
 		 307 aa  263  4e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0404  cysteine synthase  51.01 
 
 		 308 aa  262  4.999999999999999e-69  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3334  cysteine synthase A  53.64 
 
 		 309 aa  262  6e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.229416  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0413  cysteine synthase  54.03 
 
 		 309 aa  261  6.999999999999999e-69  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5186  cysteine synthase A  50.99 
 
 		 327 aa  261  8e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129775  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0075  cysteine synthase A  52.13 
 
 		 307 aa  261  8e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1235  cysteine synthase  51.78 
 
 		 320 aa  261  8e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.779914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2581  cysteine synthase A  51.67 
 
 		 309 aa  261  8.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  47.71 
 
 		 311 aa  261  8.999999999999999e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1551  cysteine synthase K/M/A  51.66 
 
 		 317 aa  261  1e-68  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0154  cysteine synthase K/M/A  49.83 
 
 		 307 aa  261  1e-68  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000000054726  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2677  cysteine synthase A  51.67 
 
 		 309 aa  261  1e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.601381  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1336  cysteine synthase A  52.15 
 
 		 311 aa  261  1e-68  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5241  cysteine synthase A  52.13 
 
 		 307 aa  261  1e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0191728 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3400  cysteine synthase  52.6 
 
 		 313 aa  261  1e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0024  cysteine synthase A  50.5 
 
 		 307 aa  261  2e-68  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2003  cysteine synthase A  52.12 
 
 		 308 aa  260  2e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.537357 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12358  cysteine synthase A cysK1  50.5 
 
 		 310 aa  259  4e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1718  cysteine synthase A  51.49 
 
 		 308 aa  259  4e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000370956  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1022  cysteine synthase A  52.63 
 
 		 310 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0422971  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0822  cysteine synthase A  51.35 
 
 		 308 aa  259  5.0000000000000005e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.326455 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>