More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0154 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0154  cysteine synthase K/M/A  100 
 
 		 307 aa  623  1e-177  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000000054726  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0922  cysteine synthase A  62.83 
 
 		 304 aa  401  1e-111  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.107998  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1332  cysteine synthase A  66.12 
 
 		 309 aa  400  9.999999999999999e-111  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000281475  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0433  cysteine synthase K/M/A  62.54 
 
 		 307 aa  384  1e-105  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.818582  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0889  cysteine synthase A  58.09 
 
 		 304 aa  362  6e-99  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  59.42 
 
 		 311 aa  361  8e-99  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1022  cysteine synthase A  61.64 
 
 		 310 aa  347  1e-94  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0422971  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0011  cysteine synthase A  59.87 
 
 		 310 aa  343  2e-93  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.857978  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1615  cysteine synthase A  58.8 
 
 		 308 aa  337  9.999999999999999e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2067  cysteine synthase A  58.17 
 
 		 327 aa  334  1e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.197318 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2000  cysteine synthase A  59.35 
 
 		 317 aa  333  3e-90  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.982832  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0921  cysteine synthase A  59.8 
 
 		 317 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3416  cysteine synthase  55.67 
 
 		 311 aa  327  1.0000000000000001e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1149  cysteine synthase A  57.14 
 
 		 311 aa  326  4.0000000000000003e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000025777  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4128  cysteine synthase  57.28 
 
 		 310 aa  325  7e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0902  cysteine synthase A  54.46 
 
 		 299 aa  323  2e-87  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00000000036612  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0990  cysteine synthase A  54.46 
 
 		 299 aa  322  3e-87  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  hitchhiker  0.0058381  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4407  cysteine synthase A  57.47 
 
 		 328 aa  322  4e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.119856 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  54.79 
 
 		 312 aa  322  5e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2364  cysteine synthase  56.31 
 
 		 310 aa  322  5e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.174971  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1551  cysteine synthase K/M/A  57.52 
 
 		 317 aa  322  7e-87  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3186  cysteine synthase A  55.74 
 
 		 310 aa  322  7e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000213805  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2422  cysteine synthase  58.94 
 
 		 308 aa  321  8e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0516344 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3859  cysteine synthase A  58.96 
 
 		 309 aa  320  9.999999999999999e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000825635  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12358  cysteine synthase A cysK1  55.41 
 
 		 310 aa  321  9.999999999999999e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1385  cysteine synthase  51.95 
 
 		 311 aa  321  9.999999999999999e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.9014  normal  0.484311 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2427  cysteine synthase  56.07 
 
 		 309 aa  320  1.9999999999999998e-86  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00952791  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0420  cysteine synthase A  57.95 
 
 		 311 aa  319  3e-86  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.858609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2233  cysteine synthase A  56.63 
 
 		 308 aa  319  3.9999999999999996e-86  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2988  cysteine synthase  57.89 
 
 		 307 aa  318  5e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000571381  normal  0.7688 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  54.58 
 
 		 312 aa  318  5e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0964  cysteine synthase  57.19 
 
 		 320 aa  318  9e-86  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274794  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0548  cysteine synthase A  52.43 
 
 		 310 aa  317  1e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0535  cysteine synthase A  52.43 
 
 		 310 aa  317  1e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.775182  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1971  cysteine synthase  56.62 
 
 		 308 aa  317  1e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000186941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0452  cysteine synthase  56.13 
 
 		 319 aa  316  2e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.118838 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2487  cysteine synthase A  52.44 
 
 		 309 aa  316  4e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.074698 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1280  cysteine synthase  52.77 
 
 		 309 aa  315  4e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0485567  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0152  cysteine synthase  51.49 
 
 		 310 aa  315  5e-85  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2677  cysteine synthase A  52.77 
 
 		 309 aa  315  5e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.601381  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2871  cysteine synthase A  52.92 
 
 		 318 aa  313  1.9999999999999998e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2581  cysteine synthase A  52.44 
 
 		 309 aa  313  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3080  cysteine synthase  56.39 
 
 		 309 aa  313  2.9999999999999996e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1558  cysteine synthase  57.76 
 
 		 309 aa  312  4.999999999999999e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0030  cysteine synthase A  56.49 
 
 		 311 aa  312  5.999999999999999e-84  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3334  cysteine synthase A  56.77 
 
 		 309 aa  311  6.999999999999999e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.229416  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3364  cysteine synthase A  52.13 
 
 		 304 aa  310  1e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000830673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2681  cysteine synthase A  56.33 
 
 		 308 aa  311  1e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0782138 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0535  cysteine synthase A  56.81 
 
 		 307 aa  310  2e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0678503  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2560  cysteine synthase A  55.74 
 
 		 310 aa  310  2e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2003  cysteine synthase A  55.19 
 
 		 308 aa  309  2.9999999999999997e-83  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.537357 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2014  cysteine synthase A  53.07 
 
 		 309 aa  309  2.9999999999999997e-83  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0113  normal  0.0387372 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4307  cysteine synthase  53.92 
 
 		 309 aa  310  2.9999999999999997e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.782932  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1390  cysteine synthase  57.67 
 
 		 311 aa  309  4e-83  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.173456  normal  0.100727 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2195  cysteine synthase A  54.64 
 
 		 311 aa  307  1.0000000000000001e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000876073 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0178  cysteine synthase A  55.78 
 
 		 316 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0627608  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1506  cysteine synthase A  55.84 
 
 		 309 aa  306  2.0000000000000002e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000603625  normal  0.533317 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3782  cysteine synthase  55.48 
 
 		 320 aa  306  3e-82  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00462193  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1258  cysteine synthase K/M/A  56.49 
 
 		 327 aa  306  4.0000000000000004e-82  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.198511  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1224  cysteine synthase A  52.15 
 
 		 300 aa  306  4.0000000000000004e-82  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  1.47956e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3794  cysteine synthase  54.22 
 
 		 339 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2657  cysteine synthase A  55.52 
 
 		 309 aa  306  4.0000000000000004e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.249918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2658  cysteine synthase  54.72 
 
 		 310 aa  305  5.0000000000000004e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.556672 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1983  cysteine synthase A  53.92 
 
 		 309 aa  305  5.0000000000000004e-82  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.722669  normal  0.957709 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0413  cysteine synthase  56.25 
 
 		 309 aa  305  6e-82  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2021  cysteine synthase A  58.42 
 
 		 309 aa  305  7e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0166882  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2776  cysteine synthase A  56.81 
 
 		 312 aa  305  7e-82  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.984194  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1671  cysteine synthase A  54.9 
 
 		 311 aa  304  1.0000000000000001e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.422965  normal  0.494898 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2759  cysteine synthase A  52.77 
 
 		 311 aa  303  2.0000000000000002e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2430  cysteine synthase A  57.43 
 
 		 306 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2446  cysteine synthase  53.31 
 
 		 311 aa  303  2.0000000000000002e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00671922  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24430  cysteine synthase  54.33 
 
 		 311 aa  304  2.0000000000000002e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.653671  normal  0.574826 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2853  cysteine synthase A  52.77 
 
 		 311 aa  303  2.0000000000000002e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000434249  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2176  cysteine synthase A  54.72 
 
 		 309 aa  302  4.0000000000000003e-81  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.265161  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2853  cysteine synthase A  56.73 
 
 		 320 aa  302  5.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26180  cysteine synthase  52.94 
 
 		 309 aa  302  5.000000000000001e-81  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1235  cysteine synthase  55.95 
 
 		 320 aa  302  5.000000000000001e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.779914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2286  cysteine synthase A  53.42 
 
 		 309 aa  302  6.000000000000001e-81  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23060  cysteine synthase A  55.08 
 
 		 305 aa  301  7.000000000000001e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000228532  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5019  cysteine synthase  55.16 
 
 		 320 aa  301  1e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0961303  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2609  cysteine synthase A  55.67 
 
 		 311 aa  301  1e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_953  cysteine synthase  54.18 
 
 		 320 aa  300  1e-80  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000343054  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2297  cysteine synthases  52.46 
 
 		 308 aa  301  1e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1219  cysteine synthase A  55.56 
 
 		 309 aa  300  2e-80  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.913066  normal  0.187801 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1718  cysteine synthase A  54.97 
 
 		 308 aa  300  3e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000370956  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1336  cysteine synthase A  53.44 
 
 		 311 aa  299  4e-80  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4466  cysteine synthase A  54.46 
 
 		 327 aa  299  4e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00243818 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05340  cysteine synthase  50 
 
 		 304 aa  299  4e-80  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0937  cysteine synthase A  55.45 
 
 		 326 aa  298  7e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.251918 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0973  cysteine synthase A  55.45 
 
 		 326 aa  298  7e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0856961  normal  0.0511521 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1638  cysteine synthase A  55.08 
 
 		 309 aa  298  8e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.444809  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5034  cysteine synthase A  53.21 
 
 		 320 aa  298  8e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1135  cysteine synthase A  54.7 
 
 		 320 aa  298  1e-79  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0019697  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3400  cysteine synthase  54.19 
 
 		 313 aa  297  1e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3549  cysteine synthase A  53.95 
 
 		 322 aa  298  1e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1541  cysteine synthase A  55.16 
 
 		 330 aa  296  2e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0076  cysteine synthase A  53.44 
 
 		 307 aa  296  2e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00534286 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3653  cysteine synthase A  55.45 
 
 		 319 aa  297  2e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.528018  hitchhiker  1.6930700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3067  cysteine synthase  52.44 
 
 		 316 aa  296  2e-79  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3363  cysteine synthase A  54.46 
 
 		 324 aa  296  3e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.589605  normal  0.886902 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>