More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0990 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE0990  cysteine synthase A  100 
 
 
299 aa  600  1.0000000000000001e-171  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  hitchhiker  0.0058381  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0902  cysteine synthase A  95.32 
 
 
299 aa  578  1e-164  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00000000036612  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0920  cysteine synthase A  99.6 
 
 
253 aa  501  1e-141  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000222574  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1224  cysteine synthase A  71.57 
 
 
300 aa  435  1e-121  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  1.47956e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0922  cysteine synthase A  58.42 
 
 
304 aa  348  8e-95  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.107998  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0889  cysteine synthase A  56.11 
 
 
304 aa  331  1e-89  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0433  cysteine synthase K/M/A  56.39 
 
 
307 aa  330  2e-89  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.818582  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0154  cysteine synthase K/M/A  54.46 
 
 
307 aa  322  3e-87  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000000054726  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  51.79 
 
 
311 aa  303  2.0000000000000002e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1706  cysteine synthase  54.79 
 
 
306 aa  301  7.000000000000001e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000550718  normal  0.263535 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1332  cysteine synthase A  53.85 
 
 
309 aa  294  2e-78  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000281475  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1971  cysteine synthase  52.96 
 
 
308 aa  290  2e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000186941  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1615  cysteine synthase A  52.48 
 
 
308 aa  289  5.0000000000000004e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  51.82 
 
 
312 aa  288  8e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0081  cysteine synthase A  51.67 
 
 
301 aa  287  1e-76  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.130263  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  51.49 
 
 
312 aa  286  2e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1551  cysteine synthase K/M/A  52.12 
 
 
317 aa  286  2.9999999999999996e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0011  cysteine synthase A  51.78 
 
 
310 aa  281  9e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.857978  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0921  cysteine synthase A  51.31 
 
 
317 aa  280  2e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23060  cysteine synthase A  53.62 
 
 
305 aa  280  3e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000228532  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2003  cysteine synthase A  50 
 
 
308 aa  279  4e-74  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.537357 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3416  cysteine synthase  47.04 
 
 
311 aa  278  8e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2364  cysteine synthase  48.2 
 
 
310 aa  278  9e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.174971  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1385  cysteine synthase  47.39 
 
 
311 aa  277  1e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.9014  normal  0.484311 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0717  cysteine synthase A  48.67 
 
 
321 aa  276  3e-73  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00067142  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2871  cysteine synthase A  49.35 
 
 
318 aa  276  4e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2014  cysteine synthase A  50 
 
 
309 aa  275  6e-73  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0113  normal  0.0387372 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0266  cysteine synthase A  53.26 
 
 
291 aa  275  7e-73  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0459085  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1149  cysteine synthase A  50.81 
 
 
311 aa  274  1.0000000000000001e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000025777  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2988  cysteine synthase  52.49 
 
 
307 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000571381  normal  0.7688 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0264  cysteine synthase A  53.26 
 
 
290 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0316091  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1022  cysteine synthase A  50.81 
 
 
310 aa  272  5.000000000000001e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0422971  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3859  cysteine synthase A  52.13 
 
 
309 aa  272  6e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000825635  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1718  cysteine synthase A  50.16 
 
 
308 aa  271  8.000000000000001e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000370956  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1589  cysteine synthase  48.81 
 
 
302 aa  271  1e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.424086  normal  0.274481 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1734  cysteine synthase  49.14 
 
 
301 aa  271  1e-71  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.30022  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1558  cysteine synthase  51.15 
 
 
309 aa  270  2e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12358  cysteine synthase A cysK1  48.21 
 
 
310 aa  270  2e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1258  cysteine synthase K/M/A  50.82 
 
 
327 aa  269  2.9999999999999997e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.198511  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2233  cysteine synthase A  47.39 
 
 
308 aa  270  2.9999999999999997e-71  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1822  cysteine synthase A  46.98 
 
 
302 aa  270  2.9999999999999997e-71  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.470327  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0535  cysteine synthase A  51.83 
 
 
307 aa  269  4e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0678503  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2000  cysteine synthase A  50 
 
 
317 aa  268  8e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.982832  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3364  cysteine synthase A  45.9 
 
 
304 aa  267  2e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000830673  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3186  cysteine synthase A  50.16 
 
 
310 aa  267  2e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000213805  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0030  cysteine synthase A  51.96 
 
 
311 aa  266  4e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0964  cysteine synthase  48.99 
 
 
320 aa  265  5e-70  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274794  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1638  cysteine synthase A  49.67 
 
 
309 aa  266  5e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.444809  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1301  cysteine synthase A  48.7 
 
 
309 aa  265  5.999999999999999e-70  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.568697 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0420  cysteine synthase A  48.7 
 
 
311 aa  265  8e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.858609  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4128  cysteine synthase  50.33 
 
 
310 aa  264  1e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2195  cysteine synthase A  50.16 
 
 
311 aa  263  3e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000876073 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0234  cysteine synthase K/M/A  49.18 
 
 
314 aa  263  4e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0213  cysteine synthase  49.51 
 
 
329 aa  262  4.999999999999999e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0914276  normal  0.144885 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0549  cysteine synthase A  47.21 
 
 
310 aa  262  6e-69  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000133483 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0178  cysteine synthase A  51.95 
 
 
331 aa  262  6e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0075  cysteine synthase A  48.69 
 
 
328 aa  261  6.999999999999999e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24430  cysteine synthase  50.33 
 
 
311 aa  261  6.999999999999999e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.653671  normal  0.574826 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1919  cysteine synthase A  50 
 
 
305 aa  261  1e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.468327  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4175  cysteine synthase  48.32 
 
 
323 aa  261  1e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1534  cysteine synthase A  50 
 
 
298 aa  261  1e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_953  cysteine synthase  47.67 
 
 
320 aa  261  1e-68  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000343054  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1438  cysteine synthase A  50 
 
 
305 aa  261  1e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.412307  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3794  cysteine synthase  47.88 
 
 
339 aa  260  2e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2427  cysteine synthase  47.56 
 
 
309 aa  260  2e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00952791  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12320  cysteine synthase  48.37 
 
 
309 aa  260  2e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.154234  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1438  cysteine synthase A  49.67 
 
 
305 aa  260  2e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3067  cysteine synthase  49.51 
 
 
316 aa  260  2e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1678  cysteine synthase A  50 
 
 
305 aa  259  3e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.423565  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0913  cysteine synthase A  49.84 
 
 
325 aa  259  3e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.282212 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1875  cysteine synthase A  50 
 
 
305 aa  259  3e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000101872 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2712  cysteine synthase  49.83 
 
 
304 aa  259  3e-68  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.470857  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4466  cysteine synthase A  50.32 
 
 
327 aa  259  4e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00243818 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1837  cysteine synthase A  50 
 
 
305 aa  259  4e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2286  cysteine synthase A  50.97 
 
 
309 aa  259  4e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1691  cysteine synthase A  50 
 
 
305 aa  259  4e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0973  cysteine synthase A  49.84 
 
 
326 aa  259  4e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0856961  normal  0.0511521 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1954  cysteine synthase A  49.67 
 
 
305 aa  259  4e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221871  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26180  cysteine synthase  48.52 
 
 
309 aa  259  4e-68  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0937  cysteine synthase A  49.84 
 
 
326 aa  259  4e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.251918 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3400  cysteine synthase  48.54 
 
 
313 aa  259  5.0000000000000005e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0152  cysteine synthase  44.77 
 
 
310 aa  259  5.0000000000000005e-68  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2422  cysteine synthase  47.87 
 
 
308 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0516344 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1653  cysteine synthase A  49.67 
 
 
305 aa  258  6e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3506  cysteine synthase A  50 
 
 
305 aa  258  6e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2067  cysteine synthase A  47.73 
 
 
327 aa  258  6e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.197318 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1697  cysteine synthase A  49.67 
 
 
305 aa  258  7e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.516314  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1831  cysteine synthase A  49.67 
 
 
305 aa  258  7e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3782  cysteine synthase  47.4 
 
 
320 aa  258  7e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00462193  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1983  cysteine synthase A  47.21 
 
 
309 aa  258  8e-68  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.722669  normal  0.957709 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2487  cysteine synthase A  45.75 
 
 
309 aa  258  9e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.074698 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1541  cysteine synthase A  47.4 
 
 
330 aa  258  1e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2176  cysteine synthase A  47.54 
 
 
309 aa  257  2e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.265161  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1280  cysteine synthase  44.44 
 
 
309 aa  257  2e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0485567  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0535  cysteine synthase A  44.12 
 
 
310 aa  256  4e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.775182  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0548  cysteine synthase A  44.12 
 
 
310 aa  256  4e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2581  cysteine synthase A  44.44 
 
 
309 aa  256  4e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5186  cysteine synthase A  49.51 
 
 
327 aa  256  5e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129775  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3363  cysteine synthase A  49.35 
 
 
324 aa  255  5e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.589605  normal  0.886902 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1671  cysteine synthase A  48.37 
 
 
311 aa  255  6e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.422965  normal  0.494898 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>