More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_1280 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_1280  cysteine synthase  100 
 
 
309 aa  617  1e-176  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0485567  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2581  cysteine synthase A  97.09 
 
 
309 aa  580  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2677  cysteine synthase A  97.09 
 
 
309 aa  580  1e-164  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.601381  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2487  cysteine synthase A  83.17 
 
 
309 aa  508  1e-143  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.074698 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2759  cysteine synthase A  79.48 
 
 
311 aa  474  1e-132  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2853  cysteine synthase A  79.15 
 
 
311 aa  473  1e-132  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000434249  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2647  cysteine synthase A  81.11 
 
 
310 aa  468  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.100926  normal  0.593402 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2668  cysteine synthase  80.78 
 
 
311 aa  467  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.456987  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12358  cysteine synthase A cysK1  69.81 
 
 
310 aa  409  1e-113  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2427  cysteine synthase  69.84 
 
 
309 aa  403  1e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00952791  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1336  cysteine synthase A  66.88 
 
 
311 aa  395  1e-109  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2422  cysteine synthase  66.34 
 
 
308 aa  397  1e-109  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0516344 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1022  cysteine synthase A  64.4 
 
 
310 aa  390  1e-107  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0422971  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1983  cysteine synthase A  64.38 
 
 
309 aa  385  1e-106  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.722669  normal  0.957709 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2021  cysteine synthase A  68.73 
 
 
309 aa  386  1e-106  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0166882  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  61.69 
 
 
311 aa  387  1e-106  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0420  cysteine synthase A  62.25 
 
 
311 aa  383  1e-105  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.858609  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4128  cysteine synthase  65.05 
 
 
310 aa  383  1e-105  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0030  cysteine synthase A  61.61 
 
 
311 aa  383  1e-105  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2096  cysteine synthase  63.23 
 
 
323 aa  378  1e-104  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.553585  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1506  cysteine synthase A  67.53 
 
 
309 aa  378  1e-104  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000603625  normal  0.533317 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1971  cysteine synthase  63.19 
 
 
308 aa  377  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000186941  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2657  cysteine synthase A  67.53 
 
 
309 aa  375  1e-103  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.249918  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3859  cysteine synthase A  62.95 
 
 
309 aa  374  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000825635  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1558  cysteine synthase  65.69 
 
 
309 aa  372  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2853  cysteine synthase A  61.86 
 
 
320 aa  372  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2000  cysteine synthase A  61.89 
 
 
317 aa  372  1e-102  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.982832  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0452  cysteine synthases  66.67 
 
 
308 aa  371  1e-102  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1219  cysteine synthase A  62.09 
 
 
309 aa  370  1e-101  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.913066  normal  0.187801 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2067  cysteine synthase A  59.55 
 
 
327 aa  369  1e-101  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.197318 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0452  cysteine synthase  63.02 
 
 
319 aa  369  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.118838 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3334  cysteine synthase A  66.34 
 
 
309 aa  370  1e-101  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.229416  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1149  cysteine synthase A  61.81 
 
 
311 aa  368  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000025777  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4407  cysteine synthase A  61.29 
 
 
328 aa  365  1e-100  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.119856 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24430  cysteine synthase  60.59 
 
 
311 aa  366  1e-100  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.653671  normal  0.574826 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1541  cysteine synthase A  61.74 
 
 
330 aa  365  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2195  cysteine synthase A  59.42 
 
 
311 aa  366  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000876073 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5019  cysteine synthase  62.06 
 
 
320 aa  366  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0961303  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1551  cysteine synthase K/M/A  60.26 
 
 
317 aa  367  1e-100  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1615  cysteine synthase A  59.87 
 
 
308 aa  365  1e-100  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3782  cysteine synthase  60.77 
 
 
320 aa  365  1e-100  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00462193  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1390  cysteine synthase  61.89 
 
 
311 aa  364  1e-100  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.173456  normal  0.100727 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2609  cysteine synthase A  64.17 
 
 
311 aa  365  1e-100  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2233  cysteine synthase A  60.91 
 
 
308 aa  367  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3400  cysteine synthase  61.74 
 
 
313 aa  366  1e-100  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  58.42 
 
 
312 aa  363  1e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2560  cysteine synthase A  64.26 
 
 
310 aa  364  1e-99  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0234  cysteine synthase K/M/A  61.56 
 
 
314 aa  363  2e-99  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2364  cysteine synthase  59.61 
 
 
310 aa  362  3e-99  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.174971  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1718  cysteine synthase A  61.11 
 
 
308 aa  362  4e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000370956  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2681  cysteine synthase A  62.3 
 
 
308 aa  362  6e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0782138 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0413  cysteine synthase  60 
 
 
309 aa  361  7.0000000000000005e-99  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1385  cysteine synthase  59.02 
 
 
311 aa  361  9e-99  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.9014  normal  0.484311 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2508  cysteine synthase  62.5 
 
 
320 aa  361  1e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000293117  normal  0.173804 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1235  cysteine synthase  61.22 
 
 
320 aa  360  1e-98  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.779914  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2003  cysteine synthase A  60.26 
 
 
308 aa  360  1e-98  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.537357 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  57.24 
 
 
312 aa  360  2e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1258  cysteine synthase K/M/A  61.56 
 
 
327 aa  358  7e-98  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.198511  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0075  cysteine synthase A  62.21 
 
 
328 aa  358  8e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0964  cysteine synthase  59.33 
 
 
320 aa  357  1.9999999999999998e-97  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274794  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2446  cysteine synthase  59.09 
 
 
311 aa  356  2.9999999999999997e-97  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00671922  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1671  cysteine synthase A  59.28 
 
 
311 aa  355  5e-97  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.422965  normal  0.494898 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0213  cysteine synthase  61.36 
 
 
329 aa  355  5.999999999999999e-97  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0914276  normal  0.144885 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5034  cysteine synthase A  61.29 
 
 
320 aa  354  1e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0477  cysteine synthase  62.46 
 
 
332 aa  354  1e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0364  cysteine synthase  61.24 
 
 
322 aa  354  1e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0011  cysteine synthase A  59.22 
 
 
310 aa  353  2.9999999999999997e-96  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.857978  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1466  cysteine synthase  63.87 
 
 
334 aa  353  2.9999999999999997e-96  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00108529  normal  0.10478 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1706  cysteine synthase  63.07 
 
 
306 aa  352  2.9999999999999997e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000550718  normal  0.263535 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0921  cysteine synthase A  58.96 
 
 
317 aa  352  2.9999999999999997e-96  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2176  cysteine synthase A  60.39 
 
 
309 aa  352  4e-96  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.265161  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4307  cysteine synthase  60.13 
 
 
309 aa  351  8.999999999999999e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.782932  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2014  cysteine synthase A  58.58 
 
 
309 aa  350  2e-95  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0113  normal  0.0387372 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1502  cysteine synthase A  60.58 
 
 
321 aa  350  2e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.18267e-17 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3416  cysteine synthase  58.22 
 
 
311 aa  349  3e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0343  cysteine synthase A  61.81 
 
 
332 aa  349  4e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.516891  normal  0.476462 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0444  cysteine synthase A  62.7 
 
 
320 aa  348  5e-95  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00894315 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0433  cysteine synthase A  62.7 
 
 
320 aa  348  5e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3549  cysteine synthase A  59.74 
 
 
322 aa  348  7e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_953  cysteine synthase  58.33 
 
 
320 aa  347  1e-94  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000343054  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2182  cysteine synthase A  59.35 
 
 
316 aa  347  1e-94  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5186  cysteine synthase A  59.22 
 
 
327 aa  347  2e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129775  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0559  cysteine synthase A  60.52 
 
 
332 aa  347  2e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.770107  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4605  cysteine synthase A  61.04 
 
 
320 aa  346  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3186  cysteine synthase A  58.9 
 
 
310 aa  346  3e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000213805  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4340  cysteine synthase A  60.71 
 
 
320 aa  345  5e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.238175  normal  0.899822 
 
 
-
 
NC_002936  DET1135  cysteine synthase A  57.48 
 
 
320 aa  344  8.999999999999999e-94  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0019697  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3364  cysteine synthase A  57.7 
 
 
304 aa  344  1e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000830673  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4466  cysteine synthase A  59.55 
 
 
327 aa  344  1e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00243818 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26180  cysteine synthase  60.13 
 
 
309 aa  343  2e-93  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0433  cysteine synthase K/M/A  55.05 
 
 
307 aa  342  4e-93  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.818582  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1638  cysteine synthase A  59.02 
 
 
309 aa  342  4e-93  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.444809  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0152  cysteine synthase  57.62 
 
 
310 aa  340  1e-92  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3067  cysteine synthase  58.12 
 
 
316 aa  340  2e-92  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1332  cysteine synthase A  56.77 
 
 
309 aa  339  2.9999999999999998e-92  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000281475  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2871  cysteine synthase A  57.33 
 
 
318 aa  340  2.9999999999999998e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1111  cysteine synthase A  59.61 
 
 
311 aa  338  5.9999999999999996e-92  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0492008  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3794  cysteine synthase  57.65 
 
 
339 aa  338  5.9999999999999996e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0548  cysteine synthase A  56.62 
 
 
310 aa  337  1.9999999999999998e-91  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0922  cysteine synthase A  52.61 
 
 
304 aa  337  1.9999999999999998e-91  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.107998  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>