More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1385 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1385  cysteine synthase  100 
 
 		 311 aa  629  1e-179  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.9014  normal  0.484311 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1638  cysteine synthase A  62.78 
 
 		 309 aa  379  1e-104  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.444809  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2297  cysteine synthases  65.26 
 
 		 308 aa  380  1e-104  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  60.13 
 
 		 311 aa  371  1e-102  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12358  cysteine synthase A cysK1  62.42 
 
 		 310 aa  365  1e-100  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2487  cysteine synthase A  60.59 
 
 		 309 aa  361  1e-98  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.074698 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3080  cysteine synthase  62.78 
 
 		 309 aa  356  2.9999999999999997e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2427  cysteine synthase  61.44 
 
 		 309 aa  355  3.9999999999999996e-97  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00952791  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3416  cysteine synthase  58.31 
 
 		 311 aa  355  5.999999999999999e-97  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2677  cysteine synthase A  60 
 
 		 309 aa  353  2e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.601381  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2759  cysteine synthase A  59.93 
 
 		 311 aa  352  5e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1558  cysteine synthase  61.56 
 
 		 309 aa  352  5e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  57.05 
 
 		 312 aa  352  5e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2853  cysteine synthase A  59.93 
 
 		 311 aa  352  7e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000434249  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2581  cysteine synthase A  59.67 
 
 		 309 aa  350  1e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3859  cysteine synthase A  60.86 
 
 		 309 aa  350  2e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000825635  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2003  cysteine synthase A  62.01 
 
 		 308 aa  348  5e-95  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.537357 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2560  cysteine synthase A  61.76 
 
 		 310 aa  348  5e-95  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2871  cysteine synthase A  57.79 
 
 		 318 aa  348  5e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  55.56 
 
 		 312 aa  348  8e-95  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1022  cysteine synthase A  60.91 
 
 		 310 aa  347  1e-94  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0422971  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3364  cysteine synthase A  57.7 
 
 		 304 aa  347  2e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000830673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1280  cysteine synthase  59.02 
 
 		 309 aa  345  8e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0485567  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2668  cysteine synthase  60.59 
 
 		 311 aa  344  1e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.456987  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0030  cysteine synthase A  57.14 
 
 		 311 aa  343  2.9999999999999997e-93  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2681  cysteine synthase A  60.53 
 
 		 308 aa  343  2.9999999999999997e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0782138 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2000  cysteine synthase A  57.88 
 
 		 317 aa  342  7e-93  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.982832  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2422  cysteine synthase  59.67 
 
 		 308 aa  340  1e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0516344 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2021  cysteine synthase A  61.69 
 
 		 309 aa  340  2e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0166882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0413  cysteine synthase  56.86 
 
 		 309 aa  339  2.9999999999999998e-92  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3334  cysteine synthase A  60.84 
 
 		 309 aa  339  2.9999999999999998e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.229416  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0889  cysteine synthase A  53.44 
 
 		 304 aa  338  7e-92  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1718  cysteine synthase A  58.55 
 
 		 308 aa  338  9.999999999999999e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000370956  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1219  cysteine synthase A  58.36 
 
 		 309 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.913066  normal  0.187801 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0433  cysteine synthase K/M/A  54.72 
 
 		 307 aa  336  2.9999999999999997e-91  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.818582  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24430  cysteine synthase  58.17 
 
 		 311 aa  335  5e-91  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.653671  normal  0.574826 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2658  cysteine synthase  60.26 
 
 		 310 aa  335  5e-91  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.556672 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1551  cysteine synthase K/M/A  55.95 
 
 		 317 aa  335  5.999999999999999e-91  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0964  cysteine synthase  56.67 
 
 		 320 aa  335  5.999999999999999e-91  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274794  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2233  cysteine synthase A  58.77 
 
 		 308 aa  335  7e-91  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1336  cysteine synthase A  60.78 
 
 		 311 aa  335  9e-91  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0213  cysteine synthase  59.61 
 
 		 329 aa  335  9e-91  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0914276  normal  0.144885 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0452  cysteine synthases  60.33 
 
 		 308 aa  333  2e-90  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0922  cysteine synthase A  53.44 
 
 		 304 aa  333  2e-90  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.107998  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1149  cysteine synthase A  58.77 
 
 		 311 aa  333  3e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000025777  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2176  cysteine synthase A  58.96 
 
 		 309 aa  333  3e-90  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.265161  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0420  cysteine synthase A  56.13 
 
 		 311 aa  332  4e-90  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.858609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0452  cysteine synthase  57.01 
 
 		 319 aa  332  7.000000000000001e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.118838 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1615  cysteine synthase A  56.11 
 
 		 308 aa  331  1e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1983  cysteine synthase A  57.38 
 
 		 309 aa  330  2e-89  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.722669  normal  0.957709 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2364  cysteine synthase  57.65 
 
 		 310 aa  330  2e-89  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.174971  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0921  cysteine synthase A  55.31 
 
 		 317 aa  329  3e-89  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2647  cysteine synthase A  60.33 
 
 		 310 aa  329  4e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.100926  normal  0.593402 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2657  cysteine synthase A  59.87 
 
 		 309 aa  328  5.0000000000000004e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.249918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1506  cysteine synthase A  59.55 
 
 		 309 aa  327  2.0000000000000001e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000603625  normal  0.533317 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4128  cysteine synthase  59.02 
 
 		 310 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_953  cysteine synthase  55.67 
 
 		 320 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000343054  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1502  cysteine synthase A  57.74 
 
 		 321 aa  325  4.0000000000000003e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.18267e-17 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5034  cysteine synthase A  55.19 
 
 		 320 aa  325  9e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2096  cysteine synthase  56.73 
 
 		 323 aa  324  1e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.553585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1235  cysteine synthase  56.27 
 
 		 320 aa  324  1e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.779914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0178  cysteine synthase A  60.59 
 
 		 331 aa  323  2e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1541  cysteine synthase A  56.17 
 
 		 330 aa  323  2e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1671  cysteine synthase A  57.52 
 
 		 311 aa  323  2e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.422965  normal  0.494898 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0559  cysteine synthase A  59.8 
 
 		 332 aa  323  3e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.770107  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0075  cysteine synthase A  59.15 
 
 		 328 aa  323  3e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2195  cysteine synthase A  56.91 
 
 		 311 aa  322  6e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000876073 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0234  cysteine synthase K/M/A  58.63 
 
 		 314 aa  322  7e-87  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1332  cysteine synthase A  54.97 
 
 		 309 aa  321  8e-87  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000281475  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1258  cysteine synthase K/M/A  57.79 
 
 		 327 aa  321  9.000000000000001e-87  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.198511  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4466  cysteine synthase A  58.17 
 
 		 327 aa  320  9.999999999999999e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00243818 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3400  cysteine synthase  55.16 
 
 		 313 aa  321  9.999999999999999e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2853  cysteine synthase A  54.55 
 
 		 320 aa  321  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0154  cysteine synthase K/M/A  51.95 
 
 		 307 aa  321  9.999999999999999e-87  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000000054726  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3782  cysteine synthase  56.49 
 
 		 320 aa  320  9.999999999999999e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00462193  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1706  cysteine synthase  59.02 
 
 		 306 aa  320  1.9999999999999998e-86  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000550718  normal  0.263535 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1466  cysteine synthase  58.71 
 
 		 334 aa  318  5e-86  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00108529  normal  0.10478 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0152  cysteine synthase  52.63 
 
 		 310 aa  318  6e-86  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5019  cysteine synthase  54.55 
 
 		 320 aa  318  7e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0961303  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26180  cysteine synthase  57.38 
 
 		 309 aa  318  7e-86  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2182  cysteine synthase A  55.16 
 
 		 316 aa  318  7.999999999999999e-86  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1390  cysteine synthase  57.19 
 
 		 311 aa  318  7.999999999999999e-86  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.173456  normal  0.100727 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2446  cysteine synthase  56.25 
 
 		 311 aa  318  9e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00671922  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2508  cysteine synthase  57.79 
 
 		 320 aa  317  1e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000293117  normal  0.173804 
 
 
-
 
NC_002936  DET1135  cysteine synthase A  54.15 
 
 		 320 aa  317  2e-85  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0019697  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4757  cysteine synthase A  55.88 
 
 		 328 aa  315  8e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.157844 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2609  cysteine synthase A  56.86 
 
 		 311 aa  315  8e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5186  cysteine synthase A  56.54 
 
 		 327 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129775  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1971  cysteine synthase  56.21 
 
 		 308 aa  314  1.9999999999999998e-84  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000186941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0477  cysteine synthase  58.5 
 
 		 332 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3068  cysteine synthase A  52.23 
 
 		 316 aa  312  3.9999999999999997e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0145676  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4360  cysteine synthase  58.17 
 
 		 322 aa  311  9e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2237  cysteine synthase A  54.46 
 
 		 317 aa  311  9e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.425208 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0556  cysteine synthases  55.59 
 
 		 323 aa  311  9e-84  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.523099  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3653  cysteine synthase A  55.56 
 
 		 319 aa  311  1e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.528018  hitchhiker  1.6930700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3256  cysteine synthase A  55.23 
 
 		 309 aa  310  2e-83  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3067  cysteine synthase  55.23 
 
 		 316 aa  310  2e-83  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4307  cysteine synthase  57.05 
 
 		 309 aa  310  2e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.782932  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0011  cysteine synthase A  53.23 
 
 		 310 aa  310  2e-83  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.857978  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0343  cysteine synthase A  58.17 
 
 		 332 aa  309  2.9999999999999997e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.516891  normal  0.476462 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>