More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2176 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_2176  cysteine synthase A  100 
 
 		 309 aa  621  1e-177  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.265161  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2364  cysteine synthase  75.9 
 
 		 310 aa  461  1e-129  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.174971  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0234  cysteine synthase K/M/A  75.57 
 
 		 314 aa  436  1e-121  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2233  cysteine synthase A  71.01 
 
 		 308 aa  425  1e-118  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2003  cysteine synthase A  70.03 
 
 		 308 aa  426  1e-118  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.537357 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0413  cysteine synthase  67.65 
 
 		 309 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1558  cysteine synthase  67.32 
 
 		 309 aa  384  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  63.64 
 
 		 311 aa  382  1e-105  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0420  cysteine synthase A  65.23 
 
 		 311 aa  378  1e-104  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.858609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2422  cysteine synthase  64.71 
 
 		 308 aa  377  1e-103  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0516344 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2487  cysteine synthase A  62.54 
 
 		 309 aa  372  1e-102  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.074698 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2759  cysteine synthase A  62.78 
 
 		 311 aa  368  1e-101  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3859  cysteine synthase A  65.25 
 
 		 309 aa  370  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000825635  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1983  cysteine synthase A  64.71 
 
 		 309 aa  368  1e-101  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.722669  normal  0.957709 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2067  cysteine synthase A  60.52 
 
 		 327 aa  365  1e-100  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.197318 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3794  cysteine synthase  61.69 
 
 		 339 aa  364  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1615  cysteine synthase A  62.5 
 
 		 308 aa  365  1e-100  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2853  cysteine synthase A  62.78 
 
 		 311 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000434249  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  59.15 
 
 		 312 aa  364  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1219  cysteine synthase A  66.01 
 
 		 309 aa  364  1e-99  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.913066  normal  0.187801 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12358  cysteine synthase A cysK1  61.36 
 
 		 310 aa  362  5.0000000000000005e-99  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1638  cysteine synthase A  60.33 
 
 		 309 aa  361  9e-99  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.444809  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1385  cysteine synthase  58.96 
 
 		 311 aa  359  4e-98  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.9014  normal  0.484311 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0213  cysteine synthase  61.94 
 
 		 329 aa  358  5e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0914276  normal  0.144885 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  58.82 
 
 		 312 aa  358  5e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2871  cysteine synthase A  60.91 
 
 		 318 aa  358  7e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2668  cysteine synthase  64.08 
 
 		 311 aa  358  7e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.456987  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2677  cysteine synthase A  61.04 
 
 		 309 aa  356  2.9999999999999997e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.601381  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2581  cysteine synthase A  60.71 
 
 		 309 aa  355  5e-97  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2681  cysteine synthase A  62.62 
 
 		 308 aa  355  5e-97  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0782138 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4407  cysteine synthase A  62.14 
 
 		 328 aa  353  2e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.119856 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3549  cysteine synthase A  60.65 
 
 		 322 aa  352  2.9999999999999997e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1280  cysteine synthase  60.39 
 
 		 309 aa  353  2.9999999999999997e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0485567  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1149  cysteine synthase A  62.99 
 
 		 311 aa  352  4e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000025777  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3364  cysteine synthase A  60 
 
 		 304 aa  351  8e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000830673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1971  cysteine synthase  61.89 
 
 		 308 aa  351  1e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000186941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2096  cysteine synthase  61.81 
 
 		 323 aa  350  1e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.553585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0452  cysteine synthases  62.42 
 
 		 308 aa  350  2e-95  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2647  cysteine synthase A  63.52 
 
 		 310 aa  349  4e-95  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.100926  normal  0.593402 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4757  cysteine synthase A  58.25 
 
 		 328 aa  349  4e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.157844 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3067  cysteine synthase  59.09 
 
 		 316 aa  349  4e-95  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0178  cysteine synthase A  58.96 
 
 		 316 aa  348  5e-95  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0627608  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5186  cysteine synthase A  61.24 
 
 		 327 aa  348  5e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129775  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3416  cysteine synthase  56.96 
 
 		 311 aa  348  9e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5019  cysteine synthase  60.77 
 
 		 320 aa  347  1e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0961303  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0364  cysteine synthase  63.52 
 
 		 322 aa  347  1e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2000  cysteine synthase A  61.54 
 
 		 317 aa  347  1e-94  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.982832  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1022  cysteine synthase A  61.36 
 
 		 310 aa  347  2e-94  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0422971  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3186  cysteine synthase A  60.26 
 
 		 310 aa  347  2e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000213805  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3782  cysteine synthase  59.81 
 
 		 320 aa  347  2e-94  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00462193  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3363  cysteine synthase A  60.26 
 
 		 324 aa  345  5e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.589605  normal  0.886902 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0075  cysteine synthase A  62.46 
 
 		 328 aa  345  5e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2427  cysteine synthase  61.64 
 
 		 309 aa  345  5e-94  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00952791  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4466  cysteine synthase A  60.91 
 
 		 327 aa  343  2e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00243818 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4128  cysteine synthase  61.36 
 
 		 310 aa  343  2e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2853  cysteine synthase A  58.52 
 
 		 320 aa  343  2e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0178  cysteine synthase A  62.9 
 
 		 331 aa  342  4e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1541  cysteine synthase A  57.37 
 
 		 330 aa  342  4e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1235  cysteine synthase  59.29 
 
 		 320 aa  342  4e-93  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.779914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2021  cysteine synthase A  63.84 
 
 		 309 aa  342  5e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0166882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1718  cysteine synthase A  59.15 
 
 		 308 aa  342  7e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000370956  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0548  cysteine synthase A  58.31 
 
 		 310 aa  342  7e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0535  cysteine synthase A  58.31 
 
 		 310 aa  342  7e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.775182  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0433  cysteine synthase K/M/A  56.03 
 
 		 307 aa  341  8e-93  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.818582  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3334  cysteine synthase A  64.38 
 
 		 309 aa  341  9e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.229416  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0921  cysteine synthase A  58.63 
 
 		 317 aa  341  9e-93  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2508  cysteine synthase  61.74 
 
 		 320 aa  341  1e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000293117  normal  0.173804 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0011  cysteine synthase A  58.58 
 
 		 310 aa  340  2e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.857978  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0964  cysteine synthase  57.33 
 
 		 320 aa  339  4e-92  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274794  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1476  cysteine synthase A  57.32 
 
 		 324 aa  338  5.9999999999999996e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2365  cysteine synthase  60.39 
 
 		 322 aa  338  8e-92  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0913  cysteine synthase A  60.26 
 
 		 325 aa  338  9e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.282212 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0152  cysteine synthase  57.84 
 
 		 310 aa  337  9.999999999999999e-92  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0030  cysteine synthase A  58.12 
 
 		 311 aa  337  9.999999999999999e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1706  cysteine synthase  63.4 
 
 		 306 aa  337  1.9999999999999998e-91  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000550718  normal  0.263535 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5034  cysteine synthase A  57.1 
 
 		 320 aa  336  1.9999999999999998e-91  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4605  cysteine synthase A  62.58 
 
 		 320 aa  336  2.9999999999999997e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0937  cysteine synthase A  59.61 
 
 		 326 aa  336  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.251918 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0973  cysteine synthase A  59.61 
 
 		 326 aa  336  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0856961  normal  0.0511521 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2297  cysteine synthases  58.03 
 
 		 308 aa  336  2.9999999999999997e-91  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3653  cysteine synthase A  60.84 
 
 		 319 aa  336  3.9999999999999995e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.528018  hitchhiker  1.6930700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3256  cysteine synthase A  59.87 
 
 		 309 aa  335  5e-91  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0452  cysteine synthase  57.88 
 
 		 319 aa  335  5.999999999999999e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.118838 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1551  cysteine synthase K/M/A  57.65 
 
 		 317 aa  335  5.999999999999999e-91  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4340  cysteine synthase A  62.58 
 
 		 320 aa  335  7.999999999999999e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.238175  normal  0.899822 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0241  cysteine synthase  60.06 
 
 		 315 aa  334  1e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24430  cysteine synthase  56.68 
 
 		 311 aa  334  1e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.653671  normal  0.574826 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_953  cysteine synthase  56.67 
 
 		 320 aa  333  2e-90  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000343054  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2014  cysteine synthase A  58.25 
 
 		 309 aa  333  2e-90  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0113  normal  0.0387372 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3080  cysteine synthase  60.98 
 
 		 309 aa  332  5e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0477  cysteine synthase  62.54 
 
 		 332 aa  331  8e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1135  cysteine synthase A  56.81 
 
 		 320 aa  331  1e-89  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0019697  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1258  cysteine synthase K/M/A  60.59 
 
 		 327 aa  330  1e-89  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.198511  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0154  cysteine synthase K/M/A  54.72 
 
 		 307 aa  330  1e-89  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000000054726  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0922  cysteine synthase A  53.27 
 
 		 304 aa  331  1e-89  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.107998  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1502  cysteine synthase A  59.49 
 
 		 321 aa  330  2e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.18267e-17 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2658  cysteine synthase  59.22 
 
 		 310 aa  330  2e-89  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.556672 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1301  cysteine synthase A  57.47 
 
 		 309 aa  328  5.0000000000000004e-89  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.568697 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0433  cysteine synthase A  60.13 
 
 		 320 aa  328  7e-89  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0444  cysteine synthase A  60.13 
 
 		 320 aa  328  7e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00894315 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>