More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_4128 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_4128  cysteine synthase  100 
 
 		 310 aa  624  1e-178  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1022  cysteine synthase A  77.02 
 
 		 310 aa  478  1e-134  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0422971  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12358  cysteine synthase A cysK1  72.79 
 
 		 310 aa  438  9.999999999999999e-123  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2427  cysteine synthase  70.13 
 
 		 309 aa  433  1e-120  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00952791  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1336  cysteine synthase A  69.16 
 
 		 311 aa  412  1e-114  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2560  cysteine synthase A  69.81 
 
 		 310 aa  403  1e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  66.12 
 
 		 311 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1280  cysteine synthase  65.05 
 
 		 309 aa  398  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0485567  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2581  cysteine synthase A  64.72 
 
 		 309 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2677  cysteine synthase A  65.05 
 
 		 309 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.601381  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1983  cysteine synthase A  67.97 
 
 		 309 aa  397  1e-109  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.722669  normal  0.957709 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2487  cysteine synthase A  63.19 
 
 		 309 aa  387  1e-106  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.074698 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2853  cysteine synthase A  65.15 
 
 		 311 aa  381  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000434249  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2759  cysteine synthase A  64.82 
 
 		 311 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0420  cysteine synthase A  64.8 
 
 		 311 aa  378  1e-104  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.858609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24430  cysteine synthase  64.17 
 
 		 311 aa  375  1e-103  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.653671  normal  0.574826 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2021  cysteine synthase A  68.2 
 
 		 309 aa  376  1e-103  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0166882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2000  cysteine synthase A  66.13 
 
 		 317 aa  376  1e-103  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.982832  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0452  cysteine synthase  63.99 
 
 		 319 aa  374  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.118838 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2067  cysteine synthase A  63.4 
 
 		 327 aa  372  1e-102  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.197318 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2871  cysteine synthase A  61.56 
 
 		 318 aa  373  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1506  cysteine synthase A  68.3 
 
 		 309 aa  373  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000603625  normal  0.533317 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2647  cysteine synthase A  65.36 
 
 		 310 aa  368  1e-101  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.100926  normal  0.593402 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1551  cysteine synthase K/M/A  63.19 
 
 		 317 aa  369  1e-101  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2657  cysteine synthase A  68.3 
 
 		 309 aa  370  1e-101  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.249918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3334  cysteine synthase A  66.99 
 
 		 309 aa  370  1e-101  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.229416  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2609  cysteine synthase A  65.47 
 
 		 311 aa  370  1e-101  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1971  cysteine synthase  62.87 
 
 		 308 aa  367  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000186941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0030  cysteine synthase A  62.34 
 
 		 311 aa  369  1e-101  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0922  cysteine synthase A  58.5 
 
 		 304 aa  369  1e-101  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.107998  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4307  cysteine synthase  63.31 
 
 		 309 aa  369  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.782932  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4407  cysteine synthase A  64.05 
 
 		 328 aa  365  1e-100  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.119856 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0011  cysteine synthase A  63.43 
 
 		 310 aa  364  1e-100  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.857978  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1615  cysteine synthase A  61.39 
 
 		 308 aa  365  1e-100  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1558  cysteine synthase  65.9 
 
 		 309 aa  367  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1671  cysteine synthase A  63.19 
 
 		 311 aa  364  1e-100  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.422965  normal  0.494898 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2668  cysteine synthase  64.82 
 
 		 311 aa  366  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.456987  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1385  cysteine synthase  59.02 
 
 		 311 aa  364  1e-100  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.9014  normal  0.484311 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3186  cysteine synthase A  63.19 
 
 		 310 aa  364  1e-99  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000213805  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0535  cysteine synthase A  59.15 
 
 		 310 aa  363  2e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.775182  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3859  cysteine synthase A  65.57 
 
 		 309 aa  363  2e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000825635  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0548  cysteine synthase A  59.15 
 
 		 310 aa  363  2e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0152  cysteine synthase  60.13 
 
 		 310 aa  363  3e-99  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3782  cysteine synthase  62.18 
 
 		 320 aa  362  3e-99  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00462193  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2422  cysteine synthase  62.75 
 
 		 308 aa  362  4e-99  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0516344 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2195  cysteine synthase A  60.91 
 
 		 311 aa  362  4e-99  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000876073 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2853  cysteine synthase A  61.54 
 
 		 320 aa  362  4e-99  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2014  cysteine synthase A  62.87 
 
 		 309 aa  361  1e-98  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0113  normal  0.0387372 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1149  cysteine synthase A  64.08 
 
 		 311 aa  360  2e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000025777  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0154  cysteine synthase K/M/A  57.28 
 
 		 307 aa  359  4e-98  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000000054726  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2096  cysteine synthase  63.43 
 
 		 323 aa  359  4e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.553585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1235  cysteine synthase  61.86 
 
 		 320 aa  358  7e-98  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.779914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2681  cysteine synthase A  62.62 
 
 		 308 aa  358  9e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0782138 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1390  cysteine synthase  63.52 
 
 		 311 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.173456  normal  0.100727 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1541  cysteine synthase A  61.09 
 
 		 330 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2508  cysteine synthase  63.14 
 
 		 320 aa  356  2.9999999999999997e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000293117  normal  0.173804 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3416  cysteine synthase  58.22 
 
 		 311 aa  356  2.9999999999999997e-97  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26180  cysteine synthase  61.04 
 
 		 309 aa  355  3.9999999999999996e-97  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2233  cysteine synthase A  61.31 
 
 		 308 aa  354  7.999999999999999e-97  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4757  cysteine synthase A  61.17 
 
 		 328 aa  353  2.9999999999999997e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.157844 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5019  cysteine synthase  60.13 
 
 		 320 aa  352  2.9999999999999997e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0961303  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1258  cysteine synthase K/M/A  63.87 
 
 		 327 aa  352  2.9999999999999997e-96  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.198511  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1638  cysteine synthase A  60.66 
 
 		 309 aa  352  4e-96  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.444809  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2446  cysteine synthase  59.28 
 
 		 311 aa  352  5.9999999999999994e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00671922  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3400  cysteine synthase  59.49 
 
 		 313 aa  351  8.999999999999999e-96  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2176  cysteine synthase A  61.36 
 
 		 309 aa  350  2e-95  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.265161  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0964  cysteine synthase  59.33 
 
 		 320 aa  350  2e-95  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274794  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0213  cysteine synthase  61.94 
 
 		 329 aa  349  3e-95  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0914276  normal  0.144885 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1219  cysteine synthase A  61.44 
 
 		 309 aa  349  3e-95  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.913066  normal  0.187801 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5034  cysteine synthase A  58.97 
 
 		 320 aa  348  9e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3364  cysteine synthase A  57.7 
 
 		 304 aa  347  2e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000830673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  58 
 
 		 312 aa  346  2e-94  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0433  cysteine synthase K/M/A  56.03 
 
 		 307 aa  346  2e-94  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.818582  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1706  cysteine synthase  63.73 
 
 		 306 aa  347  2e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000550718  normal  0.263535 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_953  cysteine synthase  58.67 
 
 		 320 aa  346  3e-94  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000343054  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0364  cysteine synthase  61.29 
 
 		 322 aa  346  3e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2003  cysteine synthase A  60.66 
 
 		 308 aa  345  8e-94  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.537357 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1718  cysteine synthase A  61.06 
 
 		 308 aa  344  8.999999999999999e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000370956  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0413  cysteine synthase  58.88 
 
 		 309 aa  344  8.999999999999999e-94  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0452  cysteine synthases  62.09 
 
 		 308 aa  344  1e-93  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  57.33 
 
 		 312 aa  344  1e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0076  cysteine synthase A  61.76 
 
 		 307 aa  343  2e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00534286 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1466  cysteine synthase  62.62 
 
 		 334 aa  343  2e-93  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00108529  normal  0.10478 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1502  cysteine synthase A  61.54 
 
 		 321 aa  343  2e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.18267e-17 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12320  cysteine synthase  60 
 
 		 309 aa  343  2e-93  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.154234  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3549  cysteine synthase A  59.03 
 
 		 322 aa  342  7e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1332  cysteine synthase A  57.52 
 
 		 309 aa  341  9e-93  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000281475  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3080  cysteine synthase  59.48 
 
 		 309 aa  341  1e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2297  cysteine synthases  59.34 
 
 		 308 aa  340  1e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0433  cysteine synthase A  62.18 
 
 		 320 aa  339  2.9999999999999998e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0444  cysteine synthase A  62.18 
 
 		 320 aa  339  2.9999999999999998e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00894315 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4605  cysteine synthase A  61.29 
 
 		 320 aa  339  4e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3067  cysteine synthase  60.59 
 
 		 316 aa  339  4e-92  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1111  cysteine synthase A  61.24 
 
 		 311 aa  338  9e-92  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0492008  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1135  cysteine synthase A  57.33 
 
 		 320 aa  337  9.999999999999999e-92  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0019697  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0921  cysteine synthase A  60.59 
 
 		 317 aa  337  9.999999999999999e-92  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3794  cysteine synthase  57.14 
 
 		 339 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3653  cysteine synthase A  59.87 
 
 		 319 aa  337  9.999999999999999e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.528018  hitchhiker  1.6930700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0178  cysteine synthase A  60.97 
 
 		 331 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0063  cysteine synthase A  62.09 
 
 		 307 aa  336  2.9999999999999997e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>