More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0011 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0011  cysteine synthase A  100 
 
 		 310 aa  618  1e-176  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.857978  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3186  cysteine synthase A  82.74 
 
 		 310 aa  502  1e-141  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000213805  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  72.4 
 
 		 311 aa  451  1.0000000000000001e-126  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2014  cysteine synthase A  72.82 
 
 		 309 aa  452  1.0000000000000001e-126  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0113  normal  0.0387372 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04800  cysteine synthase A  69.9 
 
 		 309 aa  422  1e-117  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000597368  normal  0.814351 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1149  cysteine synthase A  72.4 
 
 		 311 aa  419  1e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000025777  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2286  cysteine synthase A  71.99 
 
 		 309 aa  418  1e-116  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2000  cysteine synthase A  71.34 
 
 		 317 aa  416  9.999999999999999e-116  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.982832  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1551  cysteine synthase K/M/A  70.03 
 
 		 317 aa  414  1e-114  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1258  cysteine synthase K/M/A  70.49 
 
 		 327 aa  400  9.999999999999999e-111  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.198511  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0549  cysteine synthase A  63.84 
 
 		 310 aa  395  1e-109  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000133483 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1301  cysteine synthase A  65.91 
 
 		 309 aa  397  1e-109  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.568697 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3859  cysteine synthase A  69.71 
 
 		 309 aa  393  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000825635  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0921  cysteine synthase A  67.43 
 
 		 317 aa  389  1e-107  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1558  cysteine synthase  67.31 
 
 		 309 aa  387  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1971  cysteine synthase  65.91 
 
 		 308 aa  382  1e-105  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000186941  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1022  cysteine synthase A  64.72 
 
 		 310 aa  378  1e-104  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0422971  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12358  cysteine synthase A cysK1  63.75 
 
 		 310 aa  379  1e-104  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2021  cysteine synthase A  66.77 
 
 		 309 aa  377  1e-103  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0166882  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1615  cysteine synthase A  63.93 
 
 		 308 aa  374  1e-102  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0889  cysteine synthase A  59.61 
 
 		 304 aa  371  1e-102  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0154  cysteine synthase K/M/A  59.87 
 
 		 307 aa  369  1e-101  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000000054726  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2427  cysteine synthase  63.31 
 
 		 309 aa  368  1e-101  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00952791  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0413  cysteine synthase  62.99 
 
 		 309 aa  369  1e-101  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2871  cysteine synthase A  61.61 
 
 		 318 aa  370  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0922  cysteine synthase A  59.93 
 
 		 304 aa  369  1e-101  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.107998  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05340  cysteine synthase  60.73 
 
 		 304 aa  367  1e-100  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3364  cysteine synthase A  59.93 
 
 		 304 aa  364  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000830673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0420  cysteine synthase A  62.82 
 
 		 311 aa  365  1e-100  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.858609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2487  cysteine synthase A  60.84 
 
 		 309 aa  363  1e-99  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.074698 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1718  cysteine synthase A  62.54 
 
 		 308 aa  364  1e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000370956  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1506  cysteine synthase A  63.87 
 
 		 309 aa  361  8e-99  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000603625  normal  0.533317 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3067  cysteine synthase  60.39 
 
 		 316 aa  361  9e-99  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3549  cysteine synthase A  61.89 
 
 		 322 aa  361  1e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4128  cysteine synthase  62.78 
 
 		 310 aa  360  2e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1235  cysteine synthase  61.74 
 
 		 320 aa  358  8e-98  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.779914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2657  cysteine synthase A  63.23 
 
 		 309 aa  357  1.9999999999999998e-97  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.249918  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0152  cysteine synthase  60.73 
 
 		 310 aa  357  1.9999999999999998e-97  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0452  cysteine synthase  59.68 
 
 		 319 aa  356  1.9999999999999998e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.118838 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2067  cysteine synthase A  60.71 
 
 		 327 aa  356  2.9999999999999997e-97  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.197318 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0433  cysteine synthase K/M/A  59.55 
 
 		 307 aa  356  2.9999999999999997e-97  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.818582  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3334  cysteine synthase A  65.16 
 
 		 309 aa  355  3.9999999999999996e-97  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.229416  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0364  cysteine synthase  62.01 
 
 		 322 aa  355  3.9999999999999996e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4605  cysteine synthase A  62.87 
 
 		 320 aa  355  3.9999999999999996e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1983  cysteine synthase A  61.56 
 
 		 309 aa  355  5e-97  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.722669  normal  0.957709 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2422  cysteine synthase  62.21 
 
 		 308 aa  354  7.999999999999999e-97  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0516344 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1280  cysteine synthase  59.22 
 
 		 309 aa  353  1e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0485567  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  59.74 
 
 		 312 aa  354  1e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0548  cysteine synthase A  60.06 
 
 		 310 aa  353  2e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0535  cysteine synthase A  60.06 
 
 		 310 aa  353  2e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.775182  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4340  cysteine synthase A  62.87 
 
 		 320 aa  352  4e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.238175  normal  0.899822 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2003  cysteine synthase A  60.32 
 
 		 308 aa  352  5e-96  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.537357 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2853  cysteine synthase A  59.74 
 
 		 320 aa  352  7e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  59.42 
 
 		 312 aa  351  7e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1332  cysteine synthase A  59.21 
 
 		 309 aa  350  1e-95  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000281475  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2677  cysteine synthase A  58.58 
 
 		 309 aa  351  1e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.601381  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0030  cysteine synthase A  59.68 
 
 		 311 aa  350  2e-95  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1638  cysteine synthase A  58.39 
 
 		 309 aa  350  2e-95  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.444809  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2681  cysteine synthase A  61.95 
 
 		 308 aa  350  2e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0782138 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2581  cysteine synthase A  58.25 
 
 		 309 aa  349  4e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3794  cysteine synthase  57.79 
 
 		 339 aa  348  5e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5019  cysteine synthase  57.74 
 
 		 320 aa  348  7e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0961303  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2096  cysteine synthase  63.11 
 
 		 323 aa  348  1e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.553585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2297  cysteine synthases  57.42 
 
 		 308 aa  347  1e-94  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3782  cysteine synthase  56.77 
 
 		 320 aa  347  2e-94  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00462193  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1671  cysteine synthase A  58.77 
 
 		 311 aa  346  3e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.422965  normal  0.494898 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2364  cysteine synthase  59.87 
 
 		 310 aa  346  3e-94  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.174971  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2853  cysteine synthase A  59.87 
 
 		 311 aa  345  5e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000434249  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5034  cysteine synthase A  58.71 
 
 		 320 aa  345  5e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0213  cysteine synthase  59.93 
 
 		 329 aa  345  6e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0914276  normal  0.144885 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2233  cysteine synthase A  58.39 
 
 		 308 aa  345  6e-94  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3400  cysteine synthase  59.03 
 
 		 313 aa  345  7e-94  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1706  cysteine synthase  62.21 
 
 		 306 aa  345  7e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000550718  normal  0.263535 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0535  cysteine synthase A  61.74 
 
 		 307 aa  344  1e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0678503  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2560  cysteine synthase A  61.04 
 
 		 310 aa  343  1e-93  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2508  cysteine synthase  57.74 
 
 		 320 aa  343  1e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000293117  normal  0.173804 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4407  cysteine synthase A  60.39 
 
 		 328 aa  344  1e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.119856 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2759  cysteine synthase A  59.55 
 
 		 311 aa  344  1e-93  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0076  cysteine synthase A  62.01 
 
 		 307 aa  343  2e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00534286 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4307  cysteine synthase  60.59 
 
 		 309 aa  343  2e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.782932  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1219  cysteine synthase A  61.89 
 
 		 309 aa  342  4e-93  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.913066  normal  0.187801 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1390  cysteine synthase  60.06 
 
 		 311 aa  342  7e-93  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.173456  normal  0.100727 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3068  cysteine synthase A  60.26 
 
 		 316 aa  341  8e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0145676  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1336  cysteine synthase A  59.87 
 
 		 311 aa  341  1e-92  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3907  cysteine synthase A  62.75 
 
 		 307 aa  340  2e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000106704  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2176  cysteine synthase A  58.58 
 
 		 309 aa  340  2e-92  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.265161  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3416  cysteine synthase  55.99 
 
 		 311 aa  340  2e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2237  cysteine synthase A  60.26 
 
 		 317 aa  338  5e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.425208 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1015  cysteine synthase A  62.21 
 
 		 328 aa  338  5.9999999999999996e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0178  cysteine synthase A  60.91 
 
 		 331 aa  338  9e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1893  cysteine synthase A  62.21 
 
 		 327 aa  337  9.999999999999999e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.480284  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24430  cysteine synthase  57.47 
 
 		 311 aa  337  1.9999999999999998e-91  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.653671  normal  0.574826 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2668  cysteine synthase  60.19 
 
 		 311 aa  337  1.9999999999999998e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.456987  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1135  cysteine synthase A  56.95 
 
 		 320 aa  336  2.9999999999999997e-91  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0019697  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2658  cysteine synthase  57.74 
 
 		 310 aa  336  2.9999999999999997e-91  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.556672 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0234  cysteine synthase K/M/A  58.25 
 
 		 314 aa  335  7e-91  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2365  cysteine synthase  56.63 
 
 		 322 aa  335  7e-91  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1385  cysteine synthase  53.23 
 
 		 311 aa  334  9e-91  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.9014  normal  0.484311 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4757  cysteine synthase A  56.21 
 
 		 328 aa  334  1e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.157844 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1541  cysteine synthase A  56.45 
 
 		 330 aa  334  1e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>