More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0178 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0178  cysteine synthase A  100 
 
 		 331 aa  657    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0213  cysteine synthase  83.69 
 
 		 329 aa  528  1e-149  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0914276  normal  0.144885 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3549  cysteine synthase A  74.2 
 
 		 322 aa  457  1e-127  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4466  cysteine synthase A  71.6 
 
 		 327 aa  450  1e-125  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00243818 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0364  cysteine synthase  75.16 
 
 		 322 aa  447  1.0000000000000001e-124  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5186  cysteine synthase A  72.59 
 
 		 327 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129775  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0075  cysteine synthase A  74.2 
 
 		 328 aa  438  9.999999999999999e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4605  cysteine synthase A  74.37 
 
 		 320 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4340  cysteine synthase A  73.73 
 
 		 320 aa  434  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.238175  normal  0.899822 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3794  cysteine synthase  70 
 
 		 339 aa  421  1e-117  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3363  cysteine synthase A  70.93 
 
 		 324 aa  424  1e-117  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.589605  normal  0.886902 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3653  cysteine synthase A  71.34 
 
 		 319 aa  421  1e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.528018  hitchhiker  1.6930700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4360  cysteine synthase  72.67 
 
 		 322 aa  418  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0559  cysteine synthase A  71.84 
 
 		 332 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.770107  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0477  cysteine synthase  70.61 
 
 		 332 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0937  cysteine synthase A  69.11 
 
 		 326 aa  414  1e-114  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.251918 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0973  cysteine synthase A  69.11 
 
 		 326 aa  414  1e-114  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0856961  normal  0.0511521 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0343  cysteine synthase A  72.45 
 
 		 332 aa  413  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.516891  normal  0.476462 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0913  cysteine synthase A  68.79 
 
 		 325 aa  412  1e-114  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.282212 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3067  cysteine synthase  69.23 
 
 		 316 aa  410  1e-113  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1015  cysteine synthase A  72.2 
 
 		 328 aa  410  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4757  cysteine synthase A  67.73 
 
 		 328 aa  407  1.0000000000000001e-112  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.157844 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2594  cysteine synthase A  70.62 
 
 		 326 aa  404  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.125918  normal  0.194019 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1773  cysteine synthases  69.65 
 
 		 325 aa  402  1e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1893  cysteine synthase A  70.29 
 
 		 327 aa  404  1e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.480284  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  65.91 
 
 		 311 aa  400  9.999999999999999e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1794  cysteine synthase  68.35 
 
 		 325 aa  387  1e-106  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  unclonable  0.00000000492441  normal  0.123745 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3416  cysteine synthase  64.94 
 
 		 311 aa  386  1e-106  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2177  cysteine synthase A  61.54 
 
 		 328 aa  374  1e-102  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0452  cysteine synthase  62.9 
 
 		 319 aa  369  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.118838 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0556  cysteine synthases  61.78 
 
 		 323 aa  368  1e-101  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.523099  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2003  cysteine synthase A  64.71 
 
 		 308 aa  368  1e-100  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.537357 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3334  cysteine synthase A  65.58 
 
 		 309 aa  366  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.229416  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0241  cysteine synthase  63.43 
 
 		 315 aa  364  1e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2021  cysteine synthase A  66.12 
 
 		 309 aa  363  2e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0166882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2364  cysteine synthase  63.96 
 
 		 310 aa  363  2e-99  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.174971  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1235  cysteine synthase  63.34 
 
 		 320 aa  362  4e-99  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.779914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1149  cysteine synthase A  62.99 
 
 		 311 aa  360  1e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000025777  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1385  cysteine synthase  60.59 
 
 		 311 aa  360  2e-98  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.9014  normal  0.484311 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3782  cysteine synthase  60.32 
 
 		 320 aa  359  4e-98  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00462193  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3400  cysteine synthase  61.61 
 
 		 313 aa  358  5e-98  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2067  cysteine synthase A  62.34 
 
 		 327 aa  358  7e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.197318 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2487  cysteine synthase A  62.01 
 
 		 309 aa  357  9.999999999999999e-98  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.074698 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2014  cysteine synthase A  63.19 
 
 		 309 aa  356  2.9999999999999997e-97  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0113  normal  0.0387372 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1551  cysteine synthase K/M/A  60.71 
 
 		 317 aa  355  5.999999999999999e-97  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1541  cysteine synthase A  59.68 
 
 		 330 aa  354  1e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1506  cysteine synthase A  64.17 
 
 		 309 aa  354  1e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000603625  normal  0.533317 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0549  cysteine synthase A  58.77 
 
 		 310 aa  353  2e-96  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000133483 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2233  cysteine synthase A  61.56 
 
 		 308 aa  353  2e-96  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1558  cysteine synthase  63.64 
 
 		 309 aa  353  2e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2508  cysteine synthase  61.61 
 
 		 320 aa  353  2.9999999999999997e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000293117  normal  0.173804 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2657  cysteine synthase A  64.17 
 
 		 309 aa  352  5e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.249918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1983  cysteine synthase A  60.84 
 
 		 309 aa  352  5e-96  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.722669  normal  0.957709 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0420  cysteine synthase A  61.51 
 
 		 311 aa  351  1e-95  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.858609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12358  cysteine synthase A cysK1  61.11 
 
 		 310 aa  351  1e-95  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1022  cysteine synthase A  62.9 
 
 		 310 aa  350  2e-95  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0422971  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2176  cysteine synthase A  62.9 
 
 		 309 aa  350  2e-95  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.265161  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2422  cysteine synthase  62.58 
 
 		 308 aa  350  2e-95  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0516344 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24430  cysteine synthase  61.94 
 
 		 311 aa  350  2e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.653671  normal  0.574826 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2581  cysteine synthase A  60.39 
 
 		 309 aa  349  4e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2000  cysteine synthase A  62.01 
 
 		 317 aa  349  5e-95  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.982832  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0011  cysteine synthase A  60.91 
 
 		 310 aa  348  6e-95  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.857978  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2681  cysteine synthase A  62.34 
 
 		 308 aa  348  6e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0782138 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1615  cysteine synthase A  61.24 
 
 		 308 aa  347  1e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2677  cysteine synthase A  60.06 
 
 		 309 aa  347  2e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.601381  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12320  cysteine synthase  59.15 
 
 		 309 aa  347  2e-94  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.154234  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2427  cysteine synthase  60.97 
 
 		 309 aa  347  2e-94  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00952791  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4407  cysteine synthase A  62.54 
 
 		 328 aa  346  3e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.119856 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3186  cysteine synthase A  61.24 
 
 		 310 aa  345  4e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000213805  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5034  cysteine synthase A  59.74 
 
 		 320 aa  344  1e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1718  cysteine synthase A  61.56 
 
 		 308 aa  343  2e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000370956  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2609  cysteine synthase A  60.97 
 
 		 311 aa  343  2e-93  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1671  cysteine synthase A  59.35 
 
 		 311 aa  343  2e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.422965  normal  0.494898 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0413  cysteine synthase  60.06 
 
 		 309 aa  343  2e-93  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2853  cysteine synthase A  58.71 
 
 		 320 aa  343  2e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1280  cysteine synthase  58.77 
 
 		 309 aa  343  2.9999999999999997e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0485567  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2759  cysteine synthase A  62.66 
 
 		 311 aa  343  2.9999999999999997e-93  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2365  cysteine synthase  59.48 
 
 		 322 aa  342  4e-93  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2853  cysteine synthase A  62.66 
 
 		 311 aa  342  4e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000434249  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04800  cysteine synthase A  60.13 
 
 		 309 aa  342  5e-93  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000597368  normal  0.814351 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  58.25 
 
 		 312 aa  342  5e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5019  cysteine synthase  57.74 
 
 		 320 aa  341  9e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0961303  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1502  cysteine synthase A  60.32 
 
 		 321 aa  340  2e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.18267e-17 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3859  cysteine synthase A  62.34 
 
 		 309 aa  340  2e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000825635  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  58.31 
 
 		 312 aa  339  4e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4128  cysteine synthase  60.65 
 
 		 310 aa  338  5.9999999999999996e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1258  cysteine synthase K/M/A  61.04 
 
 		 327 aa  338  5.9999999999999996e-92  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.198511  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1971  cysteine synthase  61.17 
 
 		 308 aa  338  5.9999999999999996e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000186941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1336  cysteine synthase A  62.58 
 
 		 311 aa  338  5.9999999999999996e-92  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0922  cysteine synthase A  55.84 
 
 		 304 aa  338  8e-92  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.107998  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01381  O-acetylserine (thiol)-lyase A  57.93 
 
 		 322 aa  337  9.999999999999999e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.341989 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0452  cysteine synthases  61.61 
 
 		 308 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2560  cysteine synthase A  62.26 
 
 		 310 aa  336  3.9999999999999995e-91  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0921  cysteine synthase A  59.74 
 
 		 317 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0234  cysteine synthase K/M/A  59.74 
 
 		 314 aa  335  5e-91  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1638  cysteine synthase A  58.96 
 
 		 309 aa  335  5.999999999999999e-91  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.444809  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2096  cysteine synthase  60.65 
 
 		 323 aa  334  1e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.553585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4307  cysteine synthase  59.35 
 
 		 309 aa  333  2e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.782932  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0433  cysteine synthase A  61.29 
 
 		 320 aa  331  9e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26180  cysteine synthase  61.49 
 
 		 309 aa  331  9e-90  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>