More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_953 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_953  cysteine synthase  100 
 
 		 320 aa  639    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000343054  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0964  cysteine synthase  90.62 
 
 		 320 aa  563  1.0000000000000001e-159  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274794  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1135  cysteine synthase A  83.75 
 
 		 320 aa  524  1e-148  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0019697  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2422  cysteine synthase  62.79 
 
 		 308 aa  360  2e-98  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0516344 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1615  cysteine synthase A  59.67 
 
 		 308 aa  351  8e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2487  cysteine synthase A  60.67 
 
 		 309 aa  351  8.999999999999999e-96  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.074698 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2677  cysteine synthase A  58.67 
 
 		 309 aa  346  3e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.601381  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1718  cysteine synthase A  61.24 
 
 		 308 aa  345  5e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000370956  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1551  cysteine synthase K/M/A  61.39 
 
 		 317 aa  344  8.999999999999999e-94  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0413  cysteine synthase  58.67 
 
 		 309 aa  344  8.999999999999999e-94  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1022  cysteine synthase A  61 
 
 		 310 aa  344  1e-93  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0422971  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  58.19 
 
 		 312 aa  344  1e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  57.86 
 
 		 312 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  57.98 
 
 		 311 aa  343  2.9999999999999997e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2581  cysteine synthase A  58 
 
 		 309 aa  342  4e-93  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0452  cysteine synthases  62.13 
 
 		 308 aa  342  4e-93  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12358  cysteine synthase A cysK1  59.02 
 
 		 310 aa  342  5e-93  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2427  cysteine synthase  59.67 
 
 		 309 aa  342  5.999999999999999e-93  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00952791  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1280  cysteine synthase  58.33 
 
 		 309 aa  341  1e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0485567  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1638  cysteine synthase A  59.33 
 
 		 309 aa  340  2e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.444809  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3416  cysteine synthase  58 
 
 		 311 aa  340  2e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1385  cysteine synthase  55.67 
 
 		 311 aa  337  9.999999999999999e-92  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.9014  normal  0.484311 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2759  cysteine synthase A  60.33 
 
 		 311 aa  337  9.999999999999999e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2853  cysteine synthase A  60.33 
 
 		 311 aa  337  1.9999999999999998e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000434249  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2871  cysteine synthase A  58 
 
 		 318 aa  336  3.9999999999999995e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3364  cysteine synthase A  56.67 
 
 		 304 aa  335  7e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000830673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3859  cysteine synthase A  59 
 
 		 309 aa  333  2e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000825635  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1558  cysteine synthase  58.69 
 
 		 309 aa  333  2e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1971  cysteine synthase  60.67 
 
 		 308 aa  332  4e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000186941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5019  cysteine synthase  59.09 
 
 		 320 aa  332  7.000000000000001e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0961303  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2681  cysteine synthase A  60 
 
 		 308 aa  332  7.000000000000001e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0782138 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0030  cysteine synthase A  58.8 
 
 		 311 aa  331  9e-90  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3782  cysteine synthase  59.41 
 
 		 320 aa  331  1e-89  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00462193  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3400  cysteine synthase  59.54 
 
 		 313 aa  330  2e-89  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24430  cysteine synthase  57.05 
 
 		 311 aa  330  3e-89  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.653671  normal  0.574826 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0922  cysteine synthase A  54 
 
 		 304 aa  329  4e-89  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.107998  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2853  cysteine synthase A  59.41 
 
 		 320 aa  328  9e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1149  cysteine synthase A  58.42 
 
 		 311 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000025777  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1671  cysteine synthase A  56.72 
 
 		 311 aa  327  1.0000000000000001e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.422965  normal  0.494898 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2560  cysteine synthase A  60 
 
 		 310 aa  327  2.0000000000000001e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4128  cysteine synthase  58.67 
 
 		 310 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0452  cysteine synthase  59.08 
 
 		 319 aa  327  2.0000000000000001e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.118838 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1541  cysteine synthase A  57.47 
 
 		 330 aa  327  2.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1219  cysteine synthase A  58.8 
 
 		 309 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.913066  normal  0.187801 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0420  cysteine synthase A  58 
 
 		 311 aa  325  5e-88  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.858609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2668  cysteine synthase  60 
 
 		 311 aa  325  8.000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.456987  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2176  cysteine synthase A  56.67 
 
 		 309 aa  325  9e-88  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.265161  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2195  cysteine synthase A  55.08 
 
 		 311 aa  324  1e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000876073 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1332  cysteine synthase A  54.85 
 
 		 309 aa  324  1e-87  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000281475  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1235  cysteine synthase  59.54 
 
 		 320 aa  324  1e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.779914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1506  cysteine synthase A  61.44 
 
 		 309 aa  323  2e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000603625  normal  0.533317 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3549  cysteine synthase A  58.88 
 
 		 322 aa  323  2e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2657  cysteine synthase A  61.11 
 
 		 309 aa  323  2e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.249918  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1390  cysteine synthase  58.03 
 
 		 311 aa  322  7e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.173456  normal  0.100727 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1983  cysteine synthase A  57.14 
 
 		 309 aa  321  9.000000000000001e-87  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.722669  normal  0.957709 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0011  cysteine synthase A  57.62 
 
 		 310 aa  321  9.999999999999999e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.857978  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2508  cysteine synthase  59.41 
 
 		 320 aa  321  9.999999999999999e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000293117  normal  0.173804 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2003  cysteine synthase A  55.41 
 
 		 308 aa  320  1.9999999999999998e-86  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.537357 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2021  cysteine synthase A  61.46 
 
 		 309 aa  320  1.9999999999999998e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0166882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2446  cysteine synthase  54.1 
 
 		 311 aa  320  1.9999999999999998e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00671922  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2297  cysteine synthases  55.67 
 
 		 308 aa  320  1.9999999999999998e-86  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2233  cysteine synthase A  55.41 
 
 		 308 aa  320  1.9999999999999998e-86  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0152  cysteine synthase  55.89 
 
 		 310 aa  319  3e-86  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2000  cysteine synthase A  58.09 
 
 		 317 aa  319  3e-86  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.982832  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0178  cysteine synthase A  56.86 
 
 		 316 aa  320  3e-86  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0627608  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2364  cysteine synthase  56 
 
 		 310 aa  319  5e-86  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.174971  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0535  cysteine synthase A  55.18 
 
 		 310 aa  317  1e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.775182  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0548  cysteine synthase A  55.18 
 
 		 310 aa  317  1e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2182  cysteine synthase A  59.15 
 
 		 316 aa  318  1e-85  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2014  cysteine synthase A  56.95 
 
 		 309 aa  318  1e-85  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0113  normal  0.0387372 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4407  cysteine synthase A  57.65 
 
 		 328 aa  317  2e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.119856 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2067  cysteine synthase A  56.03 
 
 		 327 aa  317  2e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.197318 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2647  cysteine synthase A  58.36 
 
 		 310 aa  316  3e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.100926  normal  0.593402 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0433  cysteine synthase K/M/A  54.67 
 
 		 307 aa  315  4e-85  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.818582  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0364  cysteine synthase  58.09 
 
 		 322 aa  315  5e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5034  cysteine synthase A  58.42 
 
 		 320 aa  315  6e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0549  cysteine synthase A  51.13 
 
 		 310 aa  314  9.999999999999999e-85  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000133483 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0234  cysteine synthase K/M/A  57.67 
 
 		 314 aa  313  1.9999999999999998e-84  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4307  cysteine synthase  55.81 
 
 		 309 aa  314  1.9999999999999998e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.782932  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2096  cysteine synthase  56.62 
 
 		 323 aa  312  3.9999999999999997e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.553585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1502  cysteine synthase A  57.43 
 
 		 321 aa  312  4.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.18267e-17 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0154  cysteine synthase K/M/A  54.18 
 
 		 307 aa  311  5.999999999999999e-84  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000000054726  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1301  cysteine synthase A  55.12 
 
 		 309 aa  311  6.999999999999999e-84  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.568697 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0213  cysteine synthase  58.42 
 
 		 329 aa  311  7.999999999999999e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0914276  normal  0.144885 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3186  cysteine synthase A  55.59 
 
 		 310 aa  311  1e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000213805  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3068  cysteine synthase A  56.23 
 
 		 316 aa  310  2e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0145676  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3334  cysteine synthase A  60.46 
 
 		 309 aa  310  2e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.229416  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0162  cysteine synthase  59.59 
 
 		 305 aa  309  2.9999999999999997e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0889  cysteine synthase A  51.67 
 
 		 304 aa  309  5e-83  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0921  cysteine synthase A  57.43 
 
 		 317 aa  308  5e-83  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4605  cysteine synthase A  58.75 
 
 		 320 aa  308  6.999999999999999e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4466  cysteine synthase A  55.63 
 
 		 327 aa  308  9e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00243818 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04800  cysteine synthase A  54.64 
 
 		 309 aa  307  1.0000000000000001e-82  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000597368  normal  0.814351 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1336  cysteine synthase A  56.39 
 
 		 311 aa  307  1.0000000000000001e-82  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4340  cysteine synthase A  58.75 
 
 		 320 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.238175  normal  0.899822 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2365  cysteine synthase  56.11 
 
 		 322 aa  307  2.0000000000000002e-82  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23060  cysteine synthase A  57 
 
 		 305 aa  306  2.0000000000000002e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000228532  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4757  cysteine synthase A  55.52 
 
 		 328 aa  306  3e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.157844 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3794  cysteine synthase  54.3 
 
 		 339 aa  306  3e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0075  cysteine synthase A  55.91 
 
 		 328 aa  305  7e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>