More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1534 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1534  cysteine synthase A  100 
 
 		 298 aa  608  1e-173  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  50.17 
 
 		 312 aa  294  9e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  50.5 
 
 		 312 aa  291  9e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0030  cysteine synthase A  51.16 
 
 		 311 aa  287  1e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0152  cysteine synthase  46.2 
 
 		 310 aa  277  2e-73  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0921  cysteine synthase A  47.54 
 
 		 317 aa  275  5e-73  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0535  cysteine synthase A  46.03 
 
 		 310 aa  272  6e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.775182  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0548  cysteine synthase A  46.03 
 
 		 310 aa  272  6e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0154  cysteine synthase K/M/A  46.82 
 
 		 307 aa  271  9e-72  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000000054726  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  46.73 
 
 		 311 aa  271  1e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0964  cysteine synthase  47.18 
 
 		 320 aa  270  2e-71  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274794  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23060  cysteine synthase A  50.66 
 
 		 305 aa  270  2e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000228532  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2422  cysteine synthase  48.36 
 
 		 308 aa  269  4e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0516344 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1560  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  45.87 
 
 		 302 aa  267  1e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.180171  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05340  cysteine synthase  45.27 
 
 		 304 aa  267  2e-70  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_953  cysteine synthase  46.84 
 
 		 320 aa  266  2e-70  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000343054  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0889  cysteine synthase A  46.69 
 
 		 304 aa  266  2e-70  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1551  cysteine synthase K/M/A  44.92 
 
 		 317 aa  266  4e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24430  cysteine synthase  47.52 
 
 		 311 aa  266  5e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.653671  normal  0.574826 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0978  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  45.33 
 
 		 307 aa  265  7e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1971  cysteine synthase  45.36 
 
 		 308 aa  265  7e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000186941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0822  cysteine synthase A  46.36 
 
 		 308 aa  263  2e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.326455 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1615  cysteine synthase A  46.05 
 
 		 308 aa  263  2e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2000  cysteine synthase A  45.9 
 
 		 317 aa  262  4.999999999999999e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.982832  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2871  cysteine synthase A  46.38 
 
 		 318 aa  262  4.999999999999999e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0922  cysteine synthase A  46.18 
 
 		 304 aa  262  4.999999999999999e-69  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.107998  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0990  cysteine synthase A  50 
 
 		 299 aa  261  1e-68  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  hitchhiker  0.0058381  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0413  cysteine synthase  46.38 
 
 		 309 aa  261  1e-68  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3364  cysteine synthase A  45 
 
 		 304 aa  260  2e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000830673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1832  cysteine synthase A  44.69 
 
 		 317 aa  260  2e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.118091  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2475  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  45.67 
 
 		 307 aa  259  4e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0902  cysteine synthase A  49.66 
 
 		 299 aa  259  5.0000000000000005e-68  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00000000036612  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0170  cysteine synthase family protein  45.48 
 
 		 302 aa  258  8e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2609  cysteine synthase A  47.49 
 
 		 311 aa  257  2e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0433  cysteine synthase K/M/A  46.2 
 
 		 307 aa  257  2e-67  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.818582  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1706  cysteine synthase  48.17 
 
 		 306 aa  257  2e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000550718  normal  0.263535 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0170  cysteine synthase A  45.03 
 
 		 304 aa  257  2e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00475319  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0162  cysteine synthase  46.6 
 
 		 305 aa  256  3e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1280  cysteine synthase  43.89 
 
 		 309 aa  255  5e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0485567  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1135  cysteine synthase A  45.85 
 
 		 320 aa  255  6e-67  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0019697  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2237  cysteine synthase A  45.75 
 
 		 317 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.425208 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2430  cysteine synthase A  49.15 
 
 		 306 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12358  cysteine synthase A cysK1  45.21 
 
 		 310 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1438  cysteine synthase A  46.36 
 
 		 305 aa  254  1.0000000000000001e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0549  cysteine synthase A  42.3 
 
 		 310 aa  253  2.0000000000000002e-66  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000133483 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2623  cysteine synthase A  41.18 
 
 		 329 aa  253  2.0000000000000002e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1301  cysteine synthase A  44.95 
 
 		 309 aa  253  2.0000000000000002e-66  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.568697 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0213  cysteine synthase  46.58 
 
 		 329 aa  253  2.0000000000000002e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0914276  normal  0.144885 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3859  cysteine synthase A  47.85 
 
 		 309 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000825635  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3068  cysteine synthase A  45.48 
 
 		 316 aa  253  3e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0145676  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1390  cysteine synthase  47.52 
 
 		 311 aa  253  3e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.173456  normal  0.100727 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1022  cysteine synthase A  44.88 
 
 		 310 aa  252  4.0000000000000004e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0422971  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2487  cysteine synthase A  43.23 
 
 		 309 aa  252  5.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.074698 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2988  cysteine synthase  47.67 
 
 		 307 aa  252  5.000000000000001e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000571381  normal  0.7688 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3782  cysteine synthase  44.44 
 
 		 320 aa  252  6e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00462193  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0452  cysteine synthase  45.75 
 
 		 319 aa  251  7e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.118838 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0535  cysteine synthase A  46.67 
 
 		 307 aa  251  9.000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0678503  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2581  cysteine synthase A  43.56 
 
 		 309 aa  251  9.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2677  cysteine synthase A  43.56 
 
 		 309 aa  251  1e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.601381  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1311  cysteine synthase  44.7 
 
 		 302 aa  251  1e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.933049  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4307  cysteine synthase  46.15 
 
 		 309 aa  251  1e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.782932  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4466  cysteine synthase A  45.7 
 
 		 327 aa  250  2e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00243818 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0011  cysteine synthase A  44.26 
 
 		 310 aa  250  2e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.857978  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1448  cysteine synthase A  47.52 
 
 		 306 aa  249  3e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1671  cysteine synthase A  44.88 
 
 		 311 aa  249  3e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.422965  normal  0.494898 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1502  cysteine synthase A  46.08 
 
 		 321 aa  249  3e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.18267e-17 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2297  cysteine synthases  44.88 
 
 		 308 aa  249  3e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1149  cysteine synthase A  46.56 
 
 		 311 aa  249  4e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000025777  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1720  cysteine synthase  46.33 
 
 		 302 aa  249  4e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0556189 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04800  cysteine synthase A  44.26 
 
 		 309 aa  248  6e-65  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000597368  normal  0.814351 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1091  cysteine synthase  48.32 
 
 		 303 aa  249  6e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000826995  decreased coverage  0.00308217 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1235  cysteine synthase  43.46 
 
 		 320 aa  248  6e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.779914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2365  cysteine synthase  44.37 
 
 		 322 aa  248  9e-65  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1638  cysteine synthase A  46.05 
 
 		 309 aa  247  1e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.444809  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3005  cysteine synthase B  42.42 
 
 		 308 aa  248  1e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.951108  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1558  cysteine synthase  46.86 
 
 		 309 aa  248  1e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0178  cysteine synthase A  47.06 
 
 		 331 aa  247  1e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0266  cysteine synthase A  47.77 
 
 		 291 aa  248  1e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0459085  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09450  cysteine synthase  43.56 
 
 		 311 aa  247  2e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.424611  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3416  cysteine synthase  44.41 
 
 		 311 aa  247  2e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0420  cysteine synthase A  44 
 
 		 311 aa  246  3e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.858609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5019  cysteine synthase  44.12 
 
 		 320 aa  246  4e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0961303  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2014  cysteine synthase A  44.59 
 
 		 309 aa  246  4e-64  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0113  normal  0.0387372 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1087  cysteine synthase  43.33 
 
 		 303 aa  246  4e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.542203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2446  cysteine synthase  45.21 
 
 		 311 aa  246  4e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00671922  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3085  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  42.57 
 
 		 307 aa  245  6e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.520498  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1983  cysteine synthase A  43.56 
 
 		 309 aa  245  6e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.722669  normal  0.957709 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0063  cysteine synthase A  45.7 
 
 		 307 aa  245  6e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1718  cysteine synthase A  46.18 
 
 		 308 aa  245  8e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000370956  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1476  cysteine synthase A  43.93 
 
 		 324 aa  245  8e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4156  cystathionine beta-synthase  42.76 
 
 		 461 aa  244  9e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.884438 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5034  cysteine synthase A  45.03 
 
 		 320 aa  244  9e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1385  cysteine synthase  42.24 
 
 		 311 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.9014  normal  0.484311 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3400  cysteine synthase  44.12 
 
 		 313 aa  244  9.999999999999999e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1822  cysteine synthase A  43.62 
 
 		 302 aa  244  9.999999999999999e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.470327  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2195  cysteine synthase A  45.54 
 
 		 311 aa  244  9.999999999999999e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000876073 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5186  cysteine synthase A  45.36 
 
 		 327 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129775  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0149  cysteine synthase  44.55 
 
 		 306 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004156  cysteine synthase  47.67 
 
 		 322 aa  243  1.9999999999999999e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000187133  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1567  cysteine synthase  46.49 
 
 		 322 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0584009 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>