More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0978 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0978  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  100 
 
 		 307 aa  623  1e-177  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2475  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  86.6 
 
 		 307 aa  559  1e-158  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4455  O-acetylserine lyase  73.44 
 
 		 307 aa  471  1e-132  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3085  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  71.8 
 
 		 307 aa  472  1e-132  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.520498  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4453  O-acetylserine lyase  73.11 
 
 		 307 aa  468  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4269  O-acetylserine lyase  73.11 
 
 		 307 aa  468  1.0000000000000001e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4106  cysteine synthase  73.11 
 
 		 307 aa  468  1.0000000000000001e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4117  cysteine synthase  73.11 
 
 		 307 aa  468  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4492  O-acetylserine lyase  72.79 
 
 		 307 aa  468  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.986798  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4601  O-acetylserine lyase  73.11 
 
 		 307 aa  468  1.0000000000000001e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4506  O-acetylserine lyase  73.11 
 
 		 307 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0207318  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4220  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  72.46 
 
 		 307 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0744  O-acetylserine lyase  72.46 
 
 		 307 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0885  cysteine synthase  59.33 
 
 		 303 aa  338  5e-92  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1287  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  59 
 
 		 304 aa  333  2e-90  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.870324  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0170  cysteine synthase family protein  53.8 
 
 		 302 aa  320  1.9999999999999998e-86  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1759  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  56.81 
 
 		 303 aa  313  2.9999999999999996e-84  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0161218  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1560  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  49.5 
 
 		 302 aa  305  6e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.180171  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1228  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  49.33 
 
 		 302 aa  301  9e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2500  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  48.18 
 
 		 315 aa  296  3e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0166  cysteine synthase family protein  54.46 
 
 		 302 aa  296  3e-79  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1551  cysteine synthase K/M/A  49.19 
 
 		 317 aa  289  4e-77  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  47.88 
 
 		 311 aa  288  1e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1553  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  54.46 
 
 		 304 aa  286  4e-76  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.222613  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2000  cysteine synthase A  49.19 
 
 		 317 aa  281  1e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.982832  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23060  cysteine synthase A  50.49 
 
 		 305 aa  280  2e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000228532  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0011  cysteine synthase A  48.21 
 
 		 310 aa  280  2e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.857978  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0549  cysteine synthase A  45.28 
 
 		 310 aa  279  3e-74  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000133483 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0094  cysteine synthase/cystathionine beta-synthase family protein  52.7 
 
 		 302 aa  276  3e-73  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2014  cysteine synthase A  47.88 
 
 		 309 aa  273  2.0000000000000002e-72  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0113  normal  0.0387372 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0921  cysteine synthase A  49.84 
 
 		 317 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0889  cysteine synthase A  44.44 
 
 		 304 aa  273  3e-72  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1301  cysteine synthase A  47.08 
 
 		 309 aa  271  1e-71  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.568697 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3186  cysteine synthase A  48.04 
 
 		 310 aa  269  4e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000213805  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2871  cysteine synthase A  46.43 
 
 		 318 aa  268  1e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1615  cysteine synthase A  46.08 
 
 		 308 aa  266  2.9999999999999995e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1706  cysteine synthase  45.93 
 
 		 306 aa  266  2.9999999999999995e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000550718  normal  0.263535 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0481  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  50.68 
 
 		 318 aa  266  4e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000231361  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0494  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  50.68 
 
 		 318 aa  266  4e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00183291  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1258  cysteine synthase K/M/A  49.35 
 
 		 327 aa  265  5e-70  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.198511  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  44.37 
 
 		 312 aa  265  5e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4156  cystathionine beta-synthase  45.54 
 
 		 461 aa  265  5.999999999999999e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.884438 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1534  cysteine synthase A  45.33 
 
 		 298 aa  265  7e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3364  cysteine synthase A  45.25 
 
 		 304 aa  265  8e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000830673  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0152  cysteine synthase  44.15 
 
 		 310 aa  263  2e-69  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1718  cysteine synthase A  47.85 
 
 		 308 aa  264  2e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000370956  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1971  cysteine synthase  46.89 
 
 		 308 aa  261  6.999999999999999e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000186941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2003  cysteine synthase A  45.9 
 
 		 308 aa  261  1e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.537357 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0548  cysteine synthase A  44.33 
 
 		 310 aa  261  1e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0535  cysteine synthase A  44.33 
 
 		 310 aa  261  1e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.775182  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12358  cysteine synthase A cysK1  46.23 
 
 		 310 aa  259  3e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1919  cysteine synthase A  46.56 
 
 		 305 aa  259  3e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.468327  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3067  cysteine synthase  45.93 
 
 		 316 aa  259  3e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1653  cysteine synthase A  46.89 
 
 		 305 aa  259  4e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1954  cysteine synthase A  46.56 
 
 		 305 aa  259  4e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221871  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  43.23 
 
 		 312 aa  259  4e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1013  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  48.72 
 
 		 326 aa  259  5.0000000000000005e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0030  cysteine synthase A  44.84 
 
 		 311 aa  259  5.0000000000000005e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0922  cysteine synthase A  41.83 
 
 		 304 aa  259  5.0000000000000005e-68  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.107998  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1697  cysteine synthase A  46.56 
 
 		 305 aa  258  6e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.516314  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1831  cysteine synthase A  46.56 
 
 		 305 aa  258  6e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1678  cysteine synthase A  46.23 
 
 		 305 aa  258  7e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.423565  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1875  cysteine synthase A  46.23 
 
 		 305 aa  258  7e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000101872 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1837  cysteine synthase A  46.56 
 
 		 305 aa  258  7e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3859  cysteine synthase A  47.21 
 
 		 309 aa  258  7e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000825635  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3506  cysteine synthase A  46.56 
 
 		 305 aa  258  8e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4128  cysteine synthase  46.73 
 
 		 310 aa  258  1e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0076  cysteine synthase A  46.56 
 
 		 307 aa  258  1e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00534286 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0162  cysteine synthase  46.03 
 
 		 305 aa  257  2e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1691  cysteine synthase A  46.23 
 
 		 305 aa  257  2e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2422  cysteine synthase  45.1 
 
 		 308 aa  256  3e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0516344 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24430  cysteine synthase  45.07 
 
 		 311 aa  256  3e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.653671  normal  0.574826 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1438  cysteine synthase A  45.57 
 
 		 305 aa  256  3e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.412307  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2364  cysteine synthase  43.79 
 
 		 310 aa  256  3e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.174971  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2853  cysteine synthase A  44.34 
 
 		 320 aa  256  5e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1149  cysteine synthase A  44.98 
 
 		 311 aa  254  9e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000025777  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3195  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  47.62 
 
 		 326 aa  254  1.0000000000000001e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.421019  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4466  cysteine synthase A  45.13 
 
 		 327 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00243818 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5241  cysteine synthase A  47.54 
 
 		 307 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0191728 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2430  cysteine synthase A  46.1 
 
 		 306 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0413  cysteine synthase  44.92 
 
 		 309 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0213  cysteine synthase  45.69 
 
 		 329 aa  253  2.0000000000000002e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0914276  normal  0.144885 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04800  cysteine synthase A  43.97 
 
 		 309 aa  253  3e-66  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000597368  normal  0.814351 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0063  cysteine synthase A  47.54 
 
 		 307 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0832  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  41.97 
 
 		 306 aa  252  5.000000000000001e-66  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00340267  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3549  cysteine synthase A  44.66 
 
 		 322 aa  252  6e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_953  cysteine synthase  45.48 
 
 		 320 aa  252  7e-66  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000343054  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0420  cysteine synthase A  45.03 
 
 		 311 aa  251  1e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.858609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0452  cysteine synthase  44.66 
 
 		 319 aa  251  1e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.118838 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0433  cysteine synthase K/M/A  42.16 
 
 		 307 aa  251  1e-65  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.818582  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2427  cysteine synthase  46.25 
 
 		 309 aa  251  1e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00952791  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0075  cysteine synthase A  47.21 
 
 		 307 aa  251  1e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1022  cysteine synthase A  44.26 
 
 		 310 aa  250  2e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0422971  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3782  cysteine synthase  43.37 
 
 		 320 aa  250  2e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00462193  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05340  cysteine synthase  42.19 
 
 		 304 aa  250  2e-65  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3907  cysteine synthase A  46.28 
 
 		 307 aa  250  2e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000106704  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0535  cysteine synthase A  44.67 
 
 		 307 aa  249  3e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0678503  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1541  cysteine synthase A  43.37 
 
 		 330 aa  249  3e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3794  cysteine synthase  43.65 
 
 		 339 aa  249  3e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0364  cysteine synthase  46.28 
 
 		 322 aa  249  4e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>