More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1013 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_1013  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  100 
 
 		 326 aa  652    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3195  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  82.72 
 
 		 326 aa  529  1e-149  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.421019  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1763  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  73.62 
 
 		 326 aa  478  1e-134  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.629074  normal  0.0111881 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0932  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  64.42 
 
 		 327 aa  391  1e-107  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2475  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  48.23 
 
 		 307 aa  279  5e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3085  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  48.41 
 
 		 307 aa  279  5e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.520498  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0978  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  48.72 
 
 		 307 aa  275  5e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4455  O-acetylserine lyase  48.09 
 
 		 307 aa  271  1e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4269  O-acetylserine lyase  47.77 
 
 		 307 aa  271  1e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4106  cysteine synthase  47.77 
 
 		 307 aa  271  1e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4117  cysteine synthase  47.77 
 
 		 307 aa  271  1e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4601  O-acetylserine lyase  47.77 
 
 		 307 aa  271  1e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4453  O-acetylserine lyase  47.77 
 
 		 307 aa  271  1e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4506  O-acetylserine lyase  48.09 
 
 		 307 aa  271  1e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0207318  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4492  O-acetylserine lyase  47.13 
 
 		 307 aa  269  4e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.986798  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0744  O-acetylserine lyase  47.13 
 
 		 307 aa  269  5e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4220  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  47.45 
 
 		 307 aa  269  5e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0885  cysteine synthase  46.01 
 
 		 303 aa  256  4e-67  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1560  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  47.12 
 
 		 302 aa  245  6.999999999999999e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.180171  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1287  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  44.09 
 
 		 304 aa  244  1.9999999999999999e-63  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.870324  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0170  cysteine synthase family protein  42.95 
 
 		 302 aa  242  6e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1228  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  45.83 
 
 		 302 aa  240  2.9999999999999997e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1759  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  46.65 
 
 		 303 aa  239  4e-62  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0161218  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0166  cysteine synthase family protein  43.59 
 
 		 302 aa  227  2e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0889  cysteine synthase A  39.35 
 
 		 304 aa  216  2.9999999999999998e-55  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4156  cystathionine beta-synthase  40.48 
 
 		 461 aa  216  5e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.884438 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  40.45 
 
 		 311 aa  213  2.9999999999999995e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0162  cysteine synthase  43.32 
 
 		 305 aa  211  1e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0152  cysteine synthase  40.5 
 
 		 310 aa  210  2e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0717  cysteine synthase A  40.58 
 
 		 321 aa  210  2e-53  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00067142  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2500  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  38.78 
 
 		 315 aa  211  2e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2871  cysteine synthase A  41.53 
 
 		 318 aa  208  1e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1534  cysteine synthase A  38.91 
 
 		 298 aa  208  1e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0478  cysteine synthases  41.82 
 
 		 773 aa  207  2e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00249553  hitchhiker  0.000140585 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0922  cysteine synthase A  37.74 
 
 		 304 aa  207  2e-52  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.107998  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0081  cysteine synthase A  39.94 
 
 		 301 aa  206  3e-52  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.130263  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0535  cysteine synthase A  39.13 
 
 		 310 aa  205  1e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.775182  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2830  cystathionine beta-synthase  39.17 
 
 		 332 aa  204  1e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.908849  normal  0.0512396 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0548  cysteine synthase A  39.13 
 
 		 310 aa  205  1e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1971  cysteine synthase  42.54 
 
 		 308 aa  204  2e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000186941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1311  cysteine synthase  41.08 
 
 		 302 aa  203  4e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.933049  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1476  cysteine synthase A  40.19 
 
 		 324 aa  202  5e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23060  cysteine synthase A  41.67 
 
 		 305 aa  202  8e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000228532  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3846  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  38.08 
 
 		 459 aa  202  9e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.692652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1553  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  44.79 
 
 		 304 aa  201  9.999999999999999e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.222613  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05340  cysteine synthase  40.65 
 
 		 304 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2988  cysteine synthase  40.89 
 
 		 307 aa  200  3e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000571381  normal  0.7688 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1337  cysteine synthase A  47.1 
 
 		 310 aa  200  3e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.241539  normal  0.869018 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3763  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  38.67 
 
 		 459 aa  200  3e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3706  cystathionine beta-synthase  38.37 
 
 		 459 aa  199  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1990  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  39.63 
 
 		 326 aa  199  3.9999999999999996e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0094  cysteine synthase/cystathionine beta-synthase family protein  37.94 
 
 		 302 aa  199  7e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0170  cysteine synthase A  37.97 
 
 		 304 aa  199  7e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00475319  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8566  cystathionine beta-synthase  40.75 
 
 		 456 aa  199  7e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4422  cystathionine beta-synthase  39.49 
 
 		 455 aa  198  7.999999999999999e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1790  cysteine synthase  42.58 
 
 		 323 aa  198  9e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.475157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  37.97 
 
 		 312 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0154  cysteine synthase K/M/A  36.98 
 
 		 307 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000000054726  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3846  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  38.37 
 
 		 459 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0481  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  41.72 
 
 		 318 aa  197  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000231361  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0494  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  41.72 
 
 		 318 aa  197  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00183291  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12358  cysteine synthase A cysK1  42.81 
 
 		 310 aa  196  3e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2043  cystathionine beta-synthase  42.12 
 
 		 464 aa  197  3e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.140313  normal  0.388176 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1087  cysteine synthase  38.22 
 
 		 303 aa  197  3e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.542203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1720  cysteine synthase  40.38 
 
 		 302 aa  196  4.0000000000000005e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0556189 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3186  cysteine synthase A  40.76 
 
 		 310 aa  196  5.000000000000001e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000213805  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2430  cysteine synthase A  41.8 
 
 		 306 aa  196  5.000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0549  cysteine synthase A  38.8 
 
 		 310 aa  196  6e-49  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000133483 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1697  cysteine synthase A  40.63 
 
 		 305 aa  196  6e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.516314  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1831  cysteine synthase A  40.63 
 
 		 305 aa  196  6e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1615  cysteine synthase A  39.42 
 
 		 308 aa  196  6e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1045  cysteine synthases  40.72 
 
 		 306 aa  196  6e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.801481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  37.54 
 
 		 312 aa  195  7e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1678  cysteine synthase A  40.63 
 
 		 305 aa  195  8.000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.423565  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1617  cystathionine beta-synthase  39.63 
 
 		 464 aa  195  8.000000000000001e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1875  cysteine synthase A  40.63 
 
 		 305 aa  195  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000101872 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0964  cysteine synthase  39.81 
 
 		 320 aa  195  9e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274794  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1332  cysteine synthase A  38.91 
 
 		 309 aa  194  1e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000281475  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3364  cysteine synthase A  39.18 
 
 		 304 aa  194  1e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000830673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1832  cysteine synthase A  42.81 
 
 		 317 aa  194  1e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.118091  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4674  cystathionine beta-synthase  41.8 
 
 		 464 aa  194  2e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202958 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1653  cysteine synthase A  40 
 
 		 305 aa  193  3e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1954  cysteine synthase A  40.32 
 
 		 305 aa  193  3e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221871  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1358  cysteine synthase  40.06 
 
 		 316 aa  193  3e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3718  cystathionine beta-synthase  40.62 
 
 		 463 aa  193  4e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000446047  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1837  cysteine synthase A  40 
 
 		 305 aa  193  4e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1718  cysteine synthase A  41.35 
 
 		 308 aa  193  4e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000370956  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0030  cysteine synthase A  39.12 
 
 		 311 aa  192  6e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2237  cysteine synthase A  41.59 
 
 		 317 aa  192  7e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.425208 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1919  cysteine synthase A  39.68 
 
 		 305 aa  192  7e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.468327  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0011  cysteine synthase A  39.87 
 
 		 310 aa  192  7e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.857978  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1691  cysteine synthase A  40 
 
 		 305 aa  192  7e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2677  cysteine synthase A  41.9 
 
 		 309 aa  192  7e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.601381  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2581  cysteine synthase A  41.9 
 
 		 309 aa  192  7e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3506  cysteine synthase A  40 
 
 		 305 aa  192  7e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1706  cysteine synthase  41.53 
 
 		 306 aa  192  9e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000550718  normal  0.263535 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1048  cystathionine beta-synthase  41.38 
 
 		 455 aa  191  1e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0433  cysteine synthase K/M/A  38.24 
 
 		 307 aa  191  1e-47  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.818582  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1280  cysteine synthase  42.22 
 
 		 309 aa  191  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0485567  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1385  cysteine synthase  36.6 
 
 		 311 aa  191  1e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.9014  normal  0.484311 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>